Proces przygotowywania skrawków tkanki płuc obejmuje kilka kluczowych etapów, w tym przygotowanie, zatopienie w medium i sekcjonowanie. Roztwór agarozy (3% (w/v)) przygotowuje się poprzez rozpuszczenie 1,5 g agarozy niskotopliwej w 50 mL sterylnego PBS. Niezbędne materiały eksploatacyjne to plastikowy kubek, nakrętka od probówki stożkowej 50 mL (z usuniętym rantem), pinceta i nożyczki. Tkanka płucna jest ostrożnie wycinana w mniejsze bloki za pomocą precyzyjnej pincety i sterylnych nożyczek (Rycina 1A,B). Następnie, aby zatopić bloki tkanki płucnej, dno kubka wypełnia się niewielką ilością agarozy, na powierzchni agarozy kładzie się nakrętkę, a kubek przechowuje w temperaturze 4 °C przez 5 min (Rycina 1C). Na nakrętkę dodaje się około 1 mL płynnej agarozy, a następnie na nakrętce umieszcza się blok tkanki płucnej. Agarozę pozostawia się na 2-3 min w temperaturze pokojowej do częściowego zestalenia (Rycina 1D). Gdy blok płuca zostanie unieruchomiony przez częściowo zestaloną agarozę, do kubka wlewa się płynną agarozę, aż blok tkanki płucnej zostanie całkowicie zanurzony. całość przechowuje się w temperaturze 4 °C przez 15 min (Rycina 1E,F). Zatopienie w agarozie niskotopliwej zapewnia tkance płucnej niezbędne wsparcie i sztywność, co pomaga zachować jej pierwotną architekturę podczas procesu krojenia. Do usunięcia nadmiaru agarozy otaczającej tkankę płucną używa się ostrego ostrza. Wokół tkanki pozostawia się jednolitą warstwę o grubości około 5 mm (Rycina 1G). Wycięty blok tkanki płucnej jest następnie ostrożnie przyklejany do uchwytu na tkankę (Rycina 1H). Tackę z buforem w wibratomie wypełnia się PBS, w otaczającej kąpieli lodowej umieszcza się lód, a w tackach z buforem instaluje się dysk z preparatem (Rycina 1I). Parametry cięcia ustawione na panelu wibratomu wynosiły: grubość skrawka: 200 µm; częstotliwość: 100 Hz; amplituda ostrza: 1,3 mm; prędkość posuwu ostrza: 0,02-0,03 mm/s, zależnie od sztywności tkanki (Rycina 1J). Na koniec przeprowadza się barwienie wolno pływających skrawków (Rycina 1K-M).
Barwienie immunofluorescencyjne przeprowadzono w 200 µm przekroje z każdego gatunku w celu wykazania aktyny mięśni gładkich (SMA, marker komórek mięśni gładkich i myofibroblastów), elastyny (białka macierzy zewnątrzkomórkowej) oraz lektyny z *Lycopersicon Esculentum* (LEA), która wiąże się z komórkami nabłonka oskrzelowo-pęcherzykowego. Płuco jest tkanką strukturalnie heterogenną, w związku z czym w strukturach takich jak przewody pęcherzykowe, naczynia krwionośne, oskrzeliki wewnątrzprzepłucne i pęcherzyki płucne u myszy, świń i ludzi obserwuje się zróżnicowany rozkład SMA i elastyny (Rysunek 2A-L). Renderowanie w wysokiej rozdzielczości 20 µm objętość oskrzeliki pokazuje, w jaki sposób można badać drobne struktury w płucach na poziomie półtrójwymiarowym (Film uzupełniający S1). Jako przykład ilościowy, wykorzystując obrysowywanie obrazów, pokazujemy, jak różni się wielkość pęcherzyków płucnych między próbkami (n = 20 pęcherzyków) (Rysunek 2L,M).
Aby wykazać, w jaki sposób można ilościowo wykorzystać te zaawansowane dane obrazowe, porównaliśmy rozkład pneumocytów typu II (TII) w tkance płuca człowieka dorosłego oraz niemowlęcia. Przeciwciało specyficzne dla ludzkich pęcherzykowych komórek typu 2, HTII-280, wykazuje silne powinowactwo do powierzchni ludzkich komórek typu 2 (Rycyna 3A-F). Komórki te można dodatkowo obserwować w przestrzeni trójwymiarowej pojedynczego pęcherzyka powietrznego, wykorzystując obrazowanie wolumetryczne (Film uzupełniający S2). Aby określić ilościowo liczbę komórek TII w próbkach od dorosłego i niemowlęcia, przeanalizowaliśmy liczbę komórek HTII-280 w 10 losowych polach widzenia (fov). W porównaniu tych próbek, w próbce od niemowlęcia odnotowano znacznie większą liczbę komórek TII (Rycina 3G). Jednak próbka od niemowlęcia wykazała również znacznie większy stopień pokrycia rusztowania niż próbka od osoby dorosłej, co mogłoby wyjaśniać wyższą liczbę komórek (Rycina 3H). Aby to uwzględnić, oceniliśmy liczbę komórek TII w oparciu o pokrycie rusztowania, jako liczbę komórek na mm2 tkanki, co nadal wykazało istotnie większą liczbę komórek TII w próbce od niemowlęcia (Rycina 3I). Zatem większa liczba komórek TII w próbce od niemowlęcia nie wynika ze zwiększonego pokrycia rusztowania, co podkreśla znaczenie oceny rozkładu komórek w płucach w oparciu o powierzchnię rusztowania, a nie o całkowite pole widzenia (fov).

Rycina 1: Protokół wycinania skrawków tkanki płucnej. (A) Roztwory i materiały: 3% (w/v) roztwór agarozy otrzymany przez rozpuszczenie 1,5 g agarozy o niskiej temperaturze topnienia w 50 mL sterylnego roztworu soli fizjologicznej z buforem fosforanowym; plastikowy kubek; zakrętka od probówki stożkowej 50 mL; pęseta i nożyczki. (B) Tkanka płucna została wypreparowana przy użyciu precyzyjnej pęsety i sterylnych nożyczek. (C) Wypełnij dno kubka niewielką ilością agarozy i umieść zakrętkę na powierzchni agarozy, następnie przechowuj w temperaturze 4 °C przez 5 min. (D) Powoli dodaj 1-2 mL ciekłej agarozy do zakrętki, ostrożnie połóż fragment tkanki płucnej na zakrętce i przechowuj w temperaturze 4 °C przez 2 min. (E,F) Wlej ciekłą agarozę do kubka, aż fragment tkanki płucnej zostanie całkowicie zanurzony, przechowuj w temperaturze 4 °C przez 15 min, a następnie delikatnie rozbij plastikowy kubek. (G) Użyj ostrego ostrza, aby usunąć nadmiar agarozy otaczającej tkankę płucną, pozostawiając jednolitą warstwę o grubości około 5 mm wokół tkanki. (H) Wycięty blok tkanki płucnej zostaje następnie ostrożnie przyklejony do uchwytu tkanek. (I) Wypełnij tackę buforową wibratomu PBS, umieść lód w otaczającej kąpieli lodowej i zamontuj dysk z próbką w tacce buforowej. (J) Ustaw parametry cięcia na panelu wibratomu; grubość skrawka: 200 μm, częstotliwość: 100 Hz, amplituda noża: 1,3 mm oraz prędkość posuwu ostrza 0,02-0,04 mm/s. (K-M) Reprezentatywne obrazy wolno pływającego skrawka wciąż zatopionego w agarozie i gotowego do barwienia immunofluorescencyjnego. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 2: Obrazy immunofluorescencyjne struktury płuc u człowieka, świni i myszy. (A-L) Reprezentatywne obrazy przewodu pęcherzykowego, naczynia krwionośnego, oskrzelika i pęcherzyków płucnych w przekrojach tkanki płucnej odpowiednio myszy, świni i człowieka. SMA (zaznaczona na zielono) jest markerem komórek mięśni gładkich i występuje w ścianach naczyń oraz oskrzelików tkanki płucnej. Elastyna (zaznaczona na czerwono) stanowi element macierzy pozakomórkowej płuc. (M) Ilościowa ocena wielkości pęcherzyków płucnych poprzez wybór 20 losowych pozycji na każdym przekroju tkanki płucnej dla próbek pochodzących od człowieka, świni i myszy. Do przedstawienia rozkładu wielkości pęcherzyków w każdej grupie wykorzystano histogramy. Paski skali = 50 µm (A-F, H-L), 100 µm (G). Test Kruskalla-Wallisa. *p < 0.05, **p < 0.01, ***p < 0.001, ****p < 0.0001. Skróty: DAPI = 4′,6-diamidino-2-phenylindole; LEA = lektyna Lycopersicon Esculentum; SMA = aktyna mięśni gładkich; ms = mysz; hmn = człowiek. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 3. Rozmieszczenie pneumocytów typu II w próbkach pobranych od dorosłych ludzi i niemowląt. (A,B) Reprezentatywne obrazy tkanki płuca dorosłego człowieka i niemowlęcia z barwieniem na HTII-280 (kolor czerwony), CD31 (kolor zielony) oraz LEA (kolor szary). (C,D) Reprezentatywne obrazy dorosłego i niemowlęcia, przedstawiające wyłącznie rozkład pneumocytów typu II. (E,F) Reprezentatywne obrazy w rozdzielczości pojedynczych komórek pojedynczego pneumocytu typu 2 z próbek płuc dorosłego i niemowlęcia. (G) Ilościowe oznaczenie liczby pneumocytów typu II w próbkach pobranych od osób dorosłych i niemowląt. (H) Ilościowe oznaczenie stopnia pokrycia powierzchni rusztowania tkanki płucnej (% względem powietrza) w próbkach dorosłych i niemowląt. (I) Ilościowe oznaczenie pneumocytów typu II na mm2 tkanki w próbkach dorosłych i niemowląt. Paski skali = 5 µm (E,F), 100 µm (A-D). n = 10 pól widzenia (fov) na próbkę. Próba niezależna t-test lub test Manna-Whitneya. *p < 0,05, **p < 0,01, ***p < 0,001, ****p < 0.0001. Skróty: DAPI = 4', 6-diamidino-2-fenyloindol; LEA = lektyna Lycopersicon Esculentum; HTII = ludzkie komórki typu II; CD31 = cząsteczka adhezyjna komórek śródbłonka płytek krwi-1/klaster różnicowania 31; fov = pole widzenia. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ilustracji.
Wideo uzupełniające S1: Film przedstawiający objętość obrazowania 20 µm pojedynczej drogi oddechowej świni zabarwionej przy użyciu DAPI, LEA, SMA i elastyny, ukazujący wysokorozdzielczy widok struktury elementów ściany dróg oddechowych. Skróty: DAPI = 4′,6-diamidino-2-phenylindole; LEA = lektyna z Lycopersicon Esculentum; SMA = aktyna mięśni gładkich. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Wideo uzupełniające S2: Film przedstawiający objętość obrazowania 30 µm pojedynczego pęcherzyka płucnego barwionego za pomocą DAPI, LEA i HTII-280, ukazujący rozkład pneumocytów typu 2 w obrębie struktury. Skróty: DAPI = 4′,6-diamidino-2-phenylindole; LEA = lektyna Lycopersicon Esculentum; SMA = aktyna mięśni gładkich. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.