Ten protokół opisuje skuteczną metodę ilościowego wykrywania uszkodzeń oksydacyjnych DNA w komórkach MCF-7 za pomocą technologii ELISA.
Subskrypcja JoVE jest wymagana do oglądania tego materiału. Zaloguj się lub rozpocznij bezpłatny okres próbny.
Artykuł metodologiczny
* These authors contributed equally
Ten protokół opisuje skuteczną metodę ilościowego wykrywania uszkodzeń oksydacyjnych DNA w komórkach MCF-7 za pomocą technologii ELISA.
zasada 8-Oxo-7,8-dihydro-2'-deoksyguanozyny (8-oxo-dG) jest dominującą formą powszechnie obserwowanego uszkodzenia oksydacyjnego DNA. Upośledzenie DNA głęboko wpływa na ekspresję genów i służy jako kluczowy czynnik stymulujący zaburzenia neurodegeneracyjne, raka i starzenie się. W związku z tym precyzyjna kwantyfikacja 8-oxoG ma znaczenie kliniczne w badaniach nad metodologiami wykrywania uszkodzeń DNA. Jednak obecnie istniejące podejścia do wykrywania 8-oxoG stanowią wyzwanie pod względem wygody, celowości, przystępności cenowej i zwiększonej czułości. Zastosowaliśmy technikę testu immunoenzymatycznego sprzężonego z enzymem kanapkowym (ELISA), wysoce wydajną i szybką metodę kolorymetryczną, do wykrycia zmian w zawartości 8-okso-dG w próbkach komórek MCF-7 stymulowanych różnymi stężeniami nadtlenku wodoru (H2O2). Określiliśmy stężenieH2O2, które indukowało uszkodzenie oksydacyjne w komórkach MCF-7, wykrywając jego wartość IC 50 w komórkach MCF-7. Następnie potraktowaliśmy komórki MCF-7 0, 0,25 i 0,75 mM H2O2 przez 12 godzin i wyekstrahowaliśmy 8-oxo-dG z komórek. Na koniec próbki poddano testowi ELISA. Po wykonaniu szeregu etapów, w tym rozprowadzania płytki, mycia, inkubacji, opracowywania koloru, zakończenia reakcji i zbierania danych, z powodzeniem wykryliśmy zmiany w zawartości 8-okso-dG w komórkach MCF-7 indukowane przezH2O2. Dzięki takim wysiłkom dążymy do ustalenia metody oceny stopnia uszkodzeń oksydacyjnych DNA w próbkach komórkowych, a tym samym do przyspieszenia rozwoju bardziej celowych i wygodnych podejść do wykrywania uszkodzeń DNA. Przedsięwzięcie to może wnieść znaczący wkład w eksplorację analiz asocjacyjnych między uszkodzeniami oksydacyjnymi DNA a różnymi dziedzinami, w tym badaniami klinicznymi nad chorobami i wykrywaniem substancji toksycznych.
Uszkodzenie oksydacyjne DNA jest konsekwencją braku równowagi między generacją reaktywnych form tlenu (ROS) a komórkowym systemem obrony antyoksydacyjnej1. Polega przede wszystkim na utlenianiu zasad DNA, purynowych i pirymidynowych2,3. Ta oksydacyjna modyfikacja zasad DNA nie tylko zagraża integralności genomu, ale także obejmuje szeroki zakres problemów patologicznych, w tym raka, choroby neurodegeneracyjne i choroby sercowo-naczyniowe4,5. Baza guaninowa w DNA ma najniższy potencjał redukcyjny i jest najbardziej podatna na utlenianie6. Dlatego 8-okso-7,8-dihydro-2'-deoksyguanozyna (8-oxo-dG) służy jako podstawowy marker do oceny stopnia uszkodzenia oksydacyjnego DNA7,8. Dokładna kwantyfikacja 8-oxo-dG stała się kluczową kwestią w odniesieniu do różnych aspektów występowania choroby, progresji i oceny wieloczynnikowego obciążenia oksydacyjnego9.
Tradycyjne metody wykrywania 8-oxo-dG, takie jak wysokosprawna chromatografia cieczowa z detekcją elektrochemiczną (HPLC-ECD), spektrometria mas i pokrewne techniki z łącznikami, wykazują wysoką czułość i specyficzność10,11,12. Jednak techniki te często wiążą się ze złożonymi wymaganiami operacyjnymi i wysokimi kosztami, co utrudnia ich szerokie zastosowanie i praktyczność w wysokoprzepustowej analizie próbek. Wraz z ciągłym postępem nauki i technologii pojawiło się wiele nowych, wydajnych i dokładnych metod. Zastosowanie tych nowych technologii umożliwia nam dokładniejsze ilościowe określenie poziomu 8-oxo-dG i zapewnia bardziej zaawansowane narzędzia do dogłębnego badania związku między stresem oksydacyjnym a chorobami. Na przykład naukowcy zastosowali technologię nanoporów do ilościowego wykrywania i sekwencjonowania DNA13, identyfikowania typów uszkodzeń DNA za pomocą strategii sekwencjonowania kodu jednym kliknięciem14, opracowywania metod sekwencjonowania o wysokiej przepustowości i tworzenia bioczujników opartych na 8-oxoG poprzez integrację biotyny-streptawidyny z ELISA15. Wśród nich test ELISA, ze swoimi uznanymi zaletami pod względem swoistości, wysokoprzepustowych badań przesiewowych i kosztów, jest jednym z idealnych rozwiązań do wykrywania 8-oxo-dG. Dlatego tak ważne jest opracowanie wysokoprzepustowej, wysoce czułej, wygodnej i szybkiej metody wykrywania 8-oxo-dG.
Technika testu immunoenzymatycznego (ELISA), opracowana w 1971 roku16, szybko się rozwinęła w ciągu ostatnich 50 lat i stała się obecnie jedną z najczęściej stosowanych metod wykrywania w dziedzinie biologii i medycyny17,18,19. Technologia ELISA charakteryzuje się wysoką czułością i swoistością, krótkim czasem reakcji i jest łatwa w użyciu, co czyni ją powszechnie uznawanym wyborem do badań próbek na dużą skalę i analizy o wysokiej przepustowości20. W rezultacie, test ELISA jest szeroko stosowany do ilościowej lub półilościowej analizy związków, białek, przeciwciał lub cząsteczek w komórkach21,22,23. Na przykład został wykorzystany do wykrywania biomarkerów związanych z różnymi chorobami, pozostałościami leków i biomolekułami24. Testy ELISA można podzielić na cztery główne typy w oparciu o projekt eksperymentalny i zasady25. Metody te obejmują bezpośredni test ELISA, pośredni test ELISA, test ELISA typu sandwich oraz konkurencyjny test ELISA26,27. Spośród nich do badania w tym artykule wybrano test ELISA, który wykorzystuje dwa specyficzne przeciwciała, jedno do wychwytywania cząsteczki docelowej, a drugie do wykrywania. Zasada eksperymentalna testu ELISA typu sandwich jest następująca: Po pierwsze, specyficzne przeciwciało jest unieruchamiane w studzienkach mikropłytki w celu wychwycenia interesującego analitu. Po dodaniu wzorca lub próbki docelowy analit wiąże się z unieruchomionym przeciwciałem. Następnie dodaje się znakowane przeciwciało, które rozpoznaje inny epitop na antygenie, tworząc strukturę kanapkową. Po usunięciu niezwiązanych przeciwciał dodaje się substrat. Pod katalitycznym działaniem przeciwciała wtórnego zachodzi reakcja barwna, a intensywność koloru jest dodatnio skorelowana ze stężeniem docelowego analitu w próbce. Na koniec zmierzono gęstość optyczną (OD) w celu określenia stężenia próbki. Test Sandwich ELISA ma zalety zwiększonej czułości i swoistości dla próbek docelowych, dzięki czemu nadaje się do wykrywania niskich stężeń docelowych analitów i próbek złożonych28. Dodatkowo uzyskane wyniki można określić ilościowo w celu dalszej analizy. Czynniki te sprawiają, że test ELISA typu sandwich jest powszechnie stosowaną metodą wykrywania zarówno w badaniach naukowych, jak i laboratoriach klinicznych29.
To badanie miało na celu ilościowe wykrycie 8-oxo-dG w komórkach MCF-7 w celu określenia stopnia uszkodzenia oksydacyjnego DNA w komórkach. Badanie to składa się z dwóch głównych części: skonstruowania modelu uszkodzenia oksydacyjnego DNA komórki MCF-7 oraz wykrycia 8-oxo-dG za pomocą testu ELISA. Po pierwsze, komórki MCF-7 hodowano in vitro i traktowano różnymi stężeniamiH2O2przez różny czas. Żywotność komórek oceniano za pomocą testu CCK-8 w celu określenia połowy maksymalnego stężenia hamującego (IC50)H2O2w komórkach MCF-7. Na podstawie wartości IC50 wybrano odpowiedni czas zabieguH2O2i stężenie indukcyjne. Aby wyekstrahować próbki komórek MCF-7 uszkodzonych przez utlenianie, uzyskano próbki komórek i supernatanty i dodano je do dołków połączonych enzymatycznie wcześniej pokrytych przeciwciałami 8-oxo-dG. 8-oxo-dG obecny w próbce zwiąże się z przeciwciałami związanymi z nośnikiem w fazie stałej. Następnie dodano przeciwciała 8-oxo-dG znakowane peroksydazą chrzanową. Mieszaninę reakcyjną inkubowano w stałej temperaturze, aby zapewnić całkowite związanie próbki i przeciwciała. Niezwiązany enzym usunięto przez mycie, a następnie dodano substrat kolorymetryczny, który uzyskał niebieski kolor. Pod działaniem kwasu roztwór zmienił kolor na żółty. Ostatecznie wartość OD próbek studzienki reakcyjnej zmierzono przy 450 nm, a stężenie 8-oxo-dG w próbce było proporcjonalne do wartości OD. Generując krzywą wzorcową, można obliczyć stężenie 8-oxo-dG w próbce.
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
1. Budowamodelu oksydacyjnego uszkodzenia DNA indukowanego przezH2O2 w komórkach MCF-7
2. Przygotowanie próbek komórkowych i przygotowanie odczynników ELISA
3. Eksperyment ELISA
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Jak zilustrowano na Rysunku 3, oś X oznacza stężenie H2O2 zastosowane do komórek MCF-7, natomiast oś Y wskazuje żywotność komórek. Traktowanie stężeniem 0,75 mM przez 12 h zmniejszyło żywotność komórek MCF-7 do 67%. Wraz ze wzrostem stężenia odnotowano istotny spadek żywotności komórek MCF-7, szczególnie przy stężeniu 1,5 mM, gdzie żywotność spadła poniżej 3% (Tabela 1). Wyniki eksperymentalne sugerują wartość IC50 wynoszącą 0,7655 mM dla kom...
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Rozwój metod ELISA ma ogromne znaczenie zarówno dla istniejących, jak i nowych metodologii wykrywania uszkodzeń DNA. W porównaniu z tradycyjnymi technikami HPLC i spektrometrii mas, podejście to jest nie tylko przyjazne dla użytkownika, ale także wykazuje wysoką czułość i spełnia wymagania wysokoprzepustowych badań przesiewowych30. Umożliwia to monitorowanie 8-oxo-dG w badaniach przesiewowych chorób na dużą skalę, ułatwiając głębsze zrozumienie korelacji między tym biomarkerem a różnymi chorobami....
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
Autorzy nie mają do ujawnienia żadnych konfliktów interesów.
Ta praca była wspierana przez Innowacyjny Zespół Badawczy ds. Nauki i Technologii Instytucji Szkolnictwa Wyższego Jiangsu (2021), Program Centrum Badań nad Technologią Inżynieryjną Jiangsu Vocational College (2023), Kluczowy Program Technologiczny Projektów Technologicznych Ludności Suzhou (SKY2021029), Otwarty Projekt Biobanku Zasobów Klinicznych Jiangsu (TC2021B009), Projekt Państwowego Kluczowego Laboratorium Medycyny Radiacyjnej i Ochrony, Uniwersytet Soochow (GZK12023013), programy Wyższej Szkoły Zdrowia Zawodowego w Suzhou (SZWZYTD202201) oraz projekt Qing-Lan w prowincji Jiangsu w Chinach (2021, 2022).
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| 0,25% Trypsyna-EDTA(1x) | Gibco | 25200-072 | |
| Zestaw do liczenia komórek-8 | Dojindo | ||
| Inkubator | |||
| ST30-3302 | |||
| GraphPad Prism X9 | Oprogramowanie GraphPad Oprogramowanie | analizy statystycznej | |
| wirówka szybkoobrotowa | Termo | 9AQ2861 | |
| Ludzki zestaw ELISA 8-oxo-dG | Pipety Zcibio | ZC-55410 | |
| L-1000XLS+ | Rainin | 17014382 | |
| L-20XLS+ | Zbiornik | ||
| Rainin Mvecryoge | YDS-175-216 | ||
| MCF-7 CELL | BNCC | BNCC100137 | |
| Mikropłytkowy fotometr Multiskan FC | Thermo | 1410101 | |
| PBS Solarbio | P1020 | ||
| Roztwór penicyliny-streptomycyny, 100X | Beyotime | C0222 | |
| Trójokularowy mikroskop żywych komórek | Motic | 1.1001E+12 | |
| Zamrażarka ultraniskotemperaturowa | Haire | V118574 |
Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.