$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Pisemny opis pozytywnych i negatywnych wyników (w tym kontrole z dodatniej/ujemnej płytki i wymazu)
Wymazy kontroli ujemnej są dołączane do wymazu nadzorującego w celu monitorowania potencjalnego zanieczyszczenia prionami, które mogłyby zostać wprowadzone podczas procesu pobierania wymazów, ekstrakcji i koncentracji. Pierwsza płytka RT-QuIC wykonana dla danego miesięcznego nadzoru powinna zawierać dodatnie i ujemne kontrole wymazu. Udane kontrole ujemne nie przekraczają progu dodatniej fluorescencji (Rysunek 6A). Wynik ten wskazywałby, że zanieczyszczenie nie zostało wprowadzone podczas procedur doświadczalnych. Udane ekstrakty wymazów kontroli pozytywnej wykazywałyby dodatnie wysiewanie we wszystkich studzienkach replikowanych dla danej próbki (wymazy kontroli pozytywnej były zanieczyszczone homogenatem mózgu przystosowanym do chomików zakaźnym szczepem encefalopatii norek Hyper (HY TME). Włączenie serii rozcieńczeń kontroli dodatniej pozwala na określenie czułości wykrywania prionów dla danego eksperymentu (Rysunek 6A).
Podczas badania próbek ekstraktu z wymazu powierzchniowego, powierzchnie, które nie wykazują zasiewu powyżej wcześniej ustalonego progu dodatniej fluorescencji, mogą być uważane za prionowe ujemne (Rysunek 6B). I odwrotnie, ekstrakty z wymazów powierzchniowych zanieczyszczone prionami będą wykazywać zdolności wysiewu powyżej dodatniego progu fluorescencji, chociaż stosunek maxpoint (MPR) i czas do fluorescencji mogą się różnić w porównaniu z dołączoną kontrolą dodatniej płytki (Rysunek 6B). Zdolność metody do oceny odpowiedniej dezynfekcji jest podkreślona przez powierzchnie zanieczyszczone prionami poddane działaniu wybielacza, które obecnie nie są w stanie zasiać RT-QuIC (Rysunek 6B).
Ważne, chociaż nasze laboratorium definiuje pozytywną próbkę jako próbkę, która przekroczy ustawiony próg dodatniej fluorescencji w co najmniej połowie docieknięć replikowanych, konieczne jest, aby każde laboratorium ustaliło swoje własne standardy. Szybkość powstawania amyloidu (RAF) i czas do fluorescencji mogą być również wykorzystane do ustalenia specyficznych dla laboratorium progów dodatniości.
Zaobserwowaliśmy wyniki artefaktów powierzchniowych, które przekraczają próg dodatniej fluorescencji, ale ze zmienionymi krzywymi kinetycznymi i po nienormalnie długim czasie do fluorescencji w porównaniu z pozytywnymi próbkami kontrolnymi (Rysunek 6C). Wyniki te należy interpretować ostrożnie, ponieważ mogą być spowodowane obecnością kurzu lub pozostałości chemikaliów obecnych na powierzchni. Wyniki te podkreślają konieczność ogólnej czystości laboratorium, a także kryteria rozróżnienia między wysiewem prawdziwie dodatnim a fałszywie dodatnim.
Usuwanie stałych i płynnych odpadów stanowiących zagrożenie biologiczne powinno odbywać się zgodnie z aktualnymi wytycznymi danej instytucji dotyczącymi usuwania zagrożeń biologicznych. Typowe techniki dezynfekcji prionów obejmują leczenie wodorotlenkiem sodu, podchlorynem sodu (wybielaczem) lub autoklawowanie w temperaturze 134 °C przez 18 min43,44,45,46.

Rysunek 1: Schematyczny przegląd testu laboratoryjnego bezpieczeństwa prionów. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Przykładowy układ strony pobierania wymazów. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Przykładowy projekt eksperymentu dla kontroli wymazu obejmował test laboratoryjny bezpieczeństwa prionów. (A) Układ próbki dla kontroli ujemnego i dodatniego ekstraktu z wymazu. (B) Ujemne i dodatnie kontrole ekstraktu z wymazu powinny być ponownie zawieszone w 50 μlH2O. Należy uzyskać 10-krotne rozcieńczenie zawieszonego ekstraktu z wacika, rozcieńczając go do roztworu rozcieńczającego tkanki. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Przykładowy projekt eksperymentu dla ekstraktów z wymazów powierzchniowych z testu laboratoryjnego bezpieczeństwa prionów. (A) Przykładowy układ ekstraktów z wymazów powierzchniowych. (B) Próbki ekstraktu z wymazu powierzchniowego należy ponownie zawiesić w 20 μl roztworu do rozcieńczania tkanek. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 5: Comiesięczny test laboratoryjny bezpieczeństwa prionów. Schemat blokowy służący do interpretowania wyników i określania odpowiedniej reakcji. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 6: Reprezentatywny eksperyment z wymazem powierzchniowym. (A) Płytka kontrolna z wymazu powierzchniowego zawierająca kontrolę ujemnego ekstraktu z wymazu w trzech egzemplarzach (DPBS, homogenat mózgu chomika niezakażonego 10-4 i 10-10) oraz kontrole z ekstraktem z wymazu dodatniego w trzech egzemplarzach (homogenat mózgu HY 10-3). (B) Reprezentatywne ekstrakty wacikowe do powierzchni stołowych, szklanych i ze stali nierdzewnej (SS), które zostały pobrane przed zanieczyszczeniem, po zanieczyszczeniu HY 10-3 i po poddaniu zanieczyszczonych powierzchni wybielaczem. (C) Porównanie fluorescencji niezakażonego homogenatu mózgu 10-4, homogenatu mózgu HY 10-3 i ekstraktu wacika z blatu stołu pokrytego drobną warstwą kurzu. Ujemne kontrole płytki dla paneli A i B obejmują ślepą próbę (roztwór rozcieńczenia tkanki) i niezakażony homogenat mózgu chomika 10-4. Panel B obejmuje dodanie niezakażonego homogenatu mózgu 10-4 i dodatnią kontrolę płytki homogenatu mózgu HY 10-3. Dodatni próg fluorescencji (zilustrowany czerwoną przerywaną linią) określono na poziomie 2. Podany współczynnik maxpoint (MPR) to maksymalna fluorescencja podzielona przez początkowy odczyt fluorescencji uzyskany przez czytnik płytek. Każdy punkt reprezentuje jedną replikację studni technicznej dla danego typu próbki. Przedstawiona jest średnia i odchylenie standardowe. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
Tabela 1: Przykładowy formularz miesięcznej dokumentacji miejsca pobierania wymazów. Kliknij tutaj, aby pobrać tę tabelę.
Rysunek uzupełniający 1: Szablon układu strony pobierania szwów. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Rysunek uzupełniający 2: Miesięczny formularz dokumentacji miejsca pobierania wymazów. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.