Procedura ta zaoferowała produktywny sposób na zwiększenie liczby naiwnych limfocytów T CD4 + T śledziony myszy do produkcji in vitro patogennych komórek Th17. Chociaż używamy więcej cytokin niż inne zgłoszone pożywki do hodowli komórek Th17, jesteśmy zaangażowani w optymalizację warunków wzrostu patogennych komórek Th17. Rozważamy dalszą optymalizację naszego protokołu różnicowania indukowanego.
W tym przypadku po prostu użyliśmy cytometrii przepływowej i qPCR do zbadania produkcji charakterystycznych cytokin. Z kilkoma niewielkimi modyfikacjami, podejście to może być również stosowane do innych testów funkcjonalnych, takich jak proliferacja komórek.
Użyliśmy wyprodukowanego w Chinach zestawu do izolacji limfocytów do izolacji limfocytów śledziony myszy, ponieważ jest on skuteczny i oszczędza czas. Rozwiązania do separacji limfocytów oparte na innych markach mogą również osiągnąć cel separacji limfocytów śledziony myszy na różnych etapach. Inną metodą jest bezpośrednia liza czerwonych krwinek uzyskanej zawiesiny komórek śledziony; Odkryliśmy jednak, że czerwone krwinki śledziony często nie mogą być poddawane lizie w tym samym czasie.
Podczas wykonywania tego protokołu mogą wystąpić pewne problemy. Po pierwsze, liczba naiwnych limfocytów T CD4 + uzyskanych przez sortowanie magnetyczne kulek może być bardzo niska (krok 3 protokołu). Można to przypisać niewystarczającemu procesowi miażdżenia narządów. Ważne jest, aby upewnić się, że narząd jest odpowiednio homogenizowany. Zwiększenie częstotliwości płukania podczas procesu homogenizacji poprawi wskaźnik odzysku. Aby uzyskać większą liczbę naiwnych limfocytów T CD4 + śledziony, sugerujemy użycie młodszych myszy (w wieku 6-10 tygodni). Dostępne są różne metody oddzielania limfocytów śledziony, a wydajność może się różnić w zależności od użytego płynu separacyjnego. Zaleca się stosowanie uniwersalnie certyfikowanego płynu separacyjnego i próbę ekstrakcji warstwy limfocytów w jak największym stopniu.
Po drugie, proporcja limfocytów T CD4 + w cytometrii przepływowej może wynosić <80% (krok protokołu 5). Jedną z możliwych przyczyn tego problemu może być niedokładna liczba splenocytów, co skutkuje liczbą komórek większą niż w przypadku dodatkowego koktajlu przeciwciał i kulek magnetycznych. Aby zwiększyć skuteczność naiwnego oczyszczania limfocytów T CD4+ , liczenie komórek musi być precyzyjne. Dodatkowo można użyć o 10% więcej koktajlu przeciwciał i kulek magnetycznych w stosunku do tego, co zaleca ten protokół. Wreszcie, cytometrię przepływową można wykonać natychmiast po posortowaniu naiwnych limfocytów T CD4 + .
Po trzecie, podczas hodowli może nie powstać wiele skupisk limfocytów T, a większość komórek mogła umrzeć podczas różnicowania limfocytów T (krok 4 protokołu). Potencjalną przyczyną tego problemu może być niedokładne określenie liczby komórek dla naiwnych limfocytów T CD4 + przed wysiewem, co skutkuje niską gęstością komórek. Zaleca się przyjęcie dokładniejszej metody liczenia, aby osiągnąć pożądaną gęstość komórek około 4 × 105 komórek/ml na każdą studzienkę w płytce 48-dołkowej. Inną możliwą przyczyną mogą być problemy techniczne z inkubatorem CO2 , takie jak nieprawidłowa temperatura lub stężenie CO2 . Wreszcie, nadmierna siła podczas zmiany pożywki do hodowli komórkowej może potencjalnie spowodować śmierć komórki.
Po czwarte, względne poziomy ekspresji genów cytokin sygnatury mogą być niskie (krok 7 protokołu). Aby zapewnić autentyczność wyekstrahowanego RNA, zaleca się stosowanie stężenia wykrywającego nanokropelki większego niż 100 ng/ml. Potencjalną przyczyną spadku stężenia może być niezdrowy charakter hodowanych komórek, np. duża część pobranych komórek jest martwa lub w trakcie śmierci. Aby uzyskać prawdziwe stężenie RNA, konieczne jest rozwiązanie sytuacji, która może prowadzić do słabego wzrostu podczas hodowli komórek. Alternatywnym powodem tego problemu może być zbyt niska końcowa liczba komórek osiągnięta podczas ekstrakcji RNA, prawdopodobnie z powodu niezamierzonej utraty komórek podczas usuwania supernatantu. Korzystne może okazać się zastosowanie zaawansowanych technik ekstrakcji RNA, takich jak jednoetapowe zestawy do ekstrakcji RNA. Idealny stosunek OD260/OD280, mierzony za pomocą Nanodrop, powinien mieścić się w zakresie 1,9-2,1. W przypadku zbyt niskiego współczynnika możliwe staje się zanieczyszczenie białkami. Zwiększenie częstotliwości mycia wolnych od RNaz może pomóc w złagodzeniu tego problemu. I odwrotnie, nietypowo niski stosunek implikuje potencjalną degradację RNA. Aby przeciwdziałać temu problemowi, zaleca się stosowanie wody wolnej od RNaz i użycie probówek o pojemności 1,5 ml do celów dekontaminacji RNazy.
Podsumowując, obecny protokół opisuje zastosowanie nowej pożywki do hodowli komórkowych w celu bezpośredniego indukowania naiwnych limfocytów T CD4 + do różnicowania się w patogenne komórki Th17 in vitro. W porównaniu z separacją bezpośrednią nie ma wątpliwości, że ta metoda jest bardziej bezpośrednia, niedroga i bardziej wydajna. Konfiguracja pożywki jest również bardzo prosta, dzięki czemu zbudowane komórki Th17 mogą być bardziej intuicyjnie wykorzystywane do kolejnych eksperymentów, stanowiąc bardzo dobry model komórkowy do badania wielu chorób.