Ten projekt może być używany w różnych trybach, w zależności od wymagań eksperymentalnych i preferencji użytkownika końcowego. Przed każdym eksperymentem zapoznaj się ze schematem decyzyjnym przedstawionym w Rysunek 2, aby określić niezbędne kroki i moduły dla protokołu. Na przykład, jeśli użytkownik zamierza zachować format otwartej studni przez cały czas trwania eksperymentu, aby bezpośrednio porównać go z systemem typu Transwell, szablon wzoru nie jest wymagany do wysiewu komórek. Moduł główny jest dostępny na rynku (patrz Tabela materiałów), a ultracienka nanomembrana może być wybierana z biblioteki materiałów o różnej porowatości i wielkości porów, aby dopasować ją do potrzeb eksperymentalnych.
1. Wykonanie szablonu do tworzenia wzorów
UWAGA: Szablon do tworzenia wzorów służy do umieszczania komórek wyłącznie na porowatym obszarze chipa membranowego, zapobiegając osadzaniu się komórek na otaczającej warstwie krzemu, gdzie mogłyby potencjalnie ulec uszkodzeniu po dodaniu modułu przepływu16 (patrz Rysunek 3). Uszkodzenie monowarstwy może niekorzystnie wpłynąć na integralność bariery i zagrozić wynikom eksperymentów. Szablon nie jest potrzebny w otwartej, statycznej hodowli, ponieważ nie ma ryzyka uszkodzenia.
- Kup, obrób maszynowo lub wydrukuj formę 3D, korzystając z projektu dostarczonego w Dodatkowym pliku kodowania 1 (Rysunek 4A).
UWAGA: Ścianki szablonu są zwężane w celu zwiększenia pojemności nośnika i zminimalizowania pułapkowania pęcherzyków w porównaniu z elementami o prostych ściankach o wysokim współczynniku proporcji.
- Przymocuj samoprzylepną folię samoprzylepną (PSA) o grubości 130 μm do arkusza akrylowego o grubości 3,2 mm za pomocą zimnego wałka (patrz Tabela materiałów).
- Wytnij laserowo arkusz akrylowy zgodnie z projektem dostarczonym w dodatkowym pliku kodowania 2, aby utworzyć tablicę wnęk ( Rysunek 4B).
- Zdejmij warstwę ochronną z folii PSA i przymocuj arkusz akrylowy do formy.
UWAGA: Upewnij się, że arkusz wycinany laserowo jest wyrównany z formą tak, aby elementy formy były wyśrodkowane we wnęce (Rysunek 4C). Dokładność pozycjonowania komórek na membranie zależy od tego kroku.
- Dokładnie wymieszaj prepolimer PDMS (stosując stosunek zasady do katalizatora 10:1) (patrz Tabela materiałów) i odgazuj go w komorze próżniowej, aż nie pozostaną żadne widoczne pęcherzyki (5-15 min).
- Powoli wlej PDMS do wnęk formy, wyrównując ją płaską krawędzią.
UWAGA: Aby zapobiec uwięzieniu pęcherzyków, powoli wlewaj PDMS do każdej wnęki. Jeśli po nalaniu pojawią się pęcherzyki, umieść formę w komorze próżniowej i ponownie ją odgazuj.
- Utwardź PDMS na płycie grzejnej w temperaturze 70 °C przez 1 godzinę, a następnie pozwól mu ostygnąć do temperatury pokojowej.
- Wyciągnij szablony z jam formy za pomocą pęsety z płaską końcówką.
2. Wykonanie modułu przepływu
UWAGA: Moduł przepływu ma podobną powierzchnię co studnia w kształcie koniczyny modułu głównego i zawiera formowany mikrokanał (szerokość = 1,5 mm, wysokość = 0,2 mm, długość = 5 mm). Kształt koniczyny pomaga w wyrównaniu kanału nad porowatym obszarem kultury (Rysunek 5).
- Użyj standardowych technik miękkiej litografii18, aby stworzyć formę silikonową o cechach zdefiniowanych przez projekt dostarczony w Dodatkowym Pliku Kodowania 3 (Rysunek 4D).
- Przymocuj folię PSA 130 μm do arkusza akrylowego o grubości 3,2 mm.
- Wytnij laserowo arkusz akrylowy na podstawie projektu podanego w dodatkowym pliku kodowania 4, aby utworzyć tablicę wnęk w kształcie koniczyny ( Rysunek 4E).
UWAGA: Wysokość wnęki określa wysokość modułu przepływowego, który musi być nieco wyższy (o 0-0,1 mm) niż wysokość modułu rdzeniowego, aby zapewnić prawidłowe uszczelnienie.
- Usuń warstwę ochronną z folii PSA, a następnie przymocuj wycięty laserowo arkusz do formy silikonowej, wyrównując trójkątne znaki wyrównania na formie silikonowej z tymi na arkuszu wycinanym laserowo.
UWAGA: Podobnie jak w kroku 1.4, upewnij się, że wycinany laserowo arkusz akrylowy jest wyrównany z formą silikonową, tak aby elementy formy były wyśrodkowane w każdej wnęce (Rysunek 4F). Ten krok określa położenie mikrokanału względem śladu.
- Powoli wlej odgazowany PDMS do wnęk formy i wyrównaj go płaską krawędzią.
UWAGA: Jeśli po wylaniu pojawią się bąbelki, odgazuj formę, aż bąbelki zostaną usunięte.
- Umieść formę na płycie grzejnej i piecz PDMS w temperaturze 70 °C przez 1 godzinę, a następnie pozwól foremce ostygnąć do temperatury pokojowej.
- Ostrożnie wyjmij moduły przepływowe z wnęk formy za pomocą pęsety z płaską końcówką.
- Ustaw moduł przepływu tak, aby elementy mikrokanału były skierowane do góry, a porty wlotowe i wylotowe rdzenia umieścić na końcu kanału za pomocą stempla do biopsji (patrz Tabela materiałów).
3. Wykonanie dolnych i górnych obudów akrylowych
UWAGA: Główny moduł mieści się w dolnej obudowie. Przyciąganie między magnesami osadzonymi w obudowach ściska i uszczelnia moduł przepływu do modułu głównego (Rysunek 6).
- Wytnij laserowo arkusz akrylowy o grubości 2 mm, korzystając z projektu dostarczonego w dodatkowym pliku kodowania 5, aby stworzyć górną obudowę z otworami do włożenia magnesu.
- Przymocuj folię PSA 130 μm do arkusza akrylowego o grubości 3,5 mm.
- Wytnij laserowo arkusz akrylowy na podstawie wzoru podanego w dodatkowym pliku kodowania 6, aby utworzyć dolną obudowę z otworami do włożenia magnesu.
UWAGA: Grubość dolnej obudowy jest parametrem krytycznym i musi odpowiadać całkowitej grubości modułu głównego, aby zapobiec wyciekom podczas przepływu.
- Usuń warstwę ochronną PSA i przymocuj dolną obudowę do szklanego szkiełka nakrywkowego.
- Niklowane magnesy neodymowe o średnicy 4,75 mm wciskane na wcisk w laserowo wycięte otwory w obudowach.
UWAGA: Upewnij się, że magnesy w dolnej i górnej obudowie są umieszczone z przeciwną biegunowością, aby zapewnić przyciąganie magnetyczne (Rysunek 6).
4. Wykonanie obwodu przepływu
UWAGA: Obwód przepływu w pętli zamkniętej zawiera dwie fiolki do pobierania próbek jako zbiorniki (Rysunek 7). Zbiornik wlotowy jest wyposażony w filtr z polifluorku winylidenu (PVDF), który umożliwia zrównoważenie pożywki komórkowej ze stężeniem CO2 w inkubatorze.
- Użyj dziurkacza do biopsji o średnicy 1 mm, aby utworzyć dwa otwory w nakrętce fiolki do pobierania próbek.
- Za pomocą stempli biopsyjnych wykonać dwa otwory (1 mm i 4 mm) w nasadce oddzielnej fiolki do pobierania próbek, a następnie utworzyć otwór o średnicy 1 mm w dolnej części tej fiolki.
- Włóż końcówki dozujące 20 G do każdego z otworów o średnicy 1 mm i uszczelnij je gorącym klejem.
- Umieść filtr PVDF 0.22 μm (patrz Tabela materiałów) w otworze 4 mm i uszczelnij go gorącym klejem.
- Wytnij laserowo arkusz akrylowy o grubości 1,5 mm, korzystając z projektu dostarczonego w dodatkowym pliku kodowania 7, aby utworzyć stolik do przechowywania próbki.
- Umieść zbiorniki na akrylowym stoliku.
- Podłącz końcówki dozujące za pomocą rurek mikroprzepływowych (patrz Tabela materiałów).
- Połącz rurki z wlotem i wylotem modułu przepływowego za pomocą końcówek dozujących 21 G.
- Do cyrkulacji przepływu należy użyć pompy perystaltycznej (patrz tabela materiałów).
UWAGA: W razie potrzeby można również użyć pomp strzykawkowych lub pneumatycznych do wprowadzenia przepływu. Natężenie przepływu należy określić na podstawie potrzeb doświadczalnych. Obszerna tabela, pochodząca z eksperymentalnie zweryfikowanego modelu COMSOL, znajduje się w Tabeli Uzupełniającej 1, aby pomóc użytkownikom w doborze niezbędnego natężenia przepływu do osiągnięcia pożądanego naprężenia ścinającego na monowarstwie komórki16.
5. Rozsiewanie komórek
UWAGA: Podobnie jak w przypadku konwencjonalnych wkładek membranowych, na nanomembranie można hodować różne typy komórek. Wtórny typ komórki może być również hodowany wspólnie po drugiej stronie błony w dolnym kanale15.
- Pokryj membranę 5 μg/cm2 fibronektyny (patrz tabela materiałów) w temperaturze pokojowej przez 1 godzinę, aby poprawić przyczepienie komórek.
UWAGA: Wybrany typ ogniwa może mieć wpływ na wymaganą powłokę i gęstość komórek. Opisana tutaj procedura dotyczy ludzkich komórek śródbłonka żyły pępowinowej (HUVEC, patrz tabela materiałów).
- Odessać roztwór powlekający za pomocą pipety P200 i umieścić szablon do tworzenia wzorów w studzience modułu rdzeniowego.
- Dodaj nośnik komórkowy do studzienki i dolnego kanału urządzenia.
- Wysiewać HUVEC o gęstości 40 000 komórek/cm2 do dołka.
UWAGA: HUVEC o tej gęstości zazwyczaj tworzą zlewającą się monowarstwę po 24 godzinach inkubacji16,19.
- Umieść urządzenie na szalce Petriego. Dodaj stożkową nakrętkę probówki o pojemności 15 ml z wodą DI do szalki Petriego, aby utrzymać lokalną wilgotność.
- Przenieść szalkę Petriego do inkubatora.
UWAGA: Media komórkowe w górnym i dolnym kanale urządzenia należy wymieniać co 24 godziny. Aby zmienić nośnik w dolnym kanale, delikatnie wstrzyknij nowy nośnik do jednego z portów, aby przemieścić stary nośnik z drugiego portu.
6. Rekonfiguracja do trybu mikroprzepływowego
- Wysterylizuj górną obudowę, dolną obudowę, moduł przepływowy, zbiorniki, probówki i końcówki dozujące, umieszczając je w komorze sterylizacyjnej UV na 30 minut przed montażem. Cyrkulacja 70% etanolu, a następnie sterylny PBS w obiegu przepływowym.
- Napełnij zbiorniki i probówki pożywką do wzrostu komórek śródbłonka (patrz tabela materiałów).
- Umieść dolną obudowę na stoliku na próbkę. Włóż moduł z rdzeniem otwartej studzienki do dolnej obudowy.
- Odessać pożywkę komórkową z dołka modułu. Umieść moduł przepływu w studni.
- Umieść górną obudowę, aby uszczelnić moduł przepływowy w studzience modułu rdzeniowego. Podłącz końcówki dozujące wlotowe i wylotowe do portów modułu przepływu.
- Uruchom pompę perystaltyczną, aby wprowadzić przepływ płynu do układu.
7. Przeprowadzanie dalszych analiz w formacie open-well po wprowadzeniu przepływu
UWAGA: Czas hodowli zależy tutaj od celów eksperymentu. Użytkownicy mogą przeprowadzać dalsze analizy (np. immunocytochemia, ekstrakcja RNA) w formacie otwartym lub mikroprzepływowym w zależności od swoich preferencji. Na przykład, jeśli preferowany jest format z otwartą studnią, system powinien zostać ponownie skonfigurowany do przeprowadzania testów w oparciu o standardowe protokoły16,19.
- Zatrzymaj pompę, gdy osiągniesz żądany czas ekspozycji na przepływ ścinający. Wyjmij końcówki dozujące wlotowe i wylotowe.
- Zdejmij górną obudowę. Delikatnie wyjmij moduł przepływu ze studni za pomocą pęsety.
- Dodaj 100 μl pożywki komórkowej do studzienki. Przeprowadzaj pożądane testy w oparciu o standardowe protokoły.