Stosując opisaną metodologię, uzyskuje się różne pliki wynikowe. Plik DLTdv7.m *_xyzpts.csv (Supplemental File 12) zawiera współrzędne (x, y, z) w milimetrach każdego śledzonego punktu w każdej klatce czasowej, które są następnie wykorzystywane do obliczenia długości, zmiany długości i odkształcenia rozciągniętego PN. Reprezentatywne wykresy zależności długości od czasu, zmiany długości od czasu oraz odkształcenia od czasu dla rozciągniętego PN przedstawiono na Rycini 10. Rozciągnięty PN posiadał marker insercyjny, cztery markery wzdłuż jego długości oraz marker zacisku składający się z sześciu segmentów. Poprzez ilościowe określenie całkowitego i segmentowego odkształcenia rozciągniętego PN uzyskano lepsze zrozumienie niejednorodności tych struktur, a także wkładu poszczególnych segmentów w całkowite rozciągnięcie. Wykresy zależności długości od czasu (Rycina 10A) oraz zmiany długości od czasu (Rycina 10B) służą do obliczenia wykresów zależności odkształcenia od czasu (Rycina 10C). Oprócz wykresów eksportowany jest arkusz kalkulacyjny (Supplemental File 17) z danymi z wykresów (tj. czasem, długością, zmianą długości i odkształceniem).

Rysunek 10: Reprezentatywne wykresy odkształcenia w czasie, zmiany długości w czasie oraz długości w czasie rozciągniętego nerwu obwodowego. (A) Wykresy długości w czasie dla całego nerwu (tj. segment 1) oraz dla wszystkich segmentów pomiędzy sąsiednimi znacznikami (tj. segmenty 2-6). (B) Wykresy zmiany długości w czasie dla całego nerwu (tj. segment 1) oraz dla wszystkich segmentów pomiędzy sąsiednimi znacznikami (tj. segmenty 2-6). (C) Wykresy odkształcenia w czasie dla całego nerwu (tj. segment 1) oraz dla wszystkich segmentów pomiędzy sąsiednimi znacznikami (tj. segmenty 2-6). Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tego rysunku.
Pozostałe trzy pliki wyjściowe DLTdv7.m (Plik uzupełniający 11, Plik uzupełniający 13 oraz Plik uzupełniający 14) oraz projekt wyjściowy (Plik uzupełniający 15) służą do ponownego załadowania projektu w przypadku konieczności ponownego śledzenia trajektorii punktów markerów.
Rycina dodatkowa S1: Obraz wyjściowy trójwymiarowej (3D) bryły kontrolnej. Obraz wyjściowy 3D bryły kontrolnej wykonany przy użyciu systemu równoległych kamer obrazowania stereoskopowego oraz systemu oprogramowania obrazującego do kalibracji bezpośredniej transformacji liniowej. Proszę kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Rycina dodatkowa S2: Lewy obraz trójwymiarowej (3D) bryły kontrolnej. Lewy obraz bryły kontrolnej 3D wykorzystanej do kalibracji bezpośredniej transformacji liniowej. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Rycina uzupełniająca S3: Prawy obraz trójwymiarowej (3D) objętości kontrolnej.Prawy obraz 3D objętości kontrolnej wykorzystywanej do kalibracji bezpośredniej transformacji liniowej. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Rycina uzupełniająca S4: Wykresy zależności długości od czasu. (A-F) Wykresy zależności długości od czasu dla każdego segmentu w poszczególnych ramach czasowych. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Rycina dodatkowa S5: Wykresy zmian długości w czasie.(A-F) Wykresy zmian długości w czasie dla każdego segmentu w poszczególnych ramach czasowych. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Rycina uzupełniająca S6: Wykresy zależności odkształcenia od czasu. (A-F) Wykresy zależności długości od czasu dla każdego segmentu w każdej ramce czasowej. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 1: Własny kod MATLAB crop_left_right_stereoimage.m. Własny kod MATLAB użyty do rozdzielenia obrazu wyjściowego na dwa obrazy: odpowiednio lewy i prawy. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 2: DLTcal5.m22. Kod MATLAB o otwartym kodzie źródłowym, wykorzystany do wyznaczenia współczynników bezpośredniej transformacji liniowej dla równoległego systemu kamer stereo. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 3: Zdigitalizowane punkty trójwymiarowej (3D) objętości kontrolnej.Arkusz kalkulacyjny (3D Control Volume_Digitized Pts.csv) zawierający zdigitalizowane punkty (x, y, z) w milimetrach dla punktów na trójwymiarowej objętości kontrolnej. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 4: plik arkusza kalkulacyjnego z wynikami DLTcal5.m zawierający współrzędne pikselowe (x, y) punktów trójwymiarowej (3D) objętości kontrolnej.Plik arkusza kalkulacyjnego z wynikami (cal01_JOVE_test_xypts.csv) zawierający współrzędne pikselowe (x, y) punktów 3D objętości kontrolnej wyznaczone za pomocą DLTcal5.m22. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 5: Plik arkusza kalkulacyjnego z wynikami DLTcal5.m zawierający 11 współczynników bezpośredniej transformacji liniowej (DLT).Plik arkusza kalkulacyjnego z wynikami (cal01_JOVE_test_DLTcoefs.csv) zawierający 11 współczynników DLT dla widoków lewej i prawej kamery systemu obrazowania stereoskopowego z wykorzystaniem DLTcal5.m22. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 6: Własny kod MATLAB crop_left_right_stereovideo.m. Własny kod MATLAB służący do rozdzielenia wyjściowego pliku wideo na dwa pliki wideo, odpowiednio z kamery lewej i prawej. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 7: Plik wideo z obrazem rozciągniętego nerwu obwodowego.Plik wideo (nerve3_105-Nov-2021video.avi) przedstawiający rozciągnięty nerw obwodowy, zawierający połączone nagrania z widoku lewej i prawej kamery. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 8: Plik wideo z widoku lewej kamery (tj. Wideo 1) rozciągniętego nerwu obwodowego.Plik wideo z widoku lewej kamery (nerve3_105-Nov-2021video_left.avi) rozciągniętego nerwu obwodowego, wykorzystany do śledzenia trajektorii punktów markerowych przy użyciu DLTdv7.m22. Aby pobrać ten plik, kliknij tutaj.
Plik uzupełniający 9: Plik wideo z widoku prawej kamery (tj. Wideo 2) rozciągniętego nerwu obwodowego.Plik wideo z widoku prawej kamery (nerve3_105-Nov-2021video_right.avi) rozciągniętego nerwu obwodowego, wykorzystany do śledzenia trajektorii punktów znacznikowych przy użyciu DLTdv.7.m22. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 10: DLTdv7.m22. Kod MATLAB o otwartym kodzie źródłowym wykorzystany do śledzenia trajektorii punktów znacznikowych w plikach wideo uzyskanych z systemu kamer stereoskopowych skalibrowanego za pomocą bezpośredniej transformacji liniowej. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 11: Plik wyjściowy *_xypts.csv z programu DLTdv7.m. Pierwszy plik wyjściowy DLTdv7.m, *_xypts.csv (nerve3_105-Nov-2021videoanalyzed_cal09.30_trial1_xypts.csv), zawiera współrzędne pikselowe (x1, y1), (x2, y2) itd. dla każdego śledzonego punktu w każdej klatce czasowej. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 12: plik wyjściowy DLTdv7.m *_xyzpts.csv. Drugi plik wyjściowy DLTdv7.m to *_xyzpts.csv (nerve3_105-Nov-2021videoanalyzed_cal09.30_trial1_xyzpts.csv), który zawiera współrzędne rzeczywiste w milimetrach (x1, y1, z1), (x2, y2, z2) itd. dla każdego śledzonego punktu w każdej klatce czasowej. Aby pobrać ten plik, kliknij tutaj.
Plik uzupełniający 13: plik wyjściowy DLTdv7.m *_xyzres.csv.Trzeci plik wyjściowy z programu DLTdv7.m to *_xyzres.csv (nerve3_105-Nov-2021videoanalyzed_cal09.30_trial1_xyzres.csv), który zawiera reszty DLT dla każdego śledzonego punktu w każdej klatce czasowej. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 14: plik wyjściowy DLTdv7.m *_offset.csv. Pierwszy plik wyjściowy z programu DLTdv7.m to *_offset.csv (nerve3_105-Nov-2021videoanalyzed_cal09.30_trial1_offsets.csv), który zawiera przesunięcia (offset) dla wideo 1 i wideo 2 dla każdego śledzonego punktu w każdej klatce czasowej. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 15: Plik wyjściowy projektu DLTdv7.m *_dvProject.mat. Plik wyjściowy projektu DLTdv7.m (nerve3_105-Nov-2021videoanalyzed_cal09.30_trial1_dvProject.mat) zawiera ścieżki do plików wideo, wszystkie ustawienia interfejsu, trajektorie wszystkich klikniętych punktów znaczników oraz informacje o kalibracji, co umożliwia łatwe ponowne załadowanie projektu w celu wprowadzenia zmian, jeśli okaże się to konieczne. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 16: Niestandardowy kod MATLAB PercentStrain_3D.m. Niestandardowy kod MATLAB użyty do obliczenia długości, zmiany długości i procentowego odkształcenia rozciągniętego nerwu pomiędzy sąsiadującymi markerami w każdym punkcie czasowym. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 17: plik wyjściowy *_3Dstrain.xls z programu PrecentStrain_3D.m.Plik wyjściowy *_3Dstrain.xls (nerve3_105-Nov-2021_3Dstrain.xls), który zawiera czas, długość, zmianę długości oraz odkształcenie każdego śledzonego punktu w każdej klatce czasowej. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.