Zgodnie z niniejszym protokołem przeprowadzono pomiary kurczliwości, przejściowych zmian poziomu Ca2+ oraz odpowiedzi na związek w kardiomiocytach pochodzących z ludzkich indukowanych pluripotencjalnych komórek macierzystych (hiPSC-CMs). Dzięki zastosowaniu tego systemu pomiarowego opartego na optyce, komórki hiPSC-CMs można było po prostu ponownie wysiać na odpowiednie płytki i przeprowadzić pomiary kurczliwości. Kurczliwość mierzono w obszarze zainteresowania (ROI) o wymiarach 100 µm x 100 µm przy 250 klatkach na sekundę, obliczając korelację pikseli względem klatki referencyjnej. Klatka referencyjna jest automatycznie wykrywana przez system w końcowej fazie rozkurczu. Równocześnie z pomiarami skurczu rejestrowano ratiometryczny pomiar przejściowego stężenia wapnia.
W niniejszym badaniu trzy różne serie różnicowania zostały wykorzystane jako trzy powtórzenia biologiczne. Dla każdej serii różnicowania zmierzono trzy studzienki jako powtórzenia techniczne. Badanie przeprowadzono przy użyciu płytek 24-dołkowych, mierząc 10 obszarów w każdej studzience. Po wykonaniu pomiarów dane poddano natychmiastowej analizie za pomocą programu CytoSolver. Przedstawiono następujące parametry: spoczynkową częstotliwość skurczów, TP.Con oraz TB.Con80 dla kontrolnych hiPSC-CMs (Rycina 2A-C). Aby zwizualizować zmienność danych dla każdego wymienionego parametru, pomiary w obrębie każdej studzienki oraz wartości średnie z trzech studzienek dla każdej serii różnicowania przedstawiono w formie superplotów10. W celu lepszej oceny zmienności danych dla każdej serii różnicowania oraz pomiędzy trzema seriami obliczono współczynnik zmienności (Rycina 2D) dla każdego parametru. Jak pokazano na Rycynie 2D, wartości powtórzeń technicznych odpowiadających jednemu powtórzeniu biologicznemu mieszczą się w bardzo zbliżonym zakresie (tj. niski współczynnik zmienności), co ilustruje powtarzalność tej metody.
Ta aplikacja jest bardzo dobrze dostosowana do testowania działania leków. W tym przypadku przetestowano wpływ 500 nM ISO, nieselektywnego agonisty receptorów β-adrenergicznych, na kurczliwość kontrolnych hiPSC-CMs. Znane jest, że związek ten zwiększa częstotliwość pracy serca i wywiera pozytywny efekt lusitropowy. Jak przedstawiono na Rysunku 3A, ISO znacząco zwiększyło częstotliwość bicia we wszystkich studzienkach. ISO zwiększyło również kinetykę, co objawiło się spadkiem TP.Con oraz TB.Con80 (Rysunek 3B,C). Podsumowując, po inkubacji z ISO częstotliwość bicia uległa znacznemu zwiększeniu we wszystkich studzienkach, przy jednoczesnym skróceniu czasu skurczu i rozkurczu, co wskazuje, że platforma ta zarejestrowała oczekiwaną odpowiedź na ten związek.
Równolegle do pomiarów kurczliwości przeprowadzono również pomiary poziomu wapnia. W ten sam sposób, jak w przypadku danych dotyczących kurczliwości (Rysunek 2), dane z pomiarów wapnia w hiPSC-CMs przedstawiono na Rysunku 4. Wskaźnik TB.Ca80 jest znacznie wolniejszy niż w izolowanych kardiomiocytach szczura lub myszy, co częściowo wynika z różnic międzygatunkowych i różnic w częstości akcji serca11, a także z niedojrzałości mechanizmów gospodarki wapniowej w hiPSC-CMs ze względu na niższą dynamikę wapnia wewnątrz siateczki sarkoplazmatycznej i niższą ekspresję białek odpowiedzialnych za gospodarkę wapniową w porównaniu z komórkami pierwotnymi12. Podobnie jak dla danych dotyczących kurczliwości, obliczono współczynnik zmienności dla pomiarów wapnia, który wskazuje na niską zmienność pomiędzy powtórzeniami technicznymi i biologicznymi (Rysunek 4C).

Rysunek 1: Natychmiastowe użycie narzędzia do analizy przejściowej CytoSolver po eksperymencie w celu analizy danych. (A) Przykład zaakceptowanych przejściowych sygnałów (wszystkie na niebiesko) z jednego obszaru mierzonego wewnątrz studni. Panel A1 przedstawia sygnały skurczowe. Panel A2 przedstawia sygnały wapniowe. (B) Średni sygnał przejściowy kurczliwości uzyskany z pomiarów w trzech studniach z jednej serii różnicowania. Z każdego pojedynczego lub średniego sygnału można było wyodrębnić dane z różnych punktów czasowych czasu do szczytu (TP.Con) i czasu do linii bazowej (TB.Con) sygnału kurczliwości. Ponieważ dokładnego początku skurczu nie zawsze można jednoznacznie określić, za punkt wyjścia dla pomiarów czasu do szczytu przyjmuje się czas do 20% szczytu. Podobnie trudno jest ocenić dokładny moment, w którym sygnał powraca do linii bazowej. Dlatego czas do 80% linii bazowej jest używany do opisu czasu relaksacji. Tutaj zastosowano TP.Con (czas do szczytu - czas do 20% szczytu) oraz TB.Con80 (czas do 80% linii bazowej - czas do szczytu). (C) Średnie dane sygnału przejściowego wapnia uzyskane z pomiarów w trzech studniach z jednej serii różnicowania. Z każdego pojedynczego lub średniego sygnału wapniowego można było wyodrębnić dane z różnych punktów czasowych czasu do szczytu (TP.Ca) i czasu do linii bazowej (TB.Ca) sygnałów wapniowych. Dla pomiarów czasu do szczytu punktem wyjścia jest czas do 20% szczytu, a dla czasu do linii bazowej punktem końcowym jest czas do 80% linii bazowej. W niniejszym badaniu zastosowano TP.Ca(czas do szczytu - czas do 20% szczytu) oraz TB.Ca80 (czas do 80% linii bazowej - czas do szczytu). Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 2: Pomiary podstawowej kurczliwości wykonane w trzech różnych cyklach różnicowania. Trzy powtórzenia biologiczne i trzy dołki dla każdego cyklu różnicowania (tj. trzy powtórzenia techniczne). Trzy główne symbole dla każdego cyklu różnicowania reprezentują średnią wartość zmierzonych obszarów (symbole w tle w wyblakłych kolorach) w obrębie każdego dołka. Dane przedstawiono jako średnia ± SEM. Dane dotyczące spoczynkowej częstotliwości skurczów przedstawiono w hercach, a dla TP.Con i TB.Con80 dane podano w sekundach. (A) Spoczynkowa częstotliwość skurczów. (B) Czas do szczytu (TP.Con). (C) Czas do powrotu do poziomu bazowego 80% (TB.Con80). (D) Aby ocenić zmienność między danymi uzyskanymi w każdym cyklu oraz pomiędzy wszystkimi trzema cyklami różnicowania, obliczono procentowy współczynnik zmienności, korzystając ze średnich wartości dla każdego dołka. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tej ryciny.

Rysunek 3: Pomiary kurczliwości w stanie spoczynku (-) oraz po inkubacji z ISO (+) w trzech studniach z trzech serii różnicowania. (A) Częstotliwość bicia w spoczynku (-) oraz częstotliwość bicia po inkubacji z 500 nM ISO (+). (B) Pomiary czasu do szczytu (TP.Con) w stanie spoczynku i po inkubacji z ISO. (C) Pomiary czasu do 80% linii bazowej (TB.Con80) w stanie spoczynku i po inkubacji z ISO. Aby ocenić wpływ ISO na parametry kurczliwości, przeprowadzono dwuczynnikową analizę wariancji (ANOVA) z korektą Bonferroniego. Dane przedstawiono jako średnia ± SEM. Dane dotyczące częstotliwości bicia w spoczynku podano w hercach, a dla TP.Con i TB.Con80 dane podano w sekundach. Aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku, kliknij tutaj.

Rysunek 4: Pomiary bazowe przejściowych stężeń wapnia wykonane w trzech studzienkach z trzech serii różnicowania. (A) Czas do szczytu (TP.Ca) oraz (B) czas do powrotu do 80% poziomu bazowego (TB.Ca80) przejściowych stężeń wapnia. Dane przedstawiono jako średnia ± SEM. Dane TP.Ca i TB.Ca80 podano w sekundach. (C) Aby ocenić zmienność między danymi uzyskanymi w każdej serii a wszystkimi trzema seriami różnicowania, obliczono procentowy współczynnik wariancji, korzystając z wartości średniej dla każdej studzienki. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.