W niniejszej pracy zastosowano metodę WFISH do zbadania zachowania chromosomów podczas spermatogenezy u An. gambiae. Pierwszym kluczowym krokiem w zastosowaniu tego protokołu jest uzyskanie jąder, które wykazują niski poziom zmian morfologicznych po wypreparowaniu. Do pomyślnego przeprowadzenia dyssekcji jąder wymagana jest podstawowa wiedza z zakresu anatomii komara; poniżej przedstawiono wskazówki dotyczące tej procedury. U komarów z rodzaju Anopheles dojrzałe jądra znajdują się w szóstym segmencie odwłoka w stadium poczwarki oraz imago21. Jak pokazano na Rysunku 1, vas deferens łączy jądra z gruczołami akcesoryjnymi samca (MAGs), które znajdują się w ostatnim segmencie odwłoka. Gruczoły MAGs są połączone z pojedynczym przewodem ejakulacyjnym, który dostarcza plemniki i płyny nasienne do organu kopulacyjnego i zewnętrznej części aparatu genitalnego samca21. Cały wewnętrzny aparat genitalny samca można wypreparować, stosując różne podejścia w zależności od stadium życiowego komara. W stadium poczwarki jądra można łatwo zidentyfikować pod stereomikroskopem przez przejrzystą kutykulę, patrząc na stronę brzuszną odwłoka w pobliżu szóstego segmentu (Rysunek 1). Aby wypreparować jądra, dolna część odwłoka, w tym szósty segment, może zostać odizolowana od reszty ciała za pomocą dwóch igieł i przeniesiona do czystej kropli 1x PBS. Po usunięciu ostatniego segmentu cały aparat można wycisnąć z odwłoka, wywierając delikatny nacisk igłami sekcyjnymi. Aby wypreparować jądra u dorosłych samców, pierwszym krokiem jest odizolowanie całego odwłoka w świeżej kropli 1x PBS, a następnie wyciągnięcie ostatniego segmentu z chwytnikami, które są kopulacyjnymi strukturami samca (Rysunek 1). Na tym etapie powinna pojawić się dolna część gruczołów MAGs, która jest łatwo identyfikowalna dzięki żółtemu kolorowi. Następnie cały aparat samca można powoli wyciągnąć przy pomocy igły lub pęsety w kropli 1x PBS, aż do momentu, gdy widoczna stanie się para jąder przytwierdzona do vas deferens. Przed przystąpieniem do fiksacji ważne jest odizolowanie jąder od pozostałych części aparatu samca poprzez przecięcie w pobliżu dolnej części vas deferens (Rysunek 1).
Wiek poczwarek lub samców dorosłych jest istotnym czynnikiem, który należy wziąć pod uwagę w zależności od badanego etapu spermatogenezy. U An. gambiae spermatogeneza rozpoczyna się we wczesnej/środkowej fazie poczwarki i trwa przez cały okres życia osobnika24. Od 3 h do 10 h po przepoczwarczeniu w jądrach bardziej reprezentowane są etapy premeiotyczne i meiotyczne (profaza meiotyczna, podziały meiotyczne), DNA spermatyd jest stosunkowo niekondensowane, a dojrzałe plemniki nie zostały jeszcze utworzone. Późne poczwarki oraz osobniki dorosłe w wieku 1 dnia zapewniają dobrą równowagę między etapami premeiotycznymi, meiotycznymi i postmeiotycznymi (Rysunek 2 i Rysunek 3). U osobników dorosłych w wieku powyżej 4 dni etapy premeiotyczne i spermatocysty są słabiej reprezentowane, a jądra są zajęte głównie przez dojrzałe plemniki znajdujące się w zbiorniku nasiennym.
Aby zbadać zachowanie chromosomów płci w różnych etapach spermatogenezy, przeprowadzono WFISH w jądrach wypreparowanych w późnym stadium poczwarki, aby zapewnić dobrą reprezentację całego procesu. W celu śledzenia zachowania tych chromosomów zastosowano sondy fluorescencyjne specyficzne dla sekwencji powtórzonych zlokalizowanych wyłącznie na chromosomie X lub Y. Sondy fluorescencyjne można wytworzyć za pomocą PCR lub nabyć komercyjnie jako oligonukleotydy znakowane na końcu 3'. Zaleca się stosowanie oligonukleotydów o długości >40 bps, aby umożliwić dobrą detekcję sygnału z fluorescencyjnej sondy oligo. Według naszego doświadczenia oligonukleotydy znakowane na końcu 3' wykazują lepszą detekcję sygnału niż sondy znakowane metodą PCR. Ponadto liczba kopii sekwencji docelowej jest czynnikiem, który może wpływać na skuteczność WFISH. W przypadku niepowodzenia znakowania sugeruje się zastosowanie metody znakowania PCR na dłuższym fragmencie lub zaprojektowanie kilku oligonukleotydów specyficznych dla regionu docelowego.
Obecne metody, oparte na zastosowaniu roztworu przenikającego (1% Triton/0,1 M HCl w 1x PBST), zapewniają dobry poziom permeabilizacji jąder w jądrach oraz penetrację sond, co skutkuje pomyślną reakcją hybrydyzacji. Sondy oligonukleotydowe specyficzne dla sekwencji repetytywnych chromosomów płci mogą zostać zaprojektowane w oparciu o szczegółową charakterystykę elementów repetytywnych przeprowadzoną przez Halla i współpracowników20. Ponadto sekwencje konsensusowe specyficzne dla elementów repetytywnych związanych z chromosomem X lub Y można uzyskać za pomocą platformy bioinformatycznej, takiej jak potok RedKmer30. Należy zauważyć, że sondy do chromosomów płci mogą być skierowane przeciwko elementom repetytywnym, takim jak satelity i retrotranspozony, i mogą wykazywać różny poziom hybrydyzacji z chromosomami X lub Y w zależności od badanego gatunku20,31,32. Jak pokazano na Rysunku 3, wysoki poziom hybrydyzacji sond oraz niskie tło pozwoliły na wizualizację docelowych chromosomów w trakcie całej spermatogenezy. Sparowanie znakowanych chromosomów płci było widoczne w etapach premeiotycznych i meiotycznych. Następnie wykryto chromosomy X lub Y w jądrach komórek haploidalnych powstałych w wyniku podziałów meiotycznych. W dalszej kolejności można było śledzić spermatydy z chromosomem X lub Y w trakcie spermiogenezy, charakteryzującej się różnym stopniem kondensacji DNA, aż do końcowego etapu dojrzałych plemników o kształcie strzałki. W obecnym układzie doświadczalnym zastosowano serie obrazów konfokalnych (Z-stacks), aby uzyskać informacje dotyczące trójwymiarowej organizacji przestrzennej komórek podczas tego procesu (Wideo 1).

Rysunek 1: Jądra wypreparowane z poczekułek i 1-dniowych dorosłych samców Anopheles gambiae. (A) Brzuch wypreparowany na późnym etapie poczekułki, pokazujący położenie jąder w pobliżu szóstego segmentu brzusznego. Jądra można zidentyfikować przez kutykulę; widoczne są jako brązowawe struktury po obu stronach brzucha (oznaczone strzałkami). (B) Jądra wypreparowane na etapie poczekułki, pokazujące dojrzałe jądra (1), vas deferens (przewód nasienny) (2), gruczoły akcesoryjne samca (MAGs) (3) oraz przewód wytryskowy (4). (C) Brzuch wypreparowany z 1-dniowego dorosłego samca po usunięciu bazalnego segmentu chwytnego. Gruczoły MAGs można wycisnąć z brzucha, przykładając delikatny nacisk (biała strzałka). (D) Wewnętrzny aparat rozrodczy samca wypreparowany z 1-dniowego dorosłego samca. Biała strzałka wskazuje miejsce zajmowane przez dojrzałe plemniki, które widoczne są jako biały agregat na biegunie bazalnym jądra. Paski skali: (A,C) 200 µm; (B,D) 100 µm. Cyfry rzymskie od I do VIII oznaczają segmenty brzuszne. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 2: Przedstawienie spermatogenezy u Anopheles gambiae. Obraz po lewej stronie przedstawia jądro późnej poczwarki An. gambiae po barwieniu całego preparatu DAPI. Po prawej stronie znajduje się wersja schematyczna dla lepszej wizualizacji. Obserwując kształt jądra i stopień kondensacji, stosunkowo łatwo jest śledzić wszystkie etapy spermatogenezy, od komórek diploidalnych do haploidalnych plemników. Nisza komórek macierzystych znajduje się w górnym biegunie narządu, gdzie rozpoczyna się różnicowanie w spermatogonia. Liczba komórek spermatogoniów zwiększa się po podziale mitotycznym (komórki zielone), a spermatocysty zwiększają swój rozmiar (komórki żółte). Komórki spermatogoniów różnicują się w spermatocyty po wielu rundach podziałów mitotycznych (komórki niebieskie). Spermatocyty, charakteryzujące się względnie większymi jądrami niż komórki na innych etapach procesu, są komórkami, które przejdą podział meiotyczny. Komórki przechodzące mejozę można wykryć, obserwując obecność chromosomów na różnych etapach mejozy; chiasmaty i chromosomy w metafazie można dostrzec nawet przy małym powiększeniu. Etapy przedmeiotyczne są nadreprezentowane w jądrach wypreparowanych na wczesnym etapie poczwarki. Po pierwszym i drugim podziale meiotycznym powstają spermatydy, które zazwyczaj znajdują się w środkowej części jądra. Jądra spermatyd wykazują pewien stopień zmienności kształtu, od okrągłego po kształt przypominający strzałkę. Spermatydy wchodzą w proces spermiogenezy, podczas którego jądra zaczynają się kondensować, a ich struktura zmienia się w kropki w kształcie strzałek. Gdy komary osiągają dojrzałość płciową po wyjściu z poczwarki, spermatocysty zawierające dojrzałe plemniki mogą zajmować większość objętości jądra kosztem spermatocyst na innym etapie rozwoju. Pasek skali: 20 µm. Gwiazdka (*) oznacza część apikalną jądra. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 3: WFISH w jądrze An. gambiae wypreparowanym z późnego stadium poczwarki. WFISH wykonano z użyciem sond specyficznych dla chromosomów X (Contig_240) i Y (sonda oligonukleotydowa specyficzna dla AgY53B). (A) WFISH pozwala śledzić zachowanie chromosomów płci podczas spermatogenezy, od komórek diploidalnych do haploidalnych plemników. Na tym obrazie można dostrzec gwałtowne zmiany, jakim podlegają jądra podczas spermatogenezy. Markowanie chromosomów płci umożliwia rozróżnienie między komórkami diploidalnymi a haploidalnymi. W komórkach diploidalnych sygnał z chromosomów płci jest powiązany z tymi samymi jądrami. W komórkach haploidalnych (spermatydach i plemnikach) sygnał z chromosomów płci jest rozdzielony w wyniku redukcyjnego podziału meiotycznego. (B,C) Obraz jądra o większym powiększeniu (63x) przedstawionego w punkcie (A). Obrazy zostały pozyskane w różnych pozycjach wzdłuż osi Z. Białe przerywane ramki wskazują obszar akwizycji. (B) Stadium przejściowe między spermatocytami a spermatydami, ukazujące formowanie się komórek haploidalnych i rozdzielanie sygnałów z chromosomów płci do osobnych jąder. (C) Stadium przejściowe między haploidalnymi spermatydami a dojrzałymi plemnikami. Etap ten pokazuje zmiany w stopniu kondensacji jądra; dojrzałe plemniki wykazują bardziej skondensowany i wydłużony kształt niż spermatydy. Paski skali: (A), 30 µm; (B,C), 10 µm; Szary: DAPI. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
| Sekwencja docelowa | Sekwencja starterów i konsensus sond oligonukleotydowych | Literatura |
| Kontig_240 (X) | 5’-CAATAAATTTCCTTTTTAATGATGC
AAAATCTACGTCTCTAGC-3’-[Fluorochrom] | 19 |
| AgY53B (Y) | 5’AGAAGAATAGAATCAGAATAGTCGG
TTTCTTCATCCTGAAAGCC-3’-[fluorochrom] | Niniejsze badanie |
AgY477-
AgY53B
złącze
region (Y) | 5’-TTCTAAGTTTCTAGGCTTTAAGGAT
GAAGAAACCGACTATTC-3’-[Fluorochrom] | 19 |
| 18S rDNA (X) | F: AACTGTGGAAAAGCCAGAGC
R: TCCACTTGATCCTTGCAAAA | 19 |
| AgY53B (Y) | F: CCTTTAAACACATGCTCAAATT
R: GTTTCTTCATCCTTAAAGCCTAG | 19 |
Tabela 1: Lista sond oligonukleotydowych specyficznych dla chromosomu X lub Y u An. gambiae.
Wideo 1: Stos 3D WFISH wykonany na jądrze An. gambiae wypreparowanym z późnego stadium poczwarki. Aby uzyskać trójwymiarową reprezentację procesu spermatogenezy, można wykonać stos 3D konfokalny na jądrach wykazujących niewielką liczbę zmian strukturalnych. W niniejszym badaniu stosy wykonano z odstępem 1,25 µm między dwoma przekrojami optycznymi przy użyciu obiektywu olejowego 63x lub 40x, aby nie utracić informacji o 3D organizacji przestrzennej komórek. Szary: DAPI, żółty: Contig_240 (X), magenta: AgY53B (Y). Kliknij tutaj, aby pobrać to wideo.