Ten protokół usprawnia produkcję wektorów retrowirusowych i transdukcję mysich limfocytów T, ułatwiając efektywne wytwarzanie mysich komórek CAR-T.
Artykuł metodologiczny
Ten protokół usprawnia produkcję wektorów retrowirusowych i transdukcję mysich limfocytów T, ułatwiając efektywne wytwarzanie mysich komórek CAR-T.
Terapie komórkowe wykorzystujące chimeryczne receptory antygenowe (CAR)-T osiągnęły niezwykłą skuteczność u osób z nowotworami hematologicznymi i są obecnie opracowywane pod kątem leczenia różnych guzów litych. Do tej pory wstępna ocena nowych produktów komórkowych CAR-T odbywała się głównie w modelach guzów ksenoprzeszczepów z wykorzystaniem myszy z niedoborem odporności. Podejście to zostało wybrane w celu ułatwienia pomyślnego wszczepienia ludzkich komórek CAR-T w warunkach eksperymentalnych. Jednak syngeniczne modele myszy, w których nowotwory i komórki CAR-T pochodzą z tego samego szczepu myszy, umożliwiają ocenę nowych technologii CAR w kontekście funkcjonalnego układu odpornościowego i kompleksowego mikrośrodowiska guza (TME). Opisany tutaj protokół ma na celu usprawnienie procesu generowania mysich komórek CAR-T poprzez przedstawienie znormalizowanych metod transdukcji retrowirusowej i hodowli komórek T ex vivo. Metody opisane w niniejszym protokole mogą być stosowane do innych konstruktów CAR poza tymi wykorzystanymi w tym badaniu, aby umożliwić rutynową ocenę nowych technologii CAR w systemach kompetentnych immunologicznie.
Adoptywne terapie limfocytami T wyrażające chimeryczne receptory antygenowe (CAR) zrewolucjonizowały dziedzinę immunoterapii nowotworów, wykorzystując moc adaptacyjnego układu odpornościowego do specyficznego celowania i eliminowania antygenowo-dodatnich komórek nowotworowych1. Chociaż skuteczność terapii komórkowych CAR-T ukierunkowanych na nowotwory złośliwe z komórek B została potwierdzona klinicznie, badania przedkliniczne przeprowadzone na modelach zwierzęcych nadal mają kluczowe znaczenie dla opracowania nowych CAR ukierunkowanych na guzy lite. Jednak do tej pory wykazano ograniczoną skuteczność kliniczną we wskazaniach do guzów litych i staje się coraz bardziej oczywiste, że poszczególne modele przedkliniczne nie przewidują dokładnie farmakodynamiki i skuteczności klinicznej żywego leku2,3. W związku z tym badacze zaczęli rozszerzać badanie przedkliniczne produktów komórkowych CAR-T o równoległe oceny w modelach ksenoprzeszczepowych i syngenetycznych odpowiednio raka ludzkiego i mysiego.
W przeciwieństwie do modeli ksenoprzeszczepów, gdzie ludzkie nowotwory i limfocyty T są wszczepiane myszom z niedoborem odporności, modele syngeniczne umożliwiają badanie odpowiedzi komórek CAR-T w kontekście funkcjonalnego układu odpornościowego. W szczególności myszy immunokompetentne z guzami syngenicznymi zapewniają system do badania interakcji między adoptywnie przeniesionymi limfocytami T a środowiskami specyficznymi dla kontekstu - w tym makrofagami związanymi z nowotworem (TAM) i regulatorowymi limfocytami T (Treg), o których wiadomo, że hamują funkcję limfocytów T w mikrośrodowisku guza (TME)4,5,6. Co więcej, modele syngeniczne oferują dodatkową platformę do oceny toksyczności na miejscu, poza guzem i interakcji komórek CAR-T z czynnikami gospodarza, które mogą prowadzić do dodatkowych toksyczności, w tym zespołu uwalniania cytokin7.
Pomimo tych zalet, liczba badań nad syngenicznymi komórkami CAR-T pozostaje ograniczona. Warto zauważyć, że modele syngeniczne wymagają autologicznej inżynierii komórek CAR-T z tego samego szczepu myszy, a tym samym stanowią dodatkowe wyzwanie ze względu na brak metodologii wydajnej transdukcji mysich limfocytów T i ekspansji ex vivo2,8. Protokół ten przedstawia metody osiągania stabilnej ekspresji CAR poprzez produkcję wektorów retrowirusowych i zoptymalizowaną transdukcję limfocytów T. Schemat całego procesu przedstawiono na rysunku 1. Zastosowanie tego podejścia pozwala na zademonstrowanie skutecznej transdukcji retrowirusowej mysich komórek CAR-T i osiągnięcie wysokiej ekspresji CAR bez konieczności koncentracji wirusa poprzez ultrawirowanie. Omówiono strategie zmiany swoistości antygenowej konstruktu CAR oprócz koekspresji dodatkowych transgenów.
Wszystkie procedury na zwierzętach zostały przeprowadzone za zgodą Institutional Animal Care and Use Committee (Columbia University, protokoły AC-AABQ5551 i AC-AAAZ4470) przy użyciu 6-8-tygodniowych samic myszy BALB/c lub CF57BL/6 o wadze od 20 do 25 g. Zwierzęta zostały pozyskane ze źródła komercyjnego (patrz tabela materiałów). Protokół ten opiera się na "dniach po aktywacji" mysich limfocytów T, a produkcja wirusa rozpoczyna się w dniu -2. Retrowirus może być przechowywany w temperaturze -80 °C po początkowej produkcji, a w celu wykorzystania tego protokołu w przyszłości można rozpocząć od etapu 2, izolacji i aktywacji limfocytów T w dniu 0.
1. Produkcja wektorów retrowirusowych
UWAGA: Produkty wirusa stały się wadliwe pod względem replikacji poprzez rozdzielenie genów pakujących na dwa oddzielne plazmidy (patrz Tabela Materiałów), co znacznie zmniejsza prawdopodobieństwo wystąpienia zdarzeń rekombinacji i niezamierzonej produkcji wirusa kompetentnego do replikacji.
2. Izolacja mysich limfocytów T
3. Transdukcja mysich limfocytów T
Protokół opisany w niniejszym opracowaniu ma na celu standaryzację procesu transdukcji limfocytów T myszy w celu generowania mysich komórek CAR-T. Rysunek 1 przedstawia szczegółowy opis poszczególnych etapów. Proces rozpoczyna się od produkcji wektorów retrowirusowych via kotransfekcji komponentów wirusowych do komórek Phoenix Eco. Rysunek 2 przedstawia obraz optymalnej gęstości komórek Phoenix Eco w dniu transfekcji. Izolowane limfocyty T są następnie aktywowane 24 h po transfekcji, co stanowi „Dzień 0” niniejszego protokołu, w ramach przygotowania do transdukcji w Dniu 1. Po transdukcji komórki CAR-T są hodowane w obecności rekombinowanej ludzkiej IL-7 i IL-15, aby uzyskać odpowiedni stopień ekspansji przy jednoczesnym zachowaniu populacji komórek pamięci macierzystej.
Zastosowanie zalecanego zestawu do izolacji limfocytów T mysich (patrz Tabela materiałów) zgodnie z niniejszym protokołem pozwala na uzyskanie czystości limfocytów T <98% przed transdukcją, co potwierdzono za pomocą cytometrii przepływowej (Rysunek 3A). Ponadto, stosując ten protokół oraz wektor retrowiralny pMSCV zmodyfikowany w celu ekspresji konstruktu CAR z promotora PGK, można osiągnąć powtarzalne poziomy ekspresji CAR wynoszące 65%-75% (Rysunek 3B,C). Wyznaczenie miana retrowirusa wykazało wartości mian do ~2 x 107 TU/mL oraz 74% ekspresji CAR przy użyciu 1/3rd zebranego supernatantu wirusowego po kotransfekcji pMSCV z pCL-Eco (Rysunek uzupełniający 1).
Ostatecznie, hodowla ex vivo z dodatkiem 10 ng/mL IL-7 i IL-15 prowadzi do około 15-krotnej ekspansji, w wyniku czego w 10. dniu po aktywacji z jednej śledziony uzyskuje się ~150 x 106 limfocytów T (Rysunek 3D). Hodowla z IL-7 i IL-15 prowadzi do uzyskania porównywalnych częstotliwości limfocytów T CD8+ i CD4+ (Rysunek 3E) oraz zachowania populacji komórek pamięci macierzystych, określonych przez ekspresję CD62L+CD44- po 10 dniach hodowli ex vivo (Rysunek 3F).

Rycina 1: Przegląd protokołu. Górny panel: Schematyczny przegląd harmonogramu protokołu. Dolny panel: Instrukcje krok po kroku dotyczące produkcji wektora retrowirusowego i transdukcji limfocytów T myszy. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 2: Optymalna gęstość komórek do transfekcji. Obraz z mikroskopii w świetle przechodzącym komórek Phoenix Eco o optymalnej gęstości przed transfekcją pMSCV i pCL-Eco. Obraz wykonany przy użyciu obiektywu 10x. Pasek skali = 200 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 3: Produkcja mysich komórek CAR-T i hodowla ex vivo. (A) Wykres cytometrii przepływowej przedstawiający częstotliwość występowania komórek BALB/c CD3+ po izolacji mysich limfocytów T. (B) Schematyczny opis wektora retrowirusowego pMSCV użytego do ekspresji GFP-CAR w mysich limfocytach T. (C) Histogramy cytometrii przepływowej demonstrujące ekspresję CAR na powierzchni mysich limfocytów T po inkubacji z oczyszczonym sfGFP. UT, nieprzetransdukowane. (D) Krotność ekspansji komórek CAR-T w 10. dniu po aktywacji i hodowli z rekombinowaną ludzką IL-17 i IL-15. Przed transdukcją aktywowano około 8 x 106 mysich limfocytów T, a w 10. dniu po aktywacji ich liczba osiągnęła około 1,28 x 108. (E) Wykres cytometrii przepływowej przedstawiający częstotliwość występowania komórek CAR-T CD8+ i CD4+ w 10. dniu po aktywacji. (F) Wykres cytometrii przepływowej demonstrujący częstotliwość populacji pamięciowych limfocytów T CD8+ określonych na podstawie ekspresji powierzchniowej CD62L i CD44. Pamięć macierzysta (TSCM) charakteryzuje się fenotypem CD62L+CD44-, pamięć centralna (TCM) fenotypem CD62L+CD44+, a pamięć efektorowa (TEM) fenotypem CD62L-CD44+. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
Tabela 1: Skład pożywek do hodowli komórkowych. Szczegóły dotyczące składu pożywek do hodowli komórkowych wykorzystanych w protokole. Kliknij tutaj, aby pobrać tę tabelę.
Rysunek uzupełniający 1: Ekspresja powierzchniowa CAR i miana retrowirusów. (A) Histogramy z cytometrii przepływowej pokazujące ekspresję powierzchniową CAR na limfocytach T myszy BALB/c po inkubacji z oczyszczonym sfGFP. Retrowirus został wygenerowany poprzez transfekcję komórek Phoenix Eco plazmidem pMSCV_PGK_mGFP28z w połączeniu z pCL-Eco i pMD2.G (I), pCL-Eco (II) lub samym plazmidem pMSCV_PGK_mGFP28z (III). Limfocyty T zostały transdukowane rozcieńczonym retrowirusem zgodnie z oznaczeniami. (B) Miana retrowirusów określone na podstawie ekspresji powierzchniowej CAR w transdukowanych limfocytach T. Jednostki transdukcyjne (TU)/mL obliczono według wzoru: (N∙F∙D)/V, gdzie N to liczba transdukowanych komórek (1 x 105), F to częstotliwość występowania komórek CAR+, D to czynnik rozcieńczenia, a V to objętość transdukcji w mL (0.2 mL). Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 1: sekwencja wektora ekspresyjnego pMSCV. Sekwencja CAR GFP28z oraz sekwencje flankujące (kursywa) w wektorze ekspresyjnym pMSCV, z zaznaczonymi na niebiesko miejscami cięcia enzymów NotI i BamHI. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Protokół ten opisuje etapy i odczynniki niezbędne do transdukcji retrowirusowej mysich limfocytów T w celu wytworzenia komórek CAR-T do badań in vivo . Optymalizacja warunków transdukcji retrowirusowej pozwala na uzyskanie silnej ekspresji CAR bez konieczności zagęszczania wirusa poprzez ultrawirowanie lub dodatkowe odczynniki. Istnieje jednak wiele modyfikacji, które można zastosować do tej metodologii.
Chociaż protokół ten opisuje przykładową generację CAR specyficznego dla GFP, metody te można dostosować do generowania mysich komórek CAR-T ukierunkowanych na dowolny antygen zewnątrzkomórkowy będący przedmiotem zainteresowania. pMSCV_PGK wektor retrowirusowy zastosowany w tym badaniu pozwala na skuteczne uwalnianie specyficznej dla GFP sekwencji nanowirusowej poprzez trawienie enzymatyczne z NotI i BamHI i może być zastąpiony zdefiniowaną przez użytkownika domeną rozpoznawania antygenu, taką jak scFv, nanociało lub domena wiążąca ligand (plik uzupełniający 1). Aby ułatwić ocenę alternatywnej ekspresji CAR, zaleca się projektowanie CAR z N-końcowym znacznikiem epitopowym, takim jak znaczniki Myc (EQKLISEEDL) lub Flag (DYKDDDDK), które można wykryć za pomocą fluorescencyjnie sprzężonych przeciwciał12. Co więcej, obecne badanie wykazało produkcję pojedynczego transgenu; jednak włączenie peptydów samorozszczepiających (sekwencji 2A) lub wewnętrznych miejsc wejścia rybosomów (IRES) umożliwiłoby współprodukcję wielu transgenów, w tym dodatkowe technologie poprawiające funkcję komórek T in vivo 8,13,14.
Chociaż protokół ten został opracowany w celu wyeliminowania potrzeby stosowania specjalistycznego sprzętu poprzez pominięcie ultrawirowania (24 000 x g, 2 h, 4 °C), warto zauważyć, że stężenie supernatantu wirusa może osiągnąć wyższe miana wirusa i zmniejszyć objętość wirusa wymaganą do osiągnięcia wysokiej ekspresji CAR8. Protokół ten dodatkowo usprawnia produkcję wektorów retrowirusowych, osiągając powtarzalnie wysokie miana wirusa (~2 x 10,7 TU/ml) i stałą ekspresję CAR bez konieczności oznaczania miana wirusa przed użyciem. Jednak oprócz ułatwienia standaryzacji, określenie miana wirusa przed transdukcją limfocytów T może również zwiększyć żywotność limfocytów T poprzez zmniejszenie potencjalnej toksyczności spowodowanej niepotrzebnie wysokimi stężeniami wirusa10,15.
Suplementacja IL-7 i IL-15 jest zalecana w celu promowania ekspansji komórek T i zachowania populacji pamięci komórek T; jednak rekombinowana ludzka IL-2 może być stosowana jako alternatywa w celu zmniejszenia liczby niezbędnych odczynników do hodowli ex vivo 16,17,18,19. Niemniej jednak przedstawione tutaj metody generowania komórek CAR-T pozostają ograniczone przez stosunkowo słabą ekspansję mysich limfocytów T. Jednak omówione powyżej środki mające na celu poprawę żywotności limfocytów T można jeszcze bardziej wzmocnić poprzez włączenie dodatkowych suplementów i 2-ME do pożywki hodowlanej mTCM w całym procesie transdukcji20. Chociaż modyfikacje te mogą poprawić ekspansję limfocytów T od 15-krotnej do nawet20-krotnej 20, mogą skutkować niższą wydajnością transdukcji i zmniejszoną ekspresją CAR.
Ostatecznie, produkcja mysich komórek CAR-T umożliwia opracowanie modeli syngenicznych do oceny funkcji komórek CAR-T w nienaruszonym układzie odpornościowym, ułatwiając kontekstową ocenę ich siły, trwałości i bezpieczeństwa. Natomiast modele u myszy z niedoborem odporności pozwalają na ważne badania przedkliniczne produktu z ludzkich limfocytów T ukierunkowanego na ludzki antygen nowotworowy. Połączenie tych uzupełniających się systemów modelowych będzie niezbędne do zrozumienia złożoności biologii komórek CAR-T, optymalizacji nowych projektów CAR i ostatecznie przełożenia wyników przedklinicznych na skuteczne terapie kliniczne.
Nie stwierdzono konfliktu interesów.
Dziękujemy L. Brockmannowi za krytyczną recenzję manuskryptu. Prace te były wspierane przez NIH 1R01EB030352 i UL1 TR001873.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 0,45 μ m filtry | MilliporeSigma | SLHVR33RS | |
| strzykawka 1 ml | Fisher Naukowy | 14-955-450 | |
| Probówki do mikrowirówek 1,5 ml | Fisher Naukowy | 05-408-135 | |
| Strzykawka 10 ml | BD | 14-823-16E | |
| 100 μ m sitko | Corning | 07-201-432 | |
| 15 cm Naczynia do hodowli komórkowych poddane działaniu TC | ThermoFisher Scientific | ||
| Probówki stożkowe 15 ml | Sokół | 14-959-70C | |
| 40 μ m sitko | Corning | 07-201-430 | |
| Probówki stożkowe 50 ml | Sokół | 14-959-49A | |
| 70 μ m filtr siatkowy | Corning | 07-201-431 | |
| Cytometr przepływowy Attune NxT | ThermoFisher Naukowy | ||
| BALB/C, 6-8 tygodni | Jackson Laboratory | 651 | |
| B-merkaptoetanol | Gibco | 21985023 | |
| Albumina surowicy bydlęcej | GOLDBIO | A-420-500 | |
| DMEM Medium | Gibco | 11965092 | |
| Sól fizjologiczna buforowana fosforanem (PBS) firmy Dulbecco, bez wapnia i magnezu | Gibco | 14-190-250 | |
| Magnes DynaMag-2 | Magnes Invitrogen | 12-321-D | |
| EasySep | Stemcell Technologies | 18000 | |
| Zestaw do izolacji mysich komórek T EasySep | Stemcell Technologies | 19851 | |
| Bufor FACS | BD | BDB554657 | |
| Surowica bydlęca płodu (FBS) | Corning | MT35011CV | |
| GlutaMAX | Gibco | 35-050-061 | |
| G-Rex6 | Wilson Wolf | 80240M | |
| Roztwór buforowy HEPES | Gibco | 15-630-080 | |
| Ludzka rekombinowana IL-15 | Miltenyi Biotec | 130-095-765 | |
| Ludzki rekombinant IL-2 | Miltenyi Biotec | 130-097-748 | |
| Ludzki rekombinowany IL-7 | Miltenyi Biotec | 130-095-363 | |
| Lipofektamina 3000 | Invitrogen | L3000008 | |
| MEM Roztwór aminokwasów endogennych | Gibco | 11140-050 | |
| Mysz Anty-CD3 BV421 | Biolegend | 100228 | |
| Mysz Anty-CD3/CD28 Dynabeads | Mysz Gibco | 11-453-D | |
| Anty-CD4 BV605 | BD | 563151 | |
| Mysz Anty-CD44 APC | Mysz Biolegend | 103011 | |
| Anti-CD62L PE-Cy7 | Tonbo | SKU 60-0621-U025 | |
| Mysz Anti-CD8 APC-Cy7 | Tonbo | SKU 25-0081-U025 | |
| Nikon Ti2 z aparatem Prime 95B | Nikon | ||
| Nieobrobione płytki 24-dołkowe | CytoOne | CC7672-7524 | |
| Opti-MEM | Gibco | 31-985-062 | |
| pCL-Eco | Addgene | #12371 | |
| Roztwór penicyliny/streptomycyny | Gibco | 15-070-063 | |
| Komórki Phoenix Eco | ATCC | CRL-3214 | |
| pMDG.2 | Addgene | #12259 | |
| pMSCV_PGK_GFP28z | Nie dotyczy | Wyprodukowany przez R.LV. | |
| Oczyszczony sfGFP | N/A | Produkowany przez R.LV. | |
| Retronektyna ("odczynnik do transdukcji") | Takara Bio | T100B | |
| RPMI 1640 | Gibco | 21875 | |
| Pipeta serologiczna 10 ml | Fisher Scientific | 13-678-11E | |
| Pipeta serologiczna 25 ml | Fisher Scientific | 13-678-11 | |
| Pipeta serologiczna 5 ml | Fisher Scientific | 13-678-11D | |
| Pirogronian sodu | Gibco | 11-360-070 | |
| Płytki 24-dołkowe poddane działaniu TC | Corning | 08-772-1 | |
| Błękit trypanowy | Gibco | 15-250-061 |