Izolacja i uprawa pierwotnych ludzkich komórek T stanowią podstawę badań in vitro i in vivo. Jest dobrze znane, że po aktywacji i ekspansji in vitro, komórki T różnicują się na fenotyp przypominający efektorowy, a wybór suplementów cytokin silnie wpływa na te losy różnicowania9. Komórki CAR T hodowane z IL-7 i IL-15 wykazały lepsze utrzymanie się i lepsze działanie przeciwnowotworowe w modelach na myszach w porównaniu z komórkami T rozwijanymi z IL-229. Dlatego wybór zarówno środków aktywujących, jak i suplementów cytokin jest ważny, aby uzyskać komórki T o pożądanym fenotypie. Porównaliśmy dwa środki aktywujące (CD3/28 kulki i TransAct), które różnicują się pod względem kinetyki ekspansji komórek T, wydajności i stosunku CD4/CD8, przez okres trzech tygodni. Ogólnie rzecz biorąc, komórki T rozwijane po aktywacji kulkami CD3/28 wykazywały wyższy procent komórek CD8+ i niższą częstość komórek CD4+ niż po aktywacji TransAct. Ponieważ komórki T CD8⁺ różnicują się preferencyjnie na fenotyp przypominający TEMRA efektorowy, wybór środka jest kluczową zmienną, która powinna pasować do celów eksperymentu. Oprócz fenotypowych markerów powierzchniowych, ekspresja markerów aktywacji dostarcza informacji o stanie komórek T i funkcjach efektorowych. Zarówno CD25 jak i CD69 są wrażliwymi markerami aktywacji i są zwykle ekspresowane wcześnie po aktywacji. Są one powszechnie używane do oceny aktywacji komórek T, ale także innych typów komórek, takich jak komórki natural killer (NK)30,31,32. Natomiast markery aktywacji CD137 i CD154 wykazywały niższą ekspresję w rozwijanych komórkach T, podkreślając ich potencjał do oceny specyficznej ekspresji CAR T podczas współhodowania z celami. Warto zauważyć, że przy zastosowaniu panelu markerów aktywacji do oceny aktywności CAR T podczas współhodowania z celami (tj. komórkami nowotworowymi), konieczna jest staranna selekcja markerów aktywacji, aby uniknąć wysokiej ekspresji tych markerów na komórkach T nawet w przypadku braku komórek docelowych.
Podczas pracy z pierwotnymi komórkami T należy pamiętać, że ich ekspansja i różnicowanie są silnie zależne od dawcy. Jednak przechowywanie wstępnej próbki w temperaturze 4 °C przed izolacją komórek T i ogólnie krótki czas manipulacji poprawiają wydajność i jakość izolowanych komórek. Wydajność komórek zależy od czasu trwania kroków zamrażania i rozmrażania, ponieważ medium do zamrażania zawiera kryoprotektanty, takie jak dimetylosulfon (DMSO). Podczas gdy DMSO jest niezbędny do zachowania struktur komórkowych podczas zamrażania, jest toksyczny dla komórek w temperaturze pokojowej. Dlatego po rozmrożeniu konieczne jest szybkie manipulowanie i rozcieńczanie DMSO. Podczas elektroporacji komórek T, komórki są najbardziej wrażliwe po impulsie elektrycznym, którego celem jest uczynienie ściany komórkowej przepuszczalną dla mRNA. Ostrożna obsługa komórek, unikanie dodatkowego stresu ścinającego i praca z roztworami podgrzanymi znacznie zwiększy odzyskiwanie i żywotność komórek. Może być korzystne dodanie pozytywnego kontrolnego mRNA, takiego jak CAR o znanej ekspresji lub białka reportera takiego jak GFP, podczas testowania nowej konstrukcji CAR. Zaleca się również włączenie co najmniej komórek transfektowanych MOCK (tj. komórek elektroporowanych bez mRNA) jako kontroli negatywnej. W przypadku badań funkcjonalnych można zastosować mRNA kodujące CAR skierowane przeciwko innemu celowi, aby ocenić specyficzną dla CAR aktywację.
Ponieważ kinetyka ekspresji może zależeć od sekwencji mRNA, ocena kinetyki indywidualnie jest cennym narzędziem do wyboru idealnego punktu czasowego na przeprowadzenie dalszych badań. Ta metoda transfekcji jest przede wszystkim przeznaczona jako szybki, łatwy sposób na równoległe przesiewanie wielu konstrukcji CAR. Ze względu na krótki czas trwania, w którym CAR jest ekspresowany na powierzchni komórki T, nie można przeprowadzić długoterminowych badań. Jednak z wstępnych eksperymentów transfekcyjnych można określić najlepszy projekt CAR, aby przejść do transdukcji wirusowej, jeśli jest to pożądane.
Wreszcie, przeciwciała lub ich sprzężone fluorofory mogą być zamieniane, aby dopasować się do ustawienia eksperymentalnego. Jednak ważne jest, aby wziąć pod uwagę odpowiednie widma ekscytacji i emisji fluoroforów, aby wiarygodnie interpretować wyniki. Co więcej, pojedyncze barwienie jednym przeciwciałem można przeprowadzić w wstępnych eksperymentach, aby zapewnić prawidłową kompensację panelu wielobarwnego. Chociaż nie potrzebowaliśmy kompensacji spektralnej dla proponowanego panelu przeciwciał, może być konieczne ustawienie macierzy kompensacji, gdy panel zostanie zmieniony.
Przedstawiony protokół IVT i elektroporacji oferuje prostą i elastyczną alternatywę dla transdukcji wirusowej wprowadzania konstrukcji CAR do pierwotnych ludzkich komórek T. Ponieważ opiera się całkowicie na dostarczaniu opartym na RNA, można go przeprowadzić w laboratoriach bez dostępu do infrastruktury BSL-2, co