$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Stabilność i rozkład temperatury bloku
Podczas opracowywania tego protokołu testowaliśmy liniowość i stabilność czasową temperatury wewnątrz bloku. Po włączeniu systemu chłodzenia i grzejnika czas inicjalizacji bloku wynosi około godziny, podczas której większość z ośmiu równomiernie rozłożonych czujników temperatury osiąga temperaturę docelową i pozostaje stała po przekroczeniu (rysunek 13A). Po tym okresie temperatury rejestrowane przez osiem czujników potwierdzają idealny liniowy rozkład temperatury wzdłuż bloku aluminiowego (rysunek 13B).

Rysunek 13: Liniowość i stabilność czasowa wewnątrz bloku gradientu temperatury. (A) Stabilność czasową temperatur wewnątrz bloku w okresie inkubacji oraz (B) temperaturę rejestrowaną przez czujniki w momencie rozpoczęcia inkubacji. Proszę kliknąć tutaj, aby zobaczyć większą wersję tej figurki.
Temperatura bloku i temperatura gleby
Sprawdziliśmy czas potrzebny na osiągnięcie temperatury pobranej przez osiem czujników próbki gleby wewnątrz bloku (Rysunek 14). W tym badaniu mierzyliśmy temperaturę próbek gleby w ośmiu różnych miejscach w bloku, zlokalizowanych w pobliżu czujników. Czujniki, umieszczone wewnątrz bloku, były wstępnie ustabilizowane w docelowej temperaturze. Zgodnie z opisanym powyżej protokołem, gdy temperatura bloku była stabilna, próbki gleby umieszczano wewnątrz bloku. Do tego testu użyliśmy dodatkowych czujników oddzielonych od bloku. Użyliśmy 15 g gleby, zapewniając, że sonda sensora jest w pełnym kontakcie z glebą. Próbki gleby pozostawiano bez zakapłowania, a temperatura była rejestrowana co minutę przez łącznie 30 minut. Podczas tego testu blok był lekko zamknięty, aby zminimalizować wahania temperatury i odtworzyć jak największe rzeczywiste warunki wykorzystania (całkowicie zamknięte). Stwierdziliśmy, że próbki gleby potrzebują około 12 minut, aby ustabilizować się w docelowej temperaturze. Uznaliśmy ten czas stabilizacji za akceptowalny, biorąc pod uwagę, że inkubacje trwają co najmniej 3,5 godziny. Dodatkowo oceniliśmy liniowość temperatury gleby po 12 minutach inkubacji blokowej. Wyniki wskazują, że temperatury gleby wykazują liniową zależność, ściśle zgraną z liniowością obserwowaną w ośmiu czujnikach (Rysunek 15).

Rysunek 14: Zarejestrowana temperatura gleby inkubowana w różnych temperaturach. Próbki A, B, C i D były inkubowane w fiolkach umieszczonych blisko odpowiednich czujników (patrz Rysunek 10 dla odniesienia). Temperatura gleby była rejestrowana za pomocą termopary umieszczonej bezpośrednio w próbkach gleby. Temperatury monitorowane przez każdy czujnik są następujące: (A) Czujnik 1 (S1) przy 4,1 °C, (B) Czujnik 2 (S2) przy 12,5 °C, (C) Czujnik 3 (S3) przy 20,1 °C, (D) Czujnik 4 (S4) przy 28,1 °C, (E) Czujnik 5 (S5) w 36,1 °C, (F) Sensor 6 (S6) w 43,8 °C, (G) Sensor 7 (S7) przy 51,9 °C oraz (H) Sensor 8 (S8) przy 60 °C. Po umieszczeniu próbek gleby w bloku, osiągnięcie docelowej temperatury zajmuje około 12 minut. Proszę kliknąć tutaj, aby zobaczyć większą wersję tej figurki.

Rysunek 15: Silna liniowa korelacja między temperaturą gleby a temperaturą czujnika. Cztery fiolki z ziemią umieszczono blisko ośmiu czujników w pozycjach blokowych A, B, C i D. Temperatura gleby była rejestrowana za pomocą termopary umieszczonej bezpośrednio w próbkach gleby. Proszę kliknąć tutaj, aby zobaczyć większą wersję tej figurki.
Interakcja temperatura z wilgocią
Istnieje nieunikniona interakcja między temperaturą a wilgocią, którą należy ocenić podczas okresu inkubacji. Na przykład wysokie temperatury mogą przyspieszać parowanie, podczas gdy niskie mogą powodować kondensację wody. W tym teście użyliśmy czterech losowo wybranych próbek gleby o różnych fakturach (Tabela Uzupełniająca 2). Zgodnie z protokołem każda próbka gleby była umieszczana w tej samej pozycji blokowej we wszystkich 22 temperaturach. Wyniki pokazują, że po średnim czasie inkubacji wynoszącym 3,5 godziny wyższe temperatury powodowały większą utratę wilgoci w porównaniu z niższymi, niezależnie od tekstury gleby (Rysunek 16). Gleby inkubowane w temperaturze 60 °C tracą średnio 12% całkowitej dodanej wody, podczas gdy gleby inkubowane przy 4,1 °C tracą średnio tylko 1,88% całkowitej dołączonej wody. Oznacza to, że podczas 3,5 godziny inkubacji blokowej gleby były utrzymywane w warunkach optymalnej wilgotności, od 50% do 60% zdolności zatrzymywania wody, niezależnie od temperatury inkubacji44,45 (Rysunek uzupełniający 6).

Rysunek 16: Względna utrata wilgotności gleby podczas inkubacji blokowej w czterech różnych próbkach. Utrata wilgoci została obliczona względem całkowitej ilości dodanej wody, aby uwzględnić WHC. Proszę kliknąć tutaj, aby zobaczyć większą wersję tej figurki.
Pomiary stężenia CO2
Aby przetestować dokładność i precyzję analizatora gazów, przeprowadziliśmy cztery pomiary certyfikowanego gazu referencyjnego (413 ± 5 ppmCO2), dla których analizator zarejestrował 413,71 ± 0,60 (ppmCO2, średnia ± SD). Potwierdziło to wysoką dokładność i precyzję pomiarówCO2 rejestrowanych przez analizator gazów. Ponadto, aby spełnić wymagania producenta, należy co roku przeprowadzać test z użyciem certyfikowanego gazu referencyjnego.
Biorąc pod uwagę opóźnienie spowodowane linią wtryskową oraz zestawem redukcji przepływu do analizatora gazów, przeprowadzono wiele testów w celu określenia optymalnego czasu pomiaru. Wyniki pokazują, że linia wtrysku powoduje opóźnienie około pięciu sekund. W tym układzie idealny czas pomiaru wynosi 20 s, co pozwala na napełnienie jednostki detekcjiCO2 i osiągnięcie równowagi przez 5 s (rysunek 17). Biorąc pod uwagę, że zestaw redukujący przepływ mierzy 1,17 mL/s, czas pomiaru odpowiada pobieraniu 39% zawartości powietrza z fiolek 60 mL. Dodatkowo zaobserwowaliśmy, że gdy analizator gazów jest używany jako zamknięty system, następuje spadek ciśnienia. Spadek ten występuje w odstępie jednej sekundy, gdy nie ma wtrysku powietrza podczas wyciągania igły z fiolki. Aby uwzględnić ten spadek ciśnienia podczas przetwarzania danych, wykluczyliśmy wartościCO2 , które są nieco niższe (od 3% do 5%) niż poprzednia lub następna wartość.

Rysunek 17: Optimum czasu pomiaru dla pojedynczej próbki gleby inkubowanej w trzech różnych temperaturach. Ten wykres pokazuje czas wstrzyknięcia i ekstrakcji igły, równowagęCO2 przez 5 sekund oraz spadek ciśnienia związany z wybranym okresem. Incubation_ID pokazuje pozycję bloku (C) oraz fiolki (5, 10 i 15). Proszę kliknąć tutaj, aby zobaczyć większą wersję tej figurki.
Testowanie pełnego protokołu
Aby ocenić funkcjonalność i powtarzalność protokołu, inkubowaliśmy dwie różne próbki, każda z czterema technicznymi replikacjami, w 22 oddzielnych temperaturach od 4 °C do 60 °C. Próbki gleby zostały wybrane, aby pokazać rodzaj danych generowanych w tym systemie oraz jego wydajność. Konkretne cechy próby można znaleźć w Tabeli Uzupełniającej 2. Blok gradientu temperatury wiarygodnie rejestrował tempo oddychania gleby różnych próbek gleby w każdym punkcie temperatury, co pozwoliło nam zobrazować krzywą odpowiedzi temperaturowej. Dodatkowo, powstałe krzywe odpowiedzi temperaturowej dla wszystkich replikacji były niemal identyczne, co odzwierciedla niewielkie odchylenie standardowe wokół średnich prędkości oddychania we wszystkich temperaturach (Rysunek 18). Wyniki te wykazują wysoką powtarzalność i potwierdzają precyzję protokołu.

Rysunek 18: Reprezentatywne tempo rozkładu SOM (Rs) dla dwóch gleb, z których każda mierzona jest za pomocą czterech technicznych replik inkubowanych na całym gradientzie temperatury. Punkty oznaczają średnią szybkości oddechu przy każdej temperaturze, a paski błędu wskazują odchylenie standardowe wśród technicznych replik. Proszę kliknąć tutaj, aby zobaczyć większą wersję tej figurki.
Przeprowadzono drugi test, aby wykazać naukową przydatność protokołu. Zmierzyliśmy tempo oddechu gleby na całym gradiencie temperaturowym i dopasowaliśmy dane za pomocą modelu Arrheniusa lub MMRT (rysunek 19). Próbki gleby zostały wybrane, aby zdemonstrować działanie systemu dla kontrastujących krzywych odpowiedzi temperaturowej ( charakterystyka próbki podana jest w Tabeli Uzupełniającej 2). Wyniki pokazują, że dane zebrane za pomocą bloku gradientu temperatury można dodatkowo analizować poprzez testowanie różnych teorii dotyczących wrażliwości na temperaturę tempa rozkładu SOM. Jednak pojawiają się wyzwania przy pracy ze świeżą glebą w każdym eksperymencie. W ciągu 10 dni przed inkubacją obserwowaliśmy społeczności grzybów rozwijające się wewnątrz niektórych fiolek w próbkach gleby poza zestawem reprezentatywnych próbek. Pomimo naszych starań, by starannie usunąć zbiorowiska grzybowe bez zakłócania gleby, ten wzrost wpłynął na wyniki niektórych próbek (Rysunek 20). W związku z tym zdecydowaliśmy się wyrzucić zakażone próbki, usuwając całą próbkę, a nie tylko pojedyncze fiolki dotknięte wzrostem grzybów.

Rysunek 19: Reprezentatywne wyniki i tempo oddychania (Rs) czterech różnych próbek gleby inkubowanych w bloku gradientu temperatury. Czerwona linia oznacza dopasowanie Arrheniusa (A,B), a niebieska linia oznacza dopasowanie MMRT (C,D). Proszę kliknąć tutaj, aby zobaczyć większą wersję tej figurki.

Rysunek 20: Wzorce tempa oddychania u niektórych próbek dotkniętych wzrostem grzybów. Wyniki te są przykładami (A,B) dwóch skażonych próbek, które zostały wykluczone z dalszej analizy. Proszę kliknąć tutaj, aby zobaczyć większą wersję tej figurki.
Ilustracja uzupełniająca 1: Podstawowy obwód NO/NC. "C" może być również oznaczone jako "COM" dla Common. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Dodatkowy rysunek 2: Panel sterowania systemem chłodzenia. Proszę kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Ilustracja uzupełniająca 3: Przełącznik systemowy i wskaźnik światła. (A) Przełącznik blokowego systemu sterowania gradientem temperatury; oraz (B) zielona dioda wskazująca, że czujniki i system grzewczy są WŁĄCZONE. Proszę kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Dodatkowy rysunek 4: Sterowanie nagrzewaczem blokowym z gradientem temperatury w interfejsie online. Proszę kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Rysunek uzupełniający 5: Sekcja diagnostyczna analizatora gazów. Wszystko jest zielone, co oznacza, że instrument jest gotowy do pomiarów. Proszę kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Rysunek uzupełniający 6: Pojemność zatrzymywania wody gleb inkubowanych w różnych temperaturach, pomiary zarejestrowane po 3,5 godzinie inkubacji blokowej. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 1: Szczegółowe instrukcje okablowania. Proszę kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 1: Lista materiałów o wymaganej ilości. Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 2: Charakterystyka próbek gleby używanych do testu utraty wilgoci oraz pełny protokół. Te próbki zostały wybrane, aby zademonstrować funkcjonalność protokołu. Klasyfikacja tekstur podąża za systemem USDA, gdzie gruboziarnisty, glina, muł i piasek wyrażane są w procentach. OC odnosi się do zawartości węgla organicznego (gleby g C·kg-1), pH mierzono w wodzie, aCaCO3 oznacza zawartość węglanu wapnia (gleba g·kg-1). Proszę kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.