$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Rak prostaty (PC) jest drugą najczęstszą przyczyną zgonów u mężczyzn ipiątą najczęstszą przyczyną zgonów na świecie1. Leczenie pacjenta i rokowanie zależą od stopnia zaawansowania i oceny (skala Gleasona) guza, o czym świadczą wyższe 5-letnie wskaźniki przeżycia guzów zlokalizowanych i o niskim stopniu złośliwości (stopień Gleasona 6) (99%) w porównaniu z wysokimi stopniami Gleasona i guzami przerzutowymi (31%)2.
Miejscowy nawrót choroby PC i niepowodzenie leczenia zostały powiązane z charakterystyczną wysoką niejednorodnością genetyczną tego typu nowotworu3. Ponadto PC jest uważana za chorobę wieloogniskową z kilkoma ogniskami nowotworowymi wykazującymi różne cechy morfologiczne, histologiczne i molekularne4, które mogą powstawać niezależnie lub wywodzić się od wspólnego przodka komórek nowotworowych5. Wcześniejsze badania wykazały, że ewolucja guza różni się u pacjentów w oparciu o określone czynniki genetyczne, które mogą sprzyjać przerzutom lub ograniczać linię komórkową do prostaty5. Dlatego charakterystyka molekularna różnych ognisk nowotworowych ma kluczowe znaczenie nie tylko dla zapewnienia dokładniejszej diagnozy i rokowania, ale także dla dostosowania skutecznego i spersonalizowanego leczenia dla pacjenta.
W tym kontekście, badania biomedyczne i integracyjne podejścia multiomiczne oferują bezprecedensowe możliwości klasyfikowania nowotworów do różnych podtypów, identyfikacji biomarkerów diagnostycznych i prognostycznych oraz odkrywania markerów związanych z odpowiedzią na leczenie. Co więcej, podejścia te przyczyniają się do lepszego zrozumienia biologii tej choroby6,7. Próbki biologiczne, zarówno tkanki, jak i płyny biologiczne, mogą być analizowane przy użyciu różnych platform multiomicznych (genomika, transkryptomika, proteomika, metabolomika itp.) w celu odkrycia cech biologicznych leżących u podstaw patofizjologii raka, rozwiązując w ten sposób obecne ograniczenia związane z heterogenicznością genetyczną i fenotypową6. Jednak ważne jest, aby wziąć pod uwagę, że jakość danych pochodzących z badań omicznych zależy od jakości próbek pobranych z nowotworów, ich dokładnej charakterystyki oraz późniejszego przetwarzania i przechowywania8.
W tym kontekście, pozyskanie świeżej tkanki PC do badań stanowi wyzwanie metodologiczne ze względu na trudności w pomyślnym pobraniu próbek guza9. Poprzednie metody polegały na losowym pobieraniu próbek po radykalnej prostatektomii, co dawało słabe wyniki10. Jednak nowsze podejścia obejmują ukierunkowane protokoły oparte zarówno na obrazowaniu rezonansu magnetycznego (MRI), jak i danych z biopsji, co skutkuje lepszą skutecznością w pobieraniu próbek guza11.
Z drugiej strony, charakterystyka histopatologiczna próbek przed ich przechowywaniem bez znaczących zmian w tkance również stanowi interesujące wyzwanie. W związku z tym w wielu przypadkach oznaczenie histopatologiczne próbek przeprowadza się po ich analizie (np. analiza metabolomiczna HR 1H NMR)12. Praktyka ta wiąże się ze zbędnymi wydatkami, czasochłonnością i utratą znacznej liczby próbek, które ostatecznie są wyłączane z analizy (na przykład próbek, które po analizie histopatologicznej okazują się nie być próbkami nowotworowymi). W innych przypadkach charakterystykę histopatologiczną próbek przeprowadza się przed ich analizą. W rzeczywistości niektóre wcześniejsze badania próbowały ustandaryzować metody dostarczania reprezentatywnych próbek badawczych wysokiej jakości z próbek radykalnej prostatektomii dla genomiki i metabolomiki13,14. Niemniej jednak skuteczność pobierania próbek jest znacznie wyższa, gdy jest wykonywana z już histologicznie potwierdzonych odcinków (88%), które niszczą tkankę, w porównaniu z próbkami niepotwierdzonymi (45%)1.
Tutaj prezentowana jest nowa metodologia pozwalająca przezwyciężyć te ograniczenia, mająca na celu uzyskanie świeżych i dobrze scharakteryzowanych próbek PC przed przechowywaniem w Biobanku. Metoda ta została opracowana dzięki współpracy różnych służb klinicznych (urologia, patologia i biobank szpitala La Fe). Należy podkreślić, że biobanki odgrywają istotną rolę w gromadzeniu, przetwarzaniu, zabezpieczaniu i przechowywaniu próbek biologicznych, zapewniając jednocześnie wysoką jakość próbek i danych, a także zgodność z wymogami etycznymi i prawnymi8,15,16.