Artykuł metodologiczny

Badanie porównawcze trybów akwizycji DDA i DIA w spektrometrii mas UPLC-Q-Orbitrap przy użyciu proszku Huaihua

DOI:

10.3791/69227

⸱

3 października 2025

 ,  ,  ,  ,  , 
1School of Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, 2Department of Pharmacy, Shizuishan Maternal and Child Health Hospital, 3Department of Assets and Laboratory Management, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine

W tym artykule

Podsumowanie

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

W tym badaniu porównano tryby DDA i DIA (UPLC-QE-Orbitrap MS) do analizy proszku Huaihua, złożonego TCM. Opracowano zoptymalizowane metody DDA i DIA; związki zostały zidentyfikowane za pomocą Compound Discoverer. Oceniono wydajność (identyfikacja związku, odtwarzalność, jakość spektralna, czułość), dostarczając empirycznych wskazówek dotyczących wyboru trybu skanowania TCM.

Streszczenie

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

W badaniu tym systematycznie oceniano porównawczą wydajność dwóch trybów akwizycji spektrometrii mas, akwizycji zależnej od danych (DDA) i akwizycji niezależnej od danych (DIA), w połączeniu z ultra-wysokowydajną chromatografią cieczową z kwadrupolową spektrometrią mas o wysokiej rozdzielczości (UPLC-Q-Orbitrap HRMS) w celu kompleksowego profilowania chemicznego złożonych preparatów tradycyjnej medycyny chińskiej (TCM). Proszek Huaihua, klasyczna recepta, została wykorzystana jako modelowy system oceny empirycznej. Zoptymalizowane metody akwizycji DDA i DIA ustalono oddzielnie: metoda DDA obejmowała ukierunkowaną strategię wyboru jonów prekursorowych z dostosowanymi parametrami fragmentacji, podczas gdy metoda DIA wykorzystywała strategię segmentowanego okna zmiennych, aby pokryć docelowy zakres m/z , wykonując bezstronną fragmentację wszystkich jonów prekursorowych. Identyfikacja związków została przeprowadzona za pomocą oprogramowania Compound Discoverer. Ocena porównawcza koncentrowała się w szczególności na charakterystyce działania dwóch trybów akwizycji, obejmującej liczbę zidentyfikowanych związków, odtwarzalność, jakość widmową MS/MS oraz czułość wykrywania składników aktywnych o niskiej liczebności. Wyniki wykazały, że tryb DDA przyniósł wyższą całkowitą liczbę wykrytych związków, podczas gdy tryb DIA wygenerował większy odsetek identyfikacji o wysokim poziomie ufności (10,63% z wynikami dopasowania spektralnego >0,8). Warto zauważyć, że podejście DIA wykazało znacznie lepszą odtwarzalność w czasie retencji i powierzchni piku dla sześciu reprezentatywnych związków, przy czym rutyna wykazała >3-krotną różnicę w czasie retencji RSD między dwoma trybami akwizycji. Jednak DDA wytwarzało czystsze widma MS/MS z wyraźnymi jonami fragmentacyjnymi, podczas gdy widma DIA wykazywały interferencję z jonami zanieczyszczającymi. Jednocześnie w ramach projektu DIA skutecznie wykryto składniki aktywne o niskiej liczebności, których chromatogramy jonowe i fragmenty MS/MS nie mogły zostać wyekstrahowane w trybie DDA. Badanie to dostarcza krytycznych dowodów eksperymentalnych i zestawów danych analitycznych w celu poinformowania o wyborze trybów akwizycji spektrometrii mas o wysokiej rozdzielczości do złożonych badań nad preparatami TCM. Kolejni badacze mogą zintegrować uzupełniające się zalety obu podejść, aby osiągnąć podwójne cele w kompleksowej charakterystyce związku.

Wprowadzenie

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Formuły tradycyjnej medycyny chińskiej (TCM) charakteryzują się złożonymi układami chemicznymi ze znacznymi różnicami w stężeniach składników, w szczególności obecnością licznych składników aktywnych o niskiej ilości, co stanowi poważne wyzwanie dla technologii analitycznych. Huaihua Powder, klasyczna i renomowana formuła tradycyjnej medycyny chińskiej, składa się z czterech ziół leczniczych: Sophora japonica, liści Platycladus orientalis, kolców Schizonepeta tenuifolia i skórki Citrus aurantium. Formuła ta zawiera różnorodną gamę substancji bioaktywnych, w tym flawonoidy, alkaloidy i olejki lotne, o znacznych różnicach w ich stężeniach. Służy jako reprezentatywny model układów złożonych1do badania materialnych podstaw formuł TCM. Dokładny, kompleksowy i wiarygodny charakterystyk jego składu chemicznego jest krytycznym warunkiem wstępnym dla wyjaśnienia podstaw materiału farmakodynamicznego i poprawy standardów kontroli jakości.

Ultra-High Performance Liquid Chromatography-Quadrupole-Electrostatic Field Orbitrap High-Resolution Mass Spectrometry (UPLC-QE-Orbitrap MS) stała się podstawową platformą do analizy składników chemicznych w złożonych systemach TCM, ze względu na wyjątkową rozdzielczość, czułość i dokładność masy. Jeśli chodzi o strategie pozyskiwania danych, akwizycja zależna od danych (DDA) i akwizycja niezależna od danych (DIA) to dwa główne tryby 2,3,4 (rysunek 1). Tryb DDA selektywnie wyzwala fragmentację jonów o wysokiej obfitości w oparciu o wstępnie ustawione reguły (np. progi intensywności jonów prekursorowych, dynamiczne wykluczenie), dając ukierunkowane widma MS/MS o wysokiej jakości, które ułatwiają wyjaśnienie strukturalne. Ma jednak ograniczenia 5,6,7,8 w pokrywaniu jonów o niskiej obfitości. W przeciwieństwie do tego, tryb DIA wykonuje niedyskryminacyjną fragmentację wszystkich jonów prekursorowych w określonym zakresie stosunku masy do ładunku przy użyciu ciągłych lub zmiennych okien. Teoretycznie wychwytuje wszystkie wykrywalne jony, znacznie zwiększając zakres i odtwarzalność detekcji, szczególnie nadaje się do nieukierunkowanej analizy globalnej, chociaż wynikowe mieszane widma MS/MS są bardziej skomplikowane do interpretacji 5,9.

Obecnie, podczas gdy techniki DDA i DIA są indywidualnie stosowane w analizie TCM, systematyczne, empiryczne badania porównawcze podstawowych wskaźników wydajności, takich jak szerokość identyfikacji (szczególnie dla składników o niskiej obfitości), jakość widma MS/MS i czułość wykrywania, w ramach tego samego złożonego systemu formuł TCM (np. Proszek Huaihua) pozostają niewystarczające. Wyjaśnienie mających zastosowanie scenariuszy, zalet i ograniczeń tych dwóch trybów w złożonych matrycach TCM ma kluczowe znaczenie dla badaczy w celu optymalizacji wyboru strategii w oparciu o konkretne cele eksperymentalne10.

Kluczowe parametry i ograniczenia zostały podsumowane tutaj, aby poprowadzić czytelników przez możliwość zastosowania tego protokołu. Metoda jest wysoce skuteczna w profilowaniu złożonych matryc ziołowych, z parametrami zoptymalizowanymi dla systemu zawierającego flawonoidy i alkaloidy. Krytyczne okno zmiennej DIA zostało ustawione na 30 m/z po testach empirycznych; Parametr ten musi być dostrojony do próbek o różnych właściwościach fizykochemicznych. Metoda niezawodnie wykrywa jony o niskiej obfitości (obszar piku ~10,5), ale wymaga akwizycji w oddzielnych trybach jonizacji dodatniej i ujemnej, aby zapewnić jakość danych. Podstawowym ograniczeniem jest zależność DIA od bibliotek spektralnych i zaawansowanego oprogramowania do dekonwolucji w celu pewnej identyfikacji, co wpływa na wymagania dotyczące zasobów obliczeniowych.

W związku z tym badanie to ma na celu przeprowadzenie dogłębnego i systematycznego porównania kompleksowej wydajności trybów skanowania DDA i DIA na platformie UPLC-QE-Orbitrap MS, wykorzystując klasyczną formułę Huaihua Powder jako studium przypadku. Opracowane zostaną zoptymalizowane metody skanowania DDA i DIA dostosowane do analizy proszku Huaihua. Przetwarzanie danych będzie odbywać się przy użyciu oprogramowania Compound Discoverer w celu oceny i porównania dwóch modów w następujących wymiarach: (1) całkowita liczba zidentyfikowanych związków; (2) jakość pozyskanych widm MS/MS; (3) odtwarzalność powierzchni pików i czasy retencji reprezentatywnych związków; oraz 4) czułość wykrywania składników aktywnych o niskiej liczebności. Oczekuje się, że badania te dostarczą solidnych dowodów eksperymentalnych i wsparcia danych dla wyboru trybów skanowania spektrometrii mas o wysokiej rozdzielczości w badaniach złożonych systemów TCM, badając potencjał uzupełniających się zalet DDA i DIA w celu osiągnięcia "równowagi między szerokością a głębokością" i przyspieszenia modernizacji TCM.

W trakcie eksperymentu, jeśli chodzi o ustawienie parametrów okna zmiennej segmentowej w trybie akwizycji DIA, sugerujemy ustawienie go na 30 m/z. Jednocześnie efekt zbierania jonów dodatnich i ujemnych osobno jest lepszy.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Protokół

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Odczynniki i sprzęt używany w tym badaniu są wymienione w Tabeli Materiałów.

1. Przygotowanie roztworu testowego proszku Huaihua

  1. Zgodnie z normami przetwarzania "Stir-fried Sophora Flower" w wydaniu 2020 Farmakopei Chińskiej (część I), weź odpowiednią ilość oryginalnego materiału kwiatowego Sophora, usuń zanieczyszczenia i gałęzie, przesiej popiół i zanieczyszczenia, umieść na gorącej patelni i smaż na małym ogniu (100 °C) do uzyskania koloru ciemnożółtego. Wyjmij i ostudź.
  2. Przygotuj przetworzone produkty z liści Platycladus orientalis zgodnie z "0213 Ogólne zasady przygotowania" w wydaniu Farmakopei Chińskiej z 2020 r. (część IV). Weź odpowiednią ilość oryginalnych liści Platycladus orientalis , usuń zanieczyszczenia, umieść na gorącej patelni i smaż na małym ogniu (100 ºC) do żółtego koloru. Wyjmij i ostudź.
  3. Przygotuj przetworzone produkty Zhike zgodnie z metodą "smażonego Fructus Aurantii" w wydaniu Farmakopei Chińskiej z 2020 r. (część I). Weź odpowiednią ilość surowca Zhike, usuń zanieczyszczenia, podgrzej do 100 °C i posyp odpowiednią ilością otrębów pszennych w stosunku 1:10 (materiały do substancji pomocniczych).
    1. Gdy dym się uniesie, dodaj surowe plastry Zhike i szybko podsmaż. Gdy powierzchnia zmieni kolor na żółty lub ciemnożółty, usuń, przesiej otręby, ostudź i odstaw na bok.
  4. Przygotuj proszek Huaihua zgodnie z receptą stosunku wagowego 1:1:1:1 z Chinese Medical Formulology (New Century 3rd Edition). Dokładnie odważyć 1 g każdego proszku ziołowego (przesianego przez sito nr 5).
    1. Połącz proszki w moździerzu i wymieszaj zgodnie z "metodą rozcierania i mieszania" dla proszków tradycyjnej medycyny chińskiej: miel delikatnie i konsekwentnie w jednym kierunku przez 10 minut.
    2. Należy wziąć pod uwagę, że proszek jest równomiernie wymieszany, gdy nie obserwuje się żadnych widocznych smug, aglomeratów ani zmian koloru, co daje jednorodny wygląd w całej mieszaninie. Przygotuj ostateczną próbkę proszku Huaihua przy użyciu tej metody.
  5. Oceń jednorodność mieszania za pomocą znormalizowanego protokołu kontroli wizualnej. Zbadaj mieszaninę proszku w stałych warunkach oświetleniowych na białym tle.
    UWAGA: Mieszaninę należy uznać za jednorodną tylko wtedy, gdy spełnia wszystkie następujące kryteria: jednolity kolor na całej długości, bez widocznych smug lub plam na poszczególnych składnikach; spójna tekstura bez zgrubnej lub drobnej rozbieżności; brak widocznych różnic w odcieniu koloru podczas próbkowania z wielu punktów; i brak zagregowanych granulowanych grudek wykrywalnych po dokładnym przyjrzeniu się. Przeprowadź tę ocenę przez dwóch niezależnych analityków, aby zapewnić spójność.
  6. Odważ dokładnie 0,1 g dobrze wymieszanej próbki proszku Huaihua. Przenieść próbkę do kolby miarowej o pojemności 10 ml. Dodaj 8 ml metanolu.
  7. Ekstrakcję ultradźwiękową wykonywać przez 60 min o mocy 500 W i częstotliwości 40 kHz. Schłodzić do temperatury pokojowej. Uzupełnić objętość do kreski metanolem.
    1. Dobrze wstrząśnij, aby uzyskać końcowe stężenie 10 mg / ml ekstraktu w proszku Huaihua. Przefiltrować przez mikroporowatą membranę (PVDF) o grubości 0,22 μm. Przenieść filtrat do fiolki z próbką w celu przeprowadzenia badań.
      UWAGA: Podczas eksperymentu płynne odpady organiczne i inne powiązane toksyczne i szkodliwe odczynniki zostały sklasyfikowane i oznakowane. Co 2 tygodnie pracownicy Biura Zarządzania Aktywami i Eksperymentami Uniwersytetu Tradycyjnej Medycyny Chińskiej w Chengdu transportują je do wykwalifikowanej instytucji w celu ujednoliconego recyklingu i przetwarzania.

2. Warunki wykrywania dla UPLC-Q-Orbitrap HRMS

  1. Ustawienia parametrów systemu chromatograficznego
    1. Użyj kolumny C18 (3,0 mm × 100 mm, 2,6 μm). Utrzymać temperaturę kolumny na poziomie 30 °C. Zastosować fazę ruchomą A (0,1 % kwasu mrówkowego w wodzie) i fazę ruchomą B (acetonitryl).
    2. Zaprogramuj gradient w następujący sposób: 0-10 min, 5%-20% B; 10-25 min, 20%-50% B; 25-40 min, 50%-95% B; 40-45 min, 95% B. Ustaw natężenie przepływu na 0,3 ml/min. Wstrzyknąć 5 μl próbki.
  2. Wykonaj badanie spektrometrii mas z następującymi ustawieniami parametrów.
    UWAGA: Źródło jonów: Podgrzewana jonizacja elektronrozpylania (H-ESI); Tryb skanowania: W trybie akwizycji DDA pobieraj jednocześnie jony dodatnie i ujemne; w trybie akwizycji DIA pobieraj jony dodatnie i ujemne oddzielnie; Parametry źródła jonów: Napięcie rozpylania +3,5 kV (jony dodatnie)/-2,8 kV (jony ujemne); prędkość przepływu powietrza w osłonie 40 arb; prędkość przepływu powietrza pomocniczego 10 arb; prędkość wydmuchiwania gazu 1 arb; Temperatura rurki transmisyjnej: 320 °C; Temperatura parowania: 350 °C; Poziom RF obiektywu S-Lens: 55%.
    1. Budowa i optymalizacja metody Data-Dependent Acquisition (DDA)
      1. W przypadku pełnego skanowania MS (Full MS) wybierz następujące ustawienia:
        UWAGA: Rozdzielczość: 35 000; Zakres skanowania: 100-1000 m/z; Cel automatycznej kontroli wzmocnienia (AGC): 3e6; Maksymalny czas wtrysku (Max IT): 100 ms.
      2. W polu Data-Dependent MS/MS Scan (dd-MS2) wybierz następujące ustawienia:
        1. W przypadku selekcji jonów molekularnych utrzymuj próg intensywności 5e4. Wyklucz nienaładowane jony i piki izotopów (włącz wykluczanie izotopów). Zastosuj wykluczenie dynamiczne z czasem wykluczenia wynoszącym 15 s i tolerancją masy ±10 ppm, aby zapobiec ponownemu doborowi jonów o wysokiej intensywności.
        2. W przypadku ustawień fragmentacji zachowaj następujące ustawienia: Okno izolacji: 1,0 m/z; Metoda fragmentacji: wysokoenergetyczna dysocjacja zderzeń (HCD); Znormalizowana energia zderzenia (NCE): 20, 40, 60 V; Rozdzielczość wtórna: 17 500; Cel AGC: 1e5; Maksymalny czas trwania: 50 ms; Strategia TopN: Wybierz 3 pierwsze jony molekularne o największej intensywności fragmentacji w każdym cyklu skanowania.
    2. Budowa i optymalizacja metody DIA
      1. W przypadku pełnego skanowania MS użyj tych samych parametrów, co w metodzie DDA.
      2. W przypadku skanowania MS/MS niezależnego od danych (DIA-MS/MS) należy ustanowić strategię segmentowanego okna izolacji zmiennych.
      3. Określ zakres docelowy jako 100-1000 m/z. Podziel okna na podstawie rozkładu obfitości jonów w całym zakresie m/z przy użyciu wysokiej jakości widm DDA w zoptymalizowanych warunkach chromatograficznych. Ustaw zmienne okna, aby zrównoważyć całkowitą obfitość jonów w segmentach, unikając nasycenia lub niewystarczalności.
      4. Zoptymalizuj do 30 okien, aby zrównoważyć pokrycie i czas cyklu.
        UWAGA: Ustawienia fragmentacji - Metoda fragmentacji: HCD; NCE: 20, 40, 60 V; Rozdzielczość: 17 500; Cel AGC: 1e6; Max IT: Automatyczny; Okno zmienne segmentowe: 30 m/z.; Liczba pętli: 30.
      5. Ustalić listę włączeniową na podstawie centralnej masy cząsteczkowej każdego segmentu okna izolacji, np. m/z 115, 145, 175, 205 ...  925, 955, 985.
    3. Proces pozyskiwania danych
      1. Równoważenie układu: Równoważyć kolumnę chromatograficzną z fazą ruchomą przez co najmniej 5 minut.
      2. Bieganie próbki przed eksperymentem: Przygotuj roztwór testowy proszku Huaihua zgodnie z procedurą przygotowania. Wstrzyknąć 5 kolejnych próbek. Oceń stabilność systemu (czas retencji RSD < 2 %, całkowite natężenie prądu jonów RSD < 5 %).
      3. Ślepa próba: Wstrzyknąć ślepy roztwór metanolu w celu odjęcia tła.
      4. Próba proszku Huaihua biega: Analizuj każdą próbkę przez wstrzyknięcie w kolejności losowej. Uruchom wszystkie próbki niezależnie dla każdego trybu skanowania (DDA, DIA).
    4. Przetwarzanie danych
      1. Identyfikacja związków chemicznych
        1. Zaimportuj surowe dane uzyskane za pomocą spektrometrii mas do oprogramowania Compound Discoverer. Ustanów przepływ pracy identyfikacji dla nieznanych komponentów. Wykonaj przetwarzanie szczytowe i wyrównanie pików. Dopasuj zmierzone widma MS/MS do internetowej bazy danych MS/MS mzCloud i lokalnej bazy danych MS/MS mzVault.
        2. Zastosuj następujące parametry filtrowania: próg powierzchni piku 105, odchylenie masy ± 5 ppm zarówno dla jonów pierwotnych, jak i wtórnych oraz wynik dopasowania ≥80. Porównaj przefiltrowane jony z informacjami o związkach z baz danych, wzorców referencyjnych i odpowiedniej literatury, aby zidentyfikować składniki chemiczne.
        3. Specyficzna operacja w oprogramowaniu Compound Discoverer: Utwórz nowy proces analizy i wybierz identyfikator Produkt naturalny/Nieznany produkt naturalny w przepływie pracy Stats Online i Local Database Searchers .
        4. Upewnij się, że węzeł Wykrywanie związków służy do identyfikacji i ekstrakcji pików. Dodaj do obiegu pracy bazy danych Szukaj w mzCloud i Szukaj w mzVault.
        5. Dodaj plik z surowymi danymi i ustaw parametry filtrowania (próg powierzchni piku 105, odchylenie masy ± 5 ppm zarówno dla jonów pierwotnych, jak i wtórnych). Kliknij uruchom , aby wykonać analizę.
      2. Analiza porównawcza powiązanych wskaźników
        1. Ilość identyfikacyjna: Porównaj całkowitą liczbę związków zidentyfikowanych w modach jonów dodatnich i ujemnych zarówno dla trybów DDA, jak i DIA. Skonstruuj mapy rozkładu jonów dla każdego trybu.
        2. Badanie odtwarzalności: Porównaj różnice w czasie retencji (RT) i powierzchni piku (AA) reprezentatywnych związków o wysokiej obfitości (rutyna, kwercytyna), średniej obfitości (neohesperydyna, naringina) i niskiej obfitości (psoralenol, kwas trimetylokolchicynowy) między modami DDA i DIA (n = 5).
        3. Jakość widma MS/MS: Oceń jakość widm jonów fragmentarycznych MS/MS pulegonu, kluczowego związku w Q-Marker, w trybach DDA i DIA.
        4. Wykrywanie składników o niskiej liczebności: Porównaj wykrywanie fragmentów MS/MS reprezentatywnych związków o niskiej liczebności (karwon, adenozyna) w trybach DDA i DIA5.

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Wyniki

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Ogólna identyfikacja związków chemicznych

Chromatogramy całkowitego prądu jonowego proszku Huaihua w dwóch trybach akwizycji pokazano na rysunku 2, z minimalnymi ogólnymi różnicami. W trybie akwizycji DDA zidentyfikowano łącznie 14 958 związków zarówno w trybie jonów dodatnich, jak i ujemnych, podczas gdy 9 489 związków zidentyfikowano w trybie akwizycji DIA (Fi...

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Dyskusja

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

W tym badaniu szczególnie warto wspomnieć o tym, że stwierdziliśmy, że w trybie akwizycji DIA ustawienie wartości okna zmiennej segmentowanej nie powinno być zbyt duże. Próbowaliśmy ustawić go na 300mz i 100mz, ale ostateczny efekt spektralny był słaby. Po wielokrotnych poszukiwaniach i próbach w końcu wybraliśmy okno akwizycji 30mz jako najbardziej odpowiednie. W związku z tym ustawienie okna akwizycji ma decydujący wpływ na powodzenie lub porażkę eksperymentu.

Równolegle przeprowadzono równi...

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Oświadczenia

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Autorzy deklarują brak konfliktu interesów.

Podziękowania

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Niniejsze badanie było wspierane finansowo przez Fundusz Młodzieżowy Fundacji Nauk Przyrodniczych Prowincji Syczuan (nr 2025ZNSFSC1823); Projekt Sadzonki Innowacji Naukowych i Technologicznych w Prowincji Syczuan (MZGC20230055); oraz Program Promocji Badań nad Talentami w Dyscyplinie Uniwersytetu Tradycyjnej Medycyny Chińskiej w Chengdu "Xinglin Scholars" dla Specjalnego Projektu Talentów Szkółkarskich (MPRC2022017).

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Materiały

Lista materiałów użytych w tym artykule
NazwaFirmaNumer katalogowyKomentarze
AcetonitryluRybak termiczny/Czystość chromatograficzna
Oprogramowanie Compound Discoverer 3.3Rybak termiczny/Przetwarzanie danych ze spektrometrii mas i identyfikacja związków
Fructus aurantiiSyczuan Neijiang220709Zioła na receptę Huaihua Powder
Liście Platycladus orientalisShandong Linyi240619Zioła na receptę Huaihua Powder
Kolec SchizonepetaJiangsu Taizhou240601Zioła na receptę Huaihua Powder
Kwiat SophoraSyczuan Guangan241017Zioła na receptę Huaihua Powder
Ultradźwiękowa maszyna czyszczącaJietuo Ultradźwiękowy sprzęt czyszczący Co., LTDZobacz materiał 240HTEkstrakcja składników proszku Huaihua
UPLC-Q-Orbitrap HRMSRybak termiczny/Spektrometr masowy o wysokiej rozdzielczości
WodaFirma Watsons/Ultra czysta woda

Bibliografia

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Wang, D., et al. Establishment of fingerprint and chemical composition study of the classic formula Huaihua San based on two mass spectrometry techniques. Chin Herb Med. 56 (10), 3499-3512 (2025).
  2. Stincone, P., et al. Evaluation of data-dependent MS/MS acquisition parameters for non-targeted metabolomics and molecular networking of environmental samples: Focus on the Q Exactive platform. Anal Chem. 95 (34), 12673-12682 (2023).
  3. Guo, J., Huan, T. Comparison of fullscan, datadependent, and dataindependent acquisition modes in liquid chromatographymass spectrometry based untargeted metabolomics. Anal Chem. 92 (12), 8072-8080 (2020).
  4. FernándezCosta, C., et al. Impact of the identification strategy on the reproducibility of the DDA and DIA results. J Proteome Res. 19 (8), 3153-3161 (2020).
  5. Wang, H. D., et al. A novel hybrid scan approach enabling the ionmobility separation and the alternate datadependent and dataindependent acquisitions (HDDIDDA): Its combination with offline two-dimensional liquid chromatography for comprehensively characterizing the multicomponents from Compound Danshen Dripping Pill. Anal Chim Acta. 1193, 339320(2022).
  6. El Boudlali, H., et al. High-resolution accuratemass spectrometry-baseduntargeted metabolomics: Reproducibility and detection power across data-dependent acquisition, dataindependent acquisition, and AcquireX. Comput Struct Biotechnol J. 27, 2412-2423 (2025).
  7. Guo, J., Shen, S., Xing, S., Huan, T. DaDIA: Hybridizing data-dependent and data-independent acquisition modes for generating high-quality metabolomic data. Anal Chem. 93 (4), 2669-2677 (2021).
  8. Wu, Y., Wang, Y. A comparative study of dataindependent acquisition and datadependent acquisition in liquid chromatographymass spectrometrybased untargeted metabolomics analysis of Panax genus sample. Anal Bioanal Chem. 417 (14), 3215-3228 (2025).
  9. Barkovits, K., et al. Reproducibility, specificity, and accuracy of relative quantification using spectral library-based data-independent acquisition. Mol Cell Proteomics. 19 (1), 181-197 (2020).
  10. Barbier Saint Hilaire, P., et al. Comparative evaluation of data-dependent and data-independent acquisition workflows implemented on an Orbitrap Fusion for untargeted metabolomics. Metabolites. 10 (4), 158(2020).
  11. Zheng, R. L., et al. Screening and extraction process optimization for potential α-glucosidase inhibitors from quinoa seeds. Food Med Homol. 1, 9420004(2024).
  12. Cao, Z. X., et al. Analysis and comparison of staminate flowers components in five Chinese walnut varieties. Food Med Homol. 1, 9420005(2024).
  13. Zhou, J. W., et al. Anti-virulence potential of carvone against Serratia marcescens. Food Med Homol. 1, 9420001(2024).
  14. Tabb, D. L., et al. Interrogating dataindependent acquisition LCMS/MS for affinity proteomics. J Proteins Proteom. 15 (3), 281-298 (2024).
  15. Wartmann, Y., Boxler, M. I., Kraemer, T., Steuer, A. E. Impact of three different peak picking software tools on the quality of untargeted metabolomics data. J Pharm Biomed Anal. 248, 116302(2024).
  16. Bilbao, A., et al. Processing strategies and software solutions for data-independent acquisition in mass spectrometry. Proteomics. 15 (56), 964-980 (2015).
  17. Guan, S., Taylor, P. P., Han, Z., Moran, M. F., Ma, B. Data-dependentindependent acquisition (DDIA) proteomics. J Proteome Res. 19 (8), 3230-3237 (2020).

Dostęp ograniczony. Zaloguj się lub rozpocznij wersję próbną, aby wyświetlić tę treść.

Przedruki i uprawnienia

Poproś o pozwolenie na ponowne wykorzystanie tekstu lub ilustracji tego artykułu JoVE

Poproś o pozwolenie

Tagi

Akwizycja DDAtradycyjna medycyna chi skaidentyfikacja zwi zk wjako widm MS MSczu o detekcjiprofilowanie chemiczne

Powiązane artykuły