Każdego dnia około 280 miliardów czerwonych krwinek (RBC) jest wytwarzanych w szpiku kostnym, aby zapewnić transport tlenu przez całe ciało1. Erytropoeza to precyzyjnie dostrojony proces różnicowania, w którym powstają dojrzałe, funkcjonalne czerwone krwinki z hematopoetycznych komórek macierzystych. Wiele chorób, zarówno nabytych, jak i wrodzonych, może wpływać na ten proces, w tym zespół mielodysplastyczny, niedokrwistość aplastyczna, talasemia i wrodzona niedokrwistość dyserytropoetyczna2.
Klinicznym objawem zaburzonej erytropoezy jest niedokrwistość, główna przyczyna zachorowalności na całym świecie. Objawy niedokrwistości wahają się od zmęczenia, duszności i zawrotów głowy po stany zagrażające życiu, takie jak niewydolność serca i zatrzymanie akcji serca3. Ponieważ niedokrwistość dotyka 1,8 miliarda ludzi na całym świecie4, modelowanie erytropoezy ex vivo w celu zbadania tych stanów i ich mechanizmów leżących u ich podstaw pozostaje globalnym priorytetem. Opisana tutaj metoda ma na celu zapewnienie prostego i solidnego modelu do badania różnicowania erytroidalnego zarówno zdrowych, jak i chorych. Model ten pozwala na rozbiór ról poszczególnych genów w tym procesie i umożliwia testowanie związków, które mogą przynieść korzyści pacjentom z anemią. Historycznie rzecz biorąc, modelowanie nieefektywnej erytropoezy wiązało się z wieloma wyzwaniami, w tym z niedoborem komórek macierzystych w niektórych chorych szpikach kostnych i trudnościami w naśladowaniu niszy szpiku kostnego.
Poprzednie badania używały podobnych lub bardziej złożonych protokołów; na przykład, Bondu i wsp. używali koktajlu cytokin, w tym erytropoetyny (EPO), czynnika komórek macierzystych (SCF) i interleukiny-6 (IL6) przez 4 dni przed usunięciem IL6 z koktajlu różnicowania erytroidalnego, natomiast Yip i wsp. dodali EPO do swojego koktajlu cytokin dopiero po 7 dniach płynnej hodowli. Elvarsdóttir i in. opracowali trójwymiarowy (3D) model hodowli komórek CD34+, aby ułatwić najwyższą ekspansję i dojrzewanie komórek erytroidalnych, w tym generowanie wysp erytroblastycznych i wyłuszczonych erytrocytów, które są ważne dla badania zjawisk takich jak syderoblasty pierścieniowe5,6,7,8. Protokół ten wykorzystuje tylko trzy cytokiny podczas namnażania komórek (tj. SCF, trombopoetynę [TPO] i kinazę tyrozynową 3 podobną do FMS [FLT3]) i trzy cytokiny utrzymywane przez cały proces różnicowania (tj. EPO, IGF1 i SCF). Jednym z kluczowych kryteriów wspólnych dla tych różnych badań jest wykorzystanie komórek CD34+. Chociaż pochodzenie tych komórek jest różne, są one konsekwentnie stosowane w tych różnych protokołach. Źródła mogą wahać się od nieinwazyjnego pobierania UCB do bardziej inwazyjnych procedur w celu uzyskania próbek szpiku kostnego dla dorosłych, które można pobrać od pacjentów zmobilizowanych za pomocą czynnika stymulującego tworzenie kolonii granulocytów (G-CSF) lub po nakłuciu szpiku kostnego. Ogólnie rzecz biorąc, modele hodowli płynnych są przenoszone przez 14 dni, podczas gdy modele 3D mogą utrzymywać komórki przez dłuższy czas. Protokoły te są niezbędne do modelowania chorób genetycznych i zakłóceń erytropoezy. Podejścia genetyczne, takie jak knockdowny krótkiego spinki RNA (shRNA), mogą być wykorzystane do wyciszenia interesujących genów i zbadania ich roli w erytropoezie. Wpływ wyciszania genów może być następnie monitorowany na różnych etapach różnicowania, dostarczając ex vivo ludzki model produkcji czerwonych krwinek do badania niedokrwistości zarówno w zdrowiu, jak i chorobie. Protokół ten obejmuje transdukcję komórek krwi pępowinowej CD34 + za pomocą shRNA, które konstytutywnie wyrażają gen reporterowy, taki jak wzmocnione białko zielonej fluorescencji (EGFP), umożliwiając sortowanie próbek przez sortowanie komórek aktywowane fluorescencją (FACS). Komórki są następnie inkubowane w pożywkach różnicujących przez 2 tygodnie i monitorowane za pomocą analizy cytometrii przepływowej i barwienia immunochemicznego.