W tym manuskrypcie zastosowano dwie metody do wykrywania śmierci makrofagów THP-1 różnicowanych przez PMA i ATP. Zastosowano podwójne barwienie aneksyną V/7-AAD, a wyniki analizowano za pomocą cytometrii przepływowej z barwienia ogólnego. Podobnie jak w przypadku innych analiz cytometrii przepływowej, grupa niebarwionych komórek i dwie grupy pojedynczych komórek zostały skonfigurowane w celu wykluczenia wyników fałszywie dodatnich i fałszywie ujemnych. Wyniki pokazują, że po stymulacji LPS/ATP kilka komórek utraciło integralność błony, co wskazuje, że mogło dojść do śmierci komórki. Ta metoda wykrywania pozwala nam ocenić śmierć komórek z całych komórek. Warto zauważyć, że podwójne barwienie Aneksyną V/7-AAD nie jest wystarczające do rozróżnienia między piroptozą, apoptozą i nekroptozą. We wczesnych stadiach tych trzech form PS będzie wystawiony na zewnątrz błony plazmatycznej, a barwienie aneksyną V jest dodatnie. Integralność błony zostaje utracona w późnym stadium tych trzech form, a wyniki barwienia wykazują podwójnie dodatnie barwienie. Dlatego użyliśmy SEM, aby dalej obserwować możliwe formy śmierci komórki, które mogą wystąpić.
W apoptozie dochodzi do tworzenia się porów BAX/BAK na zewnętrznej błonie mitochondrialnej, a następnie kurczenia się komórek i pęcherzenia błony komórkowej. Nekroptoza wykorzystuje MLKL do otwierania porów w błonie komórkowej, podczas gdy sygnał piroptozy aktywuje gasderminę do tworzenia porów w błonie komórkowej. Warto zauważyć, że zarówno piroptozy, jak i nekroptozie towarzyszy pęknięcie błony komórkowej w końcowym etapie. Jednak pory gasederminy są znacznie większe niż pory MLKL, więc pory gasderminy nie mają selektywności jonowej. Komórki nekroptotyczne wykazują znaczny obrzęk morfologii15. Ostatecznie kończą się pęknięciem błony. Niezależnie od szlaku sygnałowego poprzedzającego aktywację przepuszczalności błony komórkowej, zmiany w błonie komórkowej towarzyszą tym trzem formom śmierci komórki. Użyliśmy SEM do dalszej obserwacji błony komórkowej, która zapewnia intuicyjny sposób badania śmierci komórki. Zaobserwowaliśmy cechy piroptozy, w tym pęcherzyki błonowe i błonę pękającą oraz nekroptozę, w tym obrzęk komórek i błonę pękającą, zgodne z cechami badanymi przez poprzednich badaczy15. Zaobserwowaliśmy pęcherzyki błonowe i kurczenie się komórek, zgodne z charakterystyką apoptozy badaną przez poprzednich badaczy16.
W poprzednich badaniach połączenie LPS i ATP było często stosowane do wywoływania piroptozy. Co ciekawe, zaobserwowaliśmy cechy apoptozy i nekroptozy. Chociaż wszystkie trzy formy mogą wystąpić w śmierci komórki wywołanej przez LPS/ATP, wcześniejsze badania wykazały, że piroptoza pozostaje dominującym sposobem śmierci. LPS jest jednym z najbardziej scharakteryzowanych wzorców molekularnych związanych z patogenami. ATP uwalniane z umierających komórek, ma wysokie stężenie w komórce. Zewnątrzkomórkowe ATP jest jednym z niebezpiecznych wzorców molekularnych17. LPS/ATP to klasyczna dwuetapowa metoda stymulacji w celu wywołania piroptozy. Badania wykazały, że dodanie ATP do komórek stymulowanych przez LPS może szybko aktywować kaspazę-118, podczas gdy wyciszenie genu kaspazy-1 może znacząco odwrócić śmierć komórki wywołaną przez LPS / ATP19. W poprzednich badaniach stwierdziliśmy również indukowaną przez LPS / ATP aktywację apoptotycznych i nekroptotycznych białek docelowych 20,21. Chociaż LPS/ATP jest klasycznym induktorem piroptozy, może również indukować apoptozę i nekroptozę.
W rzeczywistości te trzy formy często nie istnieją niezależnie, a przesłuchy między etapami sygnału. Na przykład białka gasderminy celują w mitochondria, aby promować uwalnianie cytochromu c w celu wzmocnienia mitochondrialnego szlaku apoptotycznego22. Aktywacja kaspazy-3 może rozszczepić gasderminę E, a następnie wywołać piroptozę23. Badanie sugeruje, że sygnalizacja MLKL / PIPK3 jest zaangażowana w aktywację inflamasomów NLRP324. Ta złożona interakcja doprowadziła do koncepcji PANoptosis, zdefiniowanej jako zapalny szlak zaprogramowanej śmierci komórki regulowany przez kompleks PANoptosome z kluczowymi cechami piroptozy, apoptozy i / lub nekroptozy, których nie można wyjaśnić samodzielnie przez żaden z tych zaprogramowanych szlaków śmierci komórki25. Gdy zaproponowano koncepcję PANoptosis, naukowcy opisali występowanie zaprogramowanej śmierci komórki w bardziej kompleksowy sposób, co również podkreśla złożoność programowanej śmierci komórki. Wskazuje to jednocześnie na ograniczenia tej metody badawczej. Chociaż piroptoza jest uważana za dominującą w śmierci komórki wywołanej przez LPS/ATP, nie można określić proporcji tych form śmierci ani tego, czy wszystkie istnieją, nawet obejmując inne formy zaprogramowanej śmierci. Może to być obszar do zbadania w przyszłości.
Protokół ten opiera się na śmierci makrofagów wywołanej przez LPS i ATP. Opisaliśmy metodę testowania od całości do jednostki, która ma również zastosowanie do innych modeli i komórek. Wyniki wskazują, że komórki mogły zostać poddane pyroptozie, apoptozie lub nekroptozie, która nie ogranicza się do piroptozy, pomagając naukowcom lepiej zrozumieć śmierć komórki po stymulacji LPS i ATP oraz wybrać lepszą metodę eksperymentalną. W poprzednich badaniach podwójne barwienie aneksyną V / 7-AAD lub aneksyną V / PI było powszechnie stosowane do wskazania wystąpienia apoptozy26, 27, niektórzy badacze używali go również do badania apoptozy28. W rzeczywistości nie możemy rozróżnić między trzema typami śmierci komórek poprzez te podwójne barwienie. Protokół ten przypomina badaczom, zwłaszcza początkującym, że podwójne barwienie aneksyną V/7-AAD lub aneksyną V/PI nie może określić jakościowo typu śmierci komórki. Może jedynie pokazywać uszkodzenie i śmierć komórki jako całość lub wskazywać, że komórka mogła przejść jakąś formę śmierci. W bardziej ukierunkowanych badaniach konieczne jest wprowadzenie grupy kontrolnej, która hamuje inne zgony, aby pokazać, że definitywnie śmierć programowa jest na wyciągnięcie ręki. Podobnie, dalsze badania mechanistyczne będą dotyczyły krytycznych celów różnych zaprogramowanych zgonów.
Ponadto, w trakcie przygotowań do eksperymentu, stwierdziliśmy, że obecnie istnieje wiele szczegółowych procedur eksperymentalnych dla SEM komórek adherentnych, z niewielkim opisem komórek zawieszonych. W tym miejscu przedstawiamy bardziej szczegółowy opis metody przygotowania próbki do komórek zawieszonych. Krok 5.5 jest niezbędnym krokiem, aby pomóc w unieruchomieniu zawieszonych komórek na szkiełkach komórkowych. Kolejne operacje należy wykonywać delikatnie, aby zapobiec oderwaniu się komórek. Oprócz roztworu ałunu chromowego, poli-L-lizyna może również unieruchamiać komórki.