$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Zgodnie z tym protokołem, przeprowadzono pomiary kurczliwości, stanów przejściowych Ca2+ i odpowiedzi na związek w hiPSC-CMs. Dzięki zastosowaniu tego systemu pomiarowego opartego na optyce, hiPSC-CM można było po prostu ponownie pokryć na wymaganych płytkach i przeprowadzić pomiary kurczliwości. Kurczliwość mierzy się w obszarze zainteresowania (ROI) o wymiarach 100 μm x 100 μm przy 250 klatkach na sekundę poprzez obliczenie korelacji pikseli względem klatki odniesienia. Układ odniesienia jest automatycznie wykrywany przez system przy końcu rozkurczu. Równocześnie z pomiarami skurczu rejestrowany jest ratiometryczny stan przejściowy wapnia.
W tym badaniu, trzy różne rundy różnicowania zostały użyte jako trzy biologiczne powtórzenia. Dla każdej partii różnicowania zmierzono trzy studzienki jako kontrpróby techniczne. Badanie to przeprowadzono przy użyciu 24-dołkowych płytek i zmierzono 10 obszarów w każdym dołku. Po pomiarach wykorzystano program CytoSolver do natychmiastowej analizy danych. Podano następujące parametry: spoczynkową częstotliwość dudnienia, TP. Wada i gruźlica. Con80 kontrolnych hiPSC-CM (Rysunek 2A-C). Aby zobrazować zmienność danych dla każdego z wymienionych parametrów, pomiary w każdym dołku oraz średnie wartości z trzech dołków dla każdej rundy różnicowania są prezentowane jako superwykresy10. Aby lepiej ocenić zmienność danych dla każdej rundy różnicowania i między trzema rundami, obliczono współczynnik wariancji (Rysunek 2D) dla każdego parametru. Jak pokazano na rysunku Rysunek 2D, wartości kontrprób technicznych odpowiadających jednej kontrpróbie biologicznej mieszczą się w bardzo bliskim zakresie (tj. niski współczynnik wariancji), co ilustruje solidność tej metody.
Ta aplikacja jest bardzo dobrze przystosowana do testowania efektów leku. Zbadano wpływ ISO 500 nM, nieselektywnego agonisty receptora β-adrenergicznego, na kurczliwość kontrolnych hiPSC-CM. Związek ten jest znany z tego, że zwiększa częstość akcji serca i wywiera pozytywny efekt lusytropowy. Jak pokazano w Rysunek 3A, ISO znacznie zwiększyło częstotliwość dudnienia we wszystkich studzienkach. ISO zwiększyło również kinetykę, co jest widoczne w spadku TP. Wada i gruźlica. Con80 (Rysunek 3B,C). Ogólnie rzecz biorąc, po inkubacji z ISO, częstotliwość dudnienia została znacznie zwiększona we wszystkich studzienkach, wraz ze skróceniem czasu skurczu i relaksacji, co wskazuje, że oczekiwana reakcja na ten związek została zarejestrowana przez tę platformę.
Równolegle do pomiarów kurczliwości, przeprowadzono również pomiary wapnia. W taki sam sposób, jak dane dotyczące kurczliwości (Rysunek 2), dane pomiarowe wapnia hiPSC-CMs są przedstawione w Rysunek 4. TB.Ca80 jest znacznie wolniejszy niż w izolowanych kardiomiocytach szczurów lub myszy, co częściowo tłumaczy różnice w gatunkach i częstości akcji serca11, a także niedojrzałe obchodzenie się z wapniem w hiPSC-CM z powodu niższej dynamiki wapnia w retikulum sarkoplazmatycznym i niższej ekspresji białek przetwarzających wapń w porównaniu z komórkami pierwotnymi12. Podobnie jak w przypadku danych dotyczących kurczliwości, obliczono współczynnik wariancji dla pomiarów wapnia, który wykazuje niską zmienność w obrębie kontrprób technicznych i biologicznych (Rysunek 4C).

Rysunek 1: Natychmiastowe użycie narzędzia do analizy stanów nieustalonych CytoSolver po eksperymencie w celu analizy danych. (A) Przykład akceptowalnych stanów nieustalonych (wszystkie na niebiesko) dla jednego obszaru mierzonego w studni. Panel A1 przedstawia stany przejściowe kurczliwości. Panel A2 przedstawia stany nieustalone wapnia. (B) Średnia przejściowa kurczliwość uzyskana z pomiarów w trzech dołkach jednej rundy różnicowania. Z każdego pojedynczego lub średniego stanu nieustalonego dane z różnych punktów czasowych do wartości szczytowej (TP. Con) i czas do punktu odniesienia (TB. Con) kurczliwości przejściowej można wyodrębnić. Ponieważ nie zawsze można jednoznacznie określić dokładny początek skurczu, czas do osiągnięcia szczytu 20% przyjmuje się jako punkt wyjścia dla pomiarów czasu do szczytu. Podobnie trudny do oszacowania jest dokładny moment, w którym sygnał powraca do linii bazowej. Dlatego czas do linii bazowej 80% jest używany do opisania czasu relaksu. W tym przypadku TP. Con (czas do szczytu - czas do szczytu 20%) i TB. Stosuje się Con80 (czas do linii bazowej 80% - czas do szczytu). (C) Średnie dane dotyczące stanu przejściowego wapnia uzyskane z pomiarów w trzech studzienkach jednej rundy różnicowania. Z każdego pojedynczego lub średniego stanu przejściowego wapnia można uzyskać dane z różnych punktów czasowych czasu do osiągnięcia wartości szczytowej (TP.Ca) i czasu do wartości początkowej (TB.Ca) stanów przejściowych wapnia. W przypadku pomiarów czasu do wartości szczytowej punktem początkowym jest czas do osiągnięcia wartości szczytowej 20%, a punktem końcowym do linii bazowej 80%. W tym badaniu zastosowano TP.Ca (czas do szczytu - czas do szczytu 20%) i TB.Ca80 (czas do punktu odniesienia 80% - czas do szczytu). Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Podstawowe pomiary kurczliwości wykonane w trzech różnych rundach różnicowania. Trzy kontrpróby biologiczne i trzy dołki dla każdej rundy różnicowania (tj. trzy kontrpróby techniczne). Trzy główne symbole dla każdej rundy różnicowania reprezentują średnią wartość mierzonych obszarów (symbole tła w wyblakłych kolorach) w każdym dołku. Dane są przedstawiane jako średnia ± SEM. Dane dotyczące spoczynkowej częstotliwości dudnień są reprezentowane w hercach, a dla TP. Wada i gruźlica. Con80, dane są w kilka sekund. (A) Spoczynkowa częstotliwość dudnienia. (B) Czas do osiągnięcia szczytu (TP. Przeciw). (C) Czas do osiągnięcia punktu bazowego 80% (TB. Przeciw80). (D) Aby ocenić zmienność między danymi uzyskanymi w każdej rundzie i między wszystkimi trzema rundami różnicowania, procentowy współczynnik wariancji obliczono przy użyciu średnich wartości każdego dołka. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Pomiary kurczliwości na linii bazowej (-) i po inkubacji z ISO (+) na trzech dołkach z trzech rund różnicowania. (A) Spoczynkowa częstotliwość dudnienia (-) i częstotliwość dudnienia po inkubacji z 500 nM ISO (+). (B) Czas do osiągnięcia szczytu (TP. Con) pomiary na linii podstawowej i po inkubacji z ISO. (C) Czas do osiągnięcia punktu bazowego 80% (TB. Con80) pomiary na linii podstawowej i po inkubacji z ISO. W celu oceny wpływu ISO na parametry kurczliwości wykonano dwukierunkową korektę Anova z poprawką Bonferroniego. Dane są przedstawiane jako średnia ± SEM. Dane dotyczące spoczynkowej częstotliwości dudnienia są reprezentowane w hercach i dla TP. Wada i gruźlica. Con80, dane są reprezentowane w ciągu kilku sekund. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Podstawowe pomiary przejściowe wapnia wykonane na trzech dołkach z trzech rund różnicowania. (A) Czas do osiągnięcia szczytu (TP.Ca) i (B) czas do osiągnięcia wartości wyjściowej 80% (TB.Ca80) stanów przejściowych wapnia. Dane są przedstawiane jako średnia ± SEM. TP.Ca i TB.Ca80 danych są reprezentowane w sekundach. (C) Aby ocenić zmienność między danymi uzyskanymi w każdej rundzie i między wszystkimi trzema rundami różnicowania, współczynnik wariancji procentowej obliczono przy użyciu średniej wartości każdego odwiertu. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.