Korelacyjne światło i mikroskopia elektronowa (CLEM) to kompleksowa mikroskopia, która łączy informacje o lokalizacji dostarczone przez mikroskopię fluorescencyjną (FM) oraz kontekst ultrastruktury komórkowej uzyskany przez mikroskopię elektronową (EM). CLEM to kompromis między fluorescencją a ultrastrukturą, a zwykle ultrastruktura pogarsza fluorescencję. W porównaniu z innymi hydrofilowymi żywicami do zatapiania, takimi jak metakrylan glicydylu, HM20 lub K4M, Epon jest lepszy pod względem właściwości zachowania ultrastruktury i cięcia. Wcześniej wykazaliśmy, że mEosEM może przetrwać utrwalanie tetratlenku osmu i osadzanie eponu. Korzystając z mEosEM, po raz pierwszy uzyskaliśmy Epon po zatopieniu CLEM, który utrzymuje jednocześnie fluorescencję i ultrastrukturę. Tutaj podajemy szczegółowe informacje krok po kroku na temat przygotowania próbki EM, obrazowania FM, obrazowania EM i wyrównania obrazu. Udoskonalamy również procedury identyfikacji tej samej komórki obrazowanej za pomocą obrazowania FM podczas obrazowania EM i szczegółowo opisujemy rejestrację między obrazami FM i EM. Wierzymy, że można łatwo osiągnąć Epon po osadzeniu światła korelacyjnego i mikroskopii elektronowej zgodnie z tym nowym protokołem w tradycyjnych obiektach EM.