$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Automatyczne i szybkie wykrywanie mpox w przypadkach medycznych jest klinicznie istotne, ponieważ choroba może być podobna do różnych innych wylęgów pęcherzykowych lub krostowych podczas początkowej oceny wzrokowej. Klinicyści w praktyce nie zwracają dużej uwagi wyłącznie na morfologię zmian, ale łączą wzorzec, rozmieszczenie, historię, ryzyko narażenia, kontekst epidemiologiczny oraz potwierdzenie laboratoryjne1. Niemniej jednak narzędzia obliczeniowe wykorzystują obrazy i mogą również przeprowadzić skuteczne zabiegi triage w środowiskach, gdzie profesjonalne badania dermatologiczne są ograniczone lub opóźnione. Jest szczególnie przydatna w śledzeniu epidemii, przesiewaniu teledermatologicznym oraz w miejscach ograniczonych zasobów i znacznej liczbie możliwych przypadków, które powinny być priorytetowo traktowane pod kątem testów potwierdzających.
Podejścia oparte na uczeniu głębokim również okazały się atrakcyjne do tego zadania, ponieważ potrafią wykrywać dyskryminujące obrazy zmian bez użycia ręcznych deskryptorów2. Najpopularniejszy przegląd literatury nadal należy do sieci neuronowych splotowych ze względu na ich skuteczność w rozpoznawaniu lokalnej tekstury, zakresu kolorów i marginesów zmian3. Najnowsze badania dodatkowo rozwinęły ten paradygmat przy pomocy uczenia transferowego, mechanizmów uwagi oraz modułów transformatorów, które próbują modelować większą zależność przestrzenną obrazu. Niemniej jednak literatura dotycząca mpox wykazuje wysokie wyniki i należy podchodzić do nich ostrożnie. Wiele badań korzystało z rzadkich publicznych zbiorów danych, posiadało różne zestawy heterogenicznych klas lub porównywało wyniki z różnymi reżimami wstępnego przetwarzania i walidacji4. W związku z tym często pojawia się dylemat, czy wzrost wydajności jest wynikiem naprawdę lepszego modelu, pożądanego podziału, energicznego wzmocnienia lub różnic w formułowaniu zadania.
Mpox pozostaje jedną z istotnych chorób zakaźnych o negatywnym wpływie na zdrowie publiczne, ponieważ jego zmiany związane z infekcjami skóry mogą być mylone z innymi zmianami pęcherzykowymi i krostowymi na granicy podczas badań ocznych w trakciebadania pierwszego 5. W praktyce klinicyści nie dokonują diagnozy mpox na podstawie morfologii: wzorzec, rozmieszczenie, historia, epidemiologia i potwierdzenie laboratoryjne są elementami decyzji diagnozy6. Niemniej jednak, mogą odegrać korzystną rolę w procesie triage dzięki narzędziom obliczeniowym opartym na obrazach, zwłaszcza gdy doświadczenie dermatologów jest niewystarczające, wolne lub niedostępne. Mogą być stosowane w teledermatologii, w przypadkach, gdy ognisko ma być zwalczane badaniami przesiewowymi, oraz w miejscach o ograniczonych zasobach, gdzie podejrzewane przypadki z listy priorytetów muszą być szybko rozpatrywane7.
Metody oparte na uczeniu głębokim, ponieważ pozwalają na naukę dyskryminacyjnych reprezentacji zmian, byłyby atrakcyjne do tego zadania, ponieważ uczą się takich reprezentacji bez ręcznie tworzonych deskryptorów, w zależności od cech obrazów wejściowych8. W dziedzinie obrazów dermatologicznych panuje gorączka za wykorzystaniem splotowych sieci neuronowych (CNN) do analizy obrazów, ponieważ potrafią one kodować lokalną fakturę, peryferię zmian oraz wyrafinowane znaczenie morfologiczne. Późniejsze badania dostarczyły ten paradygmat poprzez uczenie transferowe, uwagę oraz podmoduły oparte na transformatorach, aby poznać bardziej ogólne relacje przestrzenne i trendy kontekstowe9. Niemniej jednak literatura dotycząca obrazowania mpox jest nadal zróżnicowana. Nie jest rzadkością, że wydajność opiera się nie tylko na wyborze architektury, ale także na strukturze zbioru danych, planie augmentacji, definicji klas oraz strukturze walidacji10. Wtedy dobre wyniki nagłówków niekoniecznie oznaczają wzrost uogólnień.
W obecnych pracach problem ten rozwiązano poprzez zastosowanie bardziej dostrzegalnego i wewnętrznie spójnego binarnego benchmarku klasyfikacji obrazów mpox11. Nie omawia wkładu w formacie proponowania całkowicie nowej architektury hybrydowej, ponieważ metody CNN-transformatora zostały już rozsiane w całej literaturze12. Eksperyment wprowadza standardowe porównanie z jawnym pierwotnym rozkładem binarnym, gdzie dodatkowe wieloklasowe dowody, wstępne przetwarzanie/trening oraz wydajność modelu są rozpatrywane w sposób przyjazny protokołowi, a wydajność modelu w sposób zachowawczy w porównaniu do środowiska eksperymentalnego13. W tym paradygmatze model transformatora CNN może nadal mieć znaczenie funkcjonalne, ponieważ CNN są optymalnie ustrukturyzowane do rejestrowania informacji o lokalnych zmianach, podczas gdy reprezentacje oparte na transformatorze mają potencjał reprezentowania także długodystansowej struktury przestrzennej interesującej w dermatologii.
Najnowsze badania nad klasyfikacją obrazów mpox można podzielić na trzy szerokie nurty badań oparte na określonej metodologii. Ta ostatnia opiera się na konwencjonalnych CNN i transfer-learning ze względu na dojrzałość, szybkość obliczeń oraz odtwarzanie tekstur specyficznych dla zmian14. Ten ostatni bada modele oparte na uwadze lub transformatory, lepiej przystosowane do nauki globalnego kontekstu zmian. Trzecia integruje konwolucyjne i uwagi w hybrydowych potokach, aby zachować lokalną czułość, ale wykorzystując modelowanie kontekstowe większego ciała. Kilka z tych badań wykazuje wysokie wyniki, których nie da się łatwo bezpośrednio porównać, ponieważ różnią się rozmiarem zbioru danych, strategią kuracji, strukturą klas, protokołem wstępnego przetwarzania i walidacji15. Są one zorientowane na klasyfikację binarną, wieloklasowe dyskryminację dermatologiczną, z których nie wszystkie mają takie same kryteria oceny. Zbiory danych Mpox udostępnione publicznie mogą również zawierać niemal duplikaty lub bardzo podobne obrazy, które będą wymagały pozornego zwiększenia wydajności, jeśli split control nie jest wystarczający16.
Przedstawiona analiza opiera się na kontrolowanym zestawie binarnym 2 280 zdjęć zmian skórnych, planowano 1 020 zdjęć mpox oraz 1 260 fotografii innych. Kategoria Inna pokrywa się z zmianami niezwiązanymi z mpox widocznymi gołym okiem, co stawia zadanie klinicznie interesującą formułą wczesnej triage, w porównaniu do pełnego systemu lokalizacji dermatologicznej17. Wszystkie obrazy były zmieniane rozmiarem, normalizowane, standaryzowane, rozszerzone i oceniane w typowym wewnętrznym procesie treningowo-walidacyjnym. Głównym celem było porównanie zachowania konwencjonalnych i hybrydowych modeli głębokiego uczenia w przejrzystym benchmarku oraz wniosek, czy proponowana architektura hybrydowa oferuje lepszą równowagę między dyskryminacją a interpretowalnością w porównaniu do popularnych punktów wyjściowych.
Wyraźną luką, którą obecnie poprawiona wersja wypełnia, nie jest więc tylko prezentacja modelu hybrydowego, ponieważ strategie hybrydowego transformatora CNN zostały już omówione w literaturze. Zamiast tego rozbieżność polega na tym, że potrzebny był bardziej wyraźny, wewnętrznie spójny wskaźnik, który pomija główne binarne zadania i eksploracyjne wyniki wieloklasowe, charakteryzuje proces wstępnego przetwarzania i treningu w sposób powtarzalny oraz prezentuje wydajność modelu w sposób, który nie przecenia nowości ani klinicznej gotowości18. W tym kontekście warto rozważyć architekturę hybrydową, ponieważ CNN doskonale wyróżniają się w lokalnej ekstrakcji cech, a transformatorowa uwaga może teoretycznie modelować globalne konfiguracje zmian i dłuższe połączenia przestrzenne, aby wspomóc diagnostykęwzrokową 19. Praktyczne pytanie nie dotyczy tego, czy projekt hybrydowy będzie miał korzystną równowagę między rozróżnieniem, stabilnością i interpretowalnością w porównaniu z typowymi bazami dotyczącymi tego samego wyselekcjonowanego aspektu danych, lecz czy zapewnia dobrą równowagę opodatkowania, stabilności i interpretowalności.
Najnowsze prace nad analizą obrazów mpox można podzielić na trzy główne nurty badań metod. Pierwsza z nich wykorzystuje tradycyjne CNN i architektury transfer-learning ze względu na ich dojrzałość, efektywność obliczeniową oraz zdolność do uczenia się specyficznych dla zmian tekstur i lokalnych cech morfologicznych20. Drugi strumień umożliwia transformatorowi wzroku lub modelom z wzmocnioną uwagą możliwość uchwycenia szerszych powiązań przestrzennych na polu zmian, szczególnie gdy plamy tekstury składają się z kontekstowego rozkładu zmian, co może być równie ważne jak poszczególne fragmenty tekstury. Trzeci nurt dodaje konwolucyjne i uwagi, aby wspierać hybrydowe potoki, próbując utrzymać lokalną czułość CNN, wykorzystując jednocześnie możliwość modelowania kontekstowego bloków uwagi.
Mimo że większość tych prac deklaruje doskonałą dokładność, porównanie badań krzyżowych nie jest łatwym zadaniem ze względu na różnice w wielkości, strategii kuracji, składzie klas i projekcie walidacji między zbiorami danych21. Istnieją publikacje oceniające rozróżnienie binarne, a te, które oceniają wieloklasową kategoryzację dermatologiczną – niektóre są również zrównoważone pod względem dokładności i przypominania raportu, a inne skupiają się na dokładności22. Ponadto zgłoszone zbiory danych mpox mogą opierać się na zbiorach obrazów online, kuratorowanych kolekcjach lub rozszerzonych podzbiorach, co może zwiększyć raportowaną wydajność, gdy wycieki walidacji pociągów lub niemal duplikaty obrazów nie są dobrze zarządzane. Tabela 1 nie jest zatem jedynie kompendium wcześniejszych prac, lecz raczej schematyczną mapą rodzin modeli, ograniczeń zbioru danych oraz możliwości oferowanych metodami dostępnych w tym badaniu.
Wartość metodologiczna danej pracy odzwierciedla się w bardziej ograniczony i bardziej obronny sposób. W niniejszym artykule omówimy konieczność posiadania przezroczystego binarnego benchmarku z pomocą dostarczonego, kuratorowanego zbioru danych, przedstawimy procedurę wstępnego przetwarzania i treningu oraz bezpośrednio porównamy proponowany model hybrydowy z popularnymi bazami23. Zmiany te oddzielają także główny eksperyment binarny od dowodów multiklasowania uzupełniającego w sposób umożliwiający powiązanie roszczeń dotyczących wydajności z odpowiednim kontekstem eksperymentalnym24. Różnica ta ma decydujący wpływ na analizę dyskursywną zachowania modelu, raportowanych miar i praktyczności.
Głównym eksperymentem tego pisma jest eksperyment klasyfikacji binarnej na mniejszym zbiorze 2280 obrazów zmian skórnych, który został ręcznie wyselekcjonowany. W tym zbiorze danych liczba obrazów zidentyfikowanych jako mpox wynosiła 1 020, a tych sklasyfikowanych jako inne – 1 260. Druga kategoria obejmuje objawy dermatologiczne niezwiązane z mpox o charakterze wzrokowym, głównie zmiany, które w rękopisie określa jako zmiany przypominające ospę wietrzną i odrę25. Ta podwójna nomenklatura czyni tę grupę binarną klinicznie istotną jako prymitywną formułę przesiewową, ponieważ model pyta, czy model potrafi rozbić podejrzenia mpox i wizualnie mylące alternatywy, a jednocześnie jest mniej złożony niż pełny benchmark dermatologii wieloklasowej.
Trening modeli musiał być standaryzowany, a wszystkie obrazy musiały być wstępnie przetwarzane przed trenowaniem. W manuskrypcie wspomniane są także zmiany rozmiaru, normalizacja intensywności, augmentacja oraz konwersja etykiet kategorycznych na binarne. Jednak w zaktualizowanym znaczeniu te kroki są traktowane jako składniki powtarzalnego potoku, a nie jako notatki zapisywane na obrzeżach. Jego zestaw został dalej podzielony na podzbiory szkoleniowe i walidacyjne, składające się z katalogów, a wspomniane wskaźniki wydajności powinny być postrzegane jako wewnętrzne skutki walidacji, a nie jako wskaźniki całkowicie niezależnej grupy testów zewnętrznych. Dla jasności, ta kolekcja 2 280 zdjęć będzie traktowana jako oficjalne dane, na których zostanie przeprowadzona główna analiza. Ujęcie binarne zostało wybrane, ponieważ odzwierciedla wczesne pytanie o segregację, powszechne w praktyce: czy obraz podejrzanej zmiany bardziej prawdopodobne jest mpox niż inne podobne wizualnie schorzenia? To ujęcie jest ograniczone w porównaniu z rozbudowaną diagnozą dermatologiczną, ale stanowi ważny i technicznie interpretowalny punkt wyjścia do porównawczych benchmarków.
Zaktualizowany opis zbioru danych uwzględnia również fakt, że artykuł zawiera dodatkowe wyniki uzyskane przy pomocy różnych struktur klas lub wzbogaconych podzbiorów, które przedstawiono na Rysunkach 1A–I. Zamiast usuwać te materiały, rękopis umieszcza je teraz bezpośrednio w kontekście, umożliwiając czytelnikom przeglądanie wyników będących częścią binarnego benchmarku oraz tych będących częścią eksperymentów wtórnych. Ta metoda zachowa całą dokumentację tego badania, ale nie pozwoli na integrację żadnych niekompatybilnych eksperymentów w jedno twierdzenie.