Ten artykuł demonstruje ustandaryzowaną metodę konstruowania trójwymiarowych sferoid nowotworowych. Opisano również strategię obserwacji sferoidy i analizy głębokiego uczenia opartego na obrazach przy użyciu zautomatyzowanego systemu obrazowania.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
* These authors contributed equally
Ten artykuł demonstruje ustandaryzowaną metodę konstruowania trójwymiarowych sferoid nowotworowych. Opisano również strategię obserwacji sferoidy i analizy głębokiego uczenia opartego na obrazach przy użyciu zautomatyzowanego systemu obrazowania.
W ostatnich dziesięcioleciach, oprócz komórek hodowanych jednowarstwowo, opracowano trójwymiarowe sferoidy nowotworowe jako potencjalnie potężne narzędzie do oceny leków przeciwnowotworowych. Jednak konwencjonalne metody hodowli nie mają możliwości manipulowania sferoidami guza w jednorodny sposób na poziomie trójwymiarowym. Aby rozwiązać ten problem, w niniejszym artykule przedstawiamy wygodną i skuteczną metodę konstruowania sferoid guza średniej wielkości. Dodatkowo opisujemy metodę analizy obrazowej z wykorzystaniem oprogramowania analitycznego opartego na sztucznej inteligencji, które może zeskanować całą płytę i uzyskać dane na temat sferoid trójwymiarowych. Zbadano kilka parametrów. Dzięki zastosowaniu standardowej metody budowy sferoidów guza oraz wysokoprzepustowego systemu obrazowania i analizy, skuteczność i dokładność testów lekowych wykonywanych na trójwymiarowych sferoidach może zostać znacznie zwiększona.
Rak jest jedną z najbardziej przerażających chorób, nie tylko ze względu na wysoką śmiertelność1. W ostatnich latach możliwości leczenia raka wzrosły wraz z wprowadzeniem nowych terapii2,3,4,5. Dwuwymiarowe (2D) i trójwymiarowe (3D) modele in vitro są wykorzystywane do badania nowotworów w warunkach laboratoryjnych. Jednak modele 2D nie są w stanie natychmiast i dokładnie ocenić wszystkich ważnych parametrów, które wskazują na wrażliwość przeciwnowotworową; W związku z tym nie są one w stanie w pełni odwzorować interakcji in vivo w testowaniu terapii lekowej6.
Od 2020 roku globalny rynek kultur trójwymiarowych (3D) znacznie się rozwinął. Według jednego z raportów NASDAQ OMX, globalna wartość rynku kultur komórkowych 3D przekroczy 2,7 miliarda dolarów do końca 2025 roku. W porównaniu z metodami hodowli 2D, hodowla komórek 3D wykazuje korzystne właściwości, które można zoptymalizować nie tylko pod kątem proliferacji i różnicowania, ale także pod kątem długoterminowego przeżycia7,8. W ten sposób można symulować mikrośrodowiska komórkowe in vivo, aby uzyskać dokładniejszą charakterystykę guza, a także profilowanie metaboliczne, dzięki czemu można lepiej zrozumieć zmiany genomowe i białkowe. Z tego powodu systemy testów 3D powinny być obecnie włączane do głównego nurtu działań związanych z opracowywaniem leków, zwłaszcza tych, które koncentrują się na badaniach przesiewowych i ocenie nowych leków przeciwnowotworowych. Trójwymiarowe wzrosty unieśmiertelnionych, ustalonych linii komórkowych lub pierwotnych kultur komórkowych w strukturach sferoidalnych posiadają in vivo cechy nowotworów, takie jak niedotlenienie i penetracja leków, a także interakcja, odpowiedź i oporność komórek, i mogą być uważane za rygorystyczny i reprezentatywny model do przeprowadzania badań przesiewowych leków in vitro9,10,11.
Jednak te modele kultur 3D również cierpią na kilka problemów, których rozwiązanie może zająć trochę czasu. Sferoidy komórkowe mogą być tworzone przy użyciu tych protokołów, ale różnią się one pewnymi szczegółami, takimi jak czas hodowli lub zatapianie żeli12, więc te skonstruowane sferoidy komórkowe nie mogą być dobrze kontrolowane w ograniczonym zakresie rozmiarów. Wielkość sferoid może mieć wpływ na spójność badania żywotności i analizy obrazowej. Mikrośrodowiska wzrostu i czynniki wzrostu również się różnią, co może prowadzić do różnych morfologii ze względu na różnice w różnicowaniu między komórkami13. Obecnie istnieje oczywista potrzeba standardowej, prostej i opłacalnej metody konstruowania wszystkich typów nowotworów o kontrolowanych rozmiarach.
Z innej perspektywy, chociaż do oceny morfologii, żywotności i tempa wzrostu opracowano testy jednorodne i metody obrazowania o wysokiej zawartości, wysokoprzepustowe badania przesiewowe modeli 3D pozostają wyzwaniem z różnych powodów podawanych w literaturze, takich jak brak jednolitości w położeniu, rozmiarze i morfologii sferoid nowotworowych14,15,16.
W przedstawionym tutaj protokole wymieniamy każdy krok w budowie sferoid 3D guzów i opisujemy metodę obserwacji i analizy sferoidów przy użyciu wysokoprzepustowego systemu obrazowania o wysokiej zawartości, który obejmuje autofokus, automatyczne obrazowanie i analizę, wśród innych korzystnych cech. Pokazujemy, w jaki sposób ta metoda może wytworzyć sferoidy guza 3D o jednolitym rozmiarze, które są odpowiednie do obrazowania o wysokiej przepustowości. Sferoidy te wykazują również wysoką wrażliwość na leczenie farmakologiczne nowotworów, a zmiany morfologiczne w sferoidach można monitorować za pomocą obrazowania o wysokiej zawartości. Podsumowując, wykazujemy solidność tej metodologii jako środka do generowania konstruktów 3D guzów do celów oceny leków.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Tworzenie sferoidów
2. Leczenie preparatem
3. Żywotność sferoidów
4. Obserwacja sferoidów i analiza głębokiego uczenia na podstawie obrazów w teście lekowym
(Eq. 2)Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Rycina 1A, B przedstawia proces wykorzystywany do tworzenia sferoidów nowotworowych w niniejszym badaniu. Najpierw wysiano komórki na płytkę 48-dołkową z dnem w kształcie litery U. Krok ten jest niemal identyczny z tym stosowanym w hodowli komórkowej 2D. Płytkę przechowywano w inkubatorze w otoczeniu wody, aby osadzone komórki mogły rozpocząć tworzenie sferoidów w procesie samorganizacji. W normalnych warunkach operacyjnych większość typów sferoidów nowotworowych została w p...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Mikrośrodowisko odgrywa ważną rolę we wzroście guza. Może wpływać na dostarczanie macierzy zewnątrzkomórkowych, gradienty tlenu, odżywianie i interakcje mechaniczne, a tym samym wpływać na ekspresję genów, szlaki sygnałowe i wiele funkcji komórek nowotworowych 19,20,21. W wielu przypadkach komórki 2D nie wywołują takich efektów lub nawet wywołują odwrotne efekty, wpływając w ten sposób na ocenę leczenia farmakologicznego. Jednak...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Dziękujemy wszystkim członkom naszych laboratoriów za ich krytyczny wkład i sugestie. Badania te były wspierane przez kluczowy projekt Komisji Zdrowia Jiangsu (K2019030). Konceptualizacja została przeprowadzona przez C.W. i Z.C., metodologia została przeprowadzona przez W.H. i M.L., badanie zostało przeprowadzone przez W.H. i M.L., kuratoria danych została przeprowadzona przez W.H., Z.Z., S.X. i M.L., pierwotne przygotowanie projektu zostało wykonane przez Z.Z., J.Z., S.X., W.H., i X.L., recenzją i redakcją zajmowała się firma Z.C., administracją projektu zajmowały się C.W. i Z.C., a pozyskiwaniem finansowania zajmowała się firma C.W. Wszyscy autorzy zapoznali się z opublikowaną wersją manuskryptu i wyrazili na nią zgodę.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 0,5-10 &m; L Końcówki do pipet | AXYGEN | T-300 | |
| 1,5 ml Mikroprobówki odporne na gotowanie | Axygen | MCT-150-C | |
| 100-1000μ L Końcówki do pipet | KIRGEN | KG1313 | |
| 15 mL Rurka wirówkowa | Nest | 601052 | |
| 200 μ L Końcówki do pipet | AXYGEN | T-200-Y | |
| Żel 3D | Avatarget | MA02 | |
| 48-dołkowa dolna płytka | U Avatarget | P02-48UWP | |
| 50 mL Gniazdo probówki wirówkowej | 602052 | ||
| Alamar Blue | Thermo | ||
| Płyn do płukania zapobiegający przywieraniu | STEMCELL | #07010 | |
| Certyfikat FBS | BI | 04-001-1ACS | |
| Woda dejonizowana | aladdyna | W433884-500ml | |
| DMEM (Dulbecco's Modified Eagle Medium) | Gibco | 11965-092 | |
| DMSO | sigma | D2650-100ML | |
| Excel sofware | Microsoft Office | ||
| Graphpad | Oprogramowanie GraphPad | ||
| High Content Imager i system SMART | Avatarget | 1-I01 | |
| Image J oprogramowanie | National Institutes of Health | ||
| Suplement insuliny-transferyny-selenu-A (100X) | Gibco | 51300-044 | |
| Parafilm | Bemis | PM-996 | |
| PBS | Solarbio | P1020 | |
| Penicylina/ streptomycyna Sol | Gibco | 15140-122 | |
| RPMI 1640 | Gibco | 11875-093 | |
| Scientific Kolba Fluoroskan Ascent | Thermo Fluoroskan Ascent | ||
| T25 | JET Biofil | TCF012050 | |
| Trypsyna, 0,25% (1X) | Hyclon | SH30042,01 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.