W ciągu ostatnich dwóch dekad coraz więcej badaczy uznało, że doskonałe zdolności adaptacyjne gatunków hibernujących dają nieocenione możliwości odkrycia nowych mechanizmów adaptacji biologicznej i mogą zainspirować przełomy w różnych dziedzinach medycyny, takich jak konserwacja narządów i rehabilitacja metaboliczna 1,2,3,4,5,6,7,8 . Pierwszy kompleksowy protokół chirurgiczny do przedłużonego zachowania wątroby w zimnie i przeszczepu ortotopowego w hibernatorze, wiewiórce ziemnej Daurian (DGS; Spermophilus dauricus), został niedawno ustalony. Wydaje się, że adaptacyjny charakter DGS do chłodzenia umożliwia dłuższe przechowywanie przeszczepów dawcy w chłodni i wysoką przeżywalność po przeszczepie zwierząt biorców. W związku z tym potrzebny jest protokół kontrolny w celu monitorowania pooperacyjnego powrotu zwierząt do zdrowia i przygotowania próbek do różnych badań histopatologicznych i omicznych.
Biorąc pod uwagę znaczące różnice fizjologiczne między DGS a standardowymi modelami gryzoni oraz złożone i dynamiczne zmiany fizjologiczne po przeszczepieniu wątroby u zwierząt biorców, uzyskanie od nich wysokiej jakości próbek ma kluczowe znaczenie dla dalszych analiz, a tym samym dla zrozumienia fizjologii przeszczepu i gospodarza po przeszczepie. Poza pozyskiwaniem, przetwarzaniem i badaniem próbek krwi i tkanki wątroby konwencjonalnymi metodami, udana dysocjacja komórek miąższowych wątroby, które są hepatocytami, i komórek niemiąższowych (NPC), które obejmują komórki śródbłonka, komórki gwiaździste, komórki Kupffera i inne komórki odpornościowe, umożliwiłaby wyjaśnienie złożonych pooperacyjnych interakcji komórkowych i molekularnych z szybko rozwijającą się multiomiką opartą na pojedynczych komórkach. W tym celu od początku lat 50. XX wieku rozwijana jest klasyczna metoda oparta na perfuzji kolagenazy i jest stale udoskonalana 9,10,11. Niemniej jednak odrębna budowa anatomiczna wątroby DGS, zrosty pooperacyjne wywołane rekonstrukcją naczyń krwionośnych oraz wywołane operacją zmiany fizjologiczne w przeszczepach wątroby wymagają precyzyjnego dostrojenia warunków ekstrakcji.
Protokół ten zawiera szczegółowe wytyczne dotyczące postępowania pooperacyjnego i pobierania próbek w systemach gwarancji bezpieczeństwa po przeszczepieniu wątroby. W szczególności protokół ten umożliwia izolację hepatocytów z przeszczepów wątroby z wysoką wydajnością i żywotnością komórek, a także szczegółowo opisuje późniejsze przetwarzanie izolowanych hepatocytów do sekwencjonowania RNA pojedynczej komórki (scRNA-seq).