Ostatnie badania poszerzyły zrozumienie miażdżycy jako przezściennej przewlekłej choroby zapalnej obejmującej wszystkie trzy warstwy ściany tętnicy, w tym blaszkę wewnętrzną, środek i przydankę, która tworzy zewnętrzną powłokę tkankową tętnic. Nasze ostatnie badania sugerują, że przydanka jest wykorzystywana przez obwodowy układ nerwowy jako kanał docierający do wszystkich komórek tkankowych. Odkryliśmy również, że obwodowy układ nerwowy, czyli czuciowy i współczulny układ nerwowy, przechodzi poważne procesy przebudowy obejmujące neogenezę sieci aksonów sąsiadujących z blaszkami miażdżycowymi. W tym kontekście zrozumienie struktury sieci neuronowej i jej interakcji z komponentami naczyniowymi chorych tętnic daje duże nadzieje na lepsze zrozumienie patogenezy chorób sercowo-naczyniowych. Aby osiągnąć te cele, potrzebne są metody wizualizacji subkomórkowej architektury nienaruszonych zdrowych i chorych tętnic wraz z otaczającymi je przedziałami okołonaczyniowymi. Oczyszczanie tkanek umożliwia nienaruszone obrazowanie tkanek głębokich większych przedziałów tkankowych, które są niedostępne w inny sposób. Umożliwia obrazowanie wolumetryczne nienaruszonych tętnic dzięki integracji narzędzi do znakowania, oczyszczania, zaawansowanego obrazowania mikroskopowego i przetwarzania obrazu. W tym miejscu opisujemy dwa odrębne, ale uzupełniające się podejścia do pasywnego oczyszczania tkanek, to znaczy usuwanie 2, 2-tiodieetanolu (TDE) na bazie wody i trójwymiarowe obrazowanie narządu oczyszczonego rozpuszczalnikowo (iDISCO) za pomocą znakowania immunologicznego w celu zobrazowania izolowanych segmentów aorty lub całej aorty in-situ u całej myszy.