Nabłonek jelitowy ściśle współdziała z leżącymi u podstawą mezenchymalnymi komórkami stromalnymi jelita (iMSC), regulując rozwój, homeostazę i regenerację. Jednak standaryzowane metody sekwencyjnego izolowania frakcji nabłonkowej i stromalnej z tkanki wieprzowej są ograniczone. Protokół ten opisuje zoptymalizowany proces stopniowy izolowania krypt i iMSC z tego samego segmentu jejunalnego prosiaczk. Metoda wykorzystuje bufor dysociacyjny na bazie etylendiaminetetraoctowego kwasu octowego/ditiotreitolu (EDTA/DTT) do uwalniania krypt, a następnie trawienie matrycy zewnątrzkomórkowej kolagenazą/dyspazą w celu izolacji iMSC. Takie podejście minimalizuje zmienności przestrzenne w izolowanych komórkach. Izolowane krypty zostały pomyślnie hodowane i utworzyły typowe rozszerzające się, dwuwymiarowe (2D) monowarstwy enteroidalne na płytkach pokrytych kolagenem hydrożelem. Hodowane iMSC przylegały do kolb hodowlanych i wyrażały markery stromalne, takie jak receptor alfa (PDGFRα) pochodzący z płytek krwi (PDGFRα) oraz klaster różnicowania 81 (CD81), co zostało określone przez immunobarwienie. Ogólnie rzecz biorąc, ten zoptymalizowany protokół izolacji daje zarówno komórki nabłonkowe, jak i stromalne z tego samego segmentu czegowiny prosiatka, co stanowi powtarzalną podstawę dla przyszłych badań nad organoidami jelitowymi i systemami kokultury iMSC, aby wyjaśnić mechanizmy kontrolujące interakcje nabłonkowo-stromalne u świń, będąc translacyjnie istotnym modelem replikującym fizjologię człowieka i rozwijającym nauki o zwierzętach.