$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Protokół ten szczegółowo opisuje dwa systemy AAV i modele myszy do badania ektopowej ekspresji Neurod1 w kontekście łagodnego i umiarkowanego modelu udaru korowego ET-1. Należy wziąć pod uwagę szereg krytycznych kroków związanych z udarem ET-1 dla odtwarzalności i spójności urazu. Otwory na zadziory należy ostrożnie wywiercić bez przebijania opony twardej, aby zapobiec niezamierzonym obrażeniom chirurgicznym. Ważne jest, aby używać spójnych punktów orientacyjnych, w tym przypadku bregma, aby zapewnić podobny obszar zainteresowania (kora sensomotoryczna w tym badaniu). Jest to szczególnie ważne w przypadku badań wykorzystujących oceny behawioralne, ponieważ lokalizacja i wielkość zmiany będą miały wpływ na wyniki funkcjonalne 13,22,25,27. Co najważniejsze, szybkość wstrzykiwania ET-1 i nacisk wywierany przez chirurga na strzykawkę muszą być spójne, aby uzyskać powtarzalne wyniki. Należy zauważyć, że igła strzykawki może się zatkać i musi być czyszczona między zwierzętami, aby zapewnić dokładne podanie ET-1. Podczas analizy komórkowej tkanki, jeśli nie obserwuje się zmiany po udarze, igła prawdopodobnie została zatkana podczas operacji. Jeśli problem będzie się powtarzał, zaopatrz się w nową partię endoteliny-1 od producenta, ponieważ w przeszłości obserwowano problemy z potencją zależną od partii.
Etapy procedury chirurgicznej w celu dostarczenia AAV są podobne do tych w protokole indukcji udaru ET-1. W związku z tym powyższe względy są krytyczne. Ponadto miano i objętość wirusa AAV muszą być spójne, aby zapewnić możliwość porównania skuteczności transdukcji między grupami. W tym protokole podawano 1 x 109 GC/μL AAV w badaniu ostrym i 1 x10 10 GC/μL AAV w badaniu przewlekłym. Bardzo ważne jest, aby wybrać dawkę wirusa, która jest wystarczająco niska, aby zminimalizować artefakty błędnej ekspresji, a jednocześnie jest wystarczająco wysoka, aby zapewnić wystarczającą transdukcję komórkową, umożliwiając wykrycie różnic między grupami eksperymentalnymi. Optymalny zakres dawek wirusa dla takich badań został określony na 107-10 10 GC/μL13,24. Wyższe miana AAV nie tylko powodują rozległe znakowanie neuronów w grupie kontrolnej, ale wykazano również, że indukują astrocytozę, zakłócają barierę krew-mózg i zwiększają reakcje zapalne28,29. W badaniach nad dostarczaniem czynnika transkrypcyjnego za pośrednictwem wirusa po udarze mózgu wykorzystano różne miejsca dostarczania do wstrzykiwań AAV. Jedno z badań opisało udane znakowanie transdukowanych komórek za pomocą pojedynczego wstrzyknięcia AAV w miejsce zmiany po udarze13. Inne badania koncentrują się na jednym do trzech obszarów wokół obszaru zawału30. W tym przypadku AAV został dostarczony w trzech lokalizacjach, z jednym wstrzyknięciem we współrzędnych miejsca wstrzyknięcia ET-1 i 2 wokół miejsca zmiany (jedno wstrzyknięcie w 1,0 mm z przodu i jedno wstrzyknięcie w 1,0 mm z tyłu) w celu transdukcji reaktywnych astrocytów w perylezyjnej granicy glejowej9. Podczas analizy komórkowej tkanki, jeśli nie zaobserwuje się żadnych lub bardzo mało (1-10 komórek/sekcyjny) komórek fluorescencyjnych, igła mogła zostać zatkana podczas wstrzyknięcia lub AAV został zbyt wiele razy zamrożony i rozmrożony, co doprowadziło do inaktywacji wirusa.
Skuteczność transdukcji badano w różnych momentach w modelu łagodnego i umiarkowanego udaru, a wyniki pokazują, że znacznie więcej neuronów jest znakowanych w mózgach leczonych Neurod1 zarówno w podostrym, jak i przewlekłym czasie po udarze. Pokazana tutaj praca jest pierwszą, która demonstruje transdukcję Neurod1 w fazie przewlekłej po udarze i ujawnia neurony ektopowo wyrażające Neurod1 nawet 8 tygodni po udarze. Podczas gdy odkrycia, że zwiększona liczba transdukowanych neuronów jest obserwowana w mózgach z uszkodzeniem udaru, które otrzymały Neurod1 w porównaniu z wektorami kontrolnymi, są zgodne z tym, że Neurod1 odgrywa rolę w konwersji AtN, interpretacja wyników komórkowych wymaga solidnej wiedzy na temat ograniczeń paradygmatu eksperymentalnego. Zdecydowana większość opublikowanych badań dotyczących konwersji AtN wykorzystuje GFAP jako promotor, ponieważ GFAP jest regulowany w górę w reaktywnych astrocytach w chorobach neurodegeneracyjnych, w tym po udarzemózgu 4,31. Wykazano jednak, że niska ekspresja GFAP występuje również w neuronach32. Jest to zgodne z przedstawionymi tutaj odkryciami, w których odsetek transdukowanych komórek w grupie kontrolnej (Stroke-Cre) to wcześniej istniejące neurony32. W szczególności grupy kontrolne Stroke-Cre w tym protokole wykazały 18,43 +/- 3,03% i 53,05 +/- 5,028% znakowania komórek NeuN + Reporter +, co reprezentuje znakowanie wcześniej istniejących neuronów, co wskazuje na ekspresję w neuronach sterowaną przez promotor GFAP. Rzeczywiście, ukierunkowana ekspresja Neurod1 zależy od wielu czynników, w tym tropizmu wirusowego. Wykazano, że AAV5 transdukuje neurony z różną wydajnością w różnych obszarach mózgu, w tym w korze sensomotorycznej, co wskazuje, że serotypy AAV mają regionalny tropizm komórkowy, który należy wziąć pod uwagę w badaniach indukujących ektopową ekspresję czynników transkrypcyjnych31,33. Szczepy myszy mogą również wpływać na transdukcję AAV 14,34. Badanie porównujące transdukcję AAV w prążkowiu myszy typu dzikiego (C57BL / 6J) i FVB / N wykazało zmienny tropizm komórek i wydajność transdukcji w dwóch szczepach34.
Zaletą systemu Cre-Flex jest to, że może być on stosowany do długotrwałego znakowania u myszy typu dzikiego, co może zmniejszyć problem niespecyficznej ekspresji Cre obecnej w liniach myszy Cre-reporter15,35. Wadą systemu Cre-Flex jest to, że ekspresja transgenu niezależna od Cre może wystąpić z powodu 0,1%-0,8% cząstek wirusa, które mają rekombinowane miejsca LoxP podczas produkcji wirusa36. Odkrycia te podkreślają znaczenie eksperymentów ze śledzeniem linii, na przykład wstępnego znakowania astrocytów przed podaniem AAV przy użyciu linii myszy Aldh1l1-CreERT2, aby zapewnić, że konwersja AtN nie jest przeszacowana podczas przedstawiania wniosków15. Badania sugerują, że aktywacja ludzkiego promotora GFAP (stosowanego w tych badaniach) poprzez regulację cis przez geny niższego szczebla (takie jak Neurod1) może powodować ekspresję GFAP w neuronach endogennych, prowadząc do większej liczby znakowanych neuronów w grupie leczonej15,32. Łącznie badania te i ich wyniki podkreślają znaczenie eksperymentów śledzenia linii, na przykład wstępnego znakowania astrocytów lub neuronów przed podaniem AAV, w celu rozróżnienia między wcześniej istniejącymi i endogennymi neuronami podczas analizy15.
Rozważając kolejne kroki, które mogłyby zmniejszyć transdukcję neuronalną, przydatne byłyby różne serotypy AAV i / lub zastosowanie mniej rozwiązłego promotora specyficznego dla astrocytów19. Rosnąca liczba doniesień opisujących heterogeniczność astrocytów może dodatkowo wpływać na specyficzność ekspresji genów, jeśli różne subpopulacje astrocytów są ogólnie bardziej podatne na konwersję AtN 37,38,39,40.
Wiek zwierząt wykorzystywanych w przedklinicznych modelach urazów lub chorób jest również ważnym czynnikiem, który może wprowadzać zmienne wyniki. Na przykład w przypadku neurotraumy wiek może wpływać na reaktywność astrocytów, co miałoby wpływ na wyniki badań nad konwersją AtN41. Ponadto indukowane przez Cre linie reporterowe mogą z czasem tracić swoistość ekspresji, co może wpływać na miary wyników42. Do tej pory przeprogramowanie u starszych zwierząt nie zostało kompleksowo zbadane43.
Protokół opisuje dostarczanie AAV w 2 fazach po udarze: (1) fazie podostrej (po 7 dniach) i (2) fazie przewlekłej (po 21 dniach) po udarze niedokrwiennym. Ektopowa ekspresja Neurod1 w modelu przewlekłego udaru mózgu nie została zbadana; W związku z tym obserwacja, że znacznie więcej neuronów jest znakowanych na tym późnym etapie, ma ważne implikacje dla przyszłych badań mających na celu promowanie powrotu do zdrowia po udarze w przewlekłym udarze. Badania badające potencjał ektopowej ekspresji Neurod1 w celu poprawy wyników udaru będą musiały uwzględniać oceny behawioralne, ponieważ wyniki funkcjonalne po udarze są najbardziej istotnymi klinicznie miernikami sukcesu interwencji terapeutycznej 13,22,25,27.
Obecnie nie ma dostępnych metod leczenia dla pacjentów cierpiących na niepełnosprawność spowodowaną udarem mózgu w podostrej i przewlekłej fazie po udarze, z wyjątkiem rehabilitacji, która przynosi ograniczone korzyści. Wykazano, że wymuszona ekspresja neurogennych genów bHLH w gleju poprawia wyniki funkcjonalne po udarze22,30. Wyniki są zgodne z badaniami nad przeprogramowaniem AtN, które wykazały, że ektopowa ekspresja Neurod1 zwiększa transdukcję neuronalną po 3 i 7 tygodniach od dostarczenia AAV w porównaniu z myszami otrzymującymi wektor kontrolny. Co najważniejsze, w kilku artykułach przedstawiono zalecenia dotyczące kontroli, projektowania i interpretacji badań w dziedzinie przeprogramowania AtN 17,18,19,22. W tym celu w protokole tym opisano systemy AAV i mysie modele ektopowej ekspresji czynników transkrypcyjnych po udarze, które mogą być wykorzystane do informowania i posuwania naprzód dalszych badań nad mechanizmami komórkowymi leżącymi u podstaw obserwacji.