Rak wątrobowokomórkowy (HCC), trzecia najczęstsza przyczyna zgonów związanych z nowotworami na świecie, charakteryzuje się wysoką heterogenicznością i wskaźnikami nawrotów1. Ta przestrzenna i czasowa heterogeniczność sprawia, że niektóre populacje komórek w tkankach nowotworowych są bardziej aktywne niż inne pod względem metabolizmu, proliferacji, progresji, tolerancji na stres i oporności na leki. Wykrywanie in situ żywotnych komórek w tkankach HCC ma głębokie znaczenie kliniczne i biologiczne, ponieważ komórki te obejmują proliferujące się podklony, populacje oporne na terapię oraz komórki inicjujące przerzuty. Takie żywotne komórki mogą być kluczowymi czynnikami nawrotu guza, unikania układu odpornościowego i niepowodzenia terapeutycznego2.
Jednak obecne technologie profilowania przestrzennego (np. transkryptomika przestrzenna) wymagają specjalistycznego aparaturowania i wiążą się z wysokimi kosztami, podczas gdy tradycyjne analizy zbiorcze często pomijają przestrzenną heterogeniczność żywotnych komórek oraz ich dynamiczne interakcje z komponentami stromalnymi3. Na przykład pozostałe, żywotne komórki HCC po resekcji wykazują odrębne profile metaboliczne, których nie da się wiernie odtworzyć w rozłączonych układach komórkowych4. Dlatego rozwój technologii detekcji przestrzennej jest niezbędny, aby rozwikłać funkcjonalne powiązania między żywotnymi komórkami nowotworowymi a ich mikrośrodowiskiem, co ostatecznie opracuje precyzyjne strategie terapeutyczne. Chociaż konwencjonalne metody, takie jak cytometria przepływowa czy immunohistochemia (IHC), zostały przez naszą grupę wykorzystane do wykrywania żywotnych komórek w HCC, wymagają one dysocjacji lub fiksacji tkanek, co powoduje utratę kontekstu przestrzennego i utrudnia analizę interakcji między komórkami 5,6. Dlatego opracowanie nieniszczycielskich, wysokorozdzielczych technologii do wykrywania in situ żywotnych komórek jest kluczowe dla wyjaśnienia mechanizmów oporności na HCC i kierowania precyzyjnymi terapiami.
Aby szybko wykryć i wyświetlić żywotne komórki w tkankach HCC in situ bez destrukcyjnego leczenia, opracowano prostą metodę hodowli tkanek opartą na 3-(4,5-dimetylotiazol-2-yl)-2,5-difenylottetrazolowym bromku (MTT). Krótko mówiąc, świeże, cienkie tkanki HCC (około 1 × 1 × 0,2 cm3) były najpierw hodowane w podłożu DMEM przez 3 godziny, zawierające 20% surowicy płodowej bydła (FBS) oraz MTT (1 mg/mL). Następnie, po utrwaleniu 4% paraformaldehydu (PFA) i montażu zawierającym DAPI, zamrożone szkiełka tkankowe osadzone w OCT (grubość 20 μm) poddawano mikroskopowej obserwacji pod jasnym lub UV światłem. Żywotne komórki będą wykazywać fioletowe, fioletowo-czerwone lub fioletowo-czarne ubarwienie. Dzięki temu protokołowi z powodzeniem wykryliśmy żywotne komórki w tkankach HCC w ciągu 5 godzin. Jednocześnie ta metoda zachowuje mikroarchitekturę 3D, jest kompatybilna z analizą multiomiki w dalszej fazie i jest prosta, a także oszczędna w czasie i kosztach. Jednak ta metoda wykazuje pewne ograniczenia. Wieloetapowe procesy płukania, sekcjonowania i hodowli mogą wywoływać deformacje strukturalne i apoptozę w tkankach, zwłaszcza w próbkach o wysokim przemionie metabolicznym, takich jak tkanka HCC w tym badaniu. Dodatkowo, zwiększona grubość przekrojów kriosekcyjnych obniża przejrzystość i płaskość mikroskopowych obserwacji.