Izolacja neutrofili stanowi kluczowy krok w badaniu NETosis, gdzie wybór odpowiedniej metody izolacji ma kluczowe znaczenie dla uzyskania wiarygodnych wyników. Ważnym czynnikiem, który należy wziąć pod uwagę, jest wystąpienie zanieczyszczenia limfocytów podczas izolacji. Sprostanie temu wyzwaniu jest szczególnie istotne w przypadku izolowania neutrofili szczurów od szpiku kostnego. Pomimo wyraźnego zakresu gęstości neutrofili (1,0814-1,0919, ze szczytem 1,0919) w porównaniu z limfocytami (1,0337-1,0765, ze szczytem 1,0526), zanieczyszczenie limfocytami pozostaje nieuniknione. Można to częściowo przypisać obfitości limfocytów w szpiku kostnym i zwiększonej gęstości niedojrzałych limfocytów15. Techniki takie jak separacja w gradionym gradinie gęstości, takie jak stosowanie Percollu i Ficollu, mogą pomóc w ograniczeniu zanieczyszczenia limfocytów, chociaż osiągnięcie całkowitej eliminacji limfocytów może być trudne. Specjalistyczny roztwór Percoll, skalibrowany do określonego gradientu gęstości, może być zastosowany w celu zminimalizowania zanieczyszczenia poprzez wykorzystanie różnicy gęstości między neutrofilami szczura a innymi komórkami szpiku kostnego. Dlatego badacze powinni rozsądnie ocenić potencjalny wpływ zanieczyszczenia limfocytami na wyniki eksperymentów i podjąć działania w celu złagodzenia jego wpływu.
Badanie to podkreśla znaczenie dostosowania metod izolacji do konkretnych wymagań eksperymentalnych. W metodzie opisanej wcześniej14 metoda jednoetapowa okazała się mniej wymagająca pod względem czasu i wysiłku. W związku z tym został zatwierdzony do nabycia NET ze względu na nieistotny wpływ zanieczyszczenia limfocytów na wydzielanie NET. Limfocyty te mogą być następnie eliminowane na końcowym etapie wirowania. I odwrotnie, w przypadku prób obejmujących izolację neutrofili i późniejszą ocenę NETozy i wydzielania NET, zalecono metodę dwuetapową14. Podejście to pozwoliło na precyzyjną kwantyfikację NET wytwarzanych przez neutrofile, przy jednoczesnym zminimalizowaniu wpływu potencjalnych czynników zakłócających wynikających z innych zanieczyszczeń komórkowych.
W protokole izolacji można wprowadzić modyfikacje w celu zwiększenia zarówno wydajności, jak i czystości. Na przykład zastosowanie zoptymalizowanego zestawu odczynników o gradiencie gęstości może dać więcej neutrofili. Delikatne metody pipetowania i mycia mogą również złagodzić utratę komórek i zwiększyć czystość. Działania związane z rozwiązywaniem problemów, takie jak monitorowanie pH i temperatury bufora, wraz z dostosowaniem parametrów wirowania, mogą skutecznie rozwiązać problemy napotkane podczas procesu izolacji. Związane z tym ograniczenie izolacji szpiku kostnego polega na prawdopodobieństwie zanieczyszczenia niedojrzałych neutrofili i innych komórek szpiku kostnego, co wpływa zarówno na czystość, jak i wydajność. Opracowanie uproszczonego podejścia do wydalania limfocytów może zwiększyć ogólną skuteczność izolacji. Inne ograniczenie dotyczy konieczności składania ofiar zwierzęcych w celu izolacji szpiku kostnego, co może być nieodpowiednie dla badań podłużnych neutrofili u szczurów in vivo.
Izolacja neutrofili u ludzi opiera się głównie na krwi obwodowej. Konwencjonalne metody obejmują separację Ficoll-Paque, Percoll i immunomagnetyczną separację kulek 16,17,18. Metoda Ficoll segreguje populacje leukocytów na podstawie wyporu i opiera się na środku kontrastowym w celu różnicowania neutrofili. Oferuje prostotę i opłacalność, ale idzie na kompromis w zakresie czystości i wydajności oraz stanowi wyzwanie w eliminacji czerwonych krwinek. Z drugiej strony, Percoll wykorzystuje gradienty gęstości, uzyskując większą czystość i wydajność neutrofili kosztem specjalistycznego sprzętu oraz zwiększonych wydatków i czasu19. Separacja kulek immunomagnetycznych jest nowszą, bardziej specyficzną techniką wykorzystującą kulki magnetyczne sprzężone z przeciwciałami, które specyficznie wiążą się z neutrofilami przy minimalnym zanieczyszczeniu innymi leukocytami. Chociaż można go zautomatyzować, wymaga specjalistycznego sprzętu i wiąże się z wyższymi kosztami ze względu na wydatki na koraliki. Wybierając metodę izolacji neutrofili, naukowcy muszą rozważyć wydajność, czystość, koszt i złożoność. Obecnie najwygodniejszą metodą izolacji neutrofili u ludzi jest użycie PolymorphPrep20. Takie podejście pozwala uzyskać wysoce oczyszczone neutrofile w znacznych ilościach w krótkim czasie. Zasada działania PolymorphPrep opiera się na separacji komórek w zależności od gęstości.
U myszy izolowanie neutrofili od krwi obwodowej jest niewskazane ze względu na małą objętość krwi i wyzwanie związane z zapewnieniem wystarczającej ilości i czystości do dalszych eksperymentów. Pomimo tego, że szczury dostarczają wystarczającą ilość krwi (10 ml na szczura), ich cechy krwi obwodowej różnią się od cech ludzi i myszy. Szczury z natury wykazują niedobory w ekstrakcji neutrofili, przy czym monocyty są najliczniejszymi komórkami jądrzastymi13,14. W związku z tym izolacja krwi obwodowej dostarcza tylko 2 x 105-5 x 105 neutrofili od jednego szczura. Szpik kostny służy jako bardziej żywotne źródło neutrofili, oferując łatwo dostępne i obfite zaopatrzenie niezależnie od statusu infekcji zwierzęcia. Alternatywnie, indukowanie środowiska zapalnego w jamie brzusznej lub klatce piersiowej w celu zwiększenia infiltracji neutrofili w celu izolacji jest zawodne i skomplikowane. W związku z tym ekstrakcja szpiku kostnego jawi się jako praktyczna i niezawodna metoda izolacji neutrofili szczurów21.
NEToza obejmuje różnorodne procesy komórkowe obejmujące dekondensację DNA, autofagię i wydalanie macierzy wewnątrzkomórkowej1. U ludzi ekstruzja NET jest kompleksowa, pozostawiając resztki błony komórkowej. Co ciekawe, badania neutrofili na szczurach wykazują rozbieżne wzorce, ujawniając więcej zawartości wewnątrzkomórkowej po stymulacji. Pomimo stymulacji PMA, neutrofile szczurów wykazują niepełną ekstruzję NET, co jest zgodne z ich spontaniczną NETosis. Co ciekawe, szczurze sieci NET wykazują skłonność do zagregowanych form (aggNET), a nie rozległej struktury sieciowej, potencjalnie ze względu na zmniejszoną zdolność do sieciowania. Zjawisko to może znacząco wpłynąć na agregację neutrofili, wpływając na szerszą odpowiedź immunologiczną u szczurów. Przyszłe zastosowania izolacji szpiku kostnego mogą obejmować badanie odrębnych szlaków sygnałowych i komórek odpornościowych w NETosis. Ponadto metoda ta może ułatwić badanie NETozy w różnych modelach choroby, odkrywając rolę neutrofili w różnych patologiach. Ostatecznie, nowatorskie techniki izolowania i charakteryzowania NET dają nadzieję na rozwikłanie mechanizmów napędzających NETosis i jej funkcjonalnych implikacji w różnych modelach zwierzęcych.