$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Badanie przeprowadzono zgodnie z wytycznymi Basic & Clinical Pharmacology & Toxicology dotyczącymi badań eksperymentalnych i klinicznych25. Wszystkie protokoły dotyczące eksperymentów na zwierzętach zostały zatwierdzone przez Komitet Etyczny ds. Zwierząt Drugiego Szpitala Afiliacyjnego Zhejiang University School of Medicine (Numer zgody 20230102), a wszystkie eksperymenty przeprowadzono zgodnie z wytycznymi Komitetu Etyki ds. Zwierząt. Badanie przeprowadzono zgodnie z wytycznymi ARRIVE.
Wyszukiwanie kluczowych składników i celów za pomocą farmakologii sieciowej
Aktywne składniki Fritillaria cirrhosa D. Don, Lonicera japonica Thunb., Glehnia littoralis F. Schmidt ex Miq. i Adenophora stricta Miq. zostały pobrane z bazy danych farmakologii systemowej medycyny tradycyjnej chińskiej (TCMSP; dostęp 12 marca 2024). Kandydatów do związków wyszukano zgodnie z następującymi kryteriami ADME: dostępność biologiczna (OB) ≥ 30%, podobieństwo do leków (DL) ≥ 0,18 i przepuszczalność Caco-2 ≥ −0,425. Związki spełniające wszystkie trzy kryteria zostały zachowane jako kandydatki na aktywne składniki do dalszej analizy.
Skomplikowana struktura linii wejściowych molekularnych (SMILES) β-sitosterolu została uzyskana z bazy danych PubChem (dostęp 18 marca 2024) i zaimportowana do SwissTargetPrediction (dostęp 21 marca 2024) w celu przewidywania celów. Homo sapiens został wybrany jako gatunki docelowe. Potencjalne cele przewidywano na podstawie podobieństwa strukturalnego 2D i 3D między β-sitosterolem a znanymi ligandami w bazie danych. Przewidywane cele z prawdopodobieństwem większym niż 0 zostały zachowane, a zduplikowane wpisy usunięto.
Geny związane z POChP zostały pobrane z bazy danych dotyczącej celów terapeutycznych (TTD; dostęp 25 marca 2024) i bazy danych porównawczej toksykogenomik (CTD; dostęp 28 marca 2024) za pomocą słowa kluczowego „chronic obstructive pulmonary disease”. Po usunięciu zduplikowanych genów geny związane z POChP zostały przecięte z przewidywanymi celami β-sitosterolu, aby zidentyfikować kandydatów do celów potencjalnie zaangażowanych w efekty terapeutyczne β-sitosterolu przeciwko POChP.
Dokowanie molekularne β-sitosterolu i GR
Trójwymiarowa struktura β-sitosterolu w formacie SDF została pobrana z bazy danych PubChem (dostęp 2 czerwca 2026), podczas gdy struktura krystaliczna receptora glikokortykoidowego (GR) została uzyskana z Research Collaboratory for Structural Bioinformatics Protein Data Bank (RCSB PDB; dostęp 3 czerwca 2026). Po standardowej przygotowce struktury ligandu i receptora przeprowadzono dokowanie molekularne za pomocą platformy online CB-Dock2 (dostęp 3 czerwca 2026). Przygotowane pliki ligandu i receptora zostały przekazane na platformę, a obliczenia dokowania przeprowadzono przy użyciu domyślnych parametrów.
Analiza wzbogacenia funkcjonalnego Gene Ontology (GO) i Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)
Wszystkie przewidywane geny docelowe β-sitosterolu poddano analizie wzbogacenia funkcjonalnego GO i analizie wzbogacenia ścieżek KEGG. Wyniki wzbogacenia, w tym znacząco wzbogacone procesy biologiczne, komponenty komórkowe, funkcje molekularne i ścieżki sygnałowe, zostały posortowanie i przechowane w Pliku uzupełniającym 1 na potrzeby dalszej analizy bioinformatycznej.
Modelowanie zwierząt i grupowanie
Liczba prób została ustalona na sześć zwierząt na grupę na podstawie poprzedniego badania, które przeprowadziło analizę mocy a priori przy użyciu oprogramowania G*Power (α = 0,05, moc = 0,80) i wykazało, że n = 6 wystarczyło do wykrycia biologicznie istotnych różnic w porównywalnych warunkach eksperymentalnych26. Samce myszy C57BL/6 w wieku 6–8 tygodni (20 ± 2 g) zostały losowo przydzielone do pięciu grup: grupa kontrolna, grupa modelu POChP, grupa POChP + deksametazon (DEX), grupa POChP + β-sitosterol i grupa POChP + DEX + β-sitosterol. Myszy były trzymane w standardowych warunkach laboratoryjnych (25 °C, 12-godzinny cykl światło/ciemność) z wolnym dostępem do standardowej karmy i wody i były pozwolone na aklimatyzację przez 1 tydzień przed eksperymentami.
Aby utworzyć model POChP, myszy umieszczono w komorze do całkowitego ekspozycji na dym papierosowy (63 cm × 55 cm × 45 cm) i eksponowano na główny dym papierosowy przez 12 tygodni. Każdy papieros zawierał 10 mg smoły, 0,9 mg nikotyny i 10 mg tlenku węgla. Ekspozycja na dym odbywała się dwa razy dziennie (5 dni/tydzień) o godzinie 9:30 i 15:00, z dymem generowanego z 18 papierosów wprowadzanym do komory przez 90 min na sesję27.
Aby ocenić efekty terapeutyczne interwencji, podawanie leków rozpoczęto po 8 tygodniach ekspozycji na dym papierosowy i kontynuowane przez