Badanie dynamiki astrocytów i neuronów po udarze niedokrwiennym jest niezbędne do zrozumienia mechanizmów powysiłkowych. Jednak obecne metodologie często nie pozwalają na uchwycenie interakcji w czasie rzeczywistym między neuronami i astrocytami u zwierząt wykonujących określone zadania behawioralne, co ogranicza naszą zdolność do badania ostrej fazy patologii udaru. Ten protokół przedstawia zintegrowaną metodę, która łączy modelowanie udaru fototombotycznego z jednoczesnym rejestrowaniem wielokanałowym elektrofizjologii oraz fotometrią światłowodową u czujnych, zachowujących się myszy z wykorzystaniem niestandardowo wykonanego optrodu. Protokół obejmuje indukcję ogniskowego niedokrwienia poprzez fototombozę, a następnie jednoczesne rejestrowanie impulsów neuronów i przejściowych zmian wapnia w astrocytach. Optrod umożliwia jednoczesne wykonanie fototombozy, rejestrowanie sygnałów wapniowych i manipulację optogenetyczną bez konieczności oddzielnych procedur chirurgicznych. Wyniki reprezentatywne potwierdzają sukces w jednoczesnym rejestrowaniu sygnału wapniowego astrocytów i impulsów neuronów. Optogenetyczna manipulacja astrocytami powoduje mierzalne zmiany w wzorcach wyładowań neuronów (zmniejszenie częstotliwości wyładowań neuronów piramidalnych o 1,55 ± 0,45 Hz i neuronów interneuronowych o 3,64 ± 1,37 Hz w porównaniu z przedstymulacją optogenetyczną, n = 2), co potwierdza, że system jest zdolny do badania interakcji astrocytów i neuronów. To zintegrowane podejście radzi sobie z krytycznymi lukiami w metodologii badań nad udarem, zapewniając rejestrację wielomodalną w czasie rzeczywistym od fazy ostrej do przewlekłej udaru u zwierząt zachowujących się.