Artykuł metodologiczny

Ilościowa i niedroga bezkomórkowa metoda fluorescencyjna potwierdzająca zdolność nowych związków do chelatowania żelaza

DOI:

10.3791/66421

23 lutego 2024

W tym artykule

Podsumowanie

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Opisujemy test fluorescencyjny, który może szybko i tanio potwierdzić zdolność nowych związków do chelatowania żelaza. Test mierzy zdolność związków do konkurowania z aktywnością wiązania żelaza przez słabą sondę fluorescencyjną chelatującą żelazo Calceinę, co skutkuje wymiernym wzrostem fluorescencji, gdy zachodzi chelatacja.

Streszczenie

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Komórki rakowe wymagają dużych ilości żelaza, aby utrzymać swoją proliferację. Metabolizm żelaza jest uważany za cechę charakterystyczną raka, co sprawia, że żelazo jest ważnym celem w podejściach przeciwnowotworowych. Opracowywanie nowych związków i identyfikacja tropów do dalszej modyfikacji wymaga przeprowadzenia testów potwierdzających działanie mechanizmu. Istnieje wiele testów oceniających wpływ na proliferację; Jednak zdolność do chelatowania żelaza jest ważnym, a czasem pomijanym wskaźnikiem punktu końcowego ze względu na wysokie koszty sprzętu i wyzwanie związane z szybkim i powtarzalnym określeniem ilościowym siły chelatacji. W tym miejscu opisujemy wymierną i niedrogą metodę fluorescencji bezkomórkowej, aby potwierdzić zdolność nowych związków do chelatowania żelaza. Nasz test opiera się na dostępnym na rynku, niedrogim barwniku fluorescencyjnym Calcein, którego fluorescencję można określić ilościowo na większości fluorescencyjnych czytników płytek do mikromiareczkowania. Kalceina jest słabym chelatorem żelaza, a jej fluorescencja jest wygaszona, gdy wiąże Fe2 + / 3 +; fluorescencja jest przywracana, gdy nowy chelator konkuruje z kalceiną o związany Fe2 +/3 +. Usunięcie wygaszania fluorescencyjnego i wynikający z tego wzrost fluorescencji pozwala na określenie zdolności chelatacyjnej nowego przypuszczalnego chelatora. Dlatego oferujemy niedrogi, wysokoprzepustowy test, który umożliwia szybkie badanie przesiewowe nowych potencjalnych związków chelatorowych.

Wprowadzenie

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Zmiany fenotypowe w komórkach, które odnoszą się do rozwoju raka poprzez wspólny zestaw zmienionych zdolności biologicznych, są teraz powszechnie określane jako cechy charakterystyczne raka. Wśród nich są zmiany wynikające z przeprogramowania metabolizmu energetycznego, które są szeroko rozpowszechnione w biologii komórek nowotworowych1. Takie przeprogramowanie metaboliczne obejmuje zwiększone zapotrzebowanie na żelazo, aby wspierać szybką proliferację i wzrost guza2. To pragnienie żelaza prowadzi do rozregulowanego metabolizmu żelaza, który sam w sobie jest uważany za cechę charakterystyczną raka3,4, przy czym dysregulacja występuje na wszystkich etapach5. Cechy charakterystyczne przerzutów, ostatnio zaproponowane przez Welcha i Hursta, obejmują rolę iron6, ponieważ żelazo może indukować stres oksydacyjny, a to z kolei może pośredniczyć w zmianach w genomie, epigenomie i proteomie, zwiększając możliwość przerzutów7. Związek między poziomem żelaza a zwiększoną częstością występowania raka wykazano w badaniach epidemiologicznych8.

Ponieważ komórki rakowe wymagają dużych ilości żelaza, są podatne na niedobór żelaza, a co za tym idzie, chelatację żelaza. Niedawno opublikowaliśmy artykuł przeglądowy, w którym podkreśliliśmy potencjał chelatacji żelaza w odwracaniu kilku cech charakterystycznych raka poprzez NDRG1 zakłócający onkogenne szlaki sygnałowe9. Jednak zastosowanie chelatacji żelaza jako samodzielnej terapii przeciwnowotworowej nie przyniosło pozytywnych wyników w badaniach klinicznych ze względu na ich toksyczność, krótki okres półtrwania, szybki metabolizm i pojawiające się mechanizmy oporności. Niemniej jednak chelatory żelaza okazały się obiecujące w badaniach in vitro i in vivo, co wskazuje, że potrzebne są dalsze prace nad opracowaniem skutecznych chelatorów żelaza w terapii raka. Specyficzna chelatacja żelaza jest sprawdzoną strategią w odkrywaniu leków przeciwnowotworowych, ale do tej pory zgłoszono tylko kilka klas10.

Identyfikacja i charakterystyka nowych chelatorów żelaza wymaga możliwości zmierzenia ich wpływu na kilka punktów końcowych. Wiele z nich (takich jak proliferacja, apoptoza, powstawanie reaktywnych form tlenu) jest rutynowo mierzonych i zostało opisanych i zrecenzowanych w literaturze jako metody oceny cech charakterystycznych raka11. Oceniając nowy chelator żelaza, wiele grup rutynowo bada wpływ na aktywność antyproliferacyjną i redoks, a także wpływ na napływ lub odpływ żelaza. Techniki przewidywania in silico12 dodatkowo zwiększają rosnącą pulę chelatorów żelaza, które można badać.

Stworzenie chelatatorów żelaza wymaga możliwości zmierzenia ich wpływu na poziom żelaza, aby skutecznie zademonstrować dowód zasady. Obecnie najpowszechniejszą metodą jest cytometria przepływowa13, która jest kosztowna, czasochłonna i słabo kwantyfikowalna. Wybór testu często opiera się na dostępności sprzętu eksperymentalnego, szybkości i koszcie testu. W związku z tym zdolność do chelatowania żelaza może być pomijaną miarą punktu końcowego ze względu na wysokie koszty sprzętu oraz wyzwanie związane z szybkim i powtarzalnym określeniem ilościowym siły chelatacji. W tym miejscu opisujemy wymierną i niedrogą metodę fluorescencyjną bez komórek, aby potwierdzić zdolność nowych związków do chelatowania żelaza.

Protokół

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. Przygotowanie roztworu podstawowego

  1. Przygotowując roztwory wyjściowe Calcein, należy zapobiegać fotodegradacji, trzymając roztwory w ciemności. Przygotuj 1 mM roztwór kalceiny w PBS firmy Dulbecco, bez magnezu i wapnia14. Na 5 ml 1 ml roztworu kalceiny dodać 3,1 mg kalceiny (622,5 g/M) do 5 ml PBS firmy Dulbecco. Używając 1 mM skarpety Calcein, przygotuj 1 ml porcji wtórnych roztworów podstawowych w probówce do mikrofuge, jak opisano w Tabeli 1.
  2. Przygotować sześciowodny roztwór siarczanu żelazowo-amonowego, rozpuszczając 19 mg sześciowodnego FAS (392,1 g/M) w 5 ml PBS firmy Dulbecco w celu otrzymania 10 mM roztworu siarczanu żelazowo-amonowego (FAS). Przygotować zapasy wtórne FAS przez rozcieńczenie. Aby przygotować zapas 2 mM FAS (fA), rozcieńczyć 200 μL z 10 mM FAS z PBS z 800 μL PBS firmy Dulbecco. Aby przygotować zapas 100 μM FAS (fB), rozcieńczyć 50 μL naczyń fA 950 μL PBS firmy Dulbecco.
  3. Aby przygotować 10 mM wywaru deferypronu, rozpuść 2,8 mg (139,15 g/M) w 2 ml PBS firmy Dulbecco. Przygotować zapasy wtórne chelatora żelaza 2 mM, rozcieńczając 200 μl 10 mM zapasów 800 μl PBS.
    firmy Dulbecco. UWAGA: W tym teście wybrany chelator żelaza powinien być rozpuszczony w PBS firmy Dulbecco bez magnezu i wapnia. Jako działający przykład użyliśmy chelatora żelaza Deferypronu.

2. Walidacja testu poprzez określenie liniowego zakresu fluorescencji kalceiny

  1. Przygotować szereg wywarów kalceiny od 1 mM do 1 μM, zgodnie z opisem w tabeli roztworu podstawowego (patrz Tabela 1). Roztwory podstawowe należy przechowywać w ciemności, aby zapobiec degradacji fotochemicznej.
  2. Odpipetować 90 μl soli fizjologicznej buforowanej fosforanami (PBS) do studzienek od A do H i od 1 do 12 z płytki 96-dołkowej za pomocą jednokanałowej pipety ręcznej lub wielokanałowej pipety ręcznej.
  3. Dodać 10 μl 1 mM bulionu kalceinowego do kolumny 12, rzędy od A do H, płytki 96-dołkowej za pomocą jednokanałowej pipety ręcznej.
  4. Dodać 10 μl wstępnie przygotowanego bulionu kalceinowego o wielkości 800 μM (Tabela 1) do 96-dołkowej płytki w kolumnie 11, rzędy od A do H, używając jednokanałowej pipety ręcznej.
  5. Powtórzyć procedurę dodawania z wsadami z tabeli 1 tak, aby kolumna 10 zawierała 10 μl wsadu 400 μM, a kolumna 9 zawierała 10 μl wsadu 200 μM itd. Kontynuuj tę procedurę krok po kroku we wszystkich kolumnach, aż kolumna 2 będzie zawierała 10 μl wsadu 1 μM.
    UWAGA: Końcowe stężenie kalceiny w każdym dołku jest 10-krotnie niższe niż w roztworach podstawowych ze względu na rozcieńczenie 1:10.
  6. Dodać 10 μl PBS do kolumny 1, wierszy A–E.
  7. Inkubować w temperaturze pokojowej przez 30 minut i ustawić analizator na czytniku mikropłytek na wzbudzenie 490 nm i detekcję 530 nm (lub odpowiedni zestaw filtrów do fluorescencji Calcien).

3. Walidacja testu za pomocąhartowania jonów Fe2+ w celu zmniejszenia fluorescencji kalceiny

  1. Przygotować zapas kalceiny (cB) o pojemności 10 μM i zapas FAS (fA) o wielkości 2 mM (patrz tabela materiałów). Trzymaj bulion Calcein w ciemności, aby zapobiec fotodegradacji.
  2. Używając jednokanałowej pipety ręcznej lub wielokanałowej pipety ręcznej, dodaj 50 μl PBS do kolumn od 2 do 10, rzędów od A do E. Nie dodawaj PBS do kolumny 11.
  3. Dodać 100 μl zapasu FAS (fA) o pojemności 2 mM do 96-dołkowej płytki w kolumnie 11 (rzędy od A do E) za pomocą jednokanałowej pipety ręcznej.
  4. Za pomocą wielokanałowej pipety ręcznej usunąć 50 μl fA z kolumny 11 i odpipetować go do PBS już w kolumnie 10, dokładnie wymieszać pipetując.
  5. Kontynuować tę stopniową procedurę podwójnego rozcieńczania w kolumnach 9-2, rzędach od A do E płytki 96-dołkowej i mieszać pipetując.
  6. Pobrać 50 μl roztworu przez pipetowanie z kolumny 2 i wyrzucić roztwór do odpadów.
  7. Dodać 40 μl PBS do wszystkich studzienek z roztworem w nich, kolumny 2-12, rzędy od A do E.
  8. Dodać 90 μl PBS do studzienek kolumna 1, rzędy A-E. Studzienki te działają jako pozytywna kontrola 1 μM Calcein i 0 μM FAS.
  9. Dodać 10 μl 10 μM bulionu kalceinowego (cB) do każdej studzienki z roztworem w niej (kolumny od 1 do 12, rzędy od A do E). Daje to najwyższe stężenie 1000 μM FAS w kolumnie 11, przy czym stężenie FAS zmniejsza się o połowę w kolumnach 10, 9, 8 w poprzek kolumny 2. Każda z otrzymanych studzienek z kolumn zawiera 1 μM kalceiny i rozcieńczenie FAS.
  10. Dodać 100 μl PBS do wiersza F kolumn 1–5 dla samej kontroli PBS. Dodać 100 μl z 2 mM FAS do rzędu F w kolumnach 6–10 dla samej kontroli FAS. Inkubować w temperaturze pokojowej przez 10 minut w ciemności.
  11. Analizę przeprowadzić na czytniku mikropłytek ustawionym na wzbudzenie 490 nm i detekcję 530 nm (lub odpowiednim zestawie filtrów do fluorescencji kalceiny).

4. Test do ilościowego określenia zdolności chelatorów żelaza do konkurowania ze słabym chelatorem Kalceiną ojony Fe2+

  1. Przygotować zapas kalceiny (cB) 10 μM, zapas FAS (fB) 100 μM i zapas chelatora żelaza 2 mM, jak przedstawiono w tabeli 1. Przechowuj bulion Calcein w ciemności, aby zapobiec fotodegradacji.
  2. Używając jednokanałowej pipety ręcznej lub wielokanałowej pipety ręcznej, dodaj 50 μl PBS do kolumn od 2 do 10, rzędy od A do E, płytki 96-dołkowej. Nie dodawaj PBS do kolumny 11.
  3. Dodać 100 μl 2 mM zapasu (fA) chelatorów żelaza do 96-dołkowej płytki w kolumnie 11, rzędy od A do E, używając jednokanałowej pipety ręcznej.
  4. Za pomocą wielokanałowej pipety ręcznej usunąć 50 μl fA z kolumny 11 i odpipetować go do PBS w kolumnie 10, rzędy od A do E, dokładnie mieszając przez pipetowanie.
  5. Kontynuować tę stopniową procedurę podwójnego rozcieńczania w pozostałych kolumnach 9-2, rzędy od A do E płytki, wymieszać każdą studzienkę pipetując. Usunąć 50 μl z kolumny 2 i wyrzucić. Zapewnia to podwójne rozcieńczenie 2 mM chelatora żelaza (deferypronu) w 96 kolumnach z płytkami dołkowymi 11 do 2, rzędy od A do E.
  6. Odpipetować 30 μl PBS do wszystkich studzienek z roztworem w nich (np. kolumny 2-11 rzędów od A do E).
  7. Za pomocą pipety wielokanałowej dodać 10 μl 100 μM FAS (fB) do kolumn 2-12, wierszy od A do E. Powoduje to stężenie 1 μM kalceiny i 10 μM FAS w każdym dołku oraz podwójne rozcieńczenie chelatorów, przy czym stężenie zmniejsza o połowę każdą kolumnę w poprzek płytki, kolumny 11-2, przy najwyższym stężeniu chelatora żelaza na poziomie 1000 μM w kolumnie 11 dołków od A do E.
  8. Za pomocą pipety wielokanałowej dodać 10 μl 10 μM wywaru kalceinowego (cB) do kolumn 2-12, rzędy od A do E.
  9. Odpipetować pipetą 80 μl PBS i 10 μl bulionu kalceiny (cB) i 10 μl bulionu FAS (fB) do kolumny 1, rzędy A-E. Wymieszać próbki przez pipetowanie. Zapewnia to kontrolę 1 μM kalceiny za pomocą 10 μM FAS i bez chelatora.
  10. Odpipetować 100 μl PBS do kolumn 1 do 5 rzędu F. Zapewnia to kontrolę ujemną PBS.
  11. Dodać 100 μl 2 mM chelatora żelaza (deferypronu) do rzędu F, kolumny 6-10. Zapewnia to kontrolę samego chelatora.
  12. Inkubować w temperaturze pokojowej przez 10 minut w ciemności. Analizę przeprowadzić na multimodalnym czytniku mikropłytek ustawionym na wzbudzenie przy 490 nm i detekcję przy 530 nm (lub odpowiednim zestawie filtrów do fluorescencji Calciena).

5. Analiza danych

  1. Analiza w celu walidacji testu poprzez określenie liniowego zakresu fluorescencji kalceiny.
    1. Obliczyć średnie względne jednostki fluorescencji (RFU) w wierszach A-H dla każdego stężenia kalceiny w kolumnach płytki 96-dołkowej z kroku 1 i wykreślić w stosunku do stężenia. Wykreśl wykres liniowy stężenia kalceiny na osi x w stosunku do średniej RFU na osi y i użyj regresji liniowej, aby zapewnić linię najlepszego dopasowania.
    2. Określ ilościowo istotność statystyczną, porównując stężenia kalceiny w każdej kolumnie (2-11) z kontrolą PBS w kolumnie 1 wiersze od A do E. Przeprowadź analizę wariancji (ANOVA) i zastosuj analizę post hoc przy użyciu najmniejszej istotnej różnicy (LSD) z progiem p <0,001 w celu określenia istotności statystycznej (oznaczonej przez ** w Rysunek 1).
  2. Analiza w celu walidacji testu przez wygaszanie jonów Fe2+ w celu zmniejszenia fluorescencji kalceiny.
    1. Obliczyć średnie względne jednostki fluorescencji (RFU) w wierszach od A do E dla każdego stężenia FAS w kolumnach 2-11. Wykreślić średnią RFU dla każdego stężenia FAS na osi y. Na osi x wykreśla się stężenia FAS za pomocą skali Log2, ponieważ lepiej rozprowadza dane. Wykreśl linię najlepszego dopasowania przy użyciu regresji liniowej.
    2. Określić ilościowo istotność statystyczną, porównując średnią z każdej kolumny ze średnią RFU kontroli PBS, 1 μM Calcein, 0 μM FAS (kolumna 1 wiersz A do E). Przeprowadzić analizę post hoc ANOVA z LSD z progiem p <0,001 w celu określenia istotności statystycznej.
  3. Analiza do testu: Kwantyfikacja zdolności chelatorów żelaza do konkurowania ze słabym chelatorem Calceina o jony Fe2+.
    1. Obliczyć średnie względne jednostki fluorescencji (RFU) w wierszach od A do E dla każdego stężenia chelatora w kolumnach 2-11. Wykreślić średnią RFU dla każdego stężenia chelatora na osi y. Na osi x wykreśl stężenia chelatora za pomocą skali Log2, ponieważ lepiej rozprowadza dane.
    2. Określić ilościowo istotność statystyczną, porównując średnią z każdej kolumny ze średnią RFU kontroli PBS 1 μM Calcein i 10 μM FAS (kolumna 1 wiersz A–E). Przeprowadzić analizę post hoc ANOVA z LSD z progiem p <0,001 w celu określenia istotności statystycznej.

Wyniki

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Dla metody pokazanej w kroku 2, ten pierwszy eksperyment (Rysunek 1) ustalił liniowy zakres czytnika płytek fluorescencyjnych mikromiareczkowych podczas wykrywania emisji fluorescencyjnych kalceiny. Nasze reprezentatywne wyniki pokazują szeroki liniowy zakres fluorescencji kalceiny od 0 do 100 μM. ANOVA z analizą post hoc LSD pokazuje, że istnieją statystycznie istotne różnice w średnim RFU dla wszystkich stężeń kalceiny w porównaniu z kontrolą 0 μM kalceiny. W dalszych eksperymentach użyto kalceiny 1 μM (kroki 3 i 4), ponieważ daje ona statystycznie istotne różnice w stosunku do kontroli 0 μM i mieści się w zakresie, w którym jest powszechnie stosowana do komórek w postaci kalceiny AM w cytometrii przepływowej13.

Dla metody pokazanej w kroku 3 pokazujemy, że gdy żelazo w postaci Fe2+ jest dodawane w zakresie 0-1000 μM (jako FAS) do 1 μM Calceiny, jony Fe2+ powodują liniowy spadek fluorescencji kalceiny (RFU). Pozwala to na obserwację wygaszania fluorescencji kalceiny na podstawieFe2+. Kalceina jako słaby chelator żelaza wiąże żelazo, co zmniejsza emisję fluorescencyjną. W Rysunek 2, stężenia 8,9 μM FAS i wyższe wykazały znaczny spadek, p<0,001, fluorescencji kalceiny w porównaniu do 1 μM samej kalceiny. Zastosowanie 8,9 μM FAS odpowiadało 33% zmniejszeniu fluorescencji kalceiny (średnia RFU). Do dalszych eksperymentów (etap 4) użyto 10 μM FAS, ponieważ mieścił się on w zakresie fluorescencyjnego wygaszania kalceiny.

Dla metody pokazanej w kroku 4, konkurując Calceina o jony Fe2+ przez chelator żelaza, można zaobserwować w Rysunek 3. Żelazo w postaci Fe2+ zmniejsza fluorescencję kalceiny od kontroli 1 μM, a deferypron chelatora żelaza zwiększa tę fluorescencję do piku, uwalniając hartowanie żelaza kalceiny i zwiększając fluorescencję (średnia RFU). Deferypron (stosowany jako przykład) w stężeniach w zakresie 0,97-512 μM powodował statystycznie istotny wzrost fluorescencji, co zaobserwowano za pomocą analizy post hoc ANOVA i LSD (p<0,001). Największą zmianą było 3-krotne zwiększenie średniej RFU przy 62,5 μM chelatora w porównaniu z kontrolą 1 μM kalceiny AM i 10 μM FAS. Powyżej 512 μM deferypronu nie stwierdzono statystycznie istotnej różnicy między chelatorem a kontrolą 1 μM kalceiny i 10 μM FAS.

figure-results-1
Rysunek 1: Stężenie kalceiny i fluorescencja (RFU) określone za pomocą czytnika płytek do mikromiareczkowania fluorescencyjnego. Stężenia kalceiny 0-100 μM inkubowane przez 30 minut i oznaczone fluorescencji (RFU) przedstawiono tutaj. Dane pokazują średnią z 8 powtórzeń na eksperyment i trzech niezależnych eksperymentów, słupki błędów pokazują 95% przedział ufności w średniej. Istotność statystyczna jest oznaczona przez **, gdzie p<0,001 wyznaczone za pomocą analizy post hoc ANOVA i LSD (obliczonej przy użyciu pryzmatu wykresu). Średnia RFU kalceiny dla każdego stężenia jest porównywana z kontrolą PBS i 0 μM Calceiny. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

figure-results-2
Rysunek 2: Wzrost stężenia FAS powoduje liniowy spadek fluorescencji kalceiny. Stężenie FAS wzrosło z 0-1000 μM, co spowodowało liniowy spadek fluorescencji kalceiny o 1 μM po 30 minutach inkubacji w PBS Przedstawione dane są średnią z 5 powtórzeń na eksperyment i trzech niezależnych eksperymentów, słupki błędów pokazują 95% przedział ufności w średniej. Istotność statystyczna jest oznaczona przez **, gdzie p<0,001 wyznaczone za pomocą analizy post hoc ANOVA i LSD (obliczonej przy użyciu pryzmatu wykresu). Średnią RFU kalceiny dla każdego stężenia FAS i 1 μM kalceiny porównuje się z kontrolą 1 μM kalceiny, 0 μM FAS w PBS. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

figure-results-3
Rysunek 3: Rosnące stężenie deferypronu. Stężenie deferypronu zwiększono z 0-1000 μM przy inkubacji 1 μM Calceiny, 10 μM FAS w PBS. Fluorescencję mierzono na multimodalnym czytniku mikropłytek. Pokazane dane są średnią z 5 powtórzeń na eksperyment i trzech niezależnych eksperymentów, słupki błędów pokazują 95% przedział ufności średniej. Istotność statystyczna jest oznaczona przez **, gdzie p<0,001 wyznaczone za pomocą analizy post-hoc ANOVA i LSD (obliczonej przy użyciu pryzmatu wykresu). Średnia RFU w porównaniu z 1 μM kalceiną w PBS z 10 μM FAS i 0 μM deferypronu. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

szt. szt. szt. szt. Rozdział
Stężenie (μm) Objętość od (1 mM zapasu)Objętość PBSCałkowita objętość
800800 μL200 μL1 ml
400400 μL600 μL1 ml
200200 μL800 μL1 ml
100100 μL900 μL1 ml
5050 μL950 μL1 ml
2525 μL975 μL1 ml
1010 μL990 μL1 ml
66 μL994 μL1 ml
cyfra arabska2 μl998 μL1 ml
11 μL999 μL1 ml

Tabela 1: Przygotowanie bulionu wtórnego Calcein.

Dyskusja

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Nadmierne uzależnienie nowotworów od żelaza w celu napędzania ich metabolizmu sprawia, że chelatacja żelaza jest potencjalnym dodatkiem do schematów terapeutycznych4. Istnieje jednak ograniczona zdolność do szybkiego badania przesiewowego nowych chelatatorów jonów metali pod kątem ich zdolności do wiązania jonów żelaza. Powszechnie stosowana i powszechnie dostępna sonda fluorescencyjna Calcein jest znana z tego, że działa jako słaby chelator żelaza, a wiązanie przez jony żelaza wygasza fluorescencję kalceiny. Fluorescencję można następnie odzyskać, rywalizując o wiązanie z żelazem za pomocą silniejszego chelatora żelaza. Zmniejszenie fluorescencji obserwowane w wyniku wiązania żelaza przez kalceinę i przywrócenie fluorescencji, gdy jest ona konkurowana przez silniejszy chelator, zapewnia szybką i prostą metodę badań przesiewowych nowych związków o potencjale chelatacji żelaza. Podczas gdy techniki oparte na kalceinie13 są już stosowane do wizualizacji zdolności chelatorów do wiązania żelaza w komórkach, techniki te wymagają kosztownej aparatury do cytometrii przepływowej, są tylko częściowo ilościowe, wymagają intensywnego szkolenia personelu i stosowania droższej formy kalceiny przepuszczanej przez komórki, Calcien-AM. Co więcej, technika ta jest słabo odtwarzalna i nie ułatwia łatwego określania istotności danych za pomocą analizy statystycznej. Dlatego stworzyliśmy prostą, niedrogą metodę in vitro , która może działać jako pierwsze przejście przesiewowe nowych związków chelatujących żelazo. Ten bezkomórkowy test znosi wymóg stosowania kosztownych metod hodowli komórkowych jako pierwszego przejścia wysokoprzepustowego badania przesiewowego pod kątem zdolności chelatacji żelaza.

Rośnie zainteresowanie badaniami przesiewowymi lub opracowywaniem nowych chelatorów żelaza, które mogą być stosowane w leczeniu nowotworów ze względu na ich zależność od żelaza w celu napędzania ich adaptacji metabolicznych2. W artykule opisano technikę in vitro , która może być wykorzystana do potwierdzenia zdolności nowych związków do chelatowania żelaza poprzez konkurencję ze słabym chelatorem Calceiną. Pozwala to na proste, ilościowe i niedrogie badania przesiewowe nowych związków pod kątem ich zdolności do chelatacji żelaza.

Jednym z kluczowych etapów protokołu jest ustalenie zakresu liniowego czytnika fluorescencyjnych płytek do mikromiareczkowania (rysunek 1). Kalceina ma szerokie widma wzbudzenia i emisji fluorescencji, które koncentrują się wokół piku wzbudzenia 501 nm i piku emisji 521 nm. Jednak zakres liniowy kalceiny może być zależny od filtrów stosowanych do wzbudzania i wykrywania emisji fluorescencji kalceiny, zakres liniowy fotopowielacza użytego do wykrywania również częściowo określi zakres liniowy. Dlatego ważne jest, aby najpierw ustalić zakres stężeń, przy których fluorescencja kalceiny jest liniowa, aby upewnić się, że test działa w liniowym zakresie kalceiny na czytniku płytek fluorescencyjnych. Biorąc pod uwagę, że zaobserwowaliśmy liniowość między 0 a 100 mM Calceiny, pokazuje to, że Calcein ma szeroki zakres liniowy. Co więcej, fluorescencyjne czytniki płytek mikromiareczkowych są zwykle wyposażone w zestawy filtrów, które mogą mierzyć fluorescencję kalceiny, ponieważ ma ona podobne widmo do niektórych z najczęściej używanych fluoroforów emitujących zielone światło. Dlatego test ten ma szerokie zastosowanie u szerokiego grona użytkowników.

Preferowane jest stosowanie FAS jako donora jonów żelaza, ponieważ dostarcza jonów Fe2+ , które są głównym jonem żelaza w labilnej puli żelaza w komórkach. Jednak wyniki podobne do pokazanych tutaj (ryc. 2) osiągnięto za pomocą chlorku żelazowo-amonowego (FAC), który dostarcza Fe3+ (dane nie pokazane). W związku z tym test jest zgodny z obydwoma stanami redoks jonów żelaza, co rozszerza zastosowanie do chelatorów z preferencją dla każdego z tych stanów redoks.

W tym badaniu przedstawiamy dane dotyczące chelatora żelaza deferypronu, jednak oceniliśmy również zdolność innych chelatorów żelaza, w tym mimozyny, do konkurowania z kalceiną w wiązaniu jonów żelaza za pomocą tego testu (dane nie pokazane). Jednym z ograniczeń testu jest to, że powyżej 512 mM deferypronu chelatora nie stwierdzono statystycznie istotnego wzrostu fluorescencji w porównaniu z kontrolą 1 μM kalceiny i 10 μM FAS. Nie jest jasne, dlaczego wyższe stężenia chelatora nie powodują wzrostu fluorescencyjności, chociaż zaobserwowano to w przypadku innych chelatorów (dane nie pokazane). Jednak wiodący związek terapeutyczny powinien działać <100 μM, aby test działał w zakresach stężeń wymaganych do skuteczności związku ołowiu.

Test ten pozwala zatem na szybkie przebadanie każdego potencjalnego chelatora żelaza pod kątem zdolności do chelatowania żelaza jako dowodu mechanizmu. Jest to ważny pierwszy krok przed przeprowadzeniem nowych chelatatorów w kosztownych i pracochłonnych testach komórkowych lub in vivo . Ograniczeniem tego testu jest to, że przeprowadza się go przy użyciu wodnego rozpuszczalnika i dlatego wymaga, aby chelator był rozpuszczalny w wodnych. Biorąc jednak pod uwagę, że najwyższym stężeniem zastosowanym w tym badaniu był 10 mM deferypron, który jest małym lipofilowym chelatorem żelaza15, chelatory o ograniczonej rozpuszczalności w wodzie mogą być nadal testowane.

Podsumowując, opisany tutaj test może okazać się cenny w badaniach przesiewowych nowych chelatatorów żelaza, które są przedmiotem ciągłego rozwoju terapii przeciwnowotworowej.

Oświadczenia

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Autorzy deklarują brak konfliktu interesów.

Podziękowania

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Chcielibyśmy podziękować Uniwersytetowi Northumbria za wsparcie.

Materiały

Lista materiałów użytych w tym artykule
NazwaFirmaNumer katalogowyKomentarze
Sześciowodny siarczan amonu żelaza(II)Sigma-Aldrich215406inny znany jako FAS
CalceinSigma-AldrichC0875
DeferypranSigma-Aldrich379409
Dulbecco′ s Sól fizjologiczna buforowana fosforanamiSigma-AldrichD5652bez magnezu i wapnia
Greiner CELLSTAR 96-dołkowe płytkiSigma-AldrichM0812każda optycznie przezroczysta płytka 96-dołkowa będzie działać

Bibliografia

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Hsu, P. P., Sabatini, D. M. Cancer cell metabolism: Warburg and beyond. Cell. 134 (5), 703-707 (2008).
  2. Hsu, M. Y., Mina, E., Roetto, A., Porporato, P. E. Iron: An essential element of cancer metabolism. Cells. 9 (12), 2591(2020).
  3. Torti, S. V., Torti, F. M. Iron and cancer: More ore to be mined. Nat Rev Cancer. 13 (5), 342-355 (2013).
  4. Zhang, C., Zhang, F. Iron homeostasis and tumorigenesis: Molecular mechanisms and therapeutic opportunities. Protein Cell. 6 (2), 88-100 (2015).
  5. Torti, S. V., Manz, D. H., Paul, B. T., Blanchette-Farra, N., Torti, F. M. Iron and cancer. Annu Rev Nutr. 38, 97-125 (2018).
  6. Welch, D. R., Hurst, D. R. Defining the hallmarks of metastasis. Cancer Res. 79 (12), 3011-3027 (2019).
  7. Lehmann, U., et al. Epigenetic defects of hepatocellular carcinoma are already found in non-neoplastic liver cells from patients with hereditary haemochromatosis. Hum Mol Genet. 16 (11), 1335-1342 (2007).
  8. Fonseca-Nunes, A., Jakszyn, P., Agudo, A. Iron and cancer risk--a systematic review and meta-analysis of the epidemiological evidence. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 23 (1), 12-31 (2014).
  9. Abdelaal, G., Veuger, S. Reversing oncogenic transformation with iron chelation. Oncotarget. 12 (2), 106-124 (2021).
  10. Brown, R. A. M., et al. Altered iron metabolism and impact in cancer biology, metastasis, and immunology. Front Oncol. 10, 476(2020).
  11. Menyhárt, O., et al. Guidelines for the selection of functional assays to evaluate the hallmarks of cancer. Biochim Biophys Acta. 1866 (2), 300-319 (2016).
  12. Basu, A., et al. Discovering novel and diverse iron-chelators in silico. J Chem Inf Model. 56 (12), 2476-2485 (2016).
  13. Prus, E., Fibach, E. Flow cytometry measurement of the labile iron pool in human hematopoietic cells. Cytometry A. 73 (1), 22-27 (2008).
  14. Cold Spring Harb. Phosphate-buffered saline (pbs). 2006 (1), Cold Spring Harb Prot. (2006).
  15. Kontoghiorghes, G. J., Pattichis, K., Neocleous, K., Kolnagou, A. The design and development of deferiprone (l1) and other iron chelators for clinical use: Targeting methods and application prospects. Curr Med Chem. 11 (16), 2161-2183 (2004).

Przedruki i uprawnienia

Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE

Poproś o pozwolenie

Tagi

Iron ChelationFluorescent AssayCancer MetabolismIron ChelatorsCalcein FluorescenceMicroplate ReaderHigh Throughput ScreeningFerric Ammonium SulfateCell Free AssayNovel Compounds

Powiązane artykuły