$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Zmiany w TMV w pobudliwych komórkach in vitro wywołane impulsami elektrycznymi mogą być optycznie monitorowane za pomocą tego protokołu, a sygnały fluorescencyjne mogą być analizowane w celu wyodrębnienia ich odpowiednich parametrów.
Konfiguracja eksperymentalna jest pokazana w Rysunek 1A. Typowy sygnał impulsu elektrycznego 100 μs używany w eksperymentach jest pokazany na Rysunek 1B. Komórki w komorach, które są umieszczone pod mikroskopem, zazwyczaj wyglądają jak komórki w Rysunek 1C (obraz w jasnym polu) i Rysunek 1D (obraz fluorescencyjny). Przeprowadzamy eksperyment, w którym co 2 minuty do tych samych ogniw przykładany jest impuls elektryczny o rosnącym napięciu. Należy pamiętać, że 2-minutowy czas interpulsu może nie być wystarczająco długi, aby umożliwić pełne ponowne uszczelnienie i odzyskanie błon komórkowych, zwłaszcza w przypadku stosowania impulsów o najwyższej amplitudzie, które są związane z wyraźną elektroporacją. W związku z tym można spodziewać się pewnych skumulowanych efektów impulsów. Aby uniknąć tych skumulowanych efektów, opóźnienie międzyimpulsowe można wydłużyć, ale kosztem zmniejszenia liczby badanych amplitud impulsów i uniknięcia zbyt długiego trzymania komórek na mikroskopie.
Po przechwyceniu obrazów fluorescencyjnych w eksperymentach, przeanalizuj je za pomocą niestandardowej aplikacji MATLAB. Najpierw określ progi pikseli (Rysunek 2A); Regulując niski próg, uzyskujemy wyraźny obraz błon wokół komórek (w kolorze fioletowym), a dostosowując wysoki próg, usuwamy sygnał zanieczyszczeń (kolor zielony). Następnie aplikacja określa średnią intensywność fluorescencji wszystkich pikseli progowych dla każdego dostarczonego kolejnego impulsu, aby uzyskać zależny od czasu sygnał względnej zmiany fluorescencji F/F0. Sygnał ten jest korygowany dla fotowybielania barwnikowego poprzez odjęcie nachylenia liniowego spadku F wyznaczonego na podstawie kontrolnego nagrania poklatkowego, w którym nie zastosowano impulsu (Rysunek 2B). Po skorygowaniu sygnału, parametry odpowiedzi są wyodrębniane w postaci tabeli w aplikacji oraz wykresu skorygowanego sygnału fluorescencji (Rysunek 2C). W rzadkich przypadkach algorytm nie wykrywa oczywistego szczytu lub wykrywa fałszywe sygnały szumu jako fałszywe alarmy. W takich przypadkach użytkownik ma możliwość ręcznego wybrania odpowiedniego punktu w sygnale fluorescencji jako piku lub usunięcia wykrytego fałszywego piku (Rysunek 2D - usunięcie małego piku, który został anomalnie wykryty przed zastosowaniem impulsu elektrycznego).
Korzystając z aplikacji MATLAB, możemy uzyskać obrazy odpowiedzi TMV na impulsy elektryczne zarówno w pobudliwych komórkach S-HEK (Rysunek 3A), jak i niepobudliwych komórkach NS-HEK (Rysunek 3B). Wyodrębniane są następujące parametry odpowiedzi (Tabela 1): liczba szczytów (NoPeaks), średni czas od szczytu do szczytu (gdy wykryto więcej niż jeden pik, MPPT), maksymalna odpowiedź (MR), czas do pierwszego piku (TtFP) oraz czas od szczytu do 25%, 50%, 75% i 90% odzysku (odpowiednio T25, T50, T75, T90). Parametry te umożliwiają ocenę reakcji na różne impulsy elektryczne (np. określenie liczby pików wyzwalanych przez impulsy elektryczne o różnym E, Rysunek 3C) oraz wzajemne oddziaływanie między wzbudzeniem a elektroporacją.

Rysunek 1: Konfiguracja, przebieg i komórki S-HEK. (A) Obraz komory na stoliku mikroskopu. (B) Przykład przebiegu impulsu użytego w badaniu (napięcie (U) w czasie). (C, D) Obraz komórek S-HEK ((C): jasne pole, (D): fluorescencja), podziałka: 100 μm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Aplikacja do analizy danych. (A) Obraz interfejsu aplikacji - progowanie. (B) Wykres surowego i skorygowanego sygnału zmiany fluorescencji. (C) Obraz interfejsu aplikacji - wyodrębnione dane. (D) Ręczna korekta detekcji piku (usunięcie małego piku który został anomalnie wykryty przed przyłożeniem impulsu elektrycznego, oznaczonego czerwoną strzałką). Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Reprezentatywne wyniki. (A, B) Wywoływanie zmian w TMV w (A) pobudliwym S-HEK i (B) niepobudliwym NS-HEK za pomocą impulsów elektrycznych 100 μs o różnych amplitudach, wyniki reprezentatywnych eksperymentów. Dla jasności wyświetlane są tylko odpowiedzi na wybrane impulsy w zastosowanej sekwencji impulsów. (C) Parametry odpowiedzi TMV wyzwalanych przez impulsy 100 μs o różnych amplitudach: Przykład pokazuje liczbę pików. Wyniki wyrażone są jako średnia ± SE, liczba doświadczeń: N = 13. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
Rozdział
.
Rozdział
szt.
szt.
TGL
pkt.
Rozdział
szt.
Rozdział
Rozdział
pkt.
Rozdział
szt.
szt.
pkt.
Rozdział
szt.
TGLI
szt.
TGL
pkt.
szt.
pkt.
szt.
SZT.
TGL
szt.
pkt.
TGL
szt.
szt.
SZT.
| indeks | E-wytrzymałość
(V/cm) | Brak szczytów
(-) | MPPT
(MS) | MR
(-) | TtFP
(MS) | T25
(MS) | T50
(MS) | T75
(MS) | T90
(MS) |
| 1 | 0 | | | | | | | | |
| cyfra arabska | 126 Rozdział 126 | 9 | 224 | 0,104 | 360 pkt | 72 Rozdział 72 | Rozdział 108 | 144 | 180 |
| 3 | 150 | 6 | Okręg wyborczy 354 | 0,097 | Rozdział 108 | 72 Rozdział 72 | Rozdział 108 | 144 | 180 |
| 4 | 176 | cyfra arabska | 144 | 0,089 | 36 | 72 Rozdział 72 | Rozdział 108 | 144 | 180 |
| 5 | 200 | 1 | | 0,075 | 0 | Rozdział 108 | 144 | 180 | Z kolei 252 |
| 6 | Z kolei 250 | cyfra arabska | Okręg wyborczy 396 | 0,064 | 0 | Rozdział 108 | Rozdział 216 | Z numerem 432 | Rok 2052 |
| 7 | 300 | 1 | | 0,059 | 0 | 180 | 1188 | Numer katalogowy 2448 | |
| 8 | 350 | 1 | | 0,053 | 0 | Numer katalogowy 1008 | 2340 | | |
| 9 | 400 | 1 | | 0,047 | 0 | 1512 | | | |
Tabela 1: Parametry odpowiedzi TMV wywołanych impulsami 100 μs o różnych amplitudach.