$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Izolacja komponentu (Rysunek 1 i Rysunek 2)
Przed wykorzystaniem eksplantatów rdzeniowych i populacji komórek w kokulturze asembloidowej, składniki te należy sprawdzić pod mikroskopem (Rysunek 1). Eksplantaty rdzeniowe powinny mieć jednolitą średnicę (100-200 μm) i nie mieć widocznych załamań ani zmarszczek. Komórki śródbłonka powinny mieć wydłużony kształt w kontakcie z innymi komórkami, czego nie mają, gdy są wysiewane w zbyt niskiej gęstości ze względu na niską początkową wydajność izolacji. W tym przypadku komórki śródbłonka przybierają bardziej okrągły kształt z rozszerzeniami cytoszkieletu i proliferują znacznie wolniej. Podziel je 1:5 po 7-10 dniach. Fibroblasty ścięgien wyizolowane ze ścięgien Achillesa przyjmują bardziej okrągłą morfologię w porównaniu z ich ludzkimi odpowiednikami w ciągu 1-2 pasaży (10-14 dni każdy), gdy zostały podzielone 1:6. Makrofagi są znacznie mniejsze niż fibroblasty czy komórki śródbłonka i nie namnażają się po izolacji. W zależności od partii ich kształt może wahać się od piramidalnego do okrągłego.
Fenotypy składników komórkowych zostały zweryfikowane za pomocą cytometrii przepływowej. Sprzężone przeciwciało CD31 zastosowano jako marker komórek śródbłonka (Figura 2A). Ustalając próg fluorescencji na podstawie niebarwionej próbki kontrolnej (szarej), 90,1% komórek śródbłonka pasażu 1 (P1) i 48,7% komórek śródbłonka pasażu 2 (P2) zidentyfikowano jako CD31-dodatnie. Do scharakteryzowania fibroblastów ścięgien użyto genetycznie zmodyfikowanej linii myszy z koekspresją markera fibroblastów ścięgien Scleraxis wraz z zielonym białkiem fluorescencyjnym (ScxGFP) i sprzężonym przeciwciałem CD146 (Rysunek 2B) < sup class = "xref" >35,60. Po jednym pasażu (P1) 37,3% fibroblastów było ScxGFP+CD146-, 0,2% było ScxGFP+CD146+, 4,3% było ScxGFP-CD146+, a 58% było ScxGFP-CD146-. Po dwóch pasażach (P2) odsetek komórek ScxGFP+CD146- zmniejszył się do 27,6%, odsetek komórek ScxGFP+CD146+ wzrósł do 6,9%, odsetek komórek ScxGFP-CD146+ wzrósł do 10,6%, a odsetek komórek ScxGFP-CD146- spadł do 54,9%. Aby zidentyfikować i scharakteryzować makrofagi, zastosowano przeciwciało F4 / 80 w połączeniu z przeciwciałami CD86 i CD206 (Figura 2C). Po izolacji i hodowli 96,4% komórek pochodzących ze szpiku kostnego było F4/80-dodatnich. Wśród tych komórek F4 / 80-dodatnich 8,6% to CD206 + CD86-, 23,6% to CD206 + CD86 +, 28,3% to CD206-CD86 +, a 39,4% to CD206-CD86-. Szybkość sieciowania kolagenu może się różnić w zależności od partii i należy ją przetestować przed rozpoczęciem eksperymentów.
Assembloid appearance (Rysunek 3)
W warunkach hodowli podobnych do zmian chorobowych (36 °C, 20% O2) eksplant rdzenia pozostał mechanicznie rozciągliwy, nie zmienił wyglądu i nadal był wizualnie odróżnialny i fizycznie oddzielany od otaczającego hydrożelu przez co najmniej 21 dni (Rysunek 3A,B). Otaczający hydrożel był z czasem zagęszczany, a prędkość zagęszczania zależała od populacji komórek w nim zasianych. Fibroblasty wywodzące się ze ścięgna Achillesa kurczyły się najszybciej otaczający je hydrożel i robiły to promieniowo, gdy znajdowały się w hydrożelu odlewanym wokół eksplantatu rdzenia i we wszystkich kierunkach, gdy nie (Rysunek 3B, C). Początkowo bezkomórkowe hydrożele umieszczone wokół rdzenia eksplantatu również się zagęszczały. Skurcz ten był prawdopodobnie spowodowany migracją komórek z eksplantatu rdzenia, co wskazuje na dynamiczny interfejs międzyprzedziałowy. Ponieważ bezkomórkowe hydrożele bez wbudowanego eksplantatu rdzeniowego nie zagęszczały się wykrywalnie, udział skurczu wywołanego utratą wody wydaje się być znikomy (Rysunek 3B i plik uzupełniający 6).
Brak zagęszczenia hydrożelu może być zatem wykorzystany do wykrywania błędów w montażu assembloidu (np. niskie stężenia komórek) i powinien być sprawdzony przed kontynuowaniem droższych metod odczytu. Podczas opracowywania tej metody częstymi błędami zmniejszającymi stężenie komórek były obumieranie komórek w zewnętrznym hydrożelu, ponieważ pozostawiono je zbyt długo w stosunkowo ostrym roztworze sieciującym (wysokie pH, niska temperatura) oraz suszenie eksplantatów rdzeniowych, ponieważ czas między aspiracją pożywki a wstrzyknięciem hydrożelu był zbyt długi lub dlatego, że eksplant rdzenia był zaciśnięty zbyt wysoko, aby mógł zostać osadzony w kolagenie.
Konfokalna mikroskopia fluorescencyjna: Analiza żywotności i morfologii (Rysunek 3)
Po wyjęciu z zacisków za pomocą nożyczek (Rysunek 3B), asembloidy można utrwalić, wybarwić i zobrazować za pomocą mikroskopu konfokalnego jako całości bez dzielenia na sekcje. W tym przypadku rdzeń // komórka śródbłonka, rdzeń // makrofagi i rdzeń // asembloidy fibroblastów zostały wybarwione DAPI (NucBlue) i Ethidium Homodimer (EthD-1) w celu analizy żywotności oraz DAPI i F-aktyny w celu analizy morfologii i rozprzestrzeniania się komórek w hydrożelu kolagenowym 3D (Rysunek 3D). Żywotność assembloidów komórek śródbłonka (Rysunek 3E) została określona ilościowo i stwierdzono, że jest ogólnie niższa po złożeniu assembloidu niż wcześniej zgłaszano dla rdzenia // makrofagów i rdzenia // fibroblastów assembloids84. Jednak żywotność pozostawała stabilna podczas hodowli asembloidów co najmniej do 7 dnia.
Mikrouszkodzenia indukowane mechanicznie i pomiar właściwości mechanicznych (Rysunek 4)
i kołki przymocowane do uchwytów zaciskowych umożliwiają mocowanie zaciśniętych zespołów do jednoosiowych urządzeń rozciągających. Zastosowane tutaj urządzenie do rozciągania wykonane na zamówienie jest wyposażone w ogniwo obciążnikowe 10 N i zostało opisane w poprzednich publikacjach (Rysunek 4A)22. Wszystkie próbki zostały wstępnie kondycjonowane pięcioma cyklami rozciągania do 1% odkształcenia przed pomiarami.
Zapis pełnej krzywej naprężenie-odkształcenie rdzenia eksplantatów lub asembloidów (Rysunek 4B) pozwoliłoby na ilościowe określenie liniowego modułu sprężystości (α), maksymalnego naprężenia (β) i maksymalnego odkształcenia (у). Jednak nieodwracalnie uszkadza również rdzeń eksplantat lub asembloid, co uniemożliwia ocenę podłużnego rozwoju maksymalnego naprężenia (β) i maksymalnego odkształcenia (у) dla tych samych próbek (Rysunek 4B). W tym przypadku liniowy moduł sprężystości został użyty jako miara zdolności próbki do wytrzymywania sił, ponieważ pomiar ten wymaga rozciągnięcia próbki do zaledwie 2% odkształcenia, co jak wykazano wcześniej, nie powoduje trwałego zmniejszenia liniowego modułu sprężystości 18. W szczególności zespoły komórek rdzeniowych // śródbłonka poddano procedurze zaciskania na 2% odkształcenia (w przybliżeniu koniec liniowego obszaru elastycznego) lub 6% odkształcenia (w przybliżeniu maksymalne odkształcenie). Powstałe mikrouszkodzenia oceniono, mierząc liniowy moduł sprężystości przed i po zabiegu (Rysunek 4C).
Zgodnie z poprzednio przeprowadzonymi eksperymentami wykorzystującymi monokulturowe eksplantaty rdzeniowe, zespoły komórek rdzeniowych // rdzeniowych zachowywały swój liniowy moduł sprężystości przez co najmniej 14 dni, gdy były hodowane w niszowych warunkach quasi-homeostatycznych (29 °C, 3% O2) i wystawione na szczepy nie wyższe niż 2%18,21. Jeśli chodzi o mechaniczną stymulację podstawową, rozciąganie statyczne stosowane przez zaciski wydawało się wystarczająco naśladować natywne poziomy naprężeń doświadczane przez jednostki rdzenia ścięgien in vivo, aby zapobiec procesom katabolicznym ogólnie związanym z odciążaniem matrycy87. Rzeczywiście, postępujący i statystycznie istotny spadek liniowego modułu sprężystości obserwowany w zespołach komórek rdzenia // śródbłonka narażonych na 6% odkształcenie można przypisać rozładowaniu matrycy wynikającemu z mechanicznie indukowanego mikrouszkodzenia matrycy.
Podczas przeprowadzania tych eksperymentów ważne jest, aby zapobiec wysuszeniu asembloidu. W tym przypadku zostały one zamknięte w autoklawie i zwilżonym papierze, ale inne metody mogą być również opłacalne w zależności od ich kompatybilności z zastosowanym urządzeniem do rozciągania. Ponieważ tarcie między metalowymi zaciskami a eksplantatem rdzenia jest ograniczone, dodaj małe kawałki papieru między metal a eksplantat rdzenia podczas zaciskania, aby zapobiec poślizgowi i ściśle monitorować proces rozciągania, aby wykryć i wykluczyć poślizgnięte eksplantaty rdzenia i asembloidy.
Analiza transkryptomu specyficznego dla przedziału i sekretomu specyficznego dla asembloidu (Rysunek 5 i Rysunek 6)
W pierwszym zestawie podstawowych eksperymentów monokulturowych przedstawionych tutaj, stabilność ekspresji genów rdzeniowych po izolacji eksplantatów została oceniona w celu oddzielenia izolacji od efektów eksperymentalnych (Rysunek 5A). Chociaż do precyzyjnych wniosków niezbędna jest wyższa liczba powtórzeń, ekspresja Vegfa i Mmps znacznie wzrosła w świeżo wyizolowanych eksplantatach rdzeniowych w ciągu kilku godzin po izolacji eksplantatu, gdy były hodowane w niszowych warunkach przypominających zmiany chorobowe (37 °C, 20%O2).
Neowaskularyzacja jest główną cechą charakterystyczną chorób i naprawy ścięgien, która może być częściowo napędzana przez komórki śródbłonka aktywowane przez czynniki pro-angiogenne (tj. czynnik wzrostu śródbłonka naczyniowego, Vegfa) wydzielane przez rdzeń ścięgna w warunkach niedotlenienia88. Badając pierwszy etap tego potencjalnego przesłuchu (Figura 5B), stwierdzono, że ekspresja zarówno Vegfa, jak i markera hipoksji anhydrazy węglanowej 9 (Ca9) jest statystycznie istotna u eksplantatów monohodowanych przy niskim ciśnieniu tlenu (3% O2) w przeciwieństwie do tych monokulturowanych pod wysokim ciśnieniem tlenu (20% O2). Tymczasem niższe ciśnienie tlenu nie wydaje się powodować zmian w ekspresji markerów fibroblastów ścięgien, takich jak twardówka (Scx) i kolagen-1 (Col1a1). Łącznie wyniki te identyfikują komórki rezydujące w rdzeniu jako prawdopodobne czynniki przyczyniające się do sygnalizacji pro-angiogennej w niszy niedotlenionej.
Następnie, aktywacja komórek śródbłonka przez pro-angiogenną sygnalizację rdzeniową została oceniona w kokulturze asembloidów komórek śródbłonka w rdzeniu // pod wysokim (20% O2) i niskim (3% O2) ciśnieniem tlenu. Na szczęście modułowy skład asembloidów umożliwia specyficzną dla przedziałów analizę transkryptomu po hodowli poprzez fizyczne oddzielenie eksplantatu rdzenia od zewnętrznego hydrożelu kolagenowego (Figura 6A). W rdzeniu eksplantatu (Ryc. 6D) ponownie potwierdzono, że ekspresja Vegfa wzrasta przy niskim ciśnieniu tlenu, chociaż wpływ na inne markery hipoksji, takie jak Fgf2, był mniej wyraźny i wymaga większej liczby powtórzeń w celu uzyskania precyzyjnych wniosków. Ponadto ekspresja markerów prozapalnych, takich jak Tnf-α i markerów degradacji macierzy zewnątrzkomórkowej, takich jak Mmp3, była zmniejszona w rdzeniu przy niskim ciśnieniu tlenu. W zewnętrznym hydrożelu początkowo wysianym komórkami śródbłonka (Ryc. 6E), obecność żywego eksplantatu rdzeniowego (aC) zmniejszała ekspresję Vegfa przy niskim ciśnieniu tlenu, ale nie przy wysokim ciśnieniu tlenu. Ponadto obecność zdewitalizowanego (dC) eksplantatu rdzeniowego przy niskim ciśnieniu tlenu również nie zmniejszyła ekspresji Vegfa. Przy niskim ciśnieniu tlenu ekspresja Tnf-α w zewnętrznym hydrożelu była porównywalna w okolicach aC/dC, ale wzrastała przy wysokim ciśnieniu tlenu wokół żywych eksplantatów rdzeniowych. Ekspresja Fgf2 była zmniejszona we wszystkich warunkach w porównaniu z zewnętrznym hydrożelem obciążonym komórkami śródbłonka hodowanym wokół zdewitalizowanego eksplantatu rdzeniowego pod wysokim ciśnieniem tlenu, ale większość pod niskim napięciem tlenu. Ekspresja Mmp3 była najwyższa wokół żywych eksplantatów rdzeniowych przy wysokim ciśnieniu tlenu, a najniższa wokół zdewitalizowanych eksplantatów rdzeniowych przy niskim napięciu tlenu. Ogólnie rzecz biorąc, współhodowane komórki śródbłonka wydają się reagować zarówno na aktywny eksplantat rdzenia, który jest zdolny do inicjowania przesłuchów, jak i zmian poziomu tlenu. Bardziej kompleksowa analiza transkryptomu ułatwiłaby wyjaśnienie ich wkładu.
Modułowość systemu assembloid pozwala na integrację genetycznie zmodyfikowanych komórek zawierających fluorescencyjne geny reporterowe. W tym przypadku komórki śródbłonka wyizolowane z myszy MG Pdgfb-iCreER 89 zostały wysiane do komory hydrożelowej. Komórki te wykazują współekspresję markera komórek śródbłonka podjednostki b (Pdgfb) pochodzącego z płytek krwi wraz ze wzmocnionym białkiem zielonej fluorescencji (EGFP), co sprawia, że komórki śródbłonka wyrażające Pdgfb wydają się zielone pod mikroskopem (Figura 6C). Stosując tę metodę, potwierdzono, że obecność komórek śródbłonka wykazujących ekspresję Pdgfb utrzymuje się przez 7 dni w hodowli (37 °C) i wydaje się być niezależna od ciśnienia tlenu (20%O2 w porównaniu do 3%O2).
Aby przeanalizować sekretom asembloidów, pożywka hodowlana używana odpowiednio do hodowli rdzenia // bezkomórkowego i rdzeniowego // fibroblastu, rdzenia // makrofagów lub rdzenia // kohodowli komórek śródbłonka została zastąpiona swoim odpowiednikiem bez surowicy na trzy dni przed aspiracją i zamrożeniem supernatantu teraz wzbogaconego o sekretom (Rysunek 6A). Ten czas wzbogacania był wystarczający do wykrycia cytokin, takich jak czynnik wzrostu śródbłonka naczyń krwionośnych (VEGF) za pomocą testu MSD, jak pokazano tutaj dla eksplantatów rdzeniowych i asembloidów fibroblastów rdzeniowych // hodowlanych w niszowych warunkach podobnych do zmian chorobowych (Figura 6B).
Ważne kwestie do rozważenia podczas analizy sekretomów i transkryptomów głównych eksplantatów i asembloidów dotyczą użycia odpowiednich kontroli. Świeżo wyizolowane eksplantaty rdzeniowe mają ograniczoną wartość, ponieważ zwłaszcza ich ekspresja Vegfa i Mmps znacznie wzrasta w ciągu kilku godzin po izolacji (Rysunek 5A). Dopasowane w czasie eksplantaty otoczone początkowo bezkomórkowym hydrożelem są bardziej odpowiednie jako kontrola ekspresji genów w rdzeniu przedziału. W przypadku hydrożelu zewnętrznego, hydrożele obciążone komórkami hodowane bez eksplantatu rdzenia są gorszą kontrolą w porównaniu z hydrożelami obciążonymi komórkami hodowanymi wokół zdewitalizowanych eksplantatów rdzeniowych (plik uzupełniający 7), głównie dlatego, że zagęszczają się w okrągłe kształty zamiast wydłużonych hydrożeli, co znacznie zmienia morfologię komórki (Rysunek 3A).

Rysunek 1: Izolacja i montaż komponentów Assembloid do modelowania przesłuchów in vivo. Eksplantaty rdzenia ścięgien zostały wyekstrahowane z ogonów myszy, przecięte i zaciśnięte. Mięśnie nóg myszy (tj. mięsień czworogłowy uda (QF), mięsień brzuchaty łydki (G) i piszczel przedni (TA)) zostały strawione w celu wyizolowania komórek śródbłonka, które następnie hodowano na plastiku do hodowli tkankowej. Ścięgna Achillesa (AT) zostały również strawione w celu wyizolowania fibroblastów ścięgien, które następnie wyhodowano na plastikowej hodowli tkankowej. Szpik kostny z kości piszczelowej i kości udowej został wypłukany z kości. Następnie wyizolowane monocyty hodowano na plastiku z kulturą tkankową i różnicowano w naiwne makrofagi. Obrazy z mikroskopii świetlnej (10x) przedstawiają wygląd eksplantatów rdzeniowych, komórek śródbłonka, fibroblastów ścięgien i makrofagów bezpośrednio przed ich integracją w assembloidy. Podczas składania komórki hodowane na plastiku umieszczono w zawiesinie, a następnie wysiewano do roztworu kolagenu-1 (1,6 mg/ml). Następnie mieszaninę komórkowo-hydrożelową odlewano wokół zaciśniętego eksplantatu rdzeniowego i polimeryzowano przez 50 minut w temperaturze 37 °C przed dodaniem pożywki hodowlanej. Warunki hodowli kontrolowano za pomocą zacisków (naprężenie mechaniczne) i ustawień inkubatora (stężenie tlenu, temperatura). Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Charakterystyka komórkowych komponentów asembloidu. (A) Reprezentatywna analiza cytometryczna przepływu komórek śródbłonka pochodzących z mięśni po jednym pasażu (P1, górny rząd) i dwóch przejściach (P2, dolny rząd). Liczba komórek niebarwionych (szarych) i barwionych CD31 (zielonych) została znormalizowana do modalu. Wartości procentowe podano dla grupy barwionej CD31. (B) Reprezentatywna analiza cytometryczna przepływowa fibroblastów pochodzących ze ścięgna Achillesa po jednym pasażu (P1, górny rząd) i dwóch pasażach (P2, dolny rząd). Osie informują o intensywności fluorescencji komórek niebarwionych (szarych) i komórek zarówno wyrażających ScxGFP, jak i barwionych przeciwciałami CD146 (kolory tęczy). (C) Reprezentatywna analiza cytometryczna przepływowa makrofagów pochodzących ze szpiku kostnego po hodowli. W górnym rzędzie liczba komórek niebarwionych (szarych) i barwionych F4/80 (zielonych) została znormalizowana do modalnego. Wartości procentowe podano dla grupy barwionej F4/80. Wykres w dolnym wierszu przedstawia intensywność fluorescencji niebarwionych komórek (szary) i podzbioru F4/80+ komórek barwionych przeciwciałami CD206 i przeciwciałami CD86 (kolory tęczy). Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Obrazowanie i wygląd asembloidu. (A) Reprezentatywne fotografie wykonane w dniu 0 (d0) i dniu 21 (d21) hodowli (37 °C, 20% O2) pokazują wielowymiarowe skurczenie hydrożelu zawierającego zewnętrzne fibroblasty bez osadzonego eksplantatu rdzenia i silne promieniste zagęszczenie hydrożelu zawierającego zewnętrzne fibroblasty wokół rdzenia eksplantatu. (B) Reprezentatywne fotografie wykonane w 21 dniu (d21) hodowli (37 °C, 20% O2) pokazują różnice w prędkości zagęszczania między bezkomórkowymi hydrożelami, bezkomórkowymi hydrożelami odlewanymi wokół eksplantatu rdzeniowego i hydrożelami zawierającymi fibroblasty ścięgna odlane wokół eksplantatu rdzeniowego. (C) Reprezentatywne obrazy mikroskopii świetlnej (10x) wykonane w dniu 0 (d0) i dniu 21 (d21) hodowli (37 °C, 20% O2) wskazują na zmiany podłużne w obecności populacji komórek i prędkości zagęszczania hydrożelu kolagenowego (HG) wokół eksplantatu rdzenia (E) w kokulturze asembloidu fibroblastów / / bezkomórkowych i rdzeniowych // . Schematyczne przedstawienie przedstawia różnice w zagęszczeniu hydrożelu między kokulturą asembloidów rdzeniowych // bezkomórkowych a kokulturą asembloidów fibroblastów // rdzeniowych. (D) Reprezentatywne obrazy mikroskopii konfokalnej wykonane w dniu 7 (d7) komórki rdzenia // śródbłonka, rdzenia // makrofagów i rdzenia // koasembloidu fibroblastów (37 °C, 20 % O2). Obrazy w lewym rzędzie przedstawiają asembloidy z jądrami komórkowymi zabarwionymi na niebiesko (DAPI) i martwymi komórkami zabarwionymi na różowo (Ethidium homodimer-1). Pozostałe dwa rzędy przedstawiają asembloidy z jądrami komórkowymi zabarwionymi na niebiesko (DAPI) i włóknami aktynowymi na zielono (F-aktyna). (E) Wykresy pudełkowe przedstawiające ilościową żywotność zespołów komórek śródbłonka w dniu 1 (d1) i dniu 7 (d7) kohodowli. N = 5. Górny i dolny zawias odpowiadają pierwszemu i trzeciemu kwartylowi(25. i 75. percentyl), a środkowy – medianie. Wąsy rozciągają się od górnego/dolnego zawiasu do największej/najmniejszej wartości nie dalej niż 1,5-krotność przedziału międzykwartylowego. Wartości P: n.s.p > 0,05. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Mechaniczna stymulacja asembloidów i pomiar właściwości mechanicznych assembloidów. (A) Graficzne przedstawienie wykonanego na zamówienie urządzenia rozciągającego, składającego się z platform uchwytów zaciskowych, czujnika siły i silnika krokowego. Na zdjęciu fotograficznym widać asembloid zamontowany do urządzenia rozciągającego za pomocą zacisków. Pokrywka plastikowej probówki o pojemności 15 ml (Ø: 17 mm) używana do skalowania. (B) Wykres przedstawiający reprezentatywne krzywe naprężeń/odkształceń dla eksplantatów rdzeniowych (jasnoniebieski) i asembloidów (jasnoczerwony). Liniowy moduł sprężystości (α), maksymalne naprężenie (β) i maksymalne odkształcenie (у) można wyodrębnić z danych, aby mechanicznie scharakteryzować eksplantat lub asembloid rdzenia. (C) Wykres przedstawiający liniowy moduł sprężystości (Emod) zespołów komórek śródbłonka // współhodowanych (29 °C, 3%O2) w ciągu 14 dni po zaciśnięciu (linia ciągła), zaciśnięciu i rozciągnięciu do 2% odkształcenia L0 (linia przerywana) lub zaciśnięciu i rozciągnięciu do 6% szczepu L0 (linia przerywana) na początku eksperymentu. N = 5. Punkty danych zostały znormalizowane do początkowego liniowego modułu sprężystości przed rozciąganiem i wszystkie są wyświetlane jako średnia (±sem). Wartości P: *p < 0,05, **p < 0,01. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 5: Zmiany w transkryptomie rdzenia po izolacji i hodowli w różnych warunkach niszowych. (A) Wykres rozrzutu przedstawiający zmiany fałdowania w ekspresji genów Vegfa, Mmp13 i Mmp3 w monokulturowych (37 °C, 20% O2) mysich eksplantatach po 2 godzinach, 4 godzinach, 6 godzinach i 8 godzinach po wyizolowaniu ich od ogona. Zmiany fałdowania w odpowiednich punktach czasowych znormalizowano do ekspresji genu 2 godziny po izolacji. N = 2. (B) Wykresy pudełkowe przedstawiające zmiany fałdowania ekspresji genów Ca9, Vegfa, Scx i Col1a1 w eksplantatach rdzeniowych monohodowanych przy niskim ciśnieniu tlenu (3%O2) znormalizowane i porównane z monokulturami przy wysokim ciśnieniu tlenu (20%O2). N = 5-6. Górne i dolne zawiasy wykresów skrzynkowych odpowiadają pierwszemu i trzeciemu kwartylowi(25. i 75. percentylowi), a środkowy medianie. Wąsy rozciągają się od górnego/dolnego zawiasu do największej/najmniejszej wartości nie dalej niż 1,5-krotność przedziału międzykwartylowego. Punkty danych używane do normalizacji są przedstawiane jako czarne kropki, a poszczególne punkty danych jako czerwone kropki. Wartości P: **p < 0,01, ***p < 0,001. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 6: Analiza sekretomu specyficznego dla asembloidu i transkryptomu specyficznego dla kompartmentu. (A) Reprezentatywne zdjęcie przedstawiające asembloid w dniu 7 (d7), kiedy pobrano próbki sekretomu i transkryptomu, oraz przedstawienie podstawowego przepływu pracy. (B) Stężenie VEGF (pg/ml) w supernatancie asembloidów rdzeniowych // bezkomórkowych i rdzeniowych // fibroblastów po 7 dniach kohodowli (37 °C, 20%O2) przedstawionych jako wykresy pudełkowe. N = 6. (C) Reprezentatywne obrazy z mikroskopii konfokalnej zespołów komórek rdzenia // śródbłonka po 7 dniach wspólnej hodowli (37 °C) przy wysokim ciśnieniu tlenu (20% O2) i niskim ciśnieniu tlenu (3% O2 ). Jądra komórkowe są barwione na niebiesko (DAPI), a osadzone komórki śródbłonka wykazują współekspresję wzmocnionego białka zielonej fluorescencji (EGFP) wraz z markerem komórek śródbłonka podjednostką b czynnika wzrostu pochodzącego z płytek krwi (Pdgfb). Przerywana linia wskazuje interfejs kompartmentowy między eksplantatem rdzenia (E) a hydrożelem obciążonym komórkami śródbłonka (HG). (D) Wykres rozrzutu przedstawiający zmiany fałdowania ekspresji genów Vegfa, Tnf-α, Fgf2 i Mmp3 w przedziale rdzenia z asembloidów komórek rdzenia // śródbłonka współhodowanych w warunkach niskiego ciśnienia tlenu (3% O2) znormalizowanych i porównanych z tymi hodowanymi pod wysokim ciśnieniem tlenu (20% O2). N = 2. (E) Wykres rozrzutu przedstawiający zmiany fałdowania ekspresji genów Vegfa, Tnf-α, Fgf2 i Mmp3 w zewnętrznym przedziale zespołów komórek rdzenia // śródbłonka z żywym rdzeniem (aC) lub zdewitalizowanym rdzeniem (dC) współhodowanym w warunkach wysokiego ciśnienia tlenu (20% O2) i niskiego ciśnienia tlenu (3% O2). Zmiany fałdowania w odpowiednich warunkach znormalizowano do zewnętrznego przedziału rdzenia // zespołu komórek śródbłonka ze zdewitalizowanym rdzeniem (dC) współhodowanym pod wysokim napięciem tlenu (20%O2). N = 3-4. W B górne i dolne zawiasy wykresów skrzynkowych odpowiadają pierwszemu i trzeciemu kwartylowi(25. i 75. percentyl), a środkowy – medianie. Wąsy rozciągają się od górnego / dolnego zawiasu do największej / najmniejszej wartości nie dalej niż 1,5 razy przedziału międzykwartylowego. Wartości odstające są przedstawiane jako czarne kropki. Wartości P: *p < 0,05. W D i E punkty danych używane do normalizacji są przedstawiane jako czarne kropki, a poszczególne punkty danych są przedstawiane jako czerwone kropki. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
Tabela 1: Wymagania wejściowe dla systemów modelowania chorób ścięgien i urazów. Lista pierwotnych czynników wywołujących choroby ścięgien i czynników drugorzędnych dopasowanych do wybranych parametrów wejściowych, których wykonalność ma kluczowe znaczenie dla modelowania chorób i urazów ścięgien. Kliknij tutaj, aby pobrać tę tabelę.
Tabela 2: Wymagania wyjściowe dla systemów modeli chorób ścięgien i urazów. Wybór cech charakterystycznych chorób ścięgien dopasowanych do wybranych parametrów wyjściowych, których kwantyfikacja ma kluczowe znaczenie dla interpretacji choroby ścięgien i zachowania modelu urazów. Kliknij tutaj, aby pobrać tę tabelę.
Plik uzupełniający 1: plik .stl dla uchwytów zacisków, stacji montażowej i form komory. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 2: Plan prawego uchwytu zacisku. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 3: Plan lewego uchwytu zacisku. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 4: Plan platformy montażowej Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 5: Plan zacisków metalowych. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 6: Obraz przedstawiający skurcz hydrożelu bez komórek. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 7: Obraz przedstawiający zdewitalizowany rdzeń eksplantacji. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.