Wszystkie procedury eksperymentalne zostały zatwierdzone przez Instytucjonalny Komitet ds. Opieki i Wykorzystania Zwierząt (IACUC) NIH i były zgodne z polityką Public Health Service dotyczącą humanitarnej opieki i wykorzystania zwierząt laboratoryjnych.
1. Przygotowanie aparatury
UWAGA: Każdy aparat systemu testowego IntelliCage składa się z dużej plastikowej klatki domowej (39 cm x 58 cm x 21 cm), w której może przebywać do 16 myszy tej samej płci. Poprzednie kohorty liczyły od 8 do 16 myszy na klatkę. Aparat wyposażony jest w cztery narożniki operantowe, z których wszystkie są połączone z centralnym mikroprocesorem znajdującym się na górnej pokrywie. Karma dla gryzoni jest dostępna z dużego metalowego zasobnika umieszczonego w centrum pokrywy. Wewnątrz klatki myszy swobodnie przemieszczają się między narożnikami operantowymi a centralną przestrzenią życiową, która jest wyposażona w ściółkę i materiały wzbogacające środowisko. Każdy narożnik operantowy posiada małe okrągłe wejście, które fizycznie umożliwia wejście tylko jednej myszy naraz. Tożsamość myszy jest odczytywana i rejestrowana na podstawie odczytów z podwójnej anteny pierścieniowej RFID oraz czujnika temperatury; oba parametry muszą być dodatnie, aby wizyta została zarejestrowana. W każdym narożniku operantowym myszy mają do dyspozycji dwa porty do wkładania nosa (nosepoke), z których każdy steruje dostępem do jednych z dwóch zmotoryzowanych drzwi. Te programowalne, zmotoryzowane drzwi zapewniają dostęp do jednej z dwóch butelek z poidłem. Badacze ręcznie programują warunki dostępu do butelek z poidłem, a także czułość lickometrów opartych na pomiarze pojemności. Dane dotyczące wizyt, wkładania nosa i lizania są rejestrowane indywidualnie dla każdej myszy i przesyłane za pomocą centralnego mikroprocesora do komputera, na którym zainstalowany jest zastrzeżony system oprogramowania firmy TSE. Choć nie zostanie to omówione w niniejszym protokole, każda komora operantowa zawiera również programowalny zawór do podawania podmuchów powietrza, wykorzystywany w warunkowaniu awersyjnym.
- Wyposażyć plastikową klatkę domową w pięć sprężonych podkładek z włókien bawełnianych (15.24 x 25.4 cm), dwa małe kwadraty z bawełny (5.08 x 5.08 cm) oraz cztery plastikowe struktury do kopania w celu zapewnienia ściółki i wzbogacenia środowiska.
UWAGA: Stosowanie sprężonych podkładek z włókien bawełnianych jest zalecane z dwóch powodów: (1) aby uniknąć potencjalnego wpływu kurzu lub płatków powszechnie stosowanych materiałów ściółkowych na mechanizmy drzwi oraz (2) aby ułatwić identyfikację walk między zwierzętami.
- Umieścić górną pokrywę z narożnikami operacyjnymi w plastikowej klatce domowej.
- Jeśli nie są połączone, podłączyć wszystkie narożniki operacyjne do centralnego mikroprocesora za pomocą dołączonych kabli, a następnie podłączyć centralny mikroprocesor do komputera z zainstalowanym oprogramowaniem TSE za pomocą kabli CAN.
- W przypadku użycia wielu aparatów, podłączyć wszystkie klatki szeregowo do tego samego komputera.
- Podłączyć mikroprocesor do źródła zasilania i upewnić się, że diody LED w każdym narożniku zapalają się, a wszystkie osiem zmotoryzowanych drzwi się porusza.
- Napełnić osiem butelek z poidłami, wlewając do każdej ok. 250 mL wody z kranu (lub innego płynu), mocno docisnąć nakrętki, aby zapewnić szczelność, a następnie delikatnie wkręcić je w otwory likometru, zapewniając ciasne połączenie z likometrem.
UWAGA: Czułość czujników wizyt, wkładania nosa i lizania można opcjonalnie zoptymalizować podczas eksperymentu pilotażowego. Aby dostosować czułość każdego narożnika, należy postępować zgodnie z instrukcjami producenta opisanymi w pliku „Help” programu „Controller”. We wszystkich badaniach stosowano następujące ustawienia: wizyta- 816 ON/768 OFF; wkładanie nosa- 21 ON/26 OFF; likometr- 69 ON/80 OFF/15 time-out.
- Napełnić zasobnik na karmę pokarmem dla gryzoni.
- Włączyć komputer, otworzyć aplikację „Controller” i wczytać wybrany plik eksperymentu.
2. Przygotowanie zwierząt
UWAGA: Zwierzęta powinny zostać wyposażone w transpondery RFID co najmniej tydzień przed rozpoczęciem testów behawioralnych, aby zapewnić odpowiedni czas na rekonwalescencję. Należy używać myszy w wieku co najmniej ~50 dni, o masie ciała przekraczającej 15 g. Implantacja u mniejszych myszy zwiększa ryzyko obrażeń zwierzęcia podczas iniekcji. W zależności od linii myszy, problemem w warunkach utrzymywania w grupach może stać się agresja, zwłaszcza wśród samców. Ryzyko to można zminimalizować, utrzymując wszystkie myszy razem w okresie dojrzewania. Autorzy nie zaobserwowali istotnej agresji w badaniach z dorosłymi (~PND 80–150) myszami typu dzikiego C57BL/6, jednak nie gwarantuje to możliwości zastosowania tego protokołu w odniesieniu do innych genotypów, grup wiekowych lub sposobów utrzymania zwierząt.
- Implantuj myszom podskórnie transpondery RFID w obszarze grzbietowo-szyjnym w celu unikalnej identyfikacji.
- Wydrukuj tabelę danych zawierającą listę wszystkich zwierząt doświadczalnych z wolnym miejscem obok identyfikatora każdego zwierzęcia na naklejkę z kodem kreskowym zawierającym kod RFID.
- Przygotuj wszystkie zwierzęta i niezbędne materiały: transpondery RFID, wielorazowy injektor transponderów RFID oraz zestaw do indukcji izofluranem.
- Umieść pierwszą mysz w komorze indukcyjnej i znieczul za pomocą odparowanego izofluranu (przepływomierz tlenu: 1.5 mL/min, izofluran: 1.5–3.5%) do momentu, aż mysz zacznie oddychać głębokimi, przerywanymi oddechami i przestanie reagować na uciśnięcie palca u stopy.
- Oczekując na znieczulenie myszy, załaduj transponder RFID do injektora, przykręcając załadowaną igłę do podstawy injektora, a następnie powoli wysuwając strzykawkę, aż pojawi się mikrochip.
- Przyklej kod kreskowy z kodem RFID do wydrukowanej tabeli danych obok odpowiedniego identyfikatora zwierzęcia.
- Wyjmij mysz z komory indukcyjnej i implantuj załadowany transponder RFID podskórnie w obszarze grzbietowo-szyjnym.
- Po uprzednim potwierdzeniu, że mysz nie reaguje na uciśnięcie palca u stopy, chwyć kark myszy bezpośrednio nad łopatkami za pomocą kciuka i palca wskazującego niedominującej ręki.
- Używając dominującej ręki, wprowadź igłę injektora podskórnie w tylną część karku myszy, dbając o to, aby igła znajdowała się powyżej kręgosłupa i równolegle do niego, aby uniknąć zranienia zwierzęcia.
- Przy końcówce strzykawki znajdującej się w karku myszy i stabilnie unieruchomionej między kciukiem a palcem wskazującym, ostrożnie przesuń dominującą rękę tak, aby móc nacisnąć tłok injektora.
- Wstrzyknij transponder RFID, utrzymując kark myszy ściśnięty palcami niedominującej ręki, tak aby poczuć moment opuszczenia mikrochipu z końcówki strzykawki.
- Trzymając kark ściśnięty, powoli wyjmij injektor. Puść kark dopiero po całkowitym usunięciu injektora, aby zapobiec wypadnięciu transpondera.
UWAGA: Opcjonalnie można zawiązać pojedynczy szew, aby zamknąć skórę podczas znieczulenia myszy.
- Przenieś mysz do klatki macierzystej i monitoruj wybudzanie z narkozy do czasu pełnej sprawności ruchowej.
- Monitoruj mysz pod kątem wszelkich oznak upośledzenia fizycznego, w tym częściowego paraliżu, utykania lub krążenia w kółko, co może wskazywać na wstrzyknięcie poza docelowy obszar. Jeśli upośledzenia utrzymują się dłużej niż 24 h lub poważnie wpływają na dobrostan zwierzęcia, przeprowadź humanitarną eutanazję.
- Skieruj czytnik transponderów RFID nad obszar grzbietowo-szyjny myszy i zeskanuj go, aby potwierdzić prawidłowe umiejscowienie.
- Opcjonalnie pobierz próbkę tkanki do genotypowania.
- Powtórz procedurę dla wszystkich myszy doświadczalnych.
- Jeden dzień po początkowej implantacji transponderów RFID użyj czytnika transponderów RFID, aby zweryfikować, czy żadna z myszy nie utraciła transpondera. W przypadku utraty transpondera przez jakąkolwiek mysz, powtórz procedurę z nowym transponderem i odpowiednio zaktualizuj dokumentację.
UWAGA: Zazwyczaj, jeśli transponder RFID ma wypaść, dzieje się to w ciągu 24 h od implantacji. Może to być spowodowane nieprawidłowym umieszczeniem transpondera RFID i/lub pielęgnacją lub drapaniem przez mysz w miejscu wstrzyknięcia. Unikaj ponownego wstrzykiwania w miejsca poprzednich ran po iniekcji i wyklucz myszy po trzech nieudanych próbach implantacji transpondera RFID.
- Przed przeniesieniem myszy do aparatury IntelliCage zweryfikuj, czy wszystkie transpondery RFID są poprawnie odczytywane. Zważ i zapisz masę ciała wszystkich myszy.
3. Przygotowanie plików eksperymentalnych
UWAGA: System testowy IntelliCage jest sterowany i obsługiwany za pomocą graficznych interfejsów użytkownika dostarczonych przez TSE. Do przeprowadzania eksperymentów w systemie IntelliCage używa się trzech aplikacji: „Designer”, „Controller” oraz „Analyzer”. Różne fazy eksperymentu są uruchamiane za pomocą odrębnych plików eksperymentu, które są projektowane w aplikacji „Designer”, a następnie uruchamiane w aplikacji „Controller”. Szczegółowe informacje na temat projektowania i dostosowywania plików eksperymentu zostały opisane wcześniej48,49. Aby ułatwić replikację protokołu, udostępniono szablony czterech plików eksperymentu użytych w badaniu (Habituation.experiment, Water Training.experiment, Intermittent Alcohol.experiment, Open Bar.experiment). W plikach tych zmiany faz następują o godzinie 12:30. Autorzy wybrali tę godzinę, ponieważ zwierzęta przebywały w cyklu światła od 6:00 do 18:00. Pozwoliło to na nieprzerwaną fazę ciemności w celu pomiaru zachowań związanych z piciem. Badacze mogą jednak chcieć zmienić ten czas, aby był on zgodny z innymi metodologiami spożywania alkoholu, takimi jak procedury „picia w ciemności” (drinking in the dark)50.
- Przygotuj pliki eksperymentalne w aplikacji „Designer”.
UWAGA: W przypadku korzystania z plików szablonów, przed wprowadzeniem aktualnej kohorty należy usunąć cztery przykładowe zwierzęta. Należy również zmienić nazwy grup zgodnie z planem eksperymentalnym i dodać grupy w razie potrzeby. Należy upewnić się, że nowe grupy zaczynają się od tego samego klastra co grupy w szablonie.
- Otwórz plik Habituation.experiment w aplikacji „Designer” i uważnie wprowadź identyfikator zwierzęcia, kod transpondera RFID oraz grupę eksperymentalną/genotyp dla każdej myszy. Zapisz plik pod nową nazwą, aby zachować plik szablonu.
UWAGA: W przypadku błędnego wpisania kodów transponderów RFID dane nie zostaną zapisane. Przypisanie zwierząt do odpowiednich grup eksperymentalnych ułatwi monitorowanie ich zachowania i ostateczną analizę danych.
- Wyeksportuj informacje o zwierzętach do pliku animals.
- Dla każdej fazy eksperymentu otwórz odpowiedni plik eksperymentalny i załaduj plik animals. Zapisz i odpowiednio nazwij pliki.
- W przypadku projektowania plików na oddzielnym komputerze, pobierz pliki eksperymentalne na przenośny dysk flash w celu transportu do pomieszczenia behawioralnego.
- Pobierz wszystkie pliki eksperymentalne na komputer podłączony do aparatury IntelliCage i otwórz pierwszy plik w aplikacji „Controller”. Zweryfikuj, czy wszystkie informacje zostały poprawnie załadowane.
- Stwórz, w formie papierowej lub elektronicznej, dziennik eksperymentalny, w którym odnotowuje się datę i godzinę rozpoczęcia/zakończenia poszczególnych faz eksperymentu. Będzie to znacznym ułatwieniem w analizie, ponieważ pewne warunki farmakologiczne (np. alkohol z dodatkiem chininy) nie są zapisywane w plikach archiwalnych IntelliCage.

Rysunek 2: Harmonogram eksperymentalny dla operantowego paradygmatu przerywanego picia alkoholu. (A) Schemat aparatury IntelliCage z butelkami do picia zawierającymi alkohol w dwóch z czterech narożników. (B) Harmonogram eksperymentalny przedstawiający plan wszystkich faz eksperymentu, zastosowany w poprzedniej publikacji23. Kohorta 1 przeszła test alkoholu z domieszką chininy po zakończeniu przerywanego picia alkoholu, natomiast kohorty 2 i 3 powróciły do przerywanego picia alkoholu po domieszce. (C) Szczegółowy kalendarz eksperymentalny przedstawiający zmiany w oprogramowaniu dla wszystkich faz eksperymentalnych: habituacji, treningu z wodą, przerywanego picia alkoholu, testu alkoholu z domieszką chininy oraz picia alkoholu w trybie „open bar”/wolnego dostępu. Wymiana klatek jest planowana co najmniej raz w tygodniu po zakończeniu modułu „Alcohol Access ON”. Ilustracje wykonane z zmodyfikowanych szablonów BioRender przez Lucy Anderson, licencjonowane na podstawie CC BY 4.0 (https://BioRender.com/ko79xuy). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
4. Przeprowadzenie eksperymentu
UWAGA: Operantny paradygmat przerywanego spożycia alkoholu składa się z pięciu faz: (1) habituacji, (2) treningu z wodą, (3) przerywanego spożycia alkoholu, (4) testu alkoholu z domieszką chininy oraz (5) „otwartego baru”/swobodnego dostępu do alkoholu. Każda faza eksperymentu jest uruchamiana przy użyciu różnych plików eksperymentu, z wyjątkiem przerywanego spożycia alkoholu oraz testu alkoholu z domieszką chininy, które oba wykorzystują parametry określone w pliku Intermittent Alcohol.experiment. Poza wymianą klatek, badacze powinni sprawdzać stan myszy co najmniej trzy razy w tygodniu, aby ocenić dobrostan zwierząt i upewnić się, że oprogramowanie działa prawidłowo. Wszelkie myszy, u których stwierdzono urazy lub złe samopoczucie, należy wykluczyć z eksperymentu. Przykładowy harmonogram eksperymentu przedstawiono na Rysunku 2.
- Wymiana klatek
UWAGA: Wymianę klatek należy przeprowadzać co najmniej raz w tygodniu. Podczas podawania alkoholu zmiany te należy wykonywać wyłącznie po godzinie 12:30 w trakcie fazy „Water Access ONLY” (tylko dostęp do wody), aby nie przerywać spożycia alkoholu. W tym celu pliki Intermittent Alcohol.experiment oraz Open Bar.experiment będą zawsze rozpoczynać się od fazy „Water Access ONLY”. Ze względu na rozmiar klatek, samodzielna obsługa zajętych klatek jest trudna. Autorzy zalecają, aby w wymianie klatek pomagał co najmniej jeden dodatkowy badacz. Należy sprawdzić stan myszy 24 h po każdej wymianie klatki, aby upewnić się, że oprogramowanie działa poprawnie i że w reakcji na stres związany z wymianą klatki nie doszło do agresji lub walk.
- Przed rozpoczęciem wymiany klatki przygotować nową, czystą klatkę plastikową z nową ściółką i materiałami do budowy gniazd. Napełnić każdą z ośmiu butelek poidełek na klatkę ok. 250 mL wody z kranu lub 20% alkoholu (95% etanol [190 proof] w wodzie z kranu, v/v).
UWAGA: Opcjonalnie badacze mogą dodać niewielką ilość starego materiału ściółki do nowej, czystej klatki. Minimalizuje to zakłócenia w ustalonych hierarchiach grupowych i może obniżyć ryzyko walk.
- Zatrzymać eksperyment w aplikacji „Controller”. Po upewnieniu się, że w narożnikach operantowych nie ma myszy, usunąć metalny podajnik karmy. Jedna osoba powinna unieść metalową aparaturę mikroprocesorową na tyle wysoko, aby druga osoba mogła wysunąć plastikową klatkę spod niej. Zweryfikować poprawną liczbę myszy.
- Wyjąć myszy pojedynczo z brudnej klatki, zeskanować transponder RFID i zapisać masę ciała. Wizualnie zbadać każdą mysz pod kątem oznak urazów lub choroby.
UWAGA: Autorzy zalecają zapisywanie masy ciała w elektronicznym arkuszu kalkulacyjnym (csv), aby można było go łatwo zaimportować do potoku analizy.
- Po zapisaniu masy ciała tymczasowo umieścić myszy w czystym pojemniku przejściowym.
- Wyczyścić górną część oraz narożniki wilgotnym ręcznikiem nasączonym środkiem dezynfekującym. Należy szczególnie starannie przetrzeć powierzchnię i dolną krawędź płyty narożnika, nie dopuszczając do wycieku cieczy na elementy elektroniczne.
- Unieść metalową aparaturę mikroprocesorową na tyle wysoko, aby wsunąć na miejsce nową, czystą klatkę plastikową.
- Ostrożnie wkręcić nowe butelki poidełek w otwory likometru, zapewniając szczelne połączenie z likometrem.
- Przenieść myszy do nowej, czystej aparatury.
- Wymienić podajnik karmy na nowy, czysty podajnik z nową karmą dla gryzoni.
- Ponownie uruchomić ten sam eksperyment w aplikacji „Controller” lub załadować i uruchomić nowy plik eksperymentu.
- Upewnić się, że program działa poprawnie i że wszystkie wizyty, wkładanie nosa (nosepokes) oraz lizania wszystkich myszy są odpowiednio rejestrowane.
UWAGA: Program „Controller” automatycznie wyświetli ostrzeżenia, gdy w okresie 12 h nie zarejestrowano lizania u danego zwierzęcia.
- Wyczyścić brudny sprzęt. Klatki plastikowe, butelki poidełek i plastikowe struktury do kopania można zazwyczaj myć w typowych systemach mycia klatek.
- Dzień 0: Habituacja
UWAGA: Faza habituacji jest przeprowadzana przy użyciu pliku Habituation.experiment. W tej fazie wszystkie butelki poidełek zawierają wodę z kranu. Myszy mają swobodny dostęp do wszystkich butelek bez konieczności operantnego wkładania nosa. Zmotoryzowane drzwi otwierają się, gdy myszy wejdą do narożnika operantnego, odsłaniając dostęp do końcówek butelek poidełek.
- Po zweryfikowaniu obecności transponderów RFID i zapisaniu masy ciała myszy, napełnić wszystkie osiem butelek poidełek ok. 250 mL wody z kranu i ostrożnie wkręcić w otwory likometru.
- Umieścić do 16 myszy tej samej płci w przygotowanej aparaturze IntelliCage.
- Załadować plik Habituation.experiment do aplikacji „Controller” i rozpocząć rejestrację.
- Zweryfikować, czy wszystkie zmotoryzowane drzwi otwierają się poprawnie, gdy mysz wchodzi do narożnika operantnego, oraz czy wszystkie wizyty, wkładanie nosa i lizania są pomyślnie rejestrowane dla każdej myszy. Jeśli w ciągu 6 h nie zarejestrowano żadnych wizyt, wkładania nosa ani lizania dla danej myszy, należy sprawdzić plik .animal pod kątem błędów.
- Dzień 1-3: Trening wodny
UWAGA: Faza treningu wodnego jest przeprowadzana przy użyciu pliku Water Training.experiment. Wszystkie butelki poidełek powinny nadal zawierać wyłącznie wodę z kranu. W tej fazie myszy będą trenowane do wkładania nosa według schematu FR-1, a następnie FR-3, aby uzyskać dostęp do końcówek butelek poidełek. Po udanym włożeniu nosa zmotoryzowane drzwi otworzą się, zapewniając dostęp do butelki poidełka przez 5 s. Gdy pojedyncza mysz osiągnie skuteczność na poziomie 60% lub wyższym, zostaje przeniesiona na schemat FR-3 na pozostały czas trwania programu. Zazwyczaj myszy przechodzą na schemat FR-3 w ciągu 24–72 h. Monitorować wyniki zwierząt w programie „Controller”. Jeśli zwierzę nie osiągnie schematu FR-3 w ciągu 72 h, należy je wykluczyć z dalszych eksperymentów.
- Jeśli po 24 h habituacji wszystkie myszy wyglądają na nawodnione i nieposzkodowane, zatrzymać uruchamianie pliku Habitatuation.experiment i rozpocząć uruchamianie pliku Water Training.experiment.
- Zweryfikować, czy wizyty, wkładanie nosa i lizania są pomyślnie rejestrowane przez oprogramowanie dla każdej myszy oraz czy wszystkie zmotoryzowane drzwi otwierają się poprawnie.
- Dzień 4+: Intermitentne spożycie alkoholu
UWAGA: Faza intermitentnego spożycia alkoholu jest przeprowadzana przy użyciu pliku Intermittent Alcohol.experiment. W tej fazie butelki poidełek w dwóch z czterech narożników operantnych zostają zastąpione 20% alkoholem. Narożniki z wodą i alkoholem są wcześniej określone za pomocą funkcji „Clusters” w pliku eksperymentu. W szablonie woda jest podawana w narożnikach pierwszym i trzecim (oznaczonych jako „neutral”), natomiast alkohol w narożnikach drugim i czwartym (oznaczonych jako „incorrect”). Myszy mają ciągły dostęp do wody, ale intermitentny dostęp do alkoholu w okresach 24-godzinnych (od 12:30 do 12:30) co drugi dzień. Dostęp do butelki poidełka przez 5 s jest zapewniony na schemacie FR-3 dla wszystkich narożników. W tej fazie eksperymentu należy przeprowadzać wymianę klatek w okresach „Water Access ONLY”, aby uniknąć przerywania spożycia alkoholu. Badacze powinni upewnić się, że grupy eksperymentalne wykazują mniej więcej taką samą preferencję dla wszystkich czterech narożników podczas treningu wodnego, przed przypisaniem narożników z alkoholem do intermitentnego spożycia alkoholu. W każdej z kohort grupy eksperymentalne wykazywały mniej więcej taką samą liczbę wizyt i lizania we wszystkich czterech narożnikach podczas treningu wodnego. Z tego powodu autorzy utrzymali stałe przypisania narożników we wszystkich kohortach. Eksperymentatorzy mogą łatwo sprawdzić proporcje lizania i wizyt w poszczególnych narożnikach za pomocą programu „Controller”. Należy regularnie monitorować dane dotyczące wizyt i lizania w trakcie całego eksperymentu, aby upewnić się, że nie pojawiają się żadne problemy (np. awarie sprzętu lub „monopolizowanie” niektórych narożników przez myszy).
- Po tym, jak wszystkie myszy pomyślnie osiągną schemat FR-3 w dostępie do butelek poidełek, przygotować 20% alkohol (95% etanol [190 proof] w wodzie z kranu, v/v; ok. 250 mL/butelka).
- Zatrzymać uruchamianie pliku Water Training.experiment.
- Usunąć butelki poidełek w narożnikach operantnych drugim i czwartym (lub w narożnikach określonych w pliku eksperymentu, jeśli są inne) i zastąpić każdą z nich ok. 250 mL 20% alkoholu.
- Ostrożnie wkręcić nowe butelki poidełek zawierające alkohol w otwory likometru, zapewniając szczelne połączenie z likometrem.
- Załadować plik Intermittent Alcohol.experiment i rozpocząć rejestrację.
- Zweryfikować, czy wizyty, wkładanie nosa i lizania są pomyślnie rejestrowane przez oprogramowanie dla każdej myszy oraz czy wszystkie zmotoryzowane drzwi otwierają się poprawnie.
- Następnego dnia po godzinie 12:30 zweryfikować, czy program pomyślnie przełączył się z modułu „Water Access ONLY” na moduł „Alcohol Access ON” i czy zarejestrowano lizania w narożnikach operantnych zawierających alkohol.
- Dzień 16+: Test alkoholu z dodatkiem chininy
UWAGA: Faza testu alkoholu z dodatkiem chininy jest przeprowadzana przy użyciu pliku Intermittent Alcohol.experiment. W tej fazie butelki poidełek w dwóch narożnikach operantnych, które wcześniej zawierały 20% alkohol, są zastępowane 20% alkoholem z dodatkiem 0,5 mM, a następnie 1 mM chininy, aby ocenić spożycie niewrażliwe na karę. Stwierdzono wcześniej, że te stężenia chininy, które odpowiadają odpowiednio 0,016% i 0,032% chininy (w/v), są awersyjne w testach przeprowadzonych przez grupę27,28 oraz innych31 Myszy mają ciągły dostęp do wody, ale intermitentny dostęp do alkoholu z dodatkiem chininy w okresach 24-godzinnych co drugi dzień (tj. jeden dzień z chininą 0,5 mM, jeden dzień z dostępem tylko do wody, jeden dzień z chininą 1,0 mM). Dostęp jest zapewniony na schemacie FR-3 dla wszystkich narożników. W niniejszym badaniu myszy wykonywały tę fazę zadania po 16 lub 24 kolejnych dniach intermitentnego spożycia czystego alkoholu. Wymiany klatek nie przeprowadzano w dniu podawania wody pomiędzy testami z dodatkiem chininy, aby uniknąć zakłócającego wpływu stresu. Po tej fazie eksperymentu myszy mogą albo rozpocząć spożycie alkoholu w systemie „open bar”/swobodny dostęp, albo powrócić do spożycia intermitentnego w celu oceny efektu odbicia (rebound drinking) po dodaniu chininy.
- Przygotować 20% alkohol z dodatkiem 0,5 mM i 1 mM chininy (95% etanol [190 proof] w wodzie z kranu, v/v; ok. 250 mL/butelka).
- Przeprowadzić wymianę klatki, usuwając wszystkie butelki poidełek.
- Napełnić każdą butelkę poidełka w narożnikach z alkoholem ok. 250 mL 20% roztworu alkoholu z dodatkiem 0,5 mM chininy.
- Ostrożnie wkręcić nowe butelki poidełek zawierające alkohol w otwory likometru, zapewniając szczelne połączenie z likometrem.
- Załadować plik Intermittent Alcohol.experiment i rozpocząć rejestrację.
- Zweryfikować, czy wizyty, wkładanie nosa i lizania są pomyślnie rejestrowane przez oprogramowanie dla każdej myszy oraz czy wszystkie zmotoryzowane drzwi otwierają się poprawnie.
- Po godzinie 12:30 zweryfikować, czy program pomyślnie przełączył się z modułu „Water Access ONLY” na moduł „Alcohol Access ON” i czy zarejestrowano lizania w narożnikach operantnych zawierających alkohol.
- Przed godziną 12:30 w następnym dniu podawania alkoholu zastąpić każdą butelkę w narożniku z alkoholem ok. 250 mL 20% roztworu alkoholu z dodatkiem 1 mM chininy. Nie ma potrzeby zatrzymywania eksperymentu na czas wymiany butelek.
- Przed godziną 12:30 w następnym dniu podawania alkoholu usunąć butelki poidełek zawierające alkohol z dodatkiem chininy i zastąpić każdą z nich ok. 250 mL czystego 20% alkoholu.
- Dzień 20+: „Open bar”/swobodny dostęp do alkoholu
UWAGA: Opcjonalnie można przeprowadzić jeden dzień spożycia alkoholu w systemie „open bar”/swobodny dostęp, aby służył jako kontrola nieoperantna. Faza ta jest przeprowadzana przy użyciu pliku Open Bar.experiment. W tej fazie butelki poidełek w dwóch z czterech narożników operantnych zawierają 20% alkohol, do którego myszy mają dostęp przez jeden okres 24-godzinny (od 12:30 do 12:30). Wizyta w narożniku otworzy drzwi bez konieczności wkładania nosa. W niniejszym badaniu myszy wykonywały tę fazę zadania po fazie intermitentnego spożycia alkoholu lub fazie testu alkoholu z dodatkiem chininy.
- W razie potrzeby przygotować 20% alkohol (95% etanol [190 proof] w wodzie z kranu, v/v; ok. 250 mL/butelka).
- Przed godziną 12:30 w następnym dniu podawania alkoholu zatrzymać uruchamianie aktualnego pliku eksperymentu.
- W razie potrzeby usunąć butelki poidełek w narożnikach z alkoholem i zastąpić każdą z nich ok. 250 mL 20% alkoholu.
- Ostrożnie wkręcić nowe butelki poidełek zawierające alkohol w otwory likometru, zapewniając szczelne połączenie z likometrem.
- Załadować plik Open Bar.experiment i rozpocząć rejestrację.
- Zweryfikować, czy wizyty, wkładanie nosa i lizania są pomyślnie rejestrowane przez oprogramowanie dla każdej myszy oraz czy wszystkie zmotoryzowane drzwi otwierają się swobodnie.
- Po godzinie 12:30 zweryfikować, czy program pomyślnie przełączył się z modułu „Water Access ONLY” na moduł „Alcohol Access ON” i czy zarejestrowano lizania w narożnikach operantnych zawierających alkohol.
5. Analiza danych
UWAGA: Dane z każdego eksperymentu są przechowywane wewnętrznie do momentu zatrzymania programu. Wówczas tworzony jest skompresowany plik archiwum danych, który jest zapisywany na lokalnym dysku twardym w folderze C:\Documents\NewBehavior\IntelliCage Plus\Archives. Nazwa pliku składa się z daty i godziny uruchomienia programu i kończy się rozszerzeniem .zip. Pliki archiwum danych zawierają wszystkie istotne informacje o eksperymencie, w tym wizyty w narożnikach (czas rozpoczęcia, czas zakończenia, czas trwania, sekwencja wizyt), nosepokes (czas rozpoczęcia, czas zakończenia, czas trwania), lizania (czas rozpoczęcia, czas zakończenia, czas trwania), czasy oświetlenia i ciemności oraz dane o temperaturze. Archiwum danych to można odczytać i przeanalizować za pomocą programu „Analyzer”. Chociaż istnieją inne pakiety open-source do analizy wyników z IntelliCage (Ruffini et al., 2021; Gastaldi et al., 2025), autorzy stworzyli rurociąg analizy danych w języku R, wykorzystując ogólnodostępne pakiety z tidyverse, aby analizować dane z paradygmatu przerywanego spożycia alkoholu. Rurociąg ten obejmuje wiele etapów kontroli jakości, w tym analizę czasu przebywania myszy w narożnikach; średnią częstotliwość wizyt, nosepokes i lizania w obrębie rytmu okołodobowego; szybkość nabywania reakcji lizania FR-3 na mysz oraz dzienną liczbę lizania na mysz. Dodatkowo autorzy udostępniają skrypty do podstawowych analiz miar spożycia alkoholu. Podstawą jest plik szablonu notatnika R w języku znaczników Quarto, który przetwarza pliki danych i może zostać dostosowany do wariacji specyficznych dla kohorty zwierząt. Analiza jest przeprowadzana przy użyciu bezpłatnej wersji RStudio. Plik szablonu projektu dla R znajduje się w repozytorium GitHub29.
- Zgromadź wszystkie dane, w tym pliki zip wygenerowane przez aplikację „Controller” oraz plik CSV zawierający dane o masie ciała myszy.
UWAGA: Masa ciała jest wymagana do normalizacji spożycia względem masy ciała. W tym procesie bardziej zasadne było zbieranie danych o masie w osobnym pliku niż dodawanie ich do każdego pliku eksperymentalnego. Pierwsza kolumna musi odpowiadać identyfikatorowi zwierzęcia (Animal ID) z plików archiwalnych.
- Pobierz szablon projektu R z repozytorium GitHub.
- Zmień nazwę projektu tak, aby odpowiadała eksperymentowi.
- Szablon zawiera przykładowe pliki danych służące do zilustrowania działania analizy, które znajdują się w podfolderze data/C1. Zastąp pliki archiwalne spersonalizowanymi archiwami danych.
- Uruchom program RStudio i otwórz projekt.
- W sekcji plików okna w prawym dolnym rogu RStudio przejdź do folderu qmd i otwórz plik IC_template.qmd.
- Skopiuj plik szablonu i zmień jego nazwę tak, aby odpowiadała eksperymentowi.
- Skoryguj metadane w sekcji nagłówka YAML skopiowanego pliku oraz w początkowym bloku kodu.
- Dostosuj nazwy grup w pliku IC_Commons.R w katalogu R, aby odpowiadały grupom eksperymentalnym. (Szablon wykorzystuje dwie grupy: Control i LBN).
- Uruchom plik notatnika.
UWAGA: Bardziej szczegółowe instrukcje znajdują się w plikach README.md w repozytorium GitHub.

Rysunek 3: Porównywalny dostęp do narożników operacyjnych u wszystkich myszy podczas treningu i faz przerwowego spożycia alkoholu. Wśród myszy z kohorty pierwszej23, mapa ciepła przedstawiająca całkowity czas spędzony w każdym narożniku na dobę na jedną mysz podczas (A) habituacji i treningu z wodą oraz (B) pierwszych czterech dni przerwowego spożycia alkoholu (n = 15 F, 16 M). Ciemniejsze odcienie czerwieni oznaczają dłuższy czas spędzony w narożniku w ciągu dnia. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 4: Myszy wykazują aktywność w postaci wizyt, wkładania nosa i lizania zgodną z rytmem okołodobowym oraz skutecznie nabywają dostęp do operantnej butelki z poidłem w schemacie FR-3. Wśród myszy z pierwszej kohorty23, średnia gęstość wizyt w narożniku operantnym (A), wkładania nosa (B) oraz lizania (C) w czasie sesji podczas pierwszych ośmiu dni testów. (D) Czas do momentu, w którym każda mysz skutecznie polizała w schemacie FR-3 podczas treningu z wodą. (E) Wskaźnik sukcesu wizyt (= % wizyt zakończonych lizaniem / całkowita liczba wizyt) wśród myszy podczas habituacji i treningu z wodą (lewo) w porównaniu z pierwszymi czterema dniami przerywanego picia alkoholu (prawo). Symbole okręgów oznaczają samice (n = 15); symbole kwadratów oznaczają samce (n = 16). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 5: Myszy wykazują porównywalną dzienną liczbę liznięć podczas fazy treningu i przerywanego spożycia alkoholu. Wśród kohorty pierwszej myszy (A) samic (n = 15) i (B) samców (n = 16)23, całkowita liczba dziennych liznięć wody (niebieski) i alkoholu (czerwony) podczas habituacji i treningu z wodą (dni -4–0) w porównaniu z przerywanym spożyciem alkoholu (dni 1–4). C oznacza hodowlę kontrolną; L oznacza hodowlę LBN. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 6: Myszy narażone na niekorzystne warunki wczesnodziecięce spożywają więcej alkoholu niż grupa kontrolna w operantowym, przerywanym paradygmacie spożycia alkoholu. (A) Średnia liczba liznięć alkoholu na dobę znormalizowana według masy ciała (g; mierzona co tydzień) podczas 8 dni przerywanego dostępu do alkoholu w grupie kontrolnej (szary; lewo) i myszach wychowywanych w systemie LBN (różowy; prawo). (B) Średnia liczba liznięć alkoholu na dobę znormalizowana według masy ciała przed, w trakcie i po dodaniu chininy (0.5 mM, 1 mM). (C) Wykres gęstości przedstawiający średnią liczbę liznięć alkoholu na dobę znormalizowaną według masy ciała podczas jednego dnia dostępu do alkoholu w trybie FR-0 „Open Bar”. Symbole kół oznaczają samice (n = 15); symbole kwadratów oznaczają samce (n = 16). Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.