Opis pisemny wyników pozytywnych i negatywnych (w tym kontroli pozytywnych i negatywnych dla płytek i wymazów)
W ramach wymazów nadzorczych stosuje się wymazy kontrolne ujemne, aby monitorować potencjalne zanieczyszczenie prionami, które mogłoby wystąpić podczas procesu pobierania wymazów, ekstrakcji i zagęszczania. Pierwsza płytka RT-QuIC wykonana w ramach danego miesięcznego nadzoru powinna zawierać kontrolne wymazy dodatnie i ujemne. Prawidłowe kontrole ujemne nie przekraczają progu fluorescencji dodatniej (Rysunek 6A). Taki wynik wskazywałby, że podczas procedur eksperymentalnych nie wprowadzono zanieczyszczeń. Prawidłowe ekstrakty z wymazów kontrolnych dodatnich wykazałyby dodatnie zasiewanie we wszystkich powtórzonych studzienkach dla danej próbki (wymazy kontrolne dodatnie zanieczyszczono homogenatem mózgu z hodowlanym u chomików szczepem Hyper (HY TME) transmisyjnej encefalopatii norki). Włączenie serii rozcieńczeń kontroli dodatniej pozwala na określenie czułości detekcji prionów w danym eksperymencie (Rysunek 6A).
Podczas badania próbek z wymazów z powierzchni, powierzchnie, w których nie stwierdzono namnażania powyżej ustalonego progu fluorescencji dodatniej, można uznać za wolne od prionów (Rycina 6B). Z kolei wymazy z powierzchni zanieczyszczonych prionami wykażą zdolność do namnażania powyżej progu fluorescencji dodatniej, choć stosunek maxpoint (MPR) oraz czas do wystąpienia fluorescencji mogą różnić się w porównaniu z dołączoną dodatnią kontrolą na płytce (Rycina 6B). Zdolność tej metody do oceny prawidłowej dezynfekcji została podkreślona w przypadku powierzchni zanieczyszczonych prionami i potraktowanych wybielaczem, które obecnie nie wykazują zdolności do namnażania w teście RT-QuIC (Rycina 6B).
Warto zaznaczyć, że choć w naszym laboratorium próbkę dodatnią definiuje się jako taką, która przekracza ustalony próg fluorescencji dodatniej w co najmniej połowie powtórzeń, każde laboratorium powinno ustalić własne standardy. Szybkość tworzenia amyloidu (RAF) oraz czas do wystąpienia fluorescencji mogą również pomóc w ustaleniu specyficznych dla danego laboratorium progów dodatniości.
Zaobserwowaliśmy wyniki będące artefaktami powierzchniowymi, które przekraczały próg dodatniej fluorescencji, lecz charakteryzowały się zmienionymi krzywymi kinetycznymi oraz nienaturalnie długim czasem do wystąpienia fluorescencji w porównaniu z próbkami kontrolnymi dodatnimi (Rysunek 6C). Wyniki te należy interpretować z ostrożnością, ponieważ mogą być one spowodowane obecnością kurzu lub pozostałości chemikaliów na powierzchni. Wnioski te podkreślają konieczność zachowania ogólnej czystości laboratoryjnej, a także potrzebę ustalenia kryteriów pozwalających na rozróżnienie prawdziwego dodatniego zasiewu od wyników fałszywie dodatnich.
Utylizację stałych i ciekłych odpadów biologicznych należy przeprowadzać zgodnie z aktualnymi wytycznymi danej instytucji dotyczącymi utylizacji materiałów niebezpiecznych biologicznie. Powszechne techniki dezynfekcji prionów obejmująy traktowanie wodorotlenkiem sodu, podchlorynem sodu (wybielem) lub autoklawowanie w temperaturze 134 °C przez 18 min43,44,45,46.

Rysunek 1: Schematyczny przegląd testu wymazowego bezpieczeństwa prionów w laboratorium. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 2: Układ miejsca pobierania wymazów z próbek. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 3: Projekt przykładowego eksperymentu dla kontroli wymazów w ramach testu wymazowego w laboratorium bezpieczeństwa prionów. (A) Przykładowy układ dla ujemnych i dodatnich kontroli ekstraktów z wymazów. (B) Ujemne i dodatnie kontrole ekstraktów z wymazów należy resuspendować w 50 µL H2O. 10-krotne rozcieńczenie resuspendowanego ekstraktu z wymazu powinno zostać przygotowane poprzez rozcieńczenie go w roztworze do rozcieńczania tkanek. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 4: Przykładowy projekt eksperymentu dla ekstraktów z wymazów z powierzchni w ramach testu wymazowego w laboratorium bezpieczeństwa prionów. (A) Układ próbek dla ekstraktów z wymazów z powierzchni. (B) Próbki ekstraktów z wymazów z powierzchni należy resuspender w 20 µL roztworu do rozcieńczania tkanek. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 5: Comiesięczny test wymazowy w laboratorium bezpieczeństwa prionów. Schemat służący do interpretacji wyników i określenia odpowiedniej reakcji. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 6: Reprezentatywny eksperyment z wymazami z powierzchni. (A) Kontrolna płytka z wymazami powierzchniowymi zawierająca w trzech powtórzeniach negatywne kontrole ekstraktów z wymazów (DPBS, homogenat mózgu chomika niezakażonego 10-4 i 10-10) oraz w trzech powtórzeniach pozytywne kontrole ekstraktów z wymazów (homogenat mózgu HY 10-3). (B) Reprezentatywne ekstrakty z wymazów z powierzchni blatu, szkła i stali nierdzewnej (S.S.), które zostały pobrane przed kontaminacją, po kontaminacji HY 10-3 oraz po traktowaniu skażonych powierzchni wybielaczem. (C) Porównanie krzywych fluorescencji dla homogenatu mózgu niezakażonego 10-4, homogenatu mózgu HY 10-3 oraz ekstraktu z wymazu z blatu pokrytego cienką warstwą kurzu. Negatywne kontrole płytek dla paneli A i B obejmują próbkę ślepą (roztwór do rozcieńczania tkanek) oraz homogenat mózgu chomika niezakażonego 10-4. Panel B zawiera dodatek homogenatu mózgu niezakażonego 10-4 oraz pozytywną kontrolę płytkową w postaci homogenatu mózgu HY 10-3. Pozytywny próg fluorescencji (oznaczony czerwoną przerywaną linią) określono na poziomie 2. Raportowany stosunek punktu maksymalnego (MPR) to maksymalna fluorescencja podzielona przez początkowy odczyt fluorescencji uzyskany za pomocą czytnika płytek. Każdy punkt reprezentuje jeden techniczny powtórzenie w studzience dla danego typu próbki. Przedstawiono średnią i odchylenie standardowe. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
Tabela 1: Miesięczny formularz dokumentacji miejsc pobierania wymazów z próbek. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać tę tabelę.
Rycina uzupełniająca 1: Szablon układu miejsc wymazowych. Proszę kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Rycina uzupełniająca 2: Miesięczny formularz dokumentacji miejsca pobierania wymazów. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.