Powstawanie skrzepliny po ranach kłutych, która prowadzi do zatamowania krwawienia, jest jednym z najważniejszych wydarzeń w życiu1. Jednak pomimo tej istotności, wiedza na temat tego, co zachodzi strukturalnie podczas tworzenia skrzepliny, czy to w żyle, tętnicy, zdarzeniu miażdżycowym czy skrzepie okluzyjnym, była ograniczona rozdzielczością i głębokością obrazowania. Konwencjonalna mikroskopia świetlna ma ograniczoną głębokość w porównaniu z w pełni uformowaną skrzepliną po nakłuciu, od 200 do 300 μm w klasie Z1, oraz poziom rozdzielczości w porównaniu z rozmiarem organelli płytkowych i ich odstępami, często mniejszymi niż 30 nm2. Mikroskopia światła dwufotonowego może zapewnić wymaganą głębię obrazowania, ale nie poprawia znacząco rozdzielczości. Najnowsze osiągnięcia mikroskopii świetlnej, na przykład techniki superrozdzielcze, są nadal ograniczone rozdzielczością, w praktyce ~20 nm w XY i dwa razy więcej w Z, oraz ograniczoną głębokością, nie większą niż konwencjonalna mikroskopia świetlna. Co więcej, mikroskopia świetlna o wysokiej rozdzielczości, podobnie jak większość mikroskopii świetlnej w badaniach, opiera się na mikroskopii fluorescencyjnej, technice, która jest z natury stronnicza w stosunku do małego zestawu białek kandydujących, dla których istnieją dobre przeciwciała lub dobrze oznaczone konstrukty3. Podsumowując, konwencjonalna skaningowa mikroskopia elektronowa może co najwyżej uwidocznić powierzchnię tworzącej się skrzepliny bogatopłytkowej.
Aby przezwyciężyć te techniczne ograniczenia w charakterystyce struktury skrzepliny, mieliśmy trzy cele. Po pierwsze, w sposób powtarzalny należy wytworzyć zdefiniowaną ranę kłutą w żyle lub tętnicy myszy, którą można następnie łatwo ustabilizować in situ za pomocą utrwalenia chemicznego. Po drugie, należy zastosować procedurę przygotowawczą, która kładzie nacisk na zachowanie błony, co jest celem zgodnym z celem określenia pozycji poszczególnych płytek krwi w tworzącej się skrzeplinie. Po trzecie, użyj bezstronnej techniki wizualizacji, którą na pojedynczym obrazie można skalować od skali nanometrowej do prawie milimetrowej.
Zmontowana, szerokoobszarowa mikroskopia elektronowa została wybrana jako główna technika wizualizacji końcowej z jednego ważnego powodu: w obrazowaniu mikroskopem elektronowym można zobaczyć szeroki wachlarz cech w komórce, które zarysowują jej organelle i cechy w organellach. Można rozpoznać małe obiekty, takie jak rybosomy. Ten zakres cech jest widoczny, ponieważ gęste od elektronów plamy metali ciężkich, uranylu, ołowiu i osmu, które są używane w mikroskopii elektronowej w celu uzyskania kontrastu, wiążą się z szeroką gamą cząsteczek. Na obrazie z mikroskopu elektronowego widać wiele z tego, co tam jest, podczas gdy w przypadku podejścia immunofluorescencyjnego i znakowania białek widzi się tylko to, co się świeci. Oznacza to na przykład miejsca antygenowe obecne na danym gatunku białka. W przypadku znakowanej cząsteczki, często białka, jest to miejsce (miejsca), w którym znajduje się to białko. Wszystkie inne cząsteczki są ciemne i nie świecą. Czy jednak taki wybór mikroskopii elektronowej jest praktyczny? Zakrzep po ukłuciu ma rozmiar 300 na 500 μm, a przy rozmiarze piksela 3 nm jest to obraz o wymiarach 100 000 na 167 000 pikseli. Wysokiej jakości kamera mikroskopu elektronowego ma 4000 na 4000 pikseli. Oznacza to, że około 1000 klatek musi zostać zszytych/zmieszanych, aby uzyskać pojedynczy obraz. Jest to możliwość, która była obecna w większości mikroskopów elektronowych wyprodukowanych w ciągu ostatnich 15 lat. Stolik mikroskopowy jest skomputeryzowany, a obrazy można zszywać ze sobą za pomocą komputera. Jest to przesłanka, która doprowadziła do wyborów leżących u podstaw sformułowania przedstawionego protokołu.
Podsumowując, poniżej przedstawiamy serię kroków, które dają powtarzalną ranę w żyle lub tętnicy myszy, które następnie, po krokach fiksacji in situ, a następnie etapach osadzania, mogą być wizualizowane przez zmontowaną, szerokoobszarową transmisyjną mikroskopię elektronową w skali nm i na zszytym obrazie wizualizowanym w skali bliskiej mm, skali rzeczywistego in situ Naprawiono skrzeplinę. Skalowalność tego rodzaju jest niezbędna do zrozumienia powstawania skrzeplin zarówno jako problemu w hematologii/zdrowiu, jak i jako systemu biologii rozwojowej, w którym płytki krwi są głównym typem komórek. Postęp ten ma jedną główną zaletę mikroskopii elektronowej, a mianowicie, że widzi się to, co jest, a nie tylko to, co się świeci. Aby zapoznać się ze szczegółowym protokołem przygotowania próbek do mikroskopii elektronowej ze skaningiem szeregowym (SBF-SEM), czytelnik jest kierowany do niedawnego artykułu Joshi et al.4.