$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Neutrofile są bardzo dynamicznymi i wrażliwymi komórkami, które żyją krótko i nie mogą być jeszcze kriokonserwowane19, co sprawia, że badania nad ich biologią są trudne. Dlatego ważne jest, aby postępować ostrożnie w celu uzyskania żywotnych, wzbogaconych i spoczynkowych neutrofili 11,20. W badaniu tym zastosowano technikę izolacji opartą na gęstości, która kładzie nacisk na delikatną i minimalną manipulację, a także stosowanie niskich temperatur aż do etapu aktywacji. Dodatkowo przetwarzanie krwi musi nastąpić w ciągu 30 minut po wkłuciu żyły i być przechowywane w temperaturze pokojowej. Niniejsza praca przedstawia możliwość zmniejszenia stresu manipulacyjnego i czasu eksperymentu. Aby jeszcze bardziej uprościć ten proces, wprowadziliśmy nowy krok (jako opcję) w protokole, który polega na usunięciu erytrocytów poprzez delikatne ponowne zawieszenie i aspirację warstwy erytrocytów po pojedynczej procedurze hemolizy. Ten etap zmniejsza stres manipulacyjny i czas eksperymentu, ponieważ usuwa większość erytrocytów za pomocą tylko jednego etapu hemolizy hipotonicznej. Należy jednak zauważyć, że umiejętności operatora mają duży wpływ na skuteczność tego kroku i nie zawsze może on całkowicie usunąć erytrocyty. Co więcej, aspiracja erytrocytów może prowadzić do utraty neutrofili, ale nie wpływa to na plon, ponieważ więcej neutrofili zostało początkowo odzyskanych z gradientu, gdy zbierano je bliżej warstwy erytrocytów. W związku z tym aspiracja RBC jest zalecana, jeśli testy nie wymagają najwyższej możliwej czystości lub jeśli operator ma niezmiennie dobre wyniki. W przypadku przedstawionych tutaj badań przesiewowych niewielka ilość zanieczyszczeń krwinkami czerwonymi (<3%) nie zakłóciłaby wyników.
Aby upewnić się, że wszystkie procedury są wykonywane w odpowiednim czasie, w tym przygotowanie odczynników, przedstawiono przepływ pracy (rysunek 2), który szczegółowo określa harmonogram i podział zadań między dwoma badaczami. Po zakończeniu wszystkich testów funkcjonalnych pozostałe komórki można przygotować do dalszych badań molekularnych, takich jak badania omiczne poprzez lizę komórek z odpowiednim buforem do lizy i przechowywaniem.
Produkcja ROS
Wybuch oddechowy jest cechą charakterystyczną pobudzania i aktywacji neutrofili18,21, a ocena produkcji ROS jest powszechną metodą stosowaną do szacowania stanu aktywacji neutrofili. W badaniu tym oceniano produkcję ROS przy użyciu dwóch podejść: mikroskopii optycznej i spektrofotometrii.
Test NBT jest dobrze znanym podejściem do oceny wybuchu oddechowego u neutrofili22,23. Dwie powszechnie stosowane metody to testy oparte na mikroskopii optycznej (lub teście szkiełkowym) i spektrofotometrii 24,25,26. Chociaż mikroskopia optyczna pozwala na wizualizację szczegółów na poziomie komórki, jest podatna na stronniczość użytkownika. W związku z tym test szkiełkowy NBT służy jako jakościowe uzupełnienie testu spektrofotometrycznego dotyczącego cech fenotypowych, takich jak wzorce tworzenia formazanu, intensywność i agregacja komórek.
Krytycznymi etapami zarówno dla szkiełka NBT, jak i testów spektrofotometrycznych są całkowita rozpuszczalność NBT i formazanu. Wbrew zaleceniom producenta, NBT nie rozpuszcza się dobrze w wodzie. Jednak homogenizacja NBT w DMSO przez co najmniej 15 minut, a następnie dodanie wody/HBSS i wirowanie przez 2 minuty zapewnia całkowitą rozpuszczalność. Ponadto, aby przeanalizować absorbancję formazanu, należy osiągnąć dwa krytyczne etapy: (1) uwolnienie kryształów formazanu z komórek przez lizę PMN oraz (2) całkowite rozpuszczenie kryształów formazanu. Oba etapy osiągnięto poprzez potraktowanie osadu komórkowego 10% SDS, jak ostatnio sugerowano27, a następnie analizę sonikacji i absorbancji supernatantu przy 570 nm.
Ponadto wyniki NBT w ujemnych i pozytywnych grupach kontrolnych są pierwszym etapem badań przesiewowych, które należy ocenić. Ten krok musi wykazać niezwykłą różnicę, ponieważ ocena produkcji ROS za pomocą formazanu wskazuje, czy proces izolacji mógł być odpowiedzialny za niepożądane zmiany w stanie spoczynku komórek, czy to poprzez stymulację, czy hamowanie.
Inne metody, takie jak redukcja cytochromu c28 lub analiza cytometrii przepływowej29, są często stosowane do wykrywania ROS; Biorąc jednak pod uwagę podejście przesiewowe, ich zastosowanie wymaga dłuższego czasu eksperymentu, użycia specjalnych markerów i drogich instrumentów. Chemiluminescencja luminolu/izoluminolu jest szybką i opłacalną metodą wykrywania ROS, a jednocześnie umożliwia różnicowanie wewnątrz- i zewnątrzkomórkowych ROS. Jednak do tej metody wymagany jest luminometr30,31. Chociaż koszt instrumentu można obejść poprzez wykorzystanie urządzenia, nadal nie nadawałoby się ono do analizy przesiewowej wykonywanej jednocześnie z innymi testami.
Fagocytozy
Inkubacja PMN/drożdży zapewnia przegląd zdolności i skuteczności fagocytozy neutrofili poprzez zliczenie liczby neutrofili wykonujących fagocytozę oraz liczby drożdży pochłoniętych na neutrofil. Jednakże, ponieważ cząstka drożdży sama w sobie jest sygnałem aktywacji, porównanie grupy kontrolnej ze wstępnie potraktowanym PMN stanowi system podwójnej stymulacji, który może nie wykazywać znaczących zmian, jak pokazano w przypadku PMN traktowanego CTRL w porównaniu z fMLP (Figura 4). Niemniej jednak test ten jest przydatny do wskazania, czy potencjalny modulator miałby jakikolwiek wpływ na fagocytozę. Za pomocą tego testu przetestowano nowy peptyd przeciwdrobnoustrojowy, a wyniki wskazują na interesującą potencjalną reakcję na tę kombinację bodźców, która została niedawno omówiona jako potrzebna do skutecznej aktywacji32.
Krytycznym etapem tego testu jest barwienie, ponieważ analiza staje się niewiarygodna, jeśli szkiełko jest trzymane na panoptyce nr 3 (hematoksylinie) przez ≥3 s. Dzieje się tak, ponieważ komórek drożdży i płatów jądrowych neutrofili nie można od siebie odróżnić. Co więcej, podejście to pozwala na analizę morfologii neutrofili po ekspozycji na modulatory. Cytometria przepływowa jest kolejną skuteczną techniką analizy fagocytozy33, chociaż ma ograniczenia wynikające z trudności w rozróżnieniu między cząstkami związanymi z błoną a pochłoniętymi przez błonę oraz innymi czynnikami związanymi z proponowanym zestawem przesiewowym, jak omówiono w poprzednim temacie. To samo ograniczenie obserwuje się w metodzie opisanej w niniejszym dokumencie, chociaż należy ją traktować jako wstępne badanie przesiewowe w celu ukierunkowania dalszych badań.
Migracja w czasie rzeczywistym
Protokół badań przesiewowych w czasie rzeczywistym został zoptymalizowany pod kątem oceny zdolności migracyjnej PMN. Chociaż poprzednie badanie sugerowało, że pokrycie spodu płytki RTCA było konieczne, aby test migracji wykazał różnicę między kontrolą ujemną a traktowaniem IL-815, badanie to wykazało wysokie wartości przedziału ufności (CI) dla komórek traktowanych fMLP bez dodatku środków powlekających. Wyniki wykazały wysoką powtarzalność przy znacznej migracji od 12 minut. Co więcej, analiza dopasowania krzywych uzyskanych danych migracyjnych może ujawnić parametry, takie jak maksymalny indeks komórek oraz wzrost i spadek nachylenia, które są przydatne do zrozumienia dynamiki migracji i mogą zależeć od stężenia lub różnić się w zależności od warunków. Najlepszym dopasowaniem do krzywych migracji neutrofili (ryc. 5) była skorygowana funkcja Gompertza34, pokazująca, że fMLP zwiększa maksymalny indeks komórek i zwiększa nachylenie.
Należy zwrócić szczególną uwagę, aby uniknąć pęcherzyków w systemie RTCA, ponieważ mogą one blokować ogniwa przechodzące przez elektrody, zagrażając eksperymentowi. Czynnikiem ograniczającym jest wysoki koszt płyt. Chociaż tańsze techniki analizują migrację komórek, brakuje im dobrej odtwarzalności lub są trudne i czasochłonne, jak w przypadku komory Boydena35. W związku z tym RTCA jest wiarygodną analizą migracji kompatybilną z innymi przedstawionymi tutaj testami przesiewowymi.
Sieci
Wreszcie, opracowano obiecujący, łatwy i tani test do wstępnej oceny powstawania NET przy użyciu mikroskopii optycznej. Uzyskano go na podstawie obserwacji szkiełek fagocytozy, w których PMA, specyficzny bodziec indukujący NET, badany pod kątem wpływu na zdolność fagocytozy, indukował również tworzenie struktury przypominającej pajęczynę w porównaniu z grupami CTRL i fMLP. W tej pracy postawiono hipotezę, że struktury te mogą wskazywać na wydanie NET. Hipotezę taką przetestowano, traktując próbki DNazą I po aktywacji, gdzie nie znaleziono żadnych nitkowatych struktur w neutrofilach aktywowanych PMA. Założenie, że takie struktury mogą być NET, opiera się na fakcie, że PMA jest cytowany jako dobrze znany induktor powstawania NET36,37, odkryciu podobnych struktur za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej przy użyciu specyficznych markerów dla NET38,39 oraz degradacji NET katalizowanej przez DNazę I40,41. Należy podkreślić, że nie jest to metoda potwierdzania powstawania NET, a jedynie wstępne badanie, które sugeruje obecność NET. Chociaż ten test ma ograniczenia, ponieważ NET można pomylić z artefaktami barwiącymi, służy on istotnemu celowi, sugerując tworzenie NET w szybkim i tanim badaniu przesiewowym, które można przeprowadzić razem z innymi testami funkcjonalnymi. Po wykryciu, że mogą być istotne dla badania przesiewowego, NET mogą być dalej oceniane za pomocą mikroskopii konfokalnej lub elektronowej42, jak omówiono później.
W naszym laboratorium nowe peptydy przeciwdrobnoustrojowe, które również mogą mieć działanie immunomodulujące, są często oceniane za pomocą tego zestawu testów przesiewowych, aby lepiej kierować dalszą analizą wpływu niektórych peptydów na ludzkie neutrofile, ponieważ niektóre wykazują interesujące właściwości ROS43, fagocytozy, migracji i / lub modulacji NET.
Podsumowując, NeutroFun Screen oferuje cenne narzędzie do identyfikacji potencjalnych modulatorów aktywności neutrofili o normalnej gęstości na podstawie dużej liczby nieprzebadanych związków. Należy jednak pamiętać, że ta metoda służy jedynie jako wstępne badanie przesiewowe. Po tym wstępnym badaniu przesiewowym droższe, bardziej zaawansowane i czasochłonne metodologie mogą zostać skierowane do określonych funkcji lub ścieżek sugerowanych przez te pierwsze wyniki w celu walidacji danych. W przypadku produkcji ROS, fagocytozy i tworzenia NET istnieją alternatywne metody walidacji danych i uzyskiwania dalszych wyników ilościowych. Wizualizację i kwantyfikację NET można przeprowadzić za pomocą analizy mikroskopii immunofluorescencyjnej, która określa obecność i nakładanie się zewnątrzkomórkowego DNA i białek ziarnistych, takich jak mieloperoksydaza i elastaza neutrofilowa, jak opisano szczegółowo niedawno42. ROS odgrywają różne kluczowe role w wielu procesach biologicznych, dlatego ich badanie jest bardzo rozpowszechnione i zróżnicowane. Do najbardziej uznanych metodologii należą te, które wykorzystują przeciwciała, takie jak test immunoenzymatyczny (ELISA) i immunoblotting luminescencji lub wykrywanie fluorescencji - takie jak cytometria przepływowa komórek pod różnymi znakami - za pomocą DCFDA, spektroskopii EPR i pomiarów aktywności enzymatycznej44. Podobnie, solidna ocena fagocytozy jest również przeprowadzana na kilka sposobów; Alternatywne metody obejmują samą cytometrię przepływową45,46 lub w połączeniu z mikroskopią fluorescencyjną47. Opisana migracja komórek w czasie rzeczywistym jest solidnym i wystarczającym testem, który nie wymaga dalszej walidacji i przedstawia parametry, których inne metodologie nie mogą uwzględnić. Inne kombinacje takich metod mogą lepiej pasować do konkretnych scenariuszy, ale podsumowując, jest to szybka i niedroga kombinacja, która obejmuje wiele aktywności neutrofili.
Podsumowując, badanie to ma na celu dostarczenie zestawu testów składających się z prostych, szybkich i tanich metodologii do oceny wielu odpowiedzi neutrofili na nowe cząsteczki i warunki, jako sposób na lepsze skierowanie wysiłków w kierunku zaawansowanych metodologii. Jako główne ograniczenia, wyniki testów ROS, NET i fagocytozy należy uznać za wstępne i wymagają dalszej walidacji za pomocą bardziej szczegółowych i wyszukanych testów, a te, które opierają się na niezautomatyzowanym zliczaniu komórek pod mikroskopem, są podatne na nieświadome uprzedzenia.