Aby określić optymalne stężenie puromycyny do selekcji stabilnej, komórki rodzicielskie 16HBE14o− poddano działaniu zwiększających się stężeń puromycyny (0,5–4 µg/mL), a żywotność komórek oceniano po 24, 48 i 72 h za pomocą testu żywotności komórek. Puromycyna obniżała żywotność komórek w sposób zależny od dawki i czasu, przy czym wszystkie stężenia zredukowały żywotność poniżej 20% po 48–72 h (Rycina 3). Stężenie 1 µg/mL było najniższym stężeniem, które całkowicie wyeliminowało komórki nietransdukowane, redukując pozostały sygnał żywotności do około 4,5% w ciągu 48 h (p < 0,01). Zwiększenie stężenia puromycyny nie spowodowało dodatkowego spadku żywotności komórek. W związku z tym do późniejszej selekcji komórek transdukowanych wybrano puromycynę w stężeniu 1 µg/mL.
Aby zoptymalizować wydajność transdukcji lentiwirusowej, komórki 16HBE14o− poddano transdukcji lentiwirusowym reporterem lucyferazy STAT6 przy wielokrotnościach infekcji (MOI) wynoszących 1, 5, 10 i 20 przez 48 h, po czym zastosowano stymulację IL-4 i IL-13 (po 10 ng/mL każda) przez 24 h w celu aktywacji sygnalizacji STAT6. Jak pokazano na Rysunku 4, względne jednostki luminescencji (RLU) wzrastały w sposób zależny od MOI. MOI równe 20 spowodowało największą indukcję reportera, co doprowadziło do około 50-krotnego wzrostu luminescencji w porównaniu z niepobudzoną kontrolą (p < 0,001). Na podstawie tych wyników do kolejnych eksperymentów wybrano MOI równe 20.
Po transdukcji i selekcji puromycyną w zoptymalizowanych warunkach, komórki nietransdukowane uległy masowej śmierci, podczas gdy komórki transdukowane zachowały prawidłową morfologię i żywotność (Rysunek 5). Przeżyjące komórki poddano następnie rozcieńczaniu ograniczającemu w celu ustanowienia monoklonalnych linii komórkowych reporterowych STAT6.
Oceniono aktywność reportera STAT6 w trzech monoklonalnych liniach komórek reporterowych pochodzących od pojedynczych komórek. Wszystkie klony wykazały niską podstawową luminescencję (<1 0 RLU). Stymulacja IL-4 i IL-13 wywoła silną aktywność reportera w klonach 2 i 3, przy czym luminescencja przekroczyła 20 0 RLU, co odpowiadało ponad 20-krotnej indukcji (Rysunek 6A). Klon 3 wykazał najniższą podstawową luminescencję i został zatem wybrany do dalszej charakterystyki. Aktywność reportera w klonie 3 oceniano w kolejnych pasażach (P9–P21), aby zbadać stabilność długoterminową. Jak pokazano na Rysunku 6B, zależna od STAT6 indukcja reportera pozostała stabilna w całym ocenianym zakresie pasażowania. Klon uznawano za odpowiedni do dalszych eksperymentów, gdy wykazywał prawidłową szybkość wzrostu, luminescencję podstawową poniżej około 1 0 RLU oraz ponad 20-krotną indukcję po stymulacji cytokinami.
Ze względu na to, że IL-4 i IL-13 mogą aktywować dodatkowe członków rodziny STAT, w tym STAT3 i STAT5, dodatkowo oceniono swoistość testu reporterowego17,18. Komórki reporterowe STAT6 stymulowano IL-4 i IL-13 w obecności lub przy braku selektywnych inhibitorów ukierunkowanych na STAT6, STAT5 lub STAT3 przez 24 h19,20,21. Żywotność komórek pozostała powyżej 90% we wszystkich warunkach traktowania (inhibitor STAT6 AS151749, 10 nM: 98,4%; inhibitor STAT5 AC-4-130, 2,5 µM: 97,4%; inhibitor STAT3 Stattic, 2,5 µM: 96,2%; Rycina 7A). Hamowanie STAT6 znacznie zredukowało aktywność lucyferazy (p < 0,01), podczas gdy hamowanie STAT5 lub STAT3 nie wywarło istotnego wpływu na aktywność reporterową (p = 0,2593 oraz p = 0,8857, odpowiednio; Rycina 7B). Wyniki te potwierdziły, że aktywacja reportera była w przeważającej mierze zależna od STAT6.
Krzepkość testu oceniono poprzez obliczenie współczynnika Z′- przy użyciu komórek stymulowanych IL-4 i IL-13 jako kontroli o wysokim sygnale oraz komórek traktowanych inhibitorem STAT6 jako kontroli o niskim sygnale. Test wykazał współczynnik Z′- wynoszący 0,703 ± 0,097, co wskazuje na doskonałą wydajność testu, szerokie okno sygnałowe oraz przydatność do wysokoprzepustowych przesiewów.
Na koniec zastosowano test reporterowy STAT6 w celu przesiewania wybranych składników środowiskowych pyłów zawieszonych pod kątem ich zdolności do modulowania sygnalizacji STAT6. Po 24 h traktowania benzo[b]fluoranten (10 µM) znacząco zwiększył aktywność reportera STAT6 około 1,75-krotnie (p = 0,06), natomiast pyły zawieszone (10 µg/mL) zwiększyły aktywność reportera około 1,5-krotnie (p = 0,0398; Rysunek 8). Z kolei pozostałe wielopierścieniowe węglowodory aromatyczne i związki metali ciężkich, w tym CdCl2, HgCl2 oraz NiSO4 (po 10 µM każdego), nie zmieniły istotnie aktywności reportera. Wspólnie wyniki te wykazują, że test reporterowy STAT6 jest stabilny, specyficzny, powtarzalny i odpowiedni do wysokoprzepustowego przesiewania związków środowiskowych modulujących sygnalizację STAT6.

Rysunek 1Schemat generowania linii 16HBE14o-− Komórki reporterowe STAT6. Schematyczny przegląd protokołu generowania komórek 16HBE14o− komórki stabilnie wykazujące ekspresję reportera lucyferazy STAT6. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 2Schemat opracowania i zastosowania testu reporterowego STAT6. Schematyczny przegląd testu reporterowego STAT6 w celu walidacji analizy oraz przesiewowego badania toksykantów środowiskowych. Proszę kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury.

Rycina 3Wyznaczanie optymalnego stężenia puromycyny do selekcji stabilnych linii komórkowych. Linia rodzicielska 16HBE14o− komórki poddano działaniu puromycyny (0,5, 1, 2 lub 4 µg/mL) przez 24, 48 lub 72 h. Komórki kontrolne (nośnik) otrzymały 0,1% dimetylosulfotlenku (DMSO). Żywotność komórek określono za pomocą testu żywotności komórek. Żywotność komórek obliczono z różnicy absorbancji między 450 a 650 nm po odjęciu tła i normalizacji względem kontroli nośnika. Dane przedstawiono jako średnią ± SD z trzech niezależnych powtórzeń biologicznych z duplikatem technicznym (n = 3). Istotność statystyczną określono za pomocą jednoczynnikowej analizy wariancji (ANOVA), a następnie testu wielokrotnych porównań Dunnetta. pWskazano wartości p dla porównań z kontrolą nośnika. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 4Optymalizacja wydajności transdukcji lentiwirusowej. 16HBE14o− komórki poddano transdukcji lentiwirusem z reporterem lucyferazy STAT6 przy wielokrotnościach infekcji (MOI) wynoszących odpowiednio 1, 5, 10 lub 20 przez 48 h. Po 24-godzinnym okresie regeneracji komórki stymulowano IL-4 oraz IL-13 (po 10 ng/mL każdej z nich) przez 24 h.A) Względne jednostki luminescencji (RLU) w komórkach poddanych transdukcji pozornej oraz komórkach z transdukowanym genem reporterowym przy wskazanych wartościach MOI. Analizę statystyczną przeprowadzono za pomocą jednoczynnikowej analizy wariancji (ANOVA), a następnie testu wielokrotnych porównań Dunnetta. (B) Krotność indukcji po stymulacji cytokinami w stosunku do niepobudzonej kontroli MOI 20. Analizę statystyczną przeprowadzono za pomocą nieparzonego testu t Studenta t-test. Dane przedstawiono jako średnia ± SD z trzech niezależnych powtórzeń biologicznych (n = 3). pWartości p są zaznaczone. Aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury, kliknij tutaj.

Rysunek 5Reprezentatywne obrazy komórek po selekcji puromycyną. 16HBE14o− komórki poddano transdukcji z użyciem lub bez użycia lentiwirusowego reportera lucyferazy STAT6 (MOI = 20), a następnie potraktowano 1 µg/mL puromycyną przez 5 dni. Obrazy uzyskano za pomocą odwróconego mikroskopu z kontrastem fazowym przy powiększeniu 10× w identycznych warunkach obrazowania. Nieleczone komórki macierzyste tworzyły prawidłową jednowarstwę nabłonkową (lewo). Nietransdukowane komórki poddane działaniu puromycyny wykazywały rozległą śmierć komórkową i odrywanie się od podłoża (środek), natomiast transdukowane komórki wyselekcjonowane puromycyną pozostały żywe i zachowały prawidłową morfologię (prawo). Pasek skali = 50 µm. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rysunek 6Identyfikacja klonów reporterowych STAT6 oraz ocena stabilności reportera. Po rozcieńczeniu ograniczającym namnażono trzy monoklonalne linie komórek raportujących STAT6, a następnie stymulowano je IL-4 i IL-13 (po 10 ng/mL każdej z cytokin) przez 24 h.A) Aktywność lucyferazy poszczególnych klonów reporterowych po stymulacji cytokinami w porównaniu z nieukstymulowanymi kontrolami. (B) Stabilność aktywności reportera STAT6 w klonie 3 w kolejnych pasażach (P9–P21). Dane przedstawiono jako średnią ± SD z duplikatów technicznych. Prosimy kliknąć tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury.

Rysunek 7Selektywne hamowanie aktywności reportera STAT6 bez wpływu na żywotność komórek. Komórki reporterowe STAT6 stymulowano IL-4 i IL-13 (po 10 ng/mL każdej z nich) przez 24 h w obecności inhibitora STAT6 AS151749 (10 nM), inhibitora STAT5 AC-4-130 (2.5 µM), lub inhibitor STAT3 Stattic (2.5 µM). Grupa kontrolna z nośnikiem stymulowana cytokinami otrzymała 0,1% DMSO. (AŻywotność komórek określono za pomocą testu żywotności komórek.B) Aktywność lucyferazy zależna od STAT6, znormalizowana względem kontroli stymulowanej cytokinami. Dane przedstawiono jako średnią ± SD z trzech niezależnych powtórzeń biologicznych (n = 3). pWartości p są zaznaczone. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej figury.

Rysunek 8Ocena efektów modulujących STAT6 przez toksykanty środowiskowe. Komórki reporterowe STAT6 poddano 24-godzinnemu działaniu pyłu zawieszonego (100 µg/mL) lub wskazane toksykanty środowiskowe, w tym wielopierścieniowe węglowodory aromatyczne (WWA) i metale ciężkie (10 µM każdy). Aktywność lucyferazy zależna od STAT6 została znormalizowana względem kontroli nośnika (0,1% DMSO). Dane przedstawiono jako średnią ± SD z trzech niezależnych powtórzeń biologicznych (n = 3). Istotność statystyczną określono poprzez porównanie z kontrolą nośnika, a pwykazano wartości p. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
Tabela uzupełniająca 1: Specyfikacje naczyń hodowlanych i parametry pasażowania dla hodowli komórek 16HBE14o−Aby pobrać ten plik, kliknij tutaj.
Tabela uzupełniająca 2: Porównanie metod pomiaru aktywności STAT6.Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.