$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Analiza wzrostu neurytu
W tym protokole neurony glutaminergiczne i astrocyty pochodzące z iPSC zostały poddane biodrukarce w kokulturze do matrycy hydrożelowej za pomocą biodrukarki 3D. Przez pierwsze 7 dni po wydrukowaniu komórki były obrazowane co 12 godzin za pomocą mikroskopu żywych komórek. Po biodrukowaniu komórki powinny mieć zaokrągloną morfologię i powinny być rozproszone w matrycy hydrożelowej, stopniowo zmieniając się, tworząc mniejsze skupiska komórek z kilkoma wypukłościami w ciągu pierwszych kilku dni hodowli (patrz film uzupełniający 1 dla reprezentatywnego wzrostu zdrowych komórek). Do 4 dnia zdrowe komórki będą migrować w całym żelu, tworząc większe skupiska, które są połączone wyrostkami neurytów. Do 7 dnia prawie nie powinny pozostać żadne pojedyncze komórki, łączące się wiązki neurytów i projekcje astrocytarne powinny wydawać się wzmocnione, a z klastrów można zobaczyć wiele mniejszych wyrostków neurytów (Ryc. 2A). Korzystając z serii obrazów jasnego pola żywych komórek wykonanych w ciągu 7-dniowego okresu wzrostu, przeprowadzono analizę wzrostu neurytów, jak opisano w sekcji 3. Analiza ta wykazała, że wzrost neurytów wzrasta w sposób niemal liniowy (wartość R2 = 0,84) między 12 godzinami a 156 godzinami (Rysunek 2B). W tym okresie wyrastania neurytów skupiska komórek również zwiększają swój rozmiar (patrz Dodatkowe wideo 1), co wskazuje na migrację komórek w całym hydrożelu.
Żywotność komórek i stosunek populacji
W tym protokole stężenie 20 milionów komórek/ml, obejmujące 15 milionów neuronów/ml i 5 milionów astrocytów/ml, jest używane do biodruku modeli komórkowych. Używając barwienia żywych komórek kalceiną-AM (żywe komórki), homodimerem etydyny-1 (martwe komórki) i barwieniem jądrowym, liczbę komórek, które przeżyły w okresie 7 dni, można obliczyć zgodnie z sekcją 4 (Rysunek 3A). Wyniki żywotności komórek dla reprezentatywnych kultur przedstawiono dla dnia 4, gdzie 72% ± 1% (średnio ± SEM) wszystkich komórek jest żywych i wykazuje barwienie na obecność Calceiny-AM, podczas gdy 29% ± 2% (średnia ± SEM) wszystkich komórek jest martwych i wykazuje barwienie homodimerem etydyny-1 (Figura 3B). Reprezentatywne obrazy barwienia komórek za pomocą Calcein-AM i ethidium homodimer-1 można zobaczyć na rysunku uzupełniającym 1. Należy zauważyć, że wartości przeżycia komórek dla kultur 3D nie mogą być bezpośrednio porównywane z kulturami 2D, ponieważ martwe komórki są zatrzymywane w hydrożelu i nie zostaną usunięte podczas procesów odżywiania komórek.
Używając barwienia immunofluorescencyjnego dla tubuliny Β-III i GFAP, jak opisano w sekcji 5 i w Rysunek 4, można przeprowadzić analizę obrazu w celu określenia proporcji populacji komórek między neuronami a astrocytami (Rysunek 3A). Spośród wszystkich komórek na model w reprezentatywnych hodowlach, neurony Β-III tubuliny dodatnie stanowią 49% ± 3% (średnio ± SEM), podczas gdy astrocyty GFAP dodatnie stanowią 30% ± 4% (średnio ± SEM). Daje to stosunek 1:1,5 astrocytów do neuronów. Pozostawia to pozostałość 21% wszystkich komórek na model, które nie barwią się dla żadnego markera komórkowego. Ponieważ analiza żywotności komórek wykazała, że średnia wartość 29% komórek nie jest zdolna do życia w 4. dniu, jest prawdopodobne, że komórki te są martwe w hydrożelu.
Wyrażenie markerów komórkowych
Morfologię biodrukowanych neuronów i astrocytów oceniano za pomocą barwienia immunologicznego dla markera typu komórki neuronalnej (tubulina Β-III) i markera astrocytarnego (GFAP). W reprezentatywnych hodowlach pokazanych barwienie immunologiczne jest zlokalizowane w poszczególnych typach komórek, wykazując zdrową morfologię komórek, przy czym oba typy komórek wykazują wzrost wypukłości komórkowych (Rysunek 4A, B). Ponieważ struktury hydrożelu i komórki są trójwymiarowe, każdy obraz reprezentuje tylko jeden wycinek przez strukturę w Rysunek 4A,B. Rysunek 4C pokazuje połączony stos obrazów w całym hydrożelu, demonstrując widoki lokalizacji komórek w płaszczyznach X, Y i Z. Rysunek 4D pokazuje barwienie immunologiczne tylko dla tubuliny Β-III; podkreślając drobniejsze wyrostki neurytów z klastrów ciała komórki. W celu dalszego zbadania fenotypu neuronów glutaminergicznego można przeprowadzić barwienie immunologiczne markera receptora jonowego glutaminergicznego, GluR2. W obrębie Rysunek 4E, obszar 4E.1 (wstawka) został podświetlony, aby pokazać punktowe barwienie o wyższej rozdzielczości wzdłuż wiązek neurytów. Potwierdza to, że neurony w tej kokulturze mają fenotyp glutaminergiczny . Na wszystkich obrazach barwienia immunologicznego można zaobserwować immunofluorescencyjne barwione struktury niekomórkowe otaczające skupiska komórek i neuryty. Jest prawdopodobne, że struktury te reprezentują szczątki zatrzymane w hydrożelu w połączeniu z niewielkimi ilościami niespecyficznego przeciwciała wiążącego się z hydrożelem. Jest to oczekiwane w hodowlach drukowanych biologicznie, ponieważ w modelach rusztowań 3D martwe komórki i zanieczyszczenia nie są usuwane podczas odżywiania komórek. Reprezentatywny obraz barwienia immunologicznego kontroli ujemnej przedstawiono na rysunku uzupełniającym 2 w celu wykazania niespecyficznego wiązania przeciwciał drugorzędowych przez hydrożel.

Rysunek 2: Neurony glutaminergiczne i astrocyty zostały wdrukowane biodrukowane do matrycy hydrożelowej za pomocą biodrukarki i były obrazowane co 12 godzin za pomocą mikroskopu jasnego pola. (A) Przykładowy obraz kultur komórkowych w jasnym polu wykonany podczas analizy. Obraz przedstawia punkt czasowy 156 godzin, a podziałka skali reprezentuje 400 μm. (B) Średnia długość wyrostków neurytów (μm) z kultur mierzona przy użyciu pakietu NeuronJ dla ImageJ. Każdy punkt danych to n = 3 neuryty, a dane są wyświetlane jako średnia ± SEM. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Stężenie 20 milionów komórek/ml roztworu aktywatora zostało użyte do biodruku modeli komórek. (A) Żywotność komórek została obliczona przy użyciu barwników z żywych/martwych komórek (odpowiednio Calcein-AM i ethidium homodimer-1). Wartości pokazują, że 72% ± 1% (średnia ± SEM, n = 3) wszystkich komórek na studzienkę jest żywych, a 29% ± 2% (średnia ± SEM, n = 3) komórek jest martwych z całkowitej populacji komórek na studzienkę w dniu 4. Pokazane wartości reprezentują średnią ± SEM. (B) Procent populacji komórek w neuronach i astrocytach na studzienkę obliczono za pomocą analizy obrazu barwienia pokazanego na Rysunek 4. Neurony reprezentują odsetek komórek barwiących dodatnio na obecność tubuliny Β-III w dniu 7 (49% ± 3%, średnia ± SEM, n = 3), podczas gdy astrocyty reprezentują odsetek komórek barwiących dodatnio na GFAP w dniu 7 (30% ± 4%, średnia ± SEM, n = 3). Pokazane wartości reprezentują średnią ± SEM. Wszystkie obrazowania do obliczeń pokazanych w Rysunek 3 zostały wykonane na systemie obrazowania konfokalnego, a wszystkie analizy zostały przeprowadzone na platformie analizy obrazu i GraphPad Prism zgodnie z metodami. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Ekspresja markerów typu komórek nerwowych w biodrukowanych kokulturach 3D neuronów glutaminergicznym i astrocytów w dniu 7. (A,B) Barwienie immunofluorescencyjne markera neuronalnego Β-III tubuliny i markera astrocytów GFAP, zobrazowane na platformie mikroskopu odwróconego w 10-krotnym powiększeniu. Podziałka skali reprezentuje 100 μm. (C) Barwienie immunofluorescencyjne markera neuronalnego tubuliny β-III i markera astrocytów GFAP barwionych jednocześnie z Hoechstem, pokazane w widoku płaszczyzny XYZ, zobrazowane w systemie obrazowania konfokalnego przy 10-krotnym powiększeniu. Stworzony na platformie do analizy obrazu. Podziałka reprezentuje 100 μm. (D) Barwienie immunofluorescencyjne markera neuronalnego tubuliny β-III barwionej jednocześnie z Hoechstem, zobrazowane w systemie obrazowania konfokalnego przy 20-krotnym powiększeniu. Podziałka skali reprezentuje 100 μm. (E) Barwienie immunofluorescencyjne markera glutaminergicznego GluR2 barwionego jednocześnie z Hoechstem, zobrazowane na odwróconej platformie mikroskopowej przy 10-krotnym powiększeniu. W ramce 3E.1 pokazano podświetlone obszary barwienia GluR2. Podziałka skali reprezentuje 100 μm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
Dodatkowe wideo 1: Neurony glutaminergiczne i astrocyty zostały wydrukowane biologicznie na matrycy hydrożelowej za pomocą biodrukarki i były obrazowane co 12 godzin za pomocą mikroskopu jasnego pola. Film przedstawiający obrazy w jasnym polu wykonane na kulturach komórkowych podczas analizy, punkty czasowe są wskazane w prawym dolnym rogu, a paski skali reprezentują 400 μm. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Rysunek uzupełniający 1: Przykładowe obrazy analizy żywych/martwych neuronów i astrocytów w dniu 4. Barwienie Calcein-AM pokazane na zielono (488 nm), a barwienie homodimerem etydyny pokazane na czerwono (647 nm). Obraz jest wyświetlany w widoku płaszczyzny XYZ, utworzonej na platformie analizy obrazu. Podziałka odpowiada 100 μm. (A) Obrazowanie przeprowadzono przy użyciu konfokalnego systemu obrazowania przy 4-krotnym powiększeniu. (B) Obrazowanie zostało przeprowadzone przy użyciu systemu obrazowania konfokalnego przy 10-krotnym powiększeniu Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Rysunek uzupełniający 2: Przykład obrazu kontroli negatywnej po barwieniu immunofluorescencyjnym. Pominięto przeciwciała pierwszorzędowe, a zastosowano przeciwciała drugorzędowe zielone (488 nm) i czerwone (647 nm) zgodnie z protokołami barwienia immunologicznego. Obraz jest wyświetlany w widoku płaszczyzny XYZ, utworzonej na platformie analizy obrazu. Podziałka skali reprezentuje 100 μm. Obrazowanie przeprowadzono za pomocą systemu obrazowania konfokalnego przy 10-krotnym powiększeniu. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.