Zmiany TMV w pobudliwych komórkach in vitro wywołane impulsami elektrycznymi mogą być monitorowane optycznie za pomocą tego protokołu, a sygnały fluorescencyjne mogą zostać poddane analizie w celu wyznaczenia istotnych parametrów.
Układ eksperymentalny przedstawiono na Rysunku 1A. Typowy sygnał impulsu elektrycznego o czasie trwania 100 µs stosowanego w eksperymentach pokazano na Rysunku 1B. Komórki w komorach umieszczonych pod mikroskopem zazwyczaj wyglądają jak komórki na Rysunku 1C (obraz w polu jasnym) oraz Rysunku 1D (obraz fluorescencyjny). Przeprowadzamy eksperyment, w którym co 2 min do tych samych komórek przykłada się impuls elektryczny o zwiększającym się napięciu. Należy zauważyć, że 2-minutowy odstęp między impulsami może nie być wystarczająco długi, aby umożliwić pełne zasklepienie i regenerację błon komórkowych, szczególnie w przypadku stosowania impulsów o najwyższej amplitudzie, które wiążą się z intensywną elektroporacją. W związku z tym można spodziewać się pewnych efektów kumulatywnych impulsów. Aby uniknąć tych efektów kumulatywnych, można wydłużyć opóźnienie między impulsami, jednak odbywa się to kosztem zmniejszenia liczby testowanych amplitud impulsów oraz konieczności uniknięcia zbyt długiego przebywania komórek pod mikroskopem.
Po zarejestrowaniu obrazów fluorescencyjnych w eksperymentach należy przeanalizować je za pomocą dedykowanej aplikacji MATLAB. Najpierw należy wyznaczyć progi pikseli (Rysunek 2A); poprzez dostosowanie progu dolnego otrzymujemy wyraźny obraz błon wokół komórek (na fioletowo), a poprzez dostosowanie progu górnego usuwamy sygnał z zanieczyszczeń (na zielono). Następnie aplikacja wyznacza średnią intensywność fluorescencji wszystkich pikseli powyżej progu dla każdego dostarczonego kolejnego impulsu, aby uzyskać zależny od czasu sygnał względnej zmiany fluorescencji F/F0. Sygnał ten jest korygowany o fotobleaching barwnika poprzez odjęcie nachylenia liniowego spadku F, wyznaczonego z kontrolnego zapisu time-lapse, w którym nie zastosowano impulsu (Rysunek 2B). Po skorygowaniu sygnału parametry odpowiedzi są ekstrahowane w formie tabeli w aplikacji oraz wykresu skorygowanego sygnału fluorescencji (Rysunek 2C). W rzadkich przypadkach algorytm nie wykrywa oczywistego piku lub wykrywa fałszywe sygnały szumowe jako wyniki fałszywie dodatnie. W takich sytuacjach użytkownik ma możliwość ręcznego wybrania odpowiedniego punktu w sygnale fluorescencji jako piku lub usunięcia wykrytego błędnego piku (Rysunek 2D – usunięcie małego piku, który został anomalnie wykryty przed zastosowaniem impulsu elektrycznego).
Dzięki zastosowaniu aplikacji MATLAB możemy uzyskać obrazy odpowiedzi TMV na impulsy elektryczne w obu przypadkach: w pobudliwych S-HEK (Rysunek 3A) oraz niepobudliwe komórki NS-HEK (Rysunek 3B). Wyekstrahowano następujące parametry odpowiedzi (Tabela 1): liczba pików (NoPeaks), średni czas od piku do piku (w przypadku wykrycia więcej niż jednego piku, MPPT), maksymalna odpowiedź (MR), czas do pierwszego piku (TtFP) oraz czas od piku do 25%, 50%, 75% i 90% powrotu (odpowiednio T25, T50, T75, T90). Parametry te umożliwiają ocenę odpowiedzi na różne impulsy elektryczne (np. określenie liczby pików wywołanych impulsami elektrycznymi o różnym E, Rycina 3C) oraz współzależność między pobudzeniem a elektroporacją.

Rysunek 1: Układ, przebieg impulsu i komórki S-HEK. (A) Obraz komory na stole mikroskopu. (B) Przykład przebiegu impulsu zastosowanego w badaniu (napięcie (U) w funkcji czasu). (C, D) Obraz komórek S-HEK ((C): pole jasne, (D): fluorescencja), pasek skali: 100 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiekszoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Zastosowanie analizy danych. (A) Obraz interfejsu aplikacji – progowanie. (B) Wykres surowego i skorygowanego sygnału zmiany fluorescencji. (C) Obraz interfejsu aplikacji – wyekstrahowane dane. (D) Ręczna korekta detekcji piku (usunięcie małego piku, który został anomalnie wykryty przed przyłożeniem impulsu elektrycznego, zaznaczone czerwoną strzałką). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 3: Reprezentatywne wyniki. (A, B) Wywoływanie zmian w TMV w (A) pobudliwych S-HEK i (B) niepobudliwych NS-HEK za pomocą impulsów elektrycznych o czasie trwania 100 µs i różnych amplitud; wyniki z reprezentatywnych eksperymentów. Dla przejrzystości przedstawiono jedynie odpowiedzi na wybrane impulsy z zastosowanej sekwencji impulsów. (C) Parametry odpowiedzi TMV wywołane impulsami 100 µs o różnych amplitudach: przykład przedstawia liczbę pików. Wyniki wyrażone jako średnia ± SE, liczba eksperymentów: N = 13. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
| Indeks | Wytrzymałość elektryczna
(V/cm) | Brak pików
(-) | MPPT (maksymalne śledzenie punktu mocy)
(ms) | MR
(-) | TtFP
(ms) | T25
(ms) | T50
(ms) | T75
(ms) | T90
(ms) |
| 1 | 0 | | | | | | | | |
| 2 | 126 | 9 | 224 | 0.104 | 360 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 3 | 150 | 6 | 354 | 0.097 | 108 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 4 | 176 | 2 | 144 | 0.089 | 36 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 5 | 200 | 1 | | 0.075 | 0 | 108 | 144 | 180 | 252 |
| 6 | 250 | 2 | 396 | 0.064 | 0 | 108 | 216 | 432 | 2052 |
| 7 | 300 | 1 | | 0.059 | 0 | 180 | 1188 | 2448 | |
| 8 | 350 | 1 | | 0.053 | 0 | 1008 | 2340 | | |
| 9 | 400 | 1 | | 0.047 | 0 | 1512 | | | |
Tabela 1: Parametry odpowiedzi TMV wywołanych impulsami o czasie trwania 100 µs i różnych amplitudach.