Ten protokół opisuje zmodyfikowaną procedurę szybkiego izolowania czystych oocytów etapu I u danio pręgowanego pozbawionego komórek ziarnistych, zapewniając tym samym wygodną metodę do badań specyficznych dla oocytów.
Artykuł metodologiczny
Ten protokół opisuje zmodyfikowaną procedurę szybkiego izolowania czystych oocytów etapu I u danio pręgowanego pozbawionego komórek ziarnistych, zapewniając tym samym wygodną metodę do badań specyficznych dla oocytów.
Badania nad rozwojem oocytów mają znaczące implikacje w biologii rozwoju. Danio pręgowany (Danio rerio) był szeroko wykorzystywany jako organizm modelowy do badania wczesnych procesów rozwojowych od oocytu do zarodka. U danio pręgowanego oocyty są otoczone pojedynczą warstwą somatycznych komórek ziarnistych. Jednak oddzielenie komórek ziarnistych od oocytów stanowi wyzwanie, ponieważ uzyskanie czystych oocytów ma kluczowe znaczenie dla precyzyjnej analizy. Chociaż zaproponowano różne metody izolowania oocytów danio pręgowanego na różnych etapach rozwoju, obecne techniki nie są w stanie całkowicie usunąć komórek ziarnistych, co ogranicza dokładność analizy genomu skoncentrowanej wyłącznie na oocytach. W tym badaniu udało nam się opracować szybki i skuteczny proces izolowania czystych oocytów etapu I u danio pręgowanego przy jednoczesnym wyeliminowaniu zanieczyszczenia komórkami ziarnistymi. Technika ta ułatwia analizę biochemiczną i molekularną, szczególnie w badaniu aspektów epigenetycznych i struktury genomu specyficznych dla oocytów. Warto zauważyć, że metoda jest przyjazna dla użytkownika, minimalizuje uszkodzenia oocytów i zapewnia praktyczne rozwiązanie do późniejszych badań i analiz.
Danio pręgowany jest jednym z najważniejszych systemów modelowych w biologii rozwojowej. W ostatnich latach w licznych badaniach wykorzystano danio pręgowanego jako model do badania ważnych zdarzeń biologicznych i procesów regulacyjnych od oocytu do zarodka. Obejmują one skomplikowane procesy rozwoju i dojrzewania oocytów1, funkcjonalność genów matczynych2, regulację przejść matczyno-jarzygotycznych3, oraz obszerne analizy omiczne4.
Komórki ziarniste, komórki somatyczne otaczające i pielęgnujące rozwijającą się komórkę jajową w pęcherzyku jajnikowym5,6, odgrywają kluczową rolę w tym procesie rozwoju. Gdy pierwotne komórki rozrodcze (PGC) ewoluują w oogonię, są otoczone przez monowarstwę komórek ziarnistych7. Wraz z zewnętrznymi komórkami osłonowymi, oocyt i otaczające go komórki ziarniste tworzą dojrzały pęcherzyk8. Biorąc pod uwagę podstawowe rozróżnienie między komórkami rozrodczymi a komórkami somatycznymi, uzyskanie czystej próbki oocytów jest konieczne, zwłaszcza w przypadku analiz związanych z genomem.
W strukturze pęcherzykowej danio pręgowanego, komórki ziarniste zazwyczaj wykazują średnicę zaledwie kilku mikronów8, podkreślając ścisłe powiązania między komórkami ziarnistymi a oocytami9. To ścisłe powiązanie stanowi wyzwanie w osiągnięciu całkowitej separacji ze względu na znaczną różnicę zarówno w liczbie, jak i objętości komórek ziarnistych w porównaniu z oocytami (setki komórek ziarnistych w porównaniu z pojedynczym oocytem)10,11. Nawet minimalne zanieczyszczenie pojedynczą komórką ziarnistą może utrudnić dalsze analizy ukierunkowane na oocyty. Dlatego w przypadku badań koncentrujących się na cechach genomowych i epigenetycznych niezbędna jest eliminacja komórek ziarnistych.
Korzystając z dobrze scharakteryzowanych kryteriów morfologicznych, oocyty na każdym etapie mogą być rozróżniane na podstawie średnicy11. Proces oogenezy u danio pręgowanego jest podzielony na pięć etapów w zależności od morfologii i kariotypu11. Oocyty stadium I (średnica 7-140 μm) obejmują oocyty od początku mejozy do wczesnego etapu mejozy I. Co najważniejsze, oocyty te są przezroczyste, co pozwala na obserwację jądra centralnego w świetle przechodzącym (Figura 1Ai). Oocyty w stadium II (średnica 140-340 μm) stopniowo stają się pieniste i półprzezroczyste. Wraz z powiększeniem pęcherzyków włosowych i proliferacją pęcherzyków korowych, pęcherzyki rozrodcze w środku stają się trudne do odróżnienia12 (Rysunek 1Aii). Oocyty III stopnia (średnica 340-690 μm) stopniowo gromadzą witellogeninę, a świeże pęcherzyki stają się coraz bardziej nieprzezroczyste (Rysunek 1Aiii). Mejoza trwa w oocytach etapu IV (średnica 690-730 μm), gdy chromosomy wchodzą w środek mejozy II, gdzie ulegają stagnacji (Figura 1Aiv). Oocyty w stadium V (średnica 730-750 μm) dojrzały i są gotowe do owulacji7,11(Rysunek 1Av).
Na podstawie unikalnych cech każdego z wyżej wymienionych etapów, zaproponowano metodę izolowania oocytów od etapów I do III poprzez trawienie jajników danio pręgowanego za pomocą roztworu trawiennego zawierającego kolagenazę I, kolagenazę II i hialuronidazę, a następnie filtrację przez sitko komórkowe o określonej wielkości13. Jednak, chociaż metoda ta pozwala na uzyskanie oocytów na różnych etapach rozwoju, nie jest w stanie całkowicie oddzielić oocytów i komórek ziarnistych. Inni badacze zasugerowali również metody oddzielania komórek ziarnistych od oocytów. Jednak metody te opierają się przede wszystkim na metodach mechanicznych, które mogą powodować uszkodzenie oocytów, są czasochłonne i niewystarczające do uzyskania znacznej liczby oocytów do analizy14,15.
Biorąc pod uwagę ograniczenia istniejących metod i specyficzne wymagania badawcze, to badanie ma na celu ustalenie procedury dokładnego oddzielania oocytów i komórek ziarnistych oraz uzyskania wystarczającej liczby czystych oocytów I stopnia do analizy. Rozwijając przywołaną metodę13, stosujemy ulepszony bufor trawienny (patrz Tabela materiałów), który jest łagodniejszy i ułatwia dyspersję oocytów i dysocjację komórek ziarnistych. Następnie oocyty są przepuszczane przez sitko komórkowe, po którym następuje mycie i dalsza selekcja mikroskopowa, umożliwiająca pozyskanie dużej liczby czystych oocytów w stadium I.
Wszystkie danio pręgowane były traktowane zgodnie z rygorystycznymi wytycznymi dotyczącymi opieki nad zwierzętami, określonymi przez odpowiednie krajowe i/lub lokalne organy ds. dobrostanu zwierząt. Utrzymanie i obchodzenie się z rybami uzyskało zgodę zarówno władz lokalnych, jak i komisji etycznej ds. zwierząt Szpitala Zachodniochińskiego Uniwersytetu Syczuańskiego (zatwierdzenie nr 20220422003). Jajniki danio pręgowanego zawierają mieszaninę wieloetapowych oocytów, z których każdy etap rozwojowy jest obecny w jajnikach dorosłego danio pręgowanego. Jednak młode danio pręgowane zostały wybrane do tego badania ze względu na dominację oocytów w późnym stadium (stadium II-III) w jajnikach dorosłych ryb, które są duże i nieprzezroczyste. Natomiast młode osobniki mają płaskie i wydłużone jajniki składające się głównie z oocytów w stadium I (Ryc. 1B) (Ryc. 1B). Wcześniejsze badania wykazały, że cechy morfologiczne wczesnej oogenezy u dorosłych i młodocianych ryb danio pręgowanego są bardzo spójne, co potwierdza możliwość wykorzystania młodocianych danio pręgowanych13. Procedury opisane poniżej, opisane w Rysunek 2, zawierają szczegółowy opis procesu izolacji, od sekcji do uzyskania czystych oocytów w stadium I. Dla dalszych informacji odczynniki, i sprzęt wykorzystany w badaniu są wymienione w Tabeli Materiałów.
1. Rozwarstwienie jajników
2. Trawienie
3. Filtracja
4. Mycie
5. Wybór do kontroli jakości
6. Potwierdzenie przez barwienie jądrowe
UWAGA: Dla dalszego udoskonalenia wyizolowanych oocytów, zastosowano barwienie za pomocą Hoechst 33342 w celu identyfikacji i usunięcia pojedynczych oocytów z komórkami ziarnistymi, które mogły zostać pominięte w poprzednim kroku.
Rysunek 1 ilustruje morfologię jajników obserwowaną zarówno u dorosłych, jak i młodych danio pręgowanych, prezentując oocyty w różnych stadiach rozwoju, aby służyć jako punkt odniesienia. Rysunek 1A przedstawia graficzne przedstawienie morfologii i wielkości oocytów na każdym etapie rozwoju, zaczynając od pierwotnego etapu wzrostu (etap I), a kończąc na owulacji komórki jajowej (etap V). Ryciny 1Ai-v ilustrują średnice odpowiadające etapom od I do V oocytów. Rysunek 1B (lewy panel) wyświetla obrazy jajników u młodych ryb (6 wpf z SL = 1,5 cm). Warto zauważyć, że młodzieńczy jajnik wykazuje wyraźny wygląd zrazikowy, charakteryzujący się przede wszystkim dużą ilością przezroczystych oocytów w stadium I, którym towarzyszy mniejsza populacja oocytów w stadium II. To rozpowszechnienie oocytów w stadium I znacznie ułatwia ich obserwację i pobieranie. Prawy panel przedstawia morfologię jajnika dorosłej ryby (6 miesięcy), w którym można zaobserwować oocyty w różnych stadiach rozwoju. Jednak w jajniku dominują nieprzezroczyste oocyty w późnym stadium (stadium II-III).
Rysunek 2 ilustruje reprezentatywne procesy od rozbioru do uzyskania czystych komórek jajowych I stopnia. Rysunek 3 przedstawia oocyty I stopnia uzyskane zarówno metodą referencyjną, jak i metodą zmodyfikowaną. Po barwieniu metodą Hoechst jądra komórek oocytu i ziarnistości wykazywały niebieską fluorescencję w świetle UV. Na obrazach uzyskanych metodą referencyjną (Ryc. 3A) powierzchnia oocytów była gęsto otoczona licznymi barwionymi jądrami komórek ziarnistych. W przeciwieństwie do tego, oocyty w stadium I oddzielone zmodyfikowaną metodą (Ryc. 3B) wykazują pełną ekspozycję i czystość, bez obecności zabarwienia jąder komórek ziarnistych.
Nasze odkrycia wykazały skuteczność proponowanej metody izolowania oocytów pierwszego stopnia. Proces rozwoju oocytów u ryb teleost wykazuje kilka wspólnych cech7. Aby ocenić możliwość zastosowania tego zjawiska między gatunkami, przeprowadzono dalsze analizy na innych gatunkach ryb. Samice bocji stawowych pozyskano z lokalnego targu, a oocyty we wczesnym stadium (średnica <100 μm) wyizolowano zgodnie z tą samą procedurą. Skład jajnikowy bocji stawowej wykazywał również mieszaninę oocytów w wielu stadiach rozwojowych, charakteryzujących się uderzającym podobieństwem pod względem morfologii i wielkości oocytów do jaj danio pręgowanego w tym samym stadium. Jak pokazano w Rysunek 4A, jajniki dorosłej samicy bocji stawowej były zdominowane przez nieprzezroczyste późne oocyty przeplatane przezroczystymi wczesnymi oocytami. Na powierzchni oocytów zaobserwowano przezroczystą monowarstwę komórek ziarnistych. Zgodnie z naszymi obserwacjami u danio pręgowanego, oocyty bocji o średnicy mniejszej niż 100 μm odpowiadały etapowi poprzedzającemu stadium diplotenu. Rysunek 4B przedstawia oocyty czystej loachy (Misgurnus anguillicaudatus) uzyskane zmodyfikowaną metodą. W porównaniu z jajnikami danio pręgowanego, jajniki bocji stawowej są trudniejsze do dysocjacji. Po 6-7 godzinach trawienia dochodzi do dysocjacji komórek jajowych we wczesnym stadium. Niemniej jednak, to zmodyfikowane podejście dało pożądane czyste i nagie oocyty. Danio pręgowany należy do rodziny karpiowatych, podczas gdy bocje stawowe zaliczane są do rodziny zespolonych (Cobitidae). Te dwie rodziny wykazują odległe pokrewieństwo taksonomiczne, ale ich etap rozwoju jajników i morfologia są niezwykle podobne, co wskazuje, że metoda ta może być ogólnie wykorzystywana do analizy oocytów różnych gatunków ryb.

Rysunek 1: Reprezentatywne obrazy jajników i oocytów danio pręgowanego na różnych etapach. (A) Morfologia i wielkość oocytów na każdym etapie rozwoju (St). i-v reprezentuje obrazy i średnicę oocytów od stadium I do V. Podziałka = 200 μm. (B) Morfologia jajników dorosłego i młodocianego danio pręgowanego. Podziałka = 500 μm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Reprezentatywne obrazy procedury izolacji, od sekcji do pobrania czystych oocytów etapu I. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Oocyty I stopnia uzyskane dwiema metodami. (A) Oocyty etapu (St) I wyizolowane za pomocą wspomnianej metody. (B) Oocyty stadium I wyizolowane metodą zmodyfikowaną. Jądra komórek oocytu i ziarnistości wybarwiono preparatem Hoechst i wzbudzono światłem UV. Podziałka = 100 μm. BF = jasne pole. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Oocyty we wczesnym stadium z bocji stawowej uzyskane zmodyfikowaną metodą. (A) Reprezentatywne obrazy jajnika i oocytów bocjusza stawowego. I, II reprezentują jajniki bocji stawowych pod różnymi powiększeniami, a III-IV reprezentują oocyty bocji stawowych we wczesnym stadium. Podziałka liniowa: i (500 μm); ii (200 μm); III, IV (100 μm). (B) Oocyty we wczesnym stadium wyizolowane z bocji stawowej. Oocyty i jądra komórek ziarnistych barwiono preparatem Hoechst i wzbudzano światłem UV. Podziałka = 100 μm. BF = jasne pole. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
W tym badaniu opracowaliśmy metodę izolowania czystych i czystych oocytów I stopnia, z wyłączeniem komórek ziarnistych, do dalszej analizy (w szczególności analiz genomowych). Porównując tę zmodyfikowaną metodę z przywołaną metodą13, oocyty I stopnia uzyskane tą metodą są morfologicznie nienaruszone, w wystarczającej liczbie i wolne od zanieczyszczenia innymi komórkami somatycznymi, co czyni je odpowiednimi do różnych późniejszych badań i analiz. Ponadto, w porównaniu z innymi metodami separacji mechanicznej14,15, ulepszona metoda jest prostsza w obsłudze, ułatwia pozyskanie większej liczby oocytów i zapobiega uszkodzeniom oocytów.
Co więcej, oprócz skutecznego izolowania oocytów danio pręgowanego w stadium I, metoda ta może być również stosowana do bocji stawowych, co wskazuje na jej szerokie zastosowanie wśród różnych gatunków ryb. W celu zbadania wpływu zanieczyszczenia komórek ziarnistych na ekspresję genów i analizę epigenetyczną przeprowadziliśmy sekwencjonowanie RNA (RNA-seq) oraz analizę CUT&Tag na oocytach uzyskanych metodą referencyjną i zmodyfikowaną. Chociaż kilka genów o zróżnicowanej ekspresji zostało zidentyfikowanych za pomocą sekwencji RNA, niektóre geny, które były specyficznie wyrażane w komórkach ziarnistych, zostały nadal zidentyfikowane (dane nie pokazane). Analiza wykazała również istotne różnice w modyfikacjach histonów między oocytami izolowanymi różnymi metodami (dane nie pokazane). Wyniki te podkreślają znaczenie tej metody w całkowitym oddzieleniu oocytów i komórek ziarnistych w celu dokładnej ekspresji genów i analizy epigenetycznej.
Podczas wdrażania proponowanej metody należy zwrócić uwagę na kilka aspektów: (1) Wybór odpowiedniej wielkości danio pręgowanego ma kluczowe znaczenie. Zapewnia to uzyskanie wystarczającej ilości oocytów i ogranicza kolejne etapy mycia. Jajniki danio pręgowanego o średnicy SL <10 mm nie zapewniają wystarczającej liczby oocytów, co wymaga większej liczby ryb, aby spełnić wymagania dotyczące pobierania próbek i zwiększa presję hodowlaną. I odwrotnie, danio pręgowany z SL większym niż 15 mm wykazuje stopniowe tworzenie oocytów w stadium II-III, których błony łatwo pękają podczas reakcji trawienia. (2) W przypadku wykorzystywania większych ryb wyciek zawartości komórek wynikający z uszkodzonych oocytów może prowadzić do zanieczyszczenia, a tym samym do pewnego stopnia zahamować reakcję trawienia. W takich przypadkach zaleca się usunięcie starego buforu trawiennego, przemycie go L-15, a następnie dodanie nowego roztworu dysocjacji komórek Kingera w celu dalszego trawienia. (3) Jeśli dostępny jest odpowiedni sprzęt, potrząsanie podczas trawienia może zwiększyć separację.
W kroku 3.1 mniejsze komórki ziarniste mogą towarzyszyć oocytom przez sitko komórkowe. Obserwacje praktyczne wskazują jednak, że końcowa próbka pobranej oocytów nie zawiera komórek ziarnistych. Z wyjątkiem przypadków, w których niepełne trawienie skutkowało obecnością resztkowych komórek ziarnistych w niektórych oocytach, w systemie nie wykryto żadnych innych komórek ziarnistych znakowanych Hoechstem. W tym przypadku postawiliśmy hipotezę, że komórki ziarniste, będąc mniejsze i lżejsze, mogą pozostać zawieszone w pożywce hodowlanej, a następnie zostały usunięte podczas wielu etapów mycia. Skuteczność izolacji określono również ilościowo, obliczając proporcję oocytów z przyłączonymi komórkami ziarnistymi i czystych oocytów po barwieniu metodą Hoechst. Odsetek czystych oocytów do 98% zaobserwowano w próbkach zawierających 1000 oocytów.
Pomimo wielu zalet, proponowane podejście miało również pewne godne uwagi ograniczenia. Po pierwsze, metoda ta została zwalidowana pod kątem ekstrakcji DNA lub RNA, sekwencjonowania i natychmiastowego wykrywania nienaruszonych żywych komórek, ale wykonalność i niezawodność rozszerzenia na inne obszary testowe nie zostały jeszcze potwierdzone. Kolejnym ograniczeniem jest to, że proponowana metoda może być stosowana tylko do izolacji oocytów pierwszego stopnia, ponieważ skuteczność izolacji dla innych etapów jest niezadowalająca. W związku z tym konieczne są dodatkowe wysiłki w celu poprawy skuteczności i możliwości zastosowania proponowanej metody. Ponadto przyszłe badania powinny koncentrować się na ustaleniu, czy proponowaną metodę można zastosować do skutecznego izolowania oocytów od innych etapów, rozszerzając tym samym jej zastosowanie.
Autorzy nie mają nic do ujawnienia.
Ta praca była wspierana przez Narodową Fundację Nauk Przyrodniczych Chin (32170813 i 31871449) oraz Departament Nauki i Technologii Sychuanu (2024NSFSC0651), a także projekt 1·3·5 dla dyscyplin doskonałości - Fundusz Badań Klinicznych, Szpital Zachodniochiński, Uniwersytet Sichuan (2024HXFH035). Autorzy pragną podziękować Zhao Wangowi i Yanqiu Gao z Laboratorium Chirurgii Dziecięcej za hodowlę danio pręgowanego związaną z tą pracą. Autorzy pragną również podziękować wszystkim recenzentom, którzy wzięli udział w recenzji, a także firmie MJEditor (www.mjeditor.com) za zapewnienie usług redakcji w języku angielskim podczas przygotowywania tego manuskryptu.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| Roztwór do dysocjacji komórek Kingera | PlantChemMed | PC-33689 | Roztwór dysocjacji komórek Kingera może być stabilnie przechowywany w temperaturze -20 & stopni; C po zapakowaniu i może być stosowany po rozmrożeniu w niskiej temperaturze (4 ° C). Może być stosowany bezpośrednio do dysocjacji jajników danio pręgowanego. Optymalna temperatura to 28,5 ° C, przez około 2-3 godziny. Czas trwania można dostosować do konkretnych warunków dysocjacji, skrócony lub wydłużony (https://www.plantchemmed.com/chanpin?productNo=PC-33689). |
| Sitka do komórek (100 μ m ) | Mikroskop | 352360 | |
| Zeiss | Axio Zoom.V16 | ||
| Kleszcze | Dumont | #5 | |
| Szklana igła kapilarna | / | / | Stępiona przez spalenie zapalniczką |
| Hoechst | Yesen | 40732ES03 | |
| Końcówki do pipet o niskiej adsorpcji (10 μ l ) | Labsellect | T-0010-LR-R-S | |
| Leibovitz' s L-15 medium medium (z L-glutaminą) | Hyclon | SH30525.01 | |
| Wiadro na lód | / | / | Lodowata woda służy do eutanazji danio pręgowanego |
| Inkubator | WIGGENS | WH-01 | |
| Młodociane ryby | / | / | 5– 6 tygodni po zapłodnieniu, standardowa długość [SL] 10– |
| Naczynie plastikowe 15 mm (35 mm) Mikroskop | SORFA | ||
| Motic | SMZ-161 | ||
| Płytka do hodowli tkankowych (6-dołkowa) | Nożyczki sprężynowe SORFA | 0110006 | |
| Vannas | Fine Science Toosl | #15000-00 |
Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE
Poproś o pozwolenie