Komórki ośrodkowego układu nerwowego zmieniają sposób produkcji energii w odpowiedzi na normalne i chorobowe warunki 1,2. Wśród głównych szlaków metabolicznych glikoliza i fosforylacja oksydacyjna (OXPHOS) są kluczowymi szlakami regulującymi funkcje komórek odpornościowych – poddają się one w celu przeprowadzenia silnej i natychmiastowej reakcji na choroby prozapalne i przeciwzapalne, odpowiednio 3,4. W ten sposób komórki odpornościowe mogą przełączać się między szlakami metabolicznymi w odpowiedzi na sygnały zapalne i stany funkcjonalne5. Mikroglej, podobnie jak ich odpowiedniki szpikowe, są metabolicznie powiązane ze swoimi funkcjami i szybko adaptują się do różnych szlaków jako alternatywne paliwo metaboliczne, wykazując elastyczność metaboliczną 6,7. Mikroglej przechodzi szybkie przeprogramowanie metaboliczne podczas stanu zapalnego, a zwiększona glikoliza stanowi kluczowy znak metaboliczny stanów prozapalnych8. Dlatego testy identyfikujące zależność komórek od fenotypu metabolicznego pozwalają nam badać ich stany funkcjonalne w różnych warunkach. W obecnym protokole naszym celem jest ustalenie, czy mikroglej pierwotny opiera się na zwiększonej glikolizie podczas stanów prozapalnych. W tym celu rutynowo wykonujemy testy stresowe glikolizy. Chociaż analizator Seahorse XFe24 (analizator strumienia zewnątrzkomórkowego) był szeroko stosowany do pomiaru ECAR w uwiecznionych liniach komórkowych i przekształconych komórkach, mikroglej pierwotny stawia unikalne wyzwania techniczne, w tym ograniczone wydajności komórek, zmienne właściwości przylegania oraz wysoką wrażliwość na warunki hodowlane, co może zakłócać pomiary metaboliczne. Ponadto zapewnia pomiar ECAR w czasie rzeczywistym, umożliwiając precyzyjną ocenę glikolizy wywołanej mleczanem w wielu punktach czasowych, której nie można uchwycić wyłącznie za końcowe testy mleczanowe. Profilowanie metaboliczne oparte na przepływie zewnątrzkomórkowym zostało szeroko zastosowane w badaniach nad metabolizmem do charakteryzacji bioenergetyki komórek, co czyni ten protokół doskonale przygotowanym do badań nad zmianami metabolicznymi w komórkach podczas aktywacji, modelowania chorób lub testów lekowych. Czytelnicy mogą ocenić przydatność na podstawie potrzeby dynamicznych, wysokorozdzielczych pomiarów glikolizacji w komórkach pierwotnych.
Glukoza jest metabolizowana do pirorozianu poprzez glikolizę, a następnie przekształcana w mleczan w cytoplazmie lub w CO₂ i wodę w mitochondriach. Przekształcenie glukozy w mleczan prowadzi do uwalniania protonów do przestrzeni zewnątrzkomórkowej, co skutkuje zakwaszeniem ośrodka. Analizator strumienia zewnątrzkomórkowego określa tę zakwaszenie jako ECAR9. W teście stresowym glikolizy komórki najpierw inkubują się w medium wolnym od glukozy i pirosurow, a ich bazowy ECAR jest rejestrowany. Pierwszy zastrzyk dostarcza nasyconą ilość glukozy, którą komórki metabolizują poprzez glikolizę do pirorurianu, produkując ATP, NADH, wodę i protony. Zwiększone uwalnianie protonów podnosi ECAR, co odzwierciedla 'glikolizę'. Następnie dodaje się oligomycynę, aby hamować syntezę ATP mitochondrialnej, zmuszając komórki do polegania wyłącznie na glikolizie. Ta zmiana gradientu protonowego dodatkowo zwiększa ECAR i jest mierzona jako maksymalna pojemność glikolityczna komórki. Na koniec wprowadzono 2DG, analog glukozy. Konkurencyjnie hamuje heksokinazę, blokując glikolizę i obniżając ECAR. Ten spadek potwierdza, że wcześniejsze ECAR było zależne od glikolizy. Różnica między maksymalną pojemnością glikolityczną a poziomem glikolizy definiuje rezerwę glikolityczną. Początkowy ECAR przed dodaniem glukozy oznacza nieglikolityczną zakwaszanie z innych procesów komórkowych (Rysunek 1).
Przeprowadziliśmy test stresowy glikolizy za pomocą analizatora strumienia zewnętrznego. Surowe wartości ECAR zostały wyeksportowane do Excela do analizy. Dla każdego schorzenia zidentyfikowaliśmy punkty czasowe odpowiadające bazalnemu ECAR (przed dodatkiem glukozy), glikolizie (po wstrzyknięciu glukozy) oraz pojemności glikolitycznej (po leczeniu oligomycyną). Wartości ECAR z odpowiednich punktów czasowych w każdej fazie oraz w czterech technicznych replikach zostały uśrednione, a glikoliza obliczona jako wzrost ECAR po dodaniu glukozy. Pojemność glikolityczna została obliczona jako wzrost ECAR po dodaniu oligomycyny. Rezerwa glikolityczna została obliczona jako spadek ECAR po wstrzyku 2DG. Te wartości średnie zostały następnie wykorzystane do porównania odpowiedzi metabolicznych między grupami.
Z kolei do oceny tempa zużycia tlenu (OCR) i funkcji mitochondrialnych standardowym podejściem jest test obciążeniowy mitochondrialny (Agilent), który mierzy parametry takie jak oddech podstawowy, oddech powiązany z ATP, wyciek protonow, maksymalny oddech, wolna pojemność oddechowa oraz oddychanie niemitochondrialne. Pomiary te uzyskuje się poprzez kolejne wstrzyknięcie specyficznych inhibitorów mitochondrialnych, oligomycyny (inhibitor syntazy ATP), FCCP (karbonylcyjanowy-4 (trifluorometoksy)fenylhydrazonu), rozłącznika sterującego maksymalnym oddychaniem, oraz rotenonu/antymycyny A (złożonych inhibitorów I/III), co pozwala na ilościową ocenę zdrowia mitochondriów i bioenergetyki 10,11,12,13 . Testy ECAR i OCR są więc wykonywane w różnych warunkach.