Zastosowane w niniejszym badaniu protokoły eksperymentalne zostały zatwierdzone przez Komitet Etyczny Szpitala Generalnego Hainan (numer protokołu 2021-239). We wszystkich procedurach eksperymentalnych ściśle przestrzegano Wytycznych Narodowych Instytutów Zdrowia USA dotyczących opieki nad zwierzętami laboratoryjnymi i Deklaracji Helsińskiej. Reagenty oraz sprzęt użyty w tym badaniu wymieniono w Tabeli Materiałów.
1. Model zwierzęcy i projekt eksperymentu
W badaniu tym wykorzystano trzydzieści sześć samców myszy C57BL/6J (4 tygodnie, ok. 20 g). Wszystkie myszy były trzymane w standardowych warunkach laboratoryjnych (20–25 °C, 50%–65% wilgotność względna, cykl 12-godzinne światło/ciemność) z dostępem do żywności i wody ad libitum. Po okresie przystosowania trwającym 7 dni myszy losowo podzielono na dwie grupy (n=18 w każdej): grupę z przeciążeniem żelaza (grupa modelowa), która otrzymała dootrzewnowe wstrzyknięcia żelaza w dekstran (0,2 g/kg) dwa razy w tygodniu przez 4 tygodnie; oraz grupę kontrolną, otrzymującą odpowiednie objętości izotonicznego roztworu soli fizjologicznej dootrzewnowo. Po 4 tygodniach myszy uśmiercono, a tkanki trzustki zebrano do dalszej analizy.
2. Oznaczanie stężenia żelaza w surowicy
Probki krwi pobrane były z zatok oczodołowych podczas znieczulenia 1% pentobarbitalem w okresie dyjnym. Po pozostawieniu na 1 h w temperaturze pokojowej, krew wyśrodkowano przy 4 °C, 3000 obr./min przez 15 min. Surowicę oddzielono i przechowano w temperaturze -80 °C. Stężenie żelaza w surowicy oznaczono za pomocą zestawu kolorymetrycznego do oznaczania żelaza zgodnie z protokołem producenta.
3. Analiza histologiczna
Próbki tkanek trzustki zanurzono w 4% paraformaldehydzie w celu utrwalenia, a następnie zatopiono w parafinie przed przygotowaniem sekcji. Uzyskano sekcje tkankowe o grubości od 4 do 5 μm, które poddano standardowym procedurom odparafinowania i odwodnienia. Następnie przeprowadzono badanie histologiczne za pomocą barwienia hematoksyliną i eozyną, podczas gdy osadzanie żelaza w tkankach trzustki oceniono za pomocą barwienia metodą pruską zgodnie z konwencjonalnymi protokołami barwienia histologicznego.
4. Hodowla komórek i transfekcja małych interferencyjnych kwasów nukleinowych rybonukleinowych
Komórki trzustkowe MIN6 myszy kultivowano w pożywce Dulbecco’s modyfikowanej z wysokim stężeniem glukozy, uzupełnionej o 15% surowicy płodowej wołowej, 100 U/mL penicyliny, 100 μg/mL streptomycyny, 10 mM HEPES, 50 mM pirobinianu sodu i 50 μmol/L β-merkaptoetanol. Wszystkie eksperymenty przeprowadzano w 80% konfluencji komórek. Podczas hodowli komórek pobiera się zawsze 6–8 ml pożywki hodowlowej. Komórki utrzymywano w 37 °C w 5% wilgotnej atmosferze CO2. Do badań funkcjonalnych komórki MIN6 w fazie wzrostu wykładniczego przeprowadzano transfekcję małymi interferencyjnymi (si)RNA (RNAi) selektywnymi dla lncRNA (w oparciu o wyniki mikromacierzy; grupa inhibitora) lub negatywnym RNAi kontrolnym (grupa inhibitora NC) za pomocą Lipofectamine 2000 zgodnie z instrukcją producenta. Po 24-godzinnej kulturze komórki analizowano metodą ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy (qRT-PCR) lub western blot w celu określenia efektywności wyciszenia. Sekwencje docelowe tego siRNA brzmiały: siMEG3: GCGUCUUCCUGUGCCAUUUTTAAAUGGCACAGGAAGACGCTT; siNC: UUCUCCGAACGUGUCACGUTTACGUGACACGUUCGGAGAATT. Każde z badań przeprowadzano w trzech powtórzeniach i powtarzano trzykrotnie.
5. Oznaczanie odwrotnej transkryptazy reakcji łańcuchowej polimerazy
Całkowity RNA wyodrębniono z próbek tkanek trzustki i komórek MIN6 za pomocą komercyjnie dostępnego środka do izolacji RNA opartego na fenolu zgodnie z instrukcją producenta. Komplementarny DNA syntetyzowano za pomocą zestawu do odwrotnej transkryptazy w całkowitej objętości reakcji wynoszącej 20 μL. Po odwrotnej transkrypcji stężenie cDNA większości próbek wynosiło około 1 μg/μL na podstawie analizy ilościowej próbek. Następnie 1 μL szablonu cDNA wykorzystano do ilościowego amplifikacyjnego PCR w czasie rzeczywistym. qRT-PCR przeprowadzono za pomocą zestawu wykrywania PCR opartego na SYBR Green zgodnie z następującymi warunkami cyklu: 95 °C przez 30 s, 90 °C przez 15 s, 60 °C przez 34 s i 68 °C przez 30 s. Poziom ekspresji genu wyznaczono metodą porównawczych cykli progowych (metoda 2-ΔCT). GAPDH wykorzystano jako gen referencyjny wewnętrzny do normalizacji danych PCR w czasie rzeczywistym. Wszystkie procedury eksperymentalne przeprowadzano zgodnie z protokołami producentów, a