Wszystkie procedury z udziałem zwierząt były zgodne z wytycznymi National Research Council Guide for the Care and Use of Laboratory Animals i zostały zatwierdzone przez Komisję Etyczną Fuzhou First General Hospital (nr zatwierdzenia 202408002).
Hodowla danio pręgowanego
Wszystkie eksperymenty przeprowadzono z wykorzystaniem danio pręgowanego (Danio rerio) utrzymywanego w standardowych warunkach laboratoryjnych. Do testu toksyczności oraz testu regeneracji po amputacji ogona wykorzystano ryby linii dzikiej AB. Ryby Tg(mpeg1:GFP) wykorzystano specjalnie do obrazowania makrofagów. Tg(mpeg1:GFP) jest linią reporterową makrofagów, w której ekspresja GFP znakuje komórki linii makrofagów pod kontrolą promotora mpeg1 eksprymowanego w makrofagach. Wszystkie linie danio pręgowanego utrzymywano w temperaturze 28.5 °C w 14-godzinnym/10-godzinnym cyklu światło/ciemność. Do eksperymentów wykorzystano wyłącznie embriony prawidłowe morfologicznie. we wszystkich eksperymentach embriony inkubowano w buforze Danieau, który przygotowano z odczynników czystości analitycznej, w tym NaCl, KCl, Ca(NO₃)₂·4H₂O, MgSO₄·7H₂O oraz HEPES z pH dostosowanym do 7.2.
Przygotowanie leku i określenie bezpieczeństwa
Mollugin (40 mg) rozpuszczono w 1 mL DMSO, aby otrzymać roztwór zapasowy o stężeniu 40 mg/mL. Roztwór zapasowy rozcieńczono najpierw 1:10 w buforze Danieau do stężenia 4 mg/mL, a następnie dokonano dalszych rozcieńczeń do stężeń 22, 66 i 200 µg/mL do celów traktowania. Aby określić maksymalne bezpieczne stężenie, zarodki szczepu AB w 48. godzinie po zapłodnieniu (hpf) poddano dechorionacji i dezynfekcji 0,003% podchlorynem sodu, a następnie rozdysponowano do płytek 6-dołkowych (n=20, trzy dołki na grupę). Zarodki inkubowano z Molluginem (22 µg/mL, 66 µg/mL, 200 µg/mL, 240 µg/mL, 280 µg/mL, 320 µg/mL lub 360 µg/mL) w medium E3 przez 48 h w temperaturze 28,5 °C. Przeżywalność monitorowano pod stereomikroskopem, a najwyższe stężenie, przy którym żywotność zarodków wynosiła ≥90%, ustalono jako bezpieczną górną granicę dla kolejnych eksperymentów.
Konstrukcja modelu amputacji i regeneracji ogona
Do badań nad regeneracją embriony typu dzikiego AB w wieku 48 hpf znieczulono 0,03% roztworem trikainy przygotowanym w medium dla embrionów i ułożono bocznie pod stereomikroskopem. Przed amputacją ogona embriony utrzymywano w buforze Danieau. Pod nadzorem stereomikroskopowym wykonano standaryzowaną poprzeczną amputację ogona. Linię amputacji wyznaczono bezpośrednio za końcówką notochordy, przyjmując jej tylny koniec jako punkt orientacyjny. Fałd płetwy ogonowej dystalnie od tego punktu usunięto za pomocą mikroskalpela, aby zapewnić jednolity poziom uszkodzenia u wszystkich osobników. Bezpośrednio po amputacji (0 h) wykonano zdjęcia za pomocą stereomikroskopu fluorescencyjnego. Po amputacji embriony przeniesiono do odpowiedniego medium traktującego na bazie E3 w celu przeprowadzenia testu regeneracji. Roztwory robocze molluginy przygotowano poprzez rozcieńczenie roztworu zapasowego molluginy w medium E3 do stężeń końcowych 22, 66 i 200 µg/mL. Molluginę podawano poprzez kąpiel podczas okresu regeneracji. Aby zachować spójność z ekspozycją na nośnik, nieuszkodzoną grupę kontrolną oraz grupę z modelem uszkodzenia utrzymywano w medium E3 zawierającym 0,5% DMSO, co odpowiadało końcowemu stężeniu DMSO w grupie 200 µg/mL molluginy. Embriony utrzymywano w płytkach 6-dołkowych w temperaturze 28,5 °C przez 2 dni, codziennie odświeżając odpowiednie medium traktujące na bazie E3. Proces regeneracji dokumentowano za pomocą obrazowania w 24 i 48 h po amputacji, zarówno w świetle białym, jak i w ustawieniach fluorescencyjnych, aby ocenić odrastanie ogona oraz rozkład makrofagów. Pomiary obrazów przeprowadzono w programie ImageJ.
W celu kwantyfikacji regeneracji zmierzono odrodzony obszar ogona jako pole powierzchni bezwzględne w µm2, bez normalizacji do wielkości zarodka lub pierwotnego rozmiaru ogona. Aby zminimalizować zmienność, we wszystkich zarodkach amputację wykonano w tym samym punkcie anatomicznym, bezpośrednio za końcem notochordu, a ten sam punkt posłużył do zdefiniowania obszaru pomiarowego we wszystkich grupach. Obszary zainteresowania (ROI) wyznaczono ręcznie w programie ImageJ na podstawie obrysu ogona, a analizy dokonał badacz nieznający przydziału grup terapeutycznych. Do kwantyfikacji obszaru pozytywnego pod kątem makrofagów przeanalizowano w ImageJ obrazy fluorescencji GFP zarodków Tg(mpeg1:GFP). Obszar urazu/regeneracji ogona zdefiniowano ręcznie jako obszar zainteresowania, stosując ten sam punkt anatomiczny, który wykorzystano do pomiaru powierzchni ogona. Obrazy przekształcono na 8-bitową skalę szarości, a fluorescencję tła odjęto, stosując te same ustawienia korekcji tła dla wszystkich obrazów w ramach tego samego eksperymentu. Następnie do wszystkich obrazów w każdym eksperymencie zastosowano jednolity, stały próg fluorescencji w celu zidentyfikowania sygnałów GFP pozytywnych dla makrofagów. Powierzchnię pozytywną dla makrofagów obliczono jako obszar GFP powyżej progu w zdefiniowanym ROI. Pomiary oparto na powierzchni pozytywnej pod kątem fluorescencji, a nie na intensywności fluorescencji czy ręcznym liczeniu komórek. Wszystkie analizy obrazów zostały przeprowadzone przez badacza nieznającego przydziału grup terapeutycznych.
Ekstrakcja RNA i ilościowa PCR w czasie rzeczywistym (qRT-PCR)
Po zakończeniu testu regeneracji embriony z każdego wariantu doświadczalnego zostały zebrane i połączone (co najmniej 20 embrionów na grupę) w celu analizy RNA. Dla każdego wariantu jedna replika biologiczna składała się z połączonej próbki zawierającej co najmniej 20 embrionów z tej samej grupy doświadczalnej. Dla każdego wariantu przygotowano trzy niezależne, połączone repliki biologiczne, które wykorzystano do analizy statystycznej. Całkowite RNA wyizolowano po homogenizacji mechanicznej w odczynniku do ekstrakcji RNA opartym na fenolu/guanidynie. Jakość i stężenie RNA oceniono spektrofotometrycznie poprzez pomiar stosunków A260/A280. cDNA zsyntetyzowano przy użyciu komercyjnego zestawu do odwrotnej transkrypcji. Amplifikację PCR przeprowadzono z użyciem odczynników SYBR Green. Warunki cykliczne qRT-PCR były następujące: wstępna denaturacja w 95 °C przez 30 s, a następnie 40 cykli denaturacji w 95 °C przez 5 s oraz przyłączania/elongacji w 60 °C przez 30 s. Zmierzono poziomy ekspresji genów związanych z apoptozą (caspase-3 i Bcl-2), zapaleniem (TNF-α, IL-1β, IL-6, NF-κB1, TLR4, CCL2 i ICAM1) oraz fenotypem makrofagów (iNOS i arginase-1). β-Actin służyła jako gen referencyjny. Krotność zmian w ekspresji genów określono metodą 2−ΔΔCt. Informacje o starterach zamieszczono w Tabeli 1.
Testy aktywności SOD i CAT
Poziomy SOD i CAT wykorzystano do oceny stanu przeciwutleniającego po urazie ogona. W 48 h po amputacji zebraną z każdej grupy daninę ryb zebrafish poddano homogenizacji w zimnym PBS. Po wirowaniu klarowne ekstrakty wykorzystano do pomiaru SOD i CAT przy użyciu komercyjnych zestawów do testów aktywności. Aktywność SOD zmierzono za pomocą zestawu testowego opartego na WST-1 zgodnie z instrukcjami producenta. Próbki wraz ze wzorcami naniesiono na płytki testowe z 96 dołkami, a absorbancję odczytano za pomocą czytnika mikropłytek. Aktywności enzymów wyznaczono na podstawie krzywych wzorcowych. Wszystkie testy przeprowadzono w trzech powtórzeniach.
Analiza statystyczna
Dane przedstawiono jako średnia ± SEM z co najmniej trzech niezależnych eksperymentów. W przypadku testu toksyczności każdy niezależny eksperyment obejmował jedną partię zarodków, po 20 zarodków na grupę w trzech powtórzeniach w studzienkach. W obrazowaniu regeneracji i obrazowaniu makrofagów u danio pręgowanych Tg(mpeg1:GFP) jednostkami pomiarowymi były pojedyncze zarodki; w każdej grupie przeanalizowano 10 zarodków. Dla analizy qRT-PCR jedna replika biologiczna składała się z próbki zbiorczej zawierającej co najmniej 20 zarodków z tej samej grupy eksperymentalnej, a dla każdego warunku przeanalizowano trzy niezależne zbiorcze repliki biologiczne. W analizie aktywności SOD i CAT dla każdego warunku przeanalizowano pięć niezależnych zbiorczych replik biologicznych. Różnice między grupami analizowano za pomocą jednoczynnikowej analizy wariancji (ANOVA) z testem post hoc Tukeya. Analizy statystyczne wykonano w programie GraphPad Prism. Różnice przy p < 0,05 uznano za istotne statystycznie.