Analiza wzrostu neurytów
W niniejszym protokole pochodne iPSC neurony glutaminergiczne i astrocyty zostały wydrukowane biopotencjalnie w kokulturze w matrycy hydrożelowej przy użyciu biodrukarki 3D. W ciągu pierwszych 7 dni po drukowaniu komórki obrazowano co 12 h za pomocą mikroskopu do żywych komórek. Po biodruku komórki powinny mieć zaokrągloną morfologię i być rozproszone w całej matrycy hydrożelowej, stopniowo zmieniając się w mniejsze skupiska komórkowe z niewielkimi wypustkami w ciągu pierwszych kilku dni hodowli (patrz Supplementary Video 1 w celu zobaczenia reprezentatywnego wzrostu zdrowych komórek). Do 4. dnia zdrowe komórki migrują przez żel, tworząc większe skupiska połączone wypustkami neurytów. Do 7. dnia prawie nie powinno pozostać pojedynczych komórek, łączące się wiązki neurytów i projekcje astrocytarne powinny wydawać się wzmocnione, a ze skupisk powinny być widoczne liczne mniejsze wypustki neurytów (Rycina 2A). Wykorzystując serię obrazów w jasnym polu żywych komórek wykonanych w ciągu 7-dniowego okresu wzrostu, przeprowadzono analizę wyrastania neurytów, zgodnie z opisem w sekcji 3. Analiza ta wykazała, że wyrastanie neurytów zwiększa się w sposób niemal liniowy (wartość R2 = 0,84) między 12 h a 156 h (Rycina 2B). W tym okresie wyrastania neurytów wielkość skupisk ciał komórkowych również wzrasta (patrz Supplementary Video 1), co świadczy o migracji komórek w obrębie hydrożelu.
Żywotność komórek i stosunek populacji
W niniejszym protokole do biodrukowania modeli komórkowych zastosowano stężenie 20 milionów komórek/mL, składające się z 15 milionów neuronów/mL i 5 milionów astrocytów/mL. Wykorzystując barwienie żywych komórek kalceiną-AM (komórki żywe), etydinium homodimerem-1 (komórki martwe) oraz barwnikiem jądrowym, liczbę komórek przeżywających w okresie 7 dni można obliczyć zgodnie z sekcją 4 (Rysunek 3A). Wyniki żywotności komórek dla reprezentatywnych kultur przedstawiono dla dnia 4., w którym 72% ± 1% (średnia ± SEM) wszystkich komórek są żywe i wykazują barwienie kalceiną-AM, podczas gdy 29% ± 2% (średnia ± SEM) wszystkich komórek są martwe i wykazują barwienie etydinium homodimerem-1 (Rysunek 3B). Reprezentatywne obrazy barwienia komórek kalceiną-AM i etydinium homodimerem-1 znajdują się na Rysunku uzupełniającym 1. Należy zauważyć, że wartości przeżywalności komórek dla kultur 3D nie mogą być bezpośrednio porównywane z kulturami 2D, ponieważ martwe komórki zostają zatrzymane w hydrożelu i nie są usuwane podczas procesów dokarmiania komórek.
Zastosowanie barwienia immunofluorescencyjnego dla Βtubulinę $\beta$-III oraz GFAP, zgodnie z opisem w sekcji 5 oraz w Rysunek 4można przeprowadzić analizę obrazu w celu określenia proporcji populacji komórek między neuronami a astrocytami (Rysunek 3A). Z całkowitej liczby komórek na model w reprezentatywnych kulturach, ΒNeurony wykazujące pozytywny wynik w kierunku $\beta$-III tubuliny stanowią 49% ± 3% (średnia ± SEM), podczas gdy astrocyty wykazujące pozytywną ekspresję GFAP stanowią 30% ± 4% (średnia ± (SEM). Daje to stosunek astrocytów do neuronów wynoszący odpowiednio 1:1,5. Pozostawia to pozostałość w postaci 21% całkowitej liczby komórek na model, które nie wykazują barwienia dla żadnego z markerów komórkowych. Ponieważ analiza żywotności komórek wykazała, że w 4. dniu średnio 29% komórek nie jest żywotnych, prawdopodobne jest, że komórki te obumarły wewnątrz hydrożelu.
Ekspresja markerów komórkowych
Morfologię biodrukowanych neuronów i astrocytów oceniono za pomocą immunostainingu z użyciem markera specyficznego dla typu komórek neuronalnych (Β-III tubuliny) i marker astrocytarny (GFAP). Na przedstawionych reprezentatywnych hodowlach immunobarwienie jest zlokalizowane w poszczególnych typach komórek, wykazując prawidłową morfologię komórkową, przy czym oba typy komórek wykazują wzrost wypustek komórkowych (Rycina 4A,B). Ponieważ struktury hydrożelu i komórek są trójwymiarowe, każdy obraz przedstawia jedynie jeden przekrój przez strukturę w Rycina 4A,B. Rycina 4C przedstawia połączony stos obrazów z całego hydrożelu, demonstrując lokalizację komórek w płaszczyznach X, Y i Z. Rycina 4D wykazuje immunostaining dla Β-tylko tubulina III; uwidaczniając drobniejsze wypustki neurytów wyrastające z skupisk ciał komórkowych. Aby dokładniej zbadać fenotyp neuronów glutaminergicznych, można przeprowadzić barwienie immunocytochemiczne z użyciem GluR2, markera jonowego receptora glutaminergicznego. W obrębie Rycina 4Eobszar 4E.1 (wstawka) została wyróżniona, aby ukazać wyższą rozdzielczość punktowego barwienia wzdłuż pęczków neurytów. Potwierdza to zatem, że neurony w tej kokulturze wykazują fenotyp glutaminergiczny. Na wszystkich obrazach z barwienia immunohistochemicznego wokół skupisk komórek i neurytów widoczne są immunofluorescencyjnie zabarwione struktury niekomórkowe. Prawdopodobnie struktury te stanowią resztki zatrzymane w hydrożelu w połączeniu z niewielką ilością nieswoistego wiązania przeciwciał z hydrożelem. Jest to zjawisko oczekiwane w kulturach biodrukowanych, ponieważ w modelach z rusztowaniem 3D martwe komórki i resztki nie są usuwane podczas dokarmiania komórek. Reprezentacyjny obraz negatywnej kontroli barwienia immunohistochemicznego przedstawiono w Rycina uzupełniająca 2 do demonstracji niespecyficznego wiązania przeciwciał wtórnych przez hydrożel.

Rycina 2: Neurony glutaminergiczne i astrocyty zostały wydrukowane biologicznie w macierzy hydrożelowej przy użyciu biodrukarki, a następnie obrazowane co 12 h za pomocą mikroskopu w polu jasnym. (A) Przykład obrazu w polu jasnym wykonanego z kultur komórkowych podczas analizy. Obraz przedstawia punkt czasowy 156 h, a pasek skali odpowiada 40 µm. (B) Średnia długość wypustek neurytowych (µm) z kultur, zmierzona przy użyciu pakietu NeuronJ dla programu ImageJ. Każdy punkt danych odpowiada n = 3 neurytom, a dane przedstawiono jako średnia ± SEM. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 3: Do biodrukowania modeli komórkowych wykorzystano stężenie 20 milionów komórek/mL roztworu aktywatora. (A) Żywotność komórek obliczono przy użyciu barwników do komórek żywych/martwych (odpowiednio Calcein-AM i etydium homodimer-1). Wartości wskazują, że w 4 dniu 72% ± 1% (średnia ± SEM, n = 3) całkowitej liczby komórek na studzienkę są żywe, a 29% ± 2% (średnia ± SEM, n = 3) całkowitej populacji komórek na studzienkę są martwe. Przedstawione wartości stanowią średnią ± SEM. (B>) Procentowy udział populacji neuronów i astrocytów na studzienkę obliczono poprzez analizę obrazu barwień przedstawionych na Rycini 4. Neurony stanowią odsetek komórek wykazujących pozytywne barwienie na Β-III tubulinę w 7 dniu (49% ± 3%, średnia ± SEM, n = 3), natomiast astrocyty stanowią odsetek komórek wykazujących pozytywne barwienie na GFAP w 7 dniu (30% ± 4%, średnia ± SEM, n = 3). Przedstawione wartości stanowią średnią ± SEM. Wszystkie obrazy wykorzystane do obliczeń przedstawionych na Rycini 3 zostały wykonane w systemie obrazowania konfokalnego, a wszystkie analizy przeprowadzono na platformie analizy obrazu oraz w programie GraphPad Prism zgodnie z opisanymi metodami. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 4: Ekspresja markerów typów komórek neuronalnych w biodrukowanych 3D kokulturach neuronów glutaminergicznych i astrocytów w 7. dniu. (A,B) Barwienie immunofluorescencyjne markeru neuronalnego Β-III tubuliny oraz markeru astrocytów GFAP, obrazowanie wykonane na platformie mikroskopu odwróconego przy powiększeniu 10x. Paski skali odpowiadają 10 µm. (C) Barwienie immunofluorescencyjne markeru neuronalnego β-III tubuliny i markeru astrocytów GFAP z jednoczesnym barwieniem Hoechst, widok w płaszczyźnie XYZ, obrazowanie wykonane w systemie konfokalnym przy powiększeniu 10x. Przygotowano na platformie analizy obrazów. Pasek skali odpowiada 10 µm. (D) Barwienie immunofluorescencyjne markeru neuronalnego β-III tubuliny z jednoczesnym barwieniem Hoechst, obrazowanie wykonane w systemie konfokalnym przy powiększeniu 20x. Pasek skali odpowiada 10 µm. (E) Barwienie immunofluorescencyjne markeru glutaminergicznego GluR2 z jednoczesnym barwieniem Hoechst, obrazowanie wykonane na platformie mikroskopu odwróconego przy powiększeniu 10x. Pole 3E.1 przedstawia powiększone obszary barwienia GluR2. Pasek skali odpowiada 10 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
Wideo uzupełniające 1: Neurony glutaminergiczne i astrocyty zostały wydrukowane biologicznie w macierzy hydrożelowej przy użyciu biodrukarki, a następnie obrazowano je co 12 h za pomocą mikroskopu w świetle przechodzącym. Nagranie obrazów z mikroskopu w świetle przechodzącym wykonanych kultur komórkowych podczas analizy; punkty czasowe są wskazane w prawym dolnym rogu, a paski skali reprezentują 40 µm. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Rycina uzupełniająca 1: Przykładowe obrazy analizy żywotności/śmierci biodrukowanych neuronów i astrocytów w 4. dniu. Barwienie kalceiną-AM przedstawione na zielono (48 nm) oraz barwienie etydinium homodimerem przedstawione na czerwono (647 nm). Obraz pokazano w rzucie płaszczyzny XYZ, utworzonym na platformie analizy obrazu. Pasek skali odpowiada 10 µm. (A) Obrazowanie wykonano przy użyciu konfokalnego systemu obrazowania przy powiększeniu 4x. (B) Obrazowanie wykonano przy użyciu konfokalnego systemu obrazowania przy powiększeniu 10x Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Rysunek uzupełniający 2: Przykład obrazu kontroli negatywnej po barwieniu immunofluorescencyjnym. Pominięto przeciwciała pierwotne, a zielone (48 nm) i czerwone (647 nm) przeciwciała wtórne zastosowano zgodnie z protokołami immunobarwienia. Obraz przedstawiono w widoku płaszczyzny XYZ, utworzonym na platformie do analizy obrazów. Pasek skali reprezentuje 10 µm. Obrazowanie wykonano przy użyciu systemu obrazowania konfokalnego przy powiększeniu 10x. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.