Przedstawiony tutaj protokół umożliwia analizę emisji substancji lotnych indukowanych zranieniem z wysoką rozdzielczością czasową w kontrolowanych warunkach eksperymentalnych. Dzięki zintegrowaniu procesu nacinania bezpośrednio w komorze liściowej i ciągłemu monitorowaniu sygnałów lotnych (Rycina 1), system rejestruje odpowiedź emisyjną bez zniekształceń wprowadzanych przez opóźnione próbkowanie, otwieranie komory lub manipulację liściem poza układem pomiarowym. Zakłócenia te mogą zmieniać zarówno pozorne ramy czasowe, jak i wielkość szczytów emisji w pomiarach opartych na zamkniętych komorach3,6,13,17. Poprzez przeprowadzenie procesu zranienia i pomiaru w tej samej komorze, protokół zachowuje linię czasu emisji i umożliwia wiarygodną, rozdzielczą w czasie kwantyfikację odpowiedzi lotnych indukowanych stresem.
| Gatunki | Protonowana masa cząsteczkowa | Amplituda piku (nmol m-2 s-1) | Czas rozpoczęcia po przecięciu (s) | Czas szczytu (s) | Maksymalne nachylenie (nmol m-2 s-2) |
| Quercus rubra | 43 | 21.91 | ~0.0 | 55.6 | 1.49 |
| 45 | 10.52 | 7 | 111.4 | 0.29 |
| 57 | 21.27 | 20 | 55.6 | 1.37 |
| 69 | 145.6 | 25 | 61 | 1.44 |
| 83 | 24.13 | 21 | 71.8 | 1.39 |
| 99 | 243.16 | 21 | 57.4 | 18.17 |
| Acer platanoides | 43 | 20.26 | 5.4 | 54 | 1.59 |
| 45 | 18.06 | 1.8 | 154.8 | 0.55 |
| 57 | 18.65 | 10.8 | 41.4 | 1.55 |
| 69 | 15.15 | 10.8 | 41.4 | 1.13 |
| 83 | 8.78 | 7.2 | 57.6 | 0.76 |
| 99 | 292.86 | 10.8 | 43.2 | 23.62 |
| Gossypium hirsutum | 43 | 3.5 | 5.4 | 48.6 | 0.19 |
| 45 | 4.98 | 9 | 95.4 | 0.29 |
| 57 | 2.48 | 10.8 | 36 | 0.18 |
| 69 | 2.42 | 12.6 | 37.8 | 0.17 |
| 83 | 4.83 | 14.4 | 223.2 | 0.3 |
| 99 | 23.47 | 12.6 | 39.6 | 1.95 |
Tabela 1: Reprezentatywne wartości wielkości piku, początku emisji, czasu do osiągnięcia piku oraz maksymalnego nachylenia wyodrębnione z ciągłych pomiarów PTR-TOF-MS po uszkodzeniu liści.Wartości obejmują wielkość piku, początek emisji, czas do osiągnięcia piku oraz maksymalne nachylenie. Wartości te ilustrują rodzaj deskryptorów kinetycznych generowanych przez protokół i są przedstawione jako przykłady dowodu koncepcji, a nie jako porównania statystyczne między gatunkami. Początek emisji zdefiniowano jako pierwszy wykrywalny wzrost powyżej linii bazowej sprzed uszkodzenia po przecięciu, czas do osiągnięcia piku jako odstęp między przecięciem a maksymalnym sygnałem, a maksymalne nachylenie jako maksymalną pierwszą pochodną sygnału skorygowanego o linię bazową.
Porównanie pozycji poboru próbek wykazało, że konfiguracja poboru próbek znacząco wpływała na rejestrowany sygnał (Rysunek 2). Bezpośredni pobór próbek przy wylocie z komory pozwolił na zachowanie szybkiego formowania się piku, podczas gdy pobór próbek za przewodami analizatora opóźnił formowanie piku i osłabił intensywność sygnału. Efekt ten był pomijalny dla izoprenu (m/z 69), umiarkowany dla m/z 83 i najsilniejszy dla α-pinenu (m/z 137), co jest zgodne ze wzrostem zniekształceń związanych z transportem w przypadku związków cięższych lub bardziej reaktywnych10,21. Adsorpcja na powierzchniach rurek, opóźniony transport przez linię poboru próbek oraz oddziaływania chemiczne podczas transportu mogą poszerzać lub tłumić piki emisji, zmieniając tym samym interpretację kinetyki lotnych związków9,12,21.
Główną zaletą niniejszego protokołu jest zdolność do rozdzielenia najwcześniejszej fazy emisji substancji lotnych indukowanych przez zranienie. U wszystkich gatunków faza ta pojawiała się w ciągu kilku sekund po przecięciu i była zdominowana przez gwałtowny wzrost przy m/z 9, który wykazywał zarówno najwyższą amplitudę piku, jak i najstrmsze nachylenie maksymalne (Rycina 3, Rycina 4 oraz Rycina 5; Tabela 1). Maxima pików wystąpiły w czasie ~40–57 s po przecięciu, czyli znacznie wcześniej niż 10–280 s typowo raportowane w poprzednich badaniach13,19,2. Przesunięcie to prawdopodobnie odzwierciedla synchronizację zranienia i detekcji wewnątrz komory, co minimalizuje opóźnienia spowodowane manipulacją liśćmi i transportem w linii próbkowania.
Dzięki synchronizacji procesu zranienia i detekcji w tej samej komorze, protokół pozwolił również na rozstrzygnięcie kaskady na poziomie fragmentów, w której sygnały m/z 43 i 57 wzrosły natychmiast po przecięciu, podczas gdy sygnał m/z 45 osiągnął szczyt później i wykazał szerszą dynamikę zaniku (Rysunek 3, Rysunek 4 oraz Rysunek 5; Tabela 1). Kolejność ta pozostaje spójna z poprzednimi badaniami opartymi na technice PTR, mimo braku rozdzielczości na poziomie związków w porównaniu z GC-MS, w której wczesne emisje są zdominowane przez aldehydy C6 pochodne lipoksygenazy, a następnie przez alkohole i produkty pokrewne powstające w dalszych etapach szlaku19,2. Zgodnie z poprzednimi badaniami PTR-TOF-MS, dominujący sygnał m/z 9 odpowiada związkom typu heksenalu, których fragment dehydratacyjny przy m/z 81 został zidentyfikowany jako główny wczesny sygnał, podczas gdy m/z 83 odzwierciedla wkład heksenoli i heksanalu2. Sekwencja ta dodatkowo potwierdza hierarchię zależną od wielkości i szlaku metabolicznego, w której mniejsze, szybko tworzące się związki utlenione są uwalniane wcześniej niż cząsteczki większe lub bardziej złożone13,23.
Poza fragmentami pochodzącymi z lipooksygenazy, sygnał przy m/z 69, wstępnie przypisany izoprenowi, wykazywał wyraźne trajektorie emisji w reprezentatywnych przykładach (Rycina 3, Rysunek 4i Rysunek 5). Q. rubra wykazały znaczną emisję bazową, podczas gdy A. platanoides i G. hirsutum wyprodukowano jedynie w ilościach śladowych, co jest zgodne z ich znaną charakterystyką emisyjną24,25W różnych gatunkach emisja izoprenu reagowała słabo na uszkodzenia mechaniczne, co jest zgodne z jego de novo synteza poprzez szlak MEP, który zależy od metabolizmu fotosyntetycznego, a zatem jest jedynie pośrednio wpływany przez uszkodzenia mechaniczne15.
Te szybka dynamika odzwierciedla dobrze udokumentowane odpowiedzi biochemiczne liści na uszkodzenia mechaniczne. Uszkodzenie mechaniczne szybko aktywuje szlak lipooksygenazy, który generuje przejściowe impulsy lotnych związków C6 oraz powiązanych utlenionych związków pochodzących z utleniania lipidów błonowych5,7,17,2,23. Emisje te wykazują silnie asymetryczną dynamikę, z gwałtownym wzrostem po uszkodzeniu tkanki, po którym następuje wolniejsza faza zaniku16. Ten asymetryczny wzorzec w obecnym układzie rozwija się w skali od sekund do minut, co ilustrują reprezentatywne deskryptory kinetyczne podsumowane w Tabeli 1, podczas gdy badania, w których liście były raniwane poza komorą, raportują opóźnione piki13. Tak wcześniejsza rozdzielczość pozwala uchwycić sygnał od momentu jego powstania, redukuje rozmycie czasowe i umożliwia bezpośrednią kwantyfikację zarówno fazy wzrostu, jak i fazy zaniku. Te cechy kinetyczne wspólnie definiują pełną trajektorię emisji, która w podejściach opartych na dyskretnym lub opóźnionym próbkowaniu jest często niedoszacowana5,15.
Standaryzacja procesu cięcia wewnątrz komory dodatkowo poprawia powtarzalność eksperymentalną, zapewniając spójną geometrię i stopień dotkliwości rany, z których oba parametry są determinowane przez długość nacięcia i bezpośrednio wpływają na wielkość emisji LZO5,18,2. Niemniej jednak, ponieważ ostrze tnące zajmuje stałą pozycję wewnątrz komory, umiejscowienie nacięcia zależy od rozmiaru i morfologii liścia oraz od konieczności zachowania szczelności systemu. Jeśli to możliwe, nacięcie powinno zostać wykonane w obrębie blaszki międzyżyłkowej, z pominięciem żyłki środkowej oraz innych głównych żyłek. Jednakże całkowite uniknięcie głównych żyłek nie zawsze jest możliwe, szczególnie w przypadku liści wąskich lub małych. Ponieważ uszkodzenie głównych żyłek może znacząco zmienić indukowaną raną emisję LZO5, miejsce nacięcia powinno być jak najspójniejsze pomiędzy próbkami w obrębie tego samego eksperymentu.
Utrzymanie stabilnych warunków środowiskowych jest równie istotne dla uzyskania powtarzalnych pomiarów LZO indukowanych przez zranienie. Ponieważ produkcja, uwalnianie i transport LZO zależą od warunków środowiskowych, temperaturę w komorze, wilgotność, natężenie promieniowania, stężenie CO2 oraz przepływ powietrza utrzymywano na stałym poziomie podczas wszystkich pomiarów. Standaryzacja tych zmiennych dodatkowo minimalizuje zmienność eksperymentalną i poprawia powtarzalność kinetyki LZO indukowanych przez zranienie. Ponadto, ponieważ protokół jest w pełni kompatybilny z jednoczesnymi pomiarami wymiany gazowej, przyszłe zastosowania mogą bezpośrednio wiązać dynamikę emisji LZO ze zmianami w fotosyntezie i transpiracji w identycznych warunkach eksperymentalnych26. Takie pomiary mogą pomóc w odróżnieniu biochemicznej regulacji produkcji LZO od procesów fizycznych wpływających na uwalnianie substancji lotnych, w tym zwiększonego parowania rozpuszczalnych w wodzie związków utlenionych z uszkodzonej tkanki16. W związku z tym różnice między wariantami lub gatunkami należy interpretować tylko wtedy, gdy warunki środowiskowe, geometria rany i materiał roślinny, w tym stadium rozwoju liścia, są ustandaryzowane w trakcie całego eksperymentu12.
Chociaż poprzednie podejścia z wykorzystaniem pomiarów wewnątrzkomorowych wykazały możliwość pomiaru LZO indukowanych przez rany w czasie rzeczywistym, ujawniły one również istotne ograniczenia techniczne. Nieregularne nacięcia, niespójna wielkość ran oraz zaburzenia uszczelnienia komory wprowadzały zmienność pomiędzy pomiarami18,19. Ponadto podejścia te często opierały się na stosunkowo dużych objętościach komór, co spowalniało wymianę powietrza, opóźniało tworzenie się piku i poszerzało profile sygnałów związków lotnych2,27. Efekty te stają się bardziej wyraźne w przypadku związków o mniejszej lotności i mogą różnić się w zależności od temperatury21. W przeciwieństwie do tego, mniejsza komora zastosowana w niniejszym protokole (objętość wewnętrzna ~8 mL) skraca czas przebywania powietrza, co przyczynia się do ostrzejszego początku obserwowanego w naszych pomiarach (Rycina 1).
Protokół został opracowany z myślą o kontrolowanych eksperymentach fizjologicznych, a nie o bezpośrednim monitorowaniu ekosystemów leśnych in situ. Pomiary są wykonywane na przymocowanych liściach w ściśle określonych warunkach środowiskowych, co minimalizuje zmienność eksperymentalną i umożliwia precyzyjną charakterystykę kinetyki LZO indukowanej zranieniem. Zastosowania terenowe będą zależeć od dostępności przenośnych systemów wymiany gazowej i detekcji LZO. Niemniej jednak, ponieważ zintegrowany mechanizm cięcia może zostać dostosowany do różnych konfiguracji komór przy niewielkich modyfikacjach, podejście to powinno być łatwo przenoszalne na przenośne platformy wymiany gazowej oraz inne platformy eksperymentalne w miarę pojawiania się tych technologii. Elastyczność ta poszerza możliwości badania szybkich reakcji roślin na stres przy zachowaniu rozdzielczości czasowej wymaganej do dokładnej charakterystyki dynamiki emisji LZO, co ułatwia badania mechanistyczne najwcześniejszych odpowiedzi fizjologicznych i biochemicznych na uszkodzenia liści.