Architektura komórkowa jelita stanowi wyjątkowe wyzwanie w utrzymaniu jego integralności strukturalnej, gdy tkanka jelitowa jest zachowywana do barwienia immunologicznego. Jelito cienkie składa się z wydłużonych, przypominających palce struktur znanych jako kosmki1. Te kosmki często ulegają zniekształceniu podczas procesów osadzania. Zapewnienie, że badacze dysponują technikami prawidłowego osadzania jelit w celu uzyskania przekrojów poprzecznych, co pozwala na wizualizację wszystkich regionów jelita, a także warstw tworzących jelito (tj. muscularis propria, błona śluzowa i błona surowicza), ma kluczowe znaczenie dla solidnej analizy eksperymentalnej2. Nieodpowiednie utrwalenie, nadmierne utrwalenie i niewłaściwe obchodzenie się z tkankami naruszy integralność tkanki, powodując niezamierzone uszkodzenie nabłonka jelitowego3,4. Uszkodzenie nabłonka jelitowego podczas tych etapów może znacznie obniżyć jakość późniejszych analiz, takich jak immunofluorescencja, niezależnie od skuteczności protokołów immunohistochemicznych i zastosowanych przeciwciał.
Barwienie immunologiczne, podobnie jak prawidłowe utrwalanie tkanek, jest ważną częścią badań biomedycznych. Dobrze przeprowadzone barwienie immunologiczne może rzucić światło na nieznane wcześniej aspekty struktury i funkcji komórek. Barwienie immunofluorescencyjne skrawków parafiny może być trudne ze względu na modyfikacje fizykochemiczne wynikające z procesu utrwalania i zatapiania parafiny5. Utrwalanie i osadzanie parafiny powoduje maskowanie antygenu, które może zakłócać immunofluorescencyjne wykrywanie epitopów będących przedmiotem zainteresowania6. Opóźnione utrwalenie może wywołać degradację proteolityczną, co skutkuje osłabieniem lub brakiem barwienia krytycznych epitopów7. Ponadto przeciwciała są często niedokładne przy wysokim poziomie tła. Protokoły barwienia immunologicznego, które promują spójne i swoiste wiązanie przeciwciał oraz wysoki stosunek sygnału do szumu, mogą dostarczyć cennych informacji dla badaczy.
Tutaj oferujemy kompleksowy protokół przeznaczony do uzyskiwania wysokiej jakości obrazów immunofluorescencyjnych poprzez utrwalanie tkanki jelitowej, szwajcarskie przygotowanie rolki8, oraz barwienie immunologiczne. Kładąc nacisk na wytyczne dotyczące zachowania integralności jelita, protokół ma na celu zapewnienie naukowcom solidnej metodologii w celu poprawy jakości i wiarygodności badań obrazowania immunofluorescencyjnego. Staraliśmy się również wykorzystać opłacalne zasoby, w tym bibułę filtracyjną i domowe pobieranie antygenu, roztwory blokujące i rozcieńczalniki przeciwciał, aby protokół był bardziej dostępny dla laboratoriów, które mogą mieć ograniczone fundusze. Podobnie jak w przypadku wszystkich protokołów eksperymentalnych, badacze powinni zoptymalizować obecny protokół w oparciu o swoje podejście eksperymentalne i obszary zainteresowania.