Protokół ten zawiera szczegółowy opis wytwarzania, hodowli i analizy chłoniaka z komórek płaszcza w wydrukowanych w 3D hydrożelowych plastrach guza.
Artykuł metodologiczny
Protokół ten zawiera szczegółowy opis wytwarzania, hodowli i analizy chłoniaka z komórek płaszcza w wydrukowanych w 3D hydrożelowych plastrach guza.
Chłoniak z komórek płaszcza (MCL) jest rzadkim, agresywnym nowotworem z komórek B, który często dochodzi do nawrotów i wykazuje ograniczoną odpowiedź na konwencjonalną chemioterapię. Głównym wyzwaniem w badaniach MCL jest hodowla pierwotnych komórek MCL ex vivo, ponieważ komórki mają tendencję do spontanicznej apoptozy, gdy są hodowane w hodowli zawiesinowej 2D. Chociaż modele 3D są znane z tego, że lepiej odsumowują sytuację in vivo guzów litych, ich zastosowanie jest nadal słabo zbadane w chłoniakach. Opracowanie modeli 3D, które odtwarzają warunki in vivo MCL w węźle chłonnym, może zwiększyć ich przeżywalność, ułatwić badanie przesłuchów mikrośrodowiska MCL i guza oraz naśladować odpowiedź na lek in vivo . Tutaj stworzono wydrukowany w 3D model MCL w postaci hydrożelowych plastrów guza wraz ze zoptymalizowaną metodą hodowli. Opracowano standaryzowany proces z wykorzystaniem linii komórkowych MCL lub pierwotnych komórek MCL, w których komórki są zanurzane w hydrożelu zawierającym alginian, kolagen typu I i macierz błony podstawnej poprzez biodrukowanie w kąpieli podporowej żelatyny. Powstałe hydrożelowe plastry guza MCL są hodowane na podłożu filtrującym, aby utrzymać ich stabilność przez cały okres hodowli. Leczenie farmakologiczne może być stosowane do systemu. Odpowiedź pojedynczych komórek wewnątrz hydrożelowego plastra guza można śledzić za pomocą czterokolorowego obrazowania fluorescencyjnego 3D na żywo. Pierwotne komórki MCL wykazały stabilną żywotność, gdy były hodowane w hydrożelowych wycinkach guza. Protokół ten zawiera szczegółowy opis wytwarzania, hodowli i analizy komórek MCL w hydrożelowych wycinkach guza. Dzięki dokładnemu naśladowaniu mikrośrodowiska guza i wykorzystaniu kultury na granicy faz powietrze-ciecz, prezentowany model zwiększa znaczenie fizjologiczne w porównaniu z tradycyjną hodowlą 2D. Oferuje on znaczny potencjał w zakresie postępu zarówno biologicznych, jak i terapeutycznych badań nad MCL.
Chłoniak z komórek płaszcza (MCL) jest rzadkim i agresywnym chłoniakiem nieziarniczym z komórek B pochodzącym ze strefy płaszcza węzłów chłonnych1. Strefa płaszcza składa się z pierścienia małych limfocytów otaczających centrum zarodkowe pęcherzyka komórek B. Zazwyczaj MCL wykazuje agresywny przebieg kliniczny, z częstymi nawrotami po początkowej chemioterapii. Dzięki lepszemu zrozumieniu powstawaniachoroby1 i opracowaniu nowych metod leczenia, w tym immunochemioterapii2,inhibitorów kinazy tyrozynowej Brutona3 lubkoniugatów przeciwciało-lek4, opcje leczenia pacjentów z MCL doprowadziły do poprawy wskaźników odpowiedzi i wydłużenia czasu przeżycia wolnego od progresji. Jednak oporność na leki i nawroty choroby nadal sprawiają, że choroba jest nieuleczalna5. Częściowo wynika to z jego niejednorodności i wpływu mikrośrodowiska guza na rozwój guza i lekooporność6. Wyzwaniem w badaniu MCL jest trudność w hodowli pierwotnych komórek MCL w hodowli zawiesinowej7, ponieważ komórki ulegają spontanicznej apoptozie ex vivo 4,5. Podkreśla to potrzebę alternatywnych podejść do lepszego modelowania MCL w modelach przedklinicznych.
In vivo nowotwory są trójwymiarowymi (3D) strukturami złożonymi z różnych składników komórkowych, w tym komórek nowotworowych, komórek odpornościowych i komórek zrębu, a także składników niekomórkowych, takich jak macierz zewnątrzkomórkowa (ECM). ECM, który składa się z makrocząsteczek, takich jak kolagen i laminina, tworzy złożoną włóknistą siatkę elastycznych włókien, która jest wysoce hydrofilowa, tworząc środowisko podobne do żelu 2,8,9,10. Aby lepiej odtworzyć te warunki in vivo nowotworów ex vivo, opracowano różne modele 3D. W ostatnich latach modele te stały się kluczowe dla badań farmakologicznych i biologicznych nowotworów, koncentrując się głównie na guzach litych11.
Do tej pory dziedzina ta pozostaje słabo zbadana w chłoniakach, ponieważ hematologiczne komórki rakowe mają zdolność wzrostu zarówno w zawiesinie, jak i w otoczeniu zrębu, takim jak węzły chłonne, szpik kostny lub wtórne tkanki limfatyczne12. In vivo komórki MCL rozprzestrzeniają się ze strefy płaszcza węzłów chłonnych do krwi lub szpiku kostnego, chociaż rozmnażają się głównie w węzłach chłonnych, z których pochodzą13,14. W węzłach chłonnych komórki MCL są otoczone limfocytami T, makrofagami i mezenchymalnymi komórkami zrębu, z których wszystkie kontrolują przeżycie lub odpowiedź komórek MCL na leki 14,15,16,17,18. Co więcej, przesłuch mikrośrodowiska MCL i guza, a także porowatość i właściwości mechaniczne są ważnymi czynnikami, które mogą wpływać na odpowiedzi na leki i oporność 6,14. W związku z tym do badania pierwotnego MCL wymagane są standaryzowane i powtarzalne modele 3D guza MCL, które symulują natywne mikrośrodowisko. Do tej pory ustalono głównie modele komórkowe, takie jak sferoidy lub organoidy pierwotnych komórek MCL 6,19. Z powodzeniem zwiększają żywotność i długoterminową hodowlę pierwotnych komórek MCL. Jednak macierz zewnątrzkomórkowa jest niedostatecznie reprezentowana w tych modelach. W tym kontekście zaawansowany biodruk 3D oferuje obiecujące podejście. Dzięki bezpośredniemu składaniu żywych komórek i hydrożeli, technologia ta umożliwia generowanie fizjologicznie istotnych modeli węzłów chłonnych 3D na bazie hydrożelu.
W tym miejscu stworzono biodrukowany model 3D MCL w postaci hydrożelowych plastrów guza wraz ze zoptymalizowaną metodą hodowli. Komórki są osadzane w plastrach hydrożelu na bazie kolagenu typu I, alginianu i Matrigelu poprzez odwracalne zatapianie zawieszonych hydrożeli w dowolnym kształcie (FRESH) bioprinting20. Hydrożelowe plastry guza są hodowane na podłożu filtrującym, co pozwala komórkom MCL rosnąć w otoczeniu, które ściśle odzwierciedla warunki in vivo węzła chłonnego.
Protokół ten zawiera szczegółowy opis wytwarzania, hodowli i analizy komórek MCL w hydrożelowych wycinkach guza. Wykorzystując czterokolorowe obrazowanie fluorescencyjne 3D na żywo, można śledzić żywotność lub odpowiedź na lek pojedynczych komórek wewnątrz hydrożelowego wycinka guza. Pierwotne komórki MCL wykazały lepszą przeżywalność, gdy były hodowane w hydrożelowych wycinkach guza. Model ten stanowi narzędzie do badania biologii MCL i odpowiedzi na leczenie, torując drogę do zrozumienia wpływów mikrośrodowiskowych i zmienności pacjentów z MCL.
Praca z pierwotnymi komórkami MCL musi zostać zatwierdzona przez lokalną komisję etyczną. W tym badaniu komisja bioetyczna Wydziału Lekarskiego, Uniwersytetu Eberharda Karlsa i Szpitala Uniwersyteckiego w Tybindze zatwierdziła pobranie i opracowanie próbek od pacjentów i zdrowych dawców (numer projektu 159/2011BO2) i uzyskano świadomą pisemną zgodę pacjentów zgodnie z Deklaracją Helsińską. Zastosowane tutaj pierwotne komórki MCL zostały wyizolowane z całych węzłów chłonnych pacjenta z MCL, a zatem obejmowały nie tylko komórki MCL, ale także inne komórki, takie jak komórki odpornościowe i fibroblasty.
1. Przygotowanie zawiesiny żelatynowej do kąpieli podtrzymującej
UWAGA: Zawiesina żelatynowa będzie służyć jako kąpiel podporowa podczas procesu biodruku 3D. Indukuje sieciowanie biotuszu, umożliwiając tworzenie struktury 3D. Przygotowanie zawiesiny żelatynowej musi odbywać się w sterylnych warunkach w kapturze do hodowli komórkowych.
2. Przygotowanie biotuszu z komórkami
3. Bioprinting w kąpieli
UWAGA: Jeśli to możliwe, przeprowadź proces drukowania 3D w sterylnym środowisku, takim jak pod kapturem do hodowli komórkowych. Zastosowana drukarka 3D została zmodyfikowana do drukowania FRESH poprzez dodanie przedłużacza pompy strzykawkowej, jak opisano w Hinton et al.20.
4. Hodowla i leczenie plastrów guza hydrożelowego
5. Analiza żywotności komórek za pomocą testu wykluczenia błękitu trypanowego
6. Czterokolorowe obrazowanie fluorescencyjne 3D na żywo
UWAGA: Zastosowane tutaj czterokolorowe barwienie umożliwia różnicowanie między żywymi komórkami (TMRM-dodatnimi), komórkami apoptozowymi (dodatnim substratem kaspazy fluorogenicznej-3) i martwymi komórkami (PicoGreen-dodatnimi)21,22,23. Jądra są wykrywane za pomocą DRAQ5. Jednak protokół ten można dostosować do dowolnego innego fotostabilnego, specyficznego barwnika fluorescencyjnego w celu wykrycia biomarkerów, struktur komórkowych lub wybranych typów komórek. Przed barwieniem upewnij się, że mikroskop jest w stanie wykryć długości fal fluoroforów używanych do barwienia.
Hydrożelowe plastry guza zawierające komórki MCL zostały wygenerowane zgodnie z protokołem opisanym powyżej. Etapy przepływu pracy dla drukowania 3D i hodowli hydrożelowych plastrów guza pokazano na rysunku 1A. Zastosowana drukarka 3D została zmodyfikowana pod kątem druku FRESH poprzez dodanie przedłużacza pompy strzykawkowej, jak opisano w Hinton et al.20 (Rysunek 1B). Jednocześnie wydrukowano do pięciu warstw (rysunek 1C) i wyhodowano je na jednym nośniku filtra (rysunek 1D). Pożywka została dodana poniżej wspornika filtra, aby zapewnić dopływ składników odżywczych do hydrożelowych plastrów guza. Kroplę pożywki dodano na wierzch każdego hydrożelowego plastra guza, aby zapobiec ich wysychaniu. Przegląd pięciu hydrożelowych wycinków guza hodowanych na jednym nośniku filtra pokazano na rysunku 1E, wraz z obrazami z bliska wycinka hydrożelu. Podczas 3-dniowego okresu hodowli hydrożelowe plastry guza były stabilne i utrzymywały swoją strukturę (ryc. 2A). Bezpośrednio po wydrukowaniu pęcherzyki powietrza były obecne w hydrożelowych plastrach guza, ale zniknęły podczas hodowli (ryc. 2A).
Żywotność linii komórkowej MCL Jeko-1 hodowanej w hydrożelowych plastrach guza (3D) w porównaniu z komórkami Jeko-1 hodowanymi w hodowli zawiesinowej (2D) oceniano za pomocą testu wykluczenia błękitu trypanowego (Figura 2B). Po 3 dniach hodowli 80% komórek było zdolnych do życia, w porównaniu z początkową żywotnością 88% komórek Jeko-1 przed drukowaniem. Komórki Jeko-1 hodowane w 2D utrzymały początkową żywotność na poziomie 88%. Nie stwierdzono istotnej różnicy między komórkami Jeko-1 hodowanymi w 2D i 3D. Aby ocenić, czy komórki Jeko-1 namnażają się w plastrach hydrożelu, określono średnią liczbę komórek Jeko-1 na plasterek hydrożelu (Figura 2C). Podczas gdy 5x105 komórek Jeko-1 znajdowało się w każdym wycinku bezpośrednio po wydrukowaniu (d0), liczba ta prawie podwoiła się do 9,3x105 komórek po 3 dniach hodowli.
Rozmieszczenie i status komórek Jeko-1 hodowanych w plastrach hydrożelu oceniano za pomocą czterokolorowego obrazowania fluorescencji na żywo (ryc. 2D) bezpośrednio po wydrukowaniu lub po 3 dniach hodowli. Po wydrukowaniu rekonstrukcje 3D plastrów hydrożelu Jeko-1 wykazały jednorodny rozkład komórek. Większość komórek była dodatnia dla TMRM, markera potencjału błony mitochondrialnej22. Mniejszość komórek była dodatnia pod względem aktywności kaspazy-3, markera indukcji apoptozy23, a także markera martwych komórek PicoGreen21. Po 3 dniach hodowli zaobserwowano wzrost liczby komórek wraz z tworzeniem się klastrów komórkowych. Większość komórek pozostała TMRM-dodatnia, podczas gdy tylko kilka komórek wybarwionych pozytywnie pod kątem aktywności kaspazy-3 lub PicoGreen (Figura 2C).
Aby przeanalizować, czy komórki MCL w plastrach hydrożelu reagują na chemioterapeutyki, komórki Jeko-1 hodowane w hodowli zawiesinowej (2D) lub w plastrach hydrożelowych (3D) traktowano chemioterapeutykiem doksorubicyną, który jest częścią standardowego leczenia pacjentów z MCL24. Ogólna struktura plastrów hydrożelu została zachowana podczas leczenia doksorubicyną (ryc. 3A). Żywotność komórek Jeko-1 hodowanych w plastrach hydrożelu zmniejszała się w zależności od dawki w odpowiedzi na leczenie doksorubicyną. IC50 doksorubicyny w komórkach Jeko-1 był zwiększony, gdy komórki hodowano w plastrach hydrożelu (IC50 = 5,8 μM) w porównaniu z komórkami Jeko-1 hodowanymi w hodowli zawiesinowej 2D (IC50 = 2,0 μM; Rysunek 3B). Czterokolorowe obrazowanie fluorescencji na żywo wykazało zmniejszony TMRM i zwiększony sygnał PicoGreen w komórkach Jeko-1 hodowanych w plastrach hydrożelu w odpowiedzi na leczenie doksorubicyną, potwierdzając zmniejszenie żywotności wywołane leczeniem. Obrazy uzyskane z czterokolorowego obrazowania fluorescencyjnego na żywo zostały zrekonstruowane w 3D, podzielone na segmenty na podstawie sygnału jąder DRAQ5 i przeanalizowane przy użyciu skryptu Python opisanego w pliku uzupełniającym 1. Przykładowa maska segmentacji jest pokazana na rysunku uzupełniającym 1. Numer komórki zidentyfikowany na podstawie sygnału DRAQ5 został wykorzystany do określenia całkowitej liczby komórek. Liczba komórek dodatnia dla aktywności TMRM, PicoGreen i kaspazy-3 została wykorzystana do identyfikacji odsetka odpowiednio komórek żywotnych, martwych lub apoptotycznych. Oznaczanie ilościowe czterokolorowego barwienia żywą fluorescencją komórek Jeko-1 hodowanych w plastrach hydrożelu przez 3 dni z lub bez doksorubicyny 9 μM wykazało porównywalną żywotność do testu wykluczenia błękitu trypanowego (Tabela 2).
Oprócz ustalonych linii komórkowych MCL, pierwotne komórki MCL trzech różnych pacjentów z MCL hodowano albo w hodowli zawiesinowej 2D, albo w plastrach hydrożelu 3D (Figura 4, Figura uzupełniająca 2). Jak potwierdził patolog, wszystkie trzy MCL (pacjent 1-3) miały klasyczną/powszechną morfologię ze wskaźnikami Ki67 wynoszącymi 20%-50%. Pierwotne komórki MCL obejmowały wszystkie typy komórek wyizolowane z węzłów chłonnych pacjenta z MCL, a zatem zawierały nie tylko komórki MCL, ale także inne typy komórek odpornościowych lub komórek zrębu. Żywotność pierwszorzędowych plastrów hydrożelu MCL oceniano za pomocą testu wykluczającego błękit trypanowy. Po 4 dniach hodowli pierwotne komórki MCL w plastrach hydrożelu utrzymały żywotność 43,6% (45,7% w dniu 3) w porównaniu z wyjściową żywotnością 71,0% przed drukowaniem (Figura 4A). Oznacza to zwiększoną żywotność w porównaniu z komórkami hodowanymi w zawiesinie (2D), które miały przeżycie 19,6% po czterech dniach hodowli (28,4% w dniu 3). Żywotność tę zwizualizowano za pomocą czterokolorowego obrazowania fluorescencyjnego na żywo, w którym większość komórek była TMRM dodatnia i żywotna, podczas gdy subpopulacja była dodatnia pod względem aktywności kaspazy-3 i PicoGreen, co wskazuje odpowiednio na apoptozę i śmierć komórki (Figura 4B). Dane ilościowe przedstawione na rysunku 4B przedstawiono w tabeli 2. Komórki pierwotne od dwóch kolejnych pacjentów z MCL wykazały zwiększoną przeżywalność komórek podczas hodowli w wycinkach hydrożelu (3D) w porównaniu z odpowiednią kulturą zawiesinową 2D (rysunek uzupełniający 1).

Rysunek 1: Przebieg pracy druku 3D hydrożelowych plastrów guza. (A) Przepływ pracy druku 3D i hodowli komórek w hydrożelowych plastrach guza. (B) Konfiguracja drukarki używana do biodruku 3D plastrów hydrożelu w kąpieli żelatynowej w kąpieli podtrzymującej. (C) Wydrukowanie planu w oprogramowaniu drukarki 3D. Drukowano do pięciu plastrów hydrożelu jednocześnie. (D) Schematyczne przedstawienie kultury plastrów hydrożelowych. Plastry hydrożelu hodowano na podłożu filtracyjnym w płytce 6-dołkowej. Kropla pożywki została dodana na wierzch każdego plastra hydrożelu, aby utrzymać ich wilgotność. Na jednym nośniku filtra można hodować do pięciu plastrów hydrożelu. (E) Wydrukowane w 3D plastry hydrożelu hodowane na podłożu filtra, jak pokazano na obrazie przeglądowym lub na obrazach z bliska. Paski skali reprezentują 5 mm, 1 mm lub 200 μm, jak wskazano. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Hodowla linii komórkowej chłoniaka z komórek płaszcza (MCL) w wydrukowanych w 3D wycinkach hydrożelu. (A) Zbliżenie reprezentatywnego wycinka hydrożelu zawierającego linię komórkową MCL Jeko-1 po wydrukowaniu (d0) lub po 3 dniach hodowli (d3). Podziałka odpowiada 1 mm. (B) Żywotność komórek Jeko-1 hodowanych w zawiesinie (2D) lub w plastrach hydrożelu (3D) przez 2 dni, zgodnie z oceną za pomocą testu wykluczającego błękit trypanowy. Pokazano średnią ± SD z trzech niezależnych eksperymentów biodruku. (C) Liczba komórek Jeko-1 zawartych w każdym plastrze hydrożelu bezpośrednio po wydrukowaniu (d0) lub po okresie do 3 dni hodowli (d1-d3). Pokazano średnią ± SD z trzech niezależnych eksperymentów biodruku. Nie zaobserwowano różnicy istotnej statystycznie (b.s., p > 0,05, test Manna-Whitneya). (D) Trójwymiarowa rekonstrukcja plastrów hydrożelu Jeko-1 w dniu drukowania (d0) lub po 3 dniach hodowli (d3). Model został wygenerowany z z-stosów czterokolorowego obrazowania fluorescencyjnego 3D na żywo. Żywe komórki są pokazane na czerwono (TMRM), komórki apoptotyczne na żółto (aktywność enzymatyczna kaspazy-3), martwe komórki na zielono (PicoGreen), a jądra na niebiesko (DRAQ5). Podziałka odpowiada 50 μm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rycina 3: Leczenie farmakologiczne linii komórkowej chłoniaka z komórek płaszcza (MCL) w wycinkach hydrożelu. (A) Zbliżenie reprezentatywnego wycinka hydrożelu zawierającego linię komórkową MCL Jeko-1 traktowaną 3 μM doksorubicyną przez 3 dni (d3). Pasek skali reprezentuje 1 mm. (B) Komórki Jeko-1 hodowane w zawiesinie (2D) lub w plastrach hydrożelu (3D) traktowano zwiększonym stężeniem chemioterapeutyku doksorubicyny przez 2 dni. Żywotność komórek oceniano za pomocą testu wykluczenia błękitu trypanowego. Przedstawiono średnią ± SD z czterech niezależnych eksperymentów biodrukarskich. (C) Trójwymiarowa rekonstrukcja plastrów hydrożelu Jeko-1 traktowanych 9 μM doksorubicyną (Doxo) przez 3 dni (d3). Model został wygenerowany z z-stosów czterokolorowego obrazowania fluorescencyjnego 3D na żywo. Żywe komórki są pokazane na czerwono (TMRM), komórki apoptotyczne na żółto (aktywność enzymatyczna kaspazy-3), martwe komórki na zielono (PicoGreen), a jądra na niebiesko (DRAQ5). Podziałka odpowiada 50 μm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Hodowla pierwotnych komórek MCL w wydrukowanych w 3D plastrach hydrożelu. (A) Żywotność pierwotnych komórek MCL hodowanych w zawiesinie (2D) lub w plastrach hydrożelu (3D) przez okres do 4 dni, oceniana za pomocą testu wykluczającego trypan niebieski. Pokazano średnią wykonalność jednego eksperymentu. (B) Trójwymiarowa rekonstrukcja pierwotnych komórek MCL hodowanych w plastrach hydrożelu (3D) przez 3 dni. Stosy Z wygenerowano z plastrów hydrożelu wybarwionych czterokolorowym barwieniem na żywo i przeanalizowano za pomocą konfokalnego laserowego mikroskopu skaningowego (CLSM). Żywe komórki są pokazane na czerwono (TMRM), komórki apoptotyczne na żółto (aktywność enzymatyczna kaspazy-3), martwe komórki na zielono (PicoGreen), a jądra na niebiesko (DRAQ5). Podziałka odpowiada 50 μm. Kliknij tutaj, aby zobaczyć większą wersję tego rysunku.
| Plama | TMRM powiedział: | DRAQ5 powiedział: | NucView405 Podłoże kaspazy-3 | PicoZielony |
| Wzbudzenie/emisja | 548 nm/574 nm | 647 nm/681 nm | 429 nm/ 469 nm | 488 nm/ 520 nm |
Tabela 1: Maksima wzbudzenia/emisji barwników stosowanych do czterokolorowego obrazowania fluorescencyjnego 3D na żywo.
| Próbka | % komórek | ||
| TMRM (Żywe komórki) | PicoGreen (Martwe komórki) | Kaspaza-3 (komórki apoptotyczne) | |
| Jeko-1 Ctrl | 83 | 23.6 | 18.3 |
| Jeko-1 Doxo 9 μM | 27.6 | 81.3 | 86.6 |
| Pierwotny pacjent z MCL 1 | 75.2 | 31.1 | 33.1 |
Tabela 2: Kwantyfikacja rekonstrukcji 3D czterokolorowego barwienia na żywo hydrożelowych plastrów guza hodowanych. Hydrożelowe plastry guza hodowano przez 3 dni i zawierały one komórki Jeko-1 hodowane z lub bez leczenia 9 μM doksorubicyną lub pierwotnymi komórkami MCL (pacjent 1).
Rysunek uzupełniający 1: Identyfikacja komórek na podstawie rekonstrukcji 3D czterokolorowego barwienia na żywo. Rekonstrukcje 3D obrazu konfokalnego oznaczonego DRAQ5 uzyskane z (A) czterokolorowego barwienia na żywo i (B) segmentowanego obrazu na tym kanale, wygenerowanego przy użyciu potoku analizy obrazowania Python. Podziałka reprezentuje 200 μm. Kliknij tutaj, aby pobrać ten rysunek.
Rysunek uzupełniający 2: Hodowla pierwotnych komórek MCL pacjentów 2 i 3 w hydrożelowych plastrach guza.Żywotność pierwotnych komórek MCL (A) pacjenta 2 lub (B) pacjenta 3 hodowanych w zawiesinie (2D) lub w plastrach hydrożelu (3D) przez okres do 4 dni, oceniana za pomocą testu wykluczenia błękitu trypanowego. Pokazano średnią wykonalność jednego eksperymentu. Kliknij tutaj, aby pobrać ten rysunek.
Plik uzupełniający 1: Instrukcje dotyczące analizy rekonstrukcji 3D uzyskanych z czterokolorowego barwienia na żywo. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 2: Skrypt Pythona do analizy rekonstrukcji 3D uzyskanych z czterokolorowego barwienia na żywo. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Dodatkowe kodowanie F ile 1: Plik Stl. zawierający plan hydrożelowych plastrów guza. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Hydrożelowe plastry guza opisane w tym protokole oferują model MCL, który naśladuje strukturę węzłów chłonnych, umożliwiając badanie przeżycia komórek MCL i odpowiedzi na lek w mikrośrodowisku guza 3D generowanym przez biodrukowanie.
Najczęściej stosowane metody biodruku opierają się na ekstruzji, gdzie biotusz jest wyrzucany przez system dozujący. Na przykład w druku atramentowym biotusze są szybko sieciowane po osadzaniu, tworząc struktury3D 25. Takie podejście wiąże się jednak z ograniczeniami, szczególnie pod względem lepkości użytych materiałów i możliwości układania warstw. W przeciwieństwie do tego, wbudowany biodruk 3D oparty na strzykawce, taki jak FRESH bioprinting używany w tym protokole, stosuje podejście żel w żelu. Pozwala to na drukowanie biotuszy o niskiej lepkości, takich jak kolagen, w stabilne konstrukty, co umożliwia naśladowanie złożonego mikrośrodowiska guza20,26. Podczas gdy drukarki 3D opracowane specjalnie do biodruku mogą być drogie, przedstawiona tutaj metoda oferuje bardziej dostępny punkt wejścia. Można go dostosować do standardowych drukarek ekstruzyjnych ze stosunkowo prostymi modyfikacjami. Modyfikacje te można wydrukować w 3D za pomocą niedrogich filamentów, a projekty są dostępne jako zasoby typu open source, na przykład przez Hinton i wsp.20. Należy jednak pamiętać, że przygotowanie hydrożelowej kąpieli podporowej dla FRESH bioprinting jest bardzo wrażliwe na temperaturę i wymaga szczególnej uwagi podczas przygotowywania gnojowicy.
Często drukowane w 3D modele nowotworów są hodowane w systemach pływających, pozbawionych gradientu tlenu in vivo 25, lub w mikroprzepływowych kulturach chipowych27, które wychwytują wysoki stopień złożoności, ale mają niską przepustowość i wymagają dużej konserwacji. Przeszkody te można pokonać za pomocą opisanych tutaj hydrożelowych plastrów guza. Konfiguracja hodowli do pięciu hydrożelowych wycinków guza na granicy faz powietrze-ciecz wywodzi się z hodowli precyzyjnie pociętych plastrów guza litego28. Membrana wspornika filtra zastosowana w tym protokole składa się z membrany z politetrafluoroetylenu (PFTE) o wielkości porów 0,4 μm, która umożliwia wymianę składników odżywczych, ale zapobiega przyłączaniu się komórek lub migracji komórek29. Kultura na membranie PTFE zapewnia fizyczne wsparcie dla plastrów, aby utrzymać ich stabilność i zapobiec ich pękaniu lub rozpadowi. Dodatkowo zapewniają granicę faz powietrze-ciecz, dostarczając tlen głównie z powietrza powyżej i składniki odżywcze z medium poniżej filtra30. W ten sposób system uwzględnia czasoprzestrzenne zmiany w dostarczaniu składników odżywczych, proliferacji komórek i natlenianiu, które mogą wystąpić in vivo25. Hodowane w hydrożelowych wycinkach guza na podłożu filtra, pierwotne komórki MCL utrzymywały żywotność ponad 40% przez 4 dni, co było lepsze niż żywotność obserwowana w hodowli zawiesiny 2D (Figura 3A, Figura uzupełniająca 2). Dalsze badania powinny dotyczyć tego, czy przedłużoną żywotność można osiągnąć przez dodanie cytokin lub współhodowlę z fibroblastami wykazującymi ekspresję CD40L, jak opisano w sferoidach i organoidach pierwotnego guza chłoniaka z komórek B 6,19,30 lub kokulturach pierwotnych komórek MCL z komórkami L fibroblastów eksprymujących CD40L14. Należy rozważyć włączenie takich podejść do hydrożelowych wycinków guza w celu poprawy hodowli pierwotnych komórek MCL, a także podobieństwa do natywnego mikrośrodowiska.
Węzły chłonne zawierają dobrze rozwiniętą sieć włókien macierzy zewnątrzkomórkowej. Ze względu na swój wzór znane są jako włókna siatkowate. Głównie włókna te składają się z kolagenu i składników specyficznych dla błony podstawnej 31,32,33. Aby wygenerować matrycę przypominającą sytuację in vivo w węzłach chłonnych, biotusz używany do generowania hydrożelowych plastrów guza składa się z kolagenu typu I i Matrigel, który składa się z czterech głównych białek ECM błony podstawnej: lamininy, kolagenu IV, enaktyny i perlekanu34. Ponadto alginian jest dodawany do biotuszu w celu ustabilizowania hydrożelowych plastrów guza, co pozwala na przedłużoną hodowlę i transport z jednego naczynia do drugiego za pomocą szpatułki. Testowanie różnych hydrożeli zawierających kolagen i alginian wykazało najwyższą żywotność komórkową w połączeniu ze stabilnym i trwałym plastrem hydrożelu przy użyciu biotuszu z 0,5% alginianu i 20% kolagenu (dane nie pokazane). Oprócz składników, hydrożelowa średnica plastra guza wynosząca 0,8 cm bardziej przypomina średnią średnicę węzłów chłonnych wynoszącą 1 cm35. Obrazowanie 3D na żywo hydrożelowych plastrów guza wykazało ponadto równomierne rozmieszczenie komórek (ryc. 2C).
W tym przypadku zdolność do leczenia plastrów hydrożelu lekami wykazano poprzez leczenie doksorubicyną, która jest częścią terapii R-CHOP (rytuksymab, cyklofosfamid, doksorubicyna, winkrystyna, prednizon), standardowej terapii dla starszych podgrup pacjentów z MCL24. W porównaniu z kulturami 2D, wpływ mikrośrodowiska guza na efekty leczenia można badać w hydrożelowych plastrach guza. Jak pokazano na rycinie 3, komórki Jeko-1 hodowane w plastrach hydrożelu były bardziej odporne na leczenie doksorubicyną niż komórki hodowane 2D. Jest to zgodne z obserwacjami, że macierz zewnątrzkomórkowa może wpływać na reakcje na leki i często zwiększać oporność na leki poprzez modulowanie sztywności guza36, komunikację komórka-komórka37 i dostarczanie leków38. Ponadto analiza cytometrii przepływowej, a także barwienie immunohistochemiczne lub multipleksowe immunofluorescencyjne, mogą dać głębszy wgląd w odpowiedź na leczenie pojedynczych komórek w hydrożelowych wycinkach guza.
Podsumowując, protokół ten opisuje wytwarzanie i hodowlę hydrożelowych plastrów guza, które reprezentują model węzłów chłonnych 3D naśladujący natywną trójwymiarową strukturę węzłów chłonnych. Ma potencjał do rozszerzenia zastosowania z komórek MCL na inne wskazania do chłoniaka pierwotnego.
Badanie to było wspierane przez Fundację Roberta-Boscha oraz Ministerstwo Nauki, Badań Naukowych i Sztuki Badenii-Wirtembergii (3R-Network BW).
Dziękujemy Kerstin Willecke za doskonałą pomoc techniczną i Yang Zhangowi za cenną pomoc w analizie obrazu 3D.
| Nazwa | Firma | Numer katalogowy | Komentarze |
|---|---|---|---|
| &mikro;-slide 8-dołkowe szklane dno | ibidi GmbH | 80827 | Szkiełka ze szklanym dnem stosowane do obrazowania na żywo plastrów hydrożelu |
| 10 kanałów PBS | Carl Roth GmbH + Co.KG | 9150.1 | Składnik biotuszu |
| 10X RPMI-1640 Średni | Sigma-Aldrich | Czynnik R1145 | Składnik biotuszu |
| Strzykawka gazoszczelna 2,5 ml Model 1002 TLL | Hamilton | 81420 | Strzykawka do biodruku |
| Drukarka do wytłaczania 3D, PrintrBot Simple | Drukarka Printrbot | Samomodyfikacja umożliwiająca drukowanie biotuszy | |
| Płytka 6-dołkowa | Th. Geyer GmbH & Co.KG | 7696790 | Kultura plastrów hydrożelu |
| Butelkowe systemy filtracji próżniowej, membrana PES, 500 ml, 0,22 &mikro; m wielkość porów, 70 membrana o średnicy mm | Corning Inc. | 513-3355 | Sterylna filtracja |
| Chlorek wapnia odwodniony | Carl Roth GmbH + Co.KG | Zobacz materiał T885.2 | Składnik buforu do przemywania i zawiesiny żelatynowej |
| Kolagen I ze szczura | Corning Inc. | CLS354249 | Składnik biotuszu |
| Oprogramowanie Cura w wersji 15.04.5 do druku 3D | Ultimaker (Mistrz) | Oprogramowanie używane do druku 3D | |
| DRAQ5 powiedział: | Biostatus Sp. z o.o. | DR50050 | Barwienie do obrazowania na żywo plastrów hydrożelu |
| Kwas etylenodiaminotetraoctowy (EDTA) sól disodowa dwuwodna | Sigma-Aldrich | E5134 | Składnik buforu do rozpuszczania alginianów |
| Automatyczny licznik komórek EVE | Nano EnTek Inc. | 10027-452 | Licznik komórek |
| Bakteriologiczne szalki Petriego Falcon z pokrywką, średnica 35 mm | Sokół | 351008 | Wypełniony zawiesiną żelatynową w celu utworzenia kąpieli podporowej do biodruku |
| Probówki Falcon, 50 ml | Sarstedt AG & Co.KG | 62.547.254 | |
| Surowica cielęca płodu | Sigma-Aldrich | S0615 powiedział: | Suplement pożywki do hodowli komórkowych |
| Żelatyna ze skóry świni | Sigma-Aldrich | Klasa g1890 | Główny składnik zawiesiny żelatynowej |
| HEPES, wolny kwas, klasa biologii molekularnej | Merck KGaA | CAS 7365-45-9 | Składnik buforu do przemywania i zawiesiny żelatynowej |
| Linia komórkowa MCL Jeko-1 | Kontroler ATCC (Kontroler T | CRL-3006 | Linia komórkowa MCL |
| Chusteczki KIMTECH Science Precision | Korporacja Kimberly Clark | 7551 | Służy do odprowadzania nadmiaru wody z zawiesiny żelatynowej i usuwania kropelek z dyszy drukarki 3D |
| Oprogramowanie LAS X w wersji 3.5.7.23225 | Księga Leica | Oprogramowanie wykorzystywane do rekonstrukcji 3D | |
| Leica TCS SP8 Konfokalny laserowy mikroskop skaningowy | Księga Leica | TCS SP8 | Mikroskop konfokalny do obrazowania na żywo |
| Mason Jar Zwykły Kufel 16 Oz | Korporacja Piłkarska | G001 powiedział: | Słoik, w którym przygotowuje się zawiesinę żelatynową |
| Matrigel Growth Factor Reduced (GFR) Matrix Podstawna membrana | Corning Inc. | 356231 | Składnik biotuszu |
| Wkładka do hodowli komórek milikomórkowych, 0,4 i mikro; m Wielkość porów | Merck KGaA | PICMORG 50 | Wspornik filtra do plastrów hydrożelowych |
| NucView 405 Podłoże kaspazy-3, 1 mM w 1x PBS | Biot | 10405 | Barwienie do obrazowania na żywo plastrów hydrożelu |
| Blender z serii Oster Professional | Oster | Zobacz materiał BPST02-B00 | Mieszalnik do wytwarzania zawiesiny żelatynowej |
| Penicylina/Streptamycyna | Gibco (firma Gibco) | 15140163 | Suplement do pożywki do hodowli komórkowych MCL |
| Quant-iT PicoGreen dsDNA Assay-Kits und dsDNA-Reagenzien | Invitrogen | Zobacz materiał P7589 TGL | Barwienie do obrazowania na żywo plastrów hydrożelu |
| Rotina 35 R | Hettich powiedział: | 24573 | Wirowanie komórek |
| Wirówka ROTINA 38/38R | Hettich powiedział: | Z720109 | Odwirowanie zawiesiny żelatynowej |
| RPMI-1640+GlutaMAX | Gibco (firma Gibco) | 61870036 | Baza pożywki dla komórek MCL |
| Alginian sodu | Współpraca z FMC | GQ9109901 | Składnik biotuszu |
| Chlorek sodu | Merck KGaA | 1.06404 | Składnik buforu do rozpuszczania alginianów |
| Cytrynian sodu | Carl Roth GmbH + Co.KG | 3580.1 | Składnik buforu do rozpuszczania alginianów |
| Kaniule Sterican 21G 0,8x22 mm | B.Braun | 9180109 | Dysza do druku 3D |
| Nadchloran tetrametylorodaminy metyloestrowej (TMRM) | Sigma-Aldrich | Zobacz materiał T5428 | Barwienie do obrazowania na żywo plastrów hydrożelu |
| Błękit trypanowy, 0,4% | Sigma-Aldrich | Zobacz materiał T8154 TGL | Bejca do analizy rentowności |
| Wodoodporny termometr | Firma VWR | 620-2099 | Termometr do monitorowania temperatury zawiesiny żelatynowej |