Przepływ uczestników i powtarzalność testu
Przesiewowo przebadano łącznie 326 osób, z czego 49 wykluczono: 12 osób otrzymało leczenie przeciwnowotworowe przed pobraniem krwi, 8 osób miało inny nowotwór pierwotny, 9 osób cierpiało na ciężką infekcję, chorobę autoimmunologiczną lub niekontrolowane choroby współistniejące, które mogły wpłynąć na poziom markerów nowotworowych w surowicy, 1 osób wykazywało hemolizę, lipemię, interferencję z żółtaczką, miało niewystarczającą objętość surowicy lub zbyt długi odstęp czasu do przetworzenia próbek, a 9 osób miało braki w kluczowych danych klinicznych, patologicznych lub danych z obserwacji. Ostateczna populacja analityczna obejmowała 27 uczestników: 167 pacjentów z rakiem płaskonabłonkowym przełyku (ESCC), 5 pacjentów z łagodną chorobą przełyku oraz 5 zdrowych osób z grupy kontrolnej. Ośrodek A dostarczył 194 uczestników do kohorty treningowej, a Ośrodek B dostarczył 83 uczestników do kohorty walidacji zewnętrznej. Schemat przepływu uczestników, przydział do kohort, proces testowania biomarkerów, opracowanie modelu diagnostycznego, walidację zewnętrzną oraz strukturę modelowania prognostycznego przedstawiono na Rysunku 1, a szczegóły dotyczące przesiewu i wykluczeń podsumowano w Tabeli uzupełniającej 1.
Powtarzalność międzyseryjną i międzyośrodkową oceniono z wykorzystaniem 30 ślepych próbek serum pomostowych. Współczynniki zmienności międzyośrodkowej wyniosły 4,8% dla antygenu rakowo-embrionalnego (CEA), 5,6% dla antygenu raka płaskonabłonkowego (SCC-Ag) oraz 5,1% dla antygenu węglowodanowego 125 (CA125). Odpowiednie współczynniki korelacji wewnątrzklasowej wyniosły odpowiednio 0,94, 0,92 i 0,93. Przed standaryzacją statystyczną i opracowaniem modelu nie było wymaganej rekalibracji specyficznej dla żadnego z ośrodków. Wyniki powtarzalności testu przedstawiono w Tabeli uzupełniającej 2.
Charakterystyka wyjściowa populacji badanej
Mediana wieku w całej populacji wynosiła 59 lat (IQR, 53–6 lat), a 198 uczestników (71,5%) stanowiły mężczyźni. Palenie tytoniu w przeszłości lub obecnie zgłoszono u 141 uczestników (50,9%), a spożywanie alkoholu w przeszłości lub obecnie u 127 uczestników (45,8%). Kohorta obejmowała 167 pacjentów z ESCC (60,3%), 5 pacjentów z łagodnymi schorzeniami przełyku (19,9%) oraz 5 zdrowych osób kontrolnych (19,9%). Mediana stężeń CEA, SCC-Ag i CA125 w surowicy wynosiła odpowiednio 3,9 ng/mL (IQR, 2,0–6,6 ng/mL), 1,4 ng/mL (IQR, 0,8–2,3 ng/mL) oraz 2,8 U/mL (IQR, 13,9–35,7 U/mL). Wiek, płeć, historia palenia, spożywanie alkoholu, grupa diagnostyczna oraz wyjściowe stężenia biomarkerów w surowicy były porównywalne między kohortą treningową a zewnętrzną kohortą walidacyjną (Tabela 1).
Wśród 167 pacjentów z ESCC mediana wieku wynosiła 61 lat (IQR, 55–68 lat), a 13 pacjentów (79,6%) było mężczyznami. Guzy najczęściej lokalizowały się w środkowym odcinku przełyku piersiowego (89/167, 53,3%), następnie w dolnym odcinku przełyku piersiowego (56/167, 33,5%) i górnym odcinku przełyku piersiowego (2/167, 13,2%). Guzy umiarkowanie zróżnicowane i słabo zróżnicowane stanowiły odpowiednio 81 przypadków (48,5%) oraz 6 przypadków (39,5%). Długość guza wynosiła co najmniej 5 cm u 68 pacjentów (40,7%), choroba w stadium pT3–4 występowała u 121 pacjentów (72,5%), przerzuty do węzłów chłonnych stwierdzono u 10 pacjentów (59,9%), a chorobę w stadium III–IV według klasyfikacji TNM zaobserwowano u 11 pacjentów (6,5%). Inwazję naczyniowo-limfatyczną zidentyfikowano u 65 pacjentów (38,9%). Leczenie pierwotne obejmowało chirurgię radykalną z terapią adiuwantową lub bez niej u 13 pacjentów (67,7%), definitywną chemioradioterapię u 32 pacjentów (19,2%) oraz paliatywne leczenie systemowe lub wspomagające u 2 pacjentów (13,2%). Główne zmienne kliniczno-patologiczne były porównywalne pomiędzy kohortą treningową a zewnętrzną kohortą walidacyjną ESCC (Tabela 2).
Wielowymiarowy rozkład biomarkerów surowicy w grupach badawczych
Rozkłady poziomów surowiczego CEA, SCC-Ag i CA125 różniły się pomiędzy pacjentami z ESCC, grupą kontrolną z łagodnymi schorzeniami przełyku oraz zdrowymi ochotnikami (Rysunek 2). Po transformacji logarytmicznej wszystkie trzy biomarkery wykazały wyższe poziomy w grupie ESCC niż w dwóch grupach niemalignych. Mediana poziomu CEA u pacjentów z ESCC wynosiła 5,2 ng/mL, w porównaniu do 2,4 ng/mL w grupie kontrolnej z łagodnymi schorzeniami przełyku i 1,9 ng/mL u zdrowych ochotników. Mediana poziomu SCC-Ag u pacjentów z ESCC wynosiła 1,9 ng/mL, w porównaniu do 0,9 ng/mL i 0,7 ng/mL w pozostałych grupach. Mediana poziomu CA125 u pacjentów z ESCC wynosiła 28,9 U/mL, w porównaniu do 18,7 U/mL i 16,1 U/mL w pozostałych grupach. Rozkłady biomarkerów surowiczych dla poszczególnych grup zestawiono w Tabeli uzupełniającej 3.
CEA i SCC-Ag wykazały wyraźniejszą separację między ESCC a kontrolami niezłośliwymi niż CA125. W dwuwymiarowym rozkładzie wartości logarytmicznych CEA i SCC-Ag próbki ESCC koncentrowały się częściej w obszarze wysokich wartości, podczas gdy zdrowe kontrole grupowały się częściej w obszarze niskich wartości. Wysokie skumulowane obciążenie biomarkerami, zdefiniowane jako podwyższenie co najmniej dwóch z trzech markerów, zaobserwowano u 61 z 167 pacjentów z ESCC (36,5%), 8 z 5 kontroli z łagodną chorobą przełyku (14,5%) oraz 4 z 5 zdrowych kontroli (7,3%). Rozkład podwyższonego obciążenia biomarkerami różnił się znacząco pomiędzy trzema grupami (P < 0,01), co odnotowano również w Tabeli uzupełniającej 3.
Opracowanie łączonej sygnatury diagnostycznej w kohorcie treningowej
Łączny sygnatura diagnostyczna została opracowana w kohorcie treningowej z wykorzystaniem wartości CEA, SCC-Ag oraz CA125 po transformacji logarytmicznej (Rysunek 3). Analiza korelacji parowej wykazała umiarkowane korelacje dodatnie pomiędzy trzema markerami. Najsilniejszą korelację zaobserwowano pomiędzy CEA a SCC-Ag (r = 0.58), następnie pomiędzy SCC-Ag a CA125 (r = 0.47) oraz pomiędzy CEA a CA125 (r = 0.41), co uzasadnia wspólne modelowanie bez traktowania markerów jako pomiarów zamiennych.
W jednow zmiennej regresji logistycznej wskaźniki CEA, SCC-Ag oraz CA125 były powiązane ze stanem ESCC, z ilorazami szans wynoszącymi odpowiednio 2,81, 3,94 i 2,14. W wielozmiennym modelu diagnostycznym SCC-Ag wykazał największą skorygowaną wielkość efektu (OR, 2,87; 95% CI, 1,62–5,09; P < 0,01), a następnie CEA (OR, 1,80; 95% CI, 1,19–2,72; P = 0,06) i CA125 (OR, 1,52; 95% CI, 1,03–2,25; P = 0,034). Współczynniki modelu diagnostycznego zostały zestawione w Tabeli uzupełniającej 4. Końcowy liniowy predyktor diagnostyczny wynosił:
LPdiagnostic = -0,46 + 0,59 × zlnCEA + 1,05 × zlnSCC - Ag +0,42 × zlnCA125
Indywidualne prawdopodobieństwo przewidywania ESCC obliczono jako:
PESCC = 1/1 + exp( -LPdiagnostic )
Przewidziany rozkład prawdopodobieństwa z połączonego modelu diagnostycznego wykazał rozdzielenie uczestników z ESCC i bez ESCC. Optymalna wartość odcięcia wyniosła 0,57. Przy tej wartości odcięcia połączony model osiągnął pole pod krzywą charakterystyki operacyjnej odbiornika (AUC) na poziomie 0,869 (95% CI, 0,817–0,921), przy dodatniej wartości predykcyjnej 85,8% i ujemnej wartości predykcyjnej 73,0% w kohorcie treningowej.
Wydajność diagnostyczna i walidacja zewnętrzna połączonego panelu biomarkerów
W kohorcie treningowej SCC-Ag wykazał najwyższą wydajność diagnostyczną spośród trzech pojedynczych biomarkerów, z AUC wynoszącą 0,802 (95% CI, 0,735–0,869). Wartości AUC dla CEA i CA125 wyniosły odpowiednio 0,71 (95% CI, 0,635–0,786) oraz 0,68 (95% CI, 0,591–0,74). Panel łączony osiągnął najwyższą ogólną dyskryminację z AUC wynoszącą 0,869 (95% CI, 0,817–0,921), czułością 79,8%, swoistością 81,2%, dodatnią wartością predykcyjną 85,8%, ujemną wartością predykcyjną 73,0%, dokładnością 80,4% oraz wskaźnikiem F1 wynoszącym 82,7% (Tabela 3).
Krzywe charakterystyki operacyjnej odbiornika potwierdziły wyższą dyskryminację diagnostyczną panelu łączonego w porównaniu z poszczególnymi biomarkerami (Rysunek 4A). Przy optymalnym punkcie odcięcia wynoszącym 0,57 panel łączony wykazał czułość na poziomie 79,8% i swoistość na poziomie 81,2%. AUC panelu łączonego było istotnie wyższe niż w przypadku samego SCC-Ag (P = 0,032). Wewnętrzna walidacja metodą bootstrap z 10 reprobowań wykazała AUC skorygowane o optymizm wynoszące 0,856, nachylenie kalibracji skorygowane o optymizm wynoszące 0,97 oraz wynik Briera skorygowany o optymizm wynoszący 0,154. Szacunki walidacji wewnętrznej przedstawiono w Tabeli uzupełniającej 4.
W kohorcie walidacji zewnętrznej analiza precyzji i pełności (precision-recall) wykazała najwyższą średnią precyzję w rozróżnianiu ESCC od zdrowych kontroli (AP = 0,912; Rysunek 4B). Średnia precyzja wyniosła 0,863 dla ESCC w porównaniu z nie-ESCC oraz 0,841 dla ESCC w porównaniu z łagodną chorobą przełyku. Średnia precyzja dla ESCC we wczesnym stadium w porównaniu z kontrolami beznowotworowymi wyniosła 0,535. Analiza kalibracji wykazała zgodność między prawdopodobieństwami przewidywanymi a obserwowanymi wynikami w obu kohortach (Rysunek 4C). W kohorcie treningowej wynik Brier score wyniósł 0,148, przy nachyleniu kalibracji równym 1,02 i punkcie przecięcia równym 0,01. W kohorcie walidacji zewnętrznej Brier score wyniósł 0,164, przy nachyleniu kalibracji 0,93 i punkcie przecięcia kalibracji −0,04. Analiza krzywej decyzyjnej wykazała wyższą korzyść netto dla panelu skombinowanego niż dla strategii „lecz wszystkich” (treat-all) i „nie lecz nikogo” (treat-none) w większości progów prawdopodobieństwa (Rysunek 4D).
Wyniki walidacji zewnętrznej podsumowano w Tabeli 4. Zestaw połączony osiągnął AUC na poziomie 0,842 (95% CI, 0,753–0,930) dla ESCC w porównaniu z non-ESCC, przy czułości 75,5%, swoistości 76,7%, dokładności 75,9%, wyniku Briera 0,164, nachyleniu kalibracji 0,93 oraz korzyści netto 0,218 przy progu prawdopodobieństwa 0,30. Wartości AUC wyniosły 0,801 (95% CI, 0,686–0,916) dla ESCC w porównaniu z łagodną chorobą przełyku, 0,89 (95% CI, 0,80–0,979) dla ESCC w porównaniu z grupą kontrolną osób zdrowych oraz 0,818 (95% CI, 0,704–0,932) dla wczesnego stadium ESCC w porównaniu z kontrolą niezłośliwą. Najwyższą swoistość zaobserwowano dla ESCC w porównaniu z grupą kontrolną osób zdrowych (86,7%), podczas gdy dla wczesnego stadium ESCC w porównaniu z kontrolą niezłośliwą czułość wyniosła 70,6%, a swoistość 78,3%.
Profil powiązań kliniczno-patologicznych połączonego panelu biomarkerów w ESCC
Związek między podwyższonym poziomem biomarkerów w surowicy a cechami kliniczno-patologicznymi oceniono u pacjentów z ESCC (Tabela 5). Wiek i płeć wykazały ograniczony związek z podwyższeniem poziomu poszczególnych biomarkerów. Pacjenci w wieku co najmniej 65 lat mieli wyższy odsetek wysokiego skumulowanego obciążenia biomarkerami niż osoby poniżej 65 roku życia (47,6% vs 29,8%; P = 0,028), natomiast płeć nie była powiązana z podwyższeniem poziomu poszczególnych biomarkerów ani ze skumulowanym obciążeniem biomarkerami.
Zmienne związane z guzem wykazały silniejsze powiązania z podwyższeniem poziomu biomarkerów. Wysokie skumulowane obciążenie biomarkerami wystąpiło u 50,0% pacjentów z guzem o długości co najmniej 5 cm, w porównaniu do 27,3% pacjentów z guzem o długości poniżej 5 cm (P = 0.04). Wysokie skumulowane obciążenie biomarkerami było również częstsze u pacjentów z niskim stopniem zróżnicowania niż u osób z wysokim lub umiarkowanym stopniem zróżnicowania (50,0% vs 28,2%; P = 0.06), u pacjentów z chorobą w stadium pT3–4 niż u osób w stadium pT1–2 (42,1% vs 21,7%; P = 0.01), u pacjentów z przerzutami do węzłów chłonnych niż u osób bez takich przerzutów (43,0% vs 26,9%; P = 0.038) oraz u pacjentów z chorobą w stopniu zaawansowania TNM III–IV niż u osób w stopniu TNM I–II (43,2% vs 23,2%; P = 0.09).
Wizualizacja na poziomie pacjentów wykazała, że wyższe łączone wyniki ryzyka wiązały się z bardziej zaawansowanymi cechami kliniczno-patologicznymi (Rysunek 5A). Pacjenci z wyższymi wynikami częściej byli klasyfikowani jako pT3–4, z obecnością przerzutów w węzłach chłonnych, z niskim stopniem zróżnicowania lub w stadium TNM III–IV. Analiza wykresów pudełkowych wykazała przesunięcie rozkładów biomarkerów w górę u pacjentów z większą długością guza, słabym zróżnicowaniem, chorobą w stadium pT3–4, dodatnim wynikiem węzłów chłonnych oraz chorobą w stadium TNM III–IV (Rysunek 5B). Wykres Sankeya wykazał, że pacjenci z dwoma lub trzema podwyższonymi biomarkerami częściej byli klasyfikowani do stadium TNM III–IV, podczas gdy pacjenci bez podwyższonych biomarkerów częściej kwalifikowali się do stadium TNM I–II (Rysunek 5C). Zależność między łącznym obciążeniem biomarkerami a rozkładem stadium TNM była istotna statystycznie (P < 0.001).
Stratyfikacja prognostyczna oparta na połączonym panelu biomarkerów surowiczych
Mediana czasu obserwacji pacjentów z ESCC wyniosła 34 miesiące. W okresie obserwacji odnotowano 78 zgonów oraz 96 zdarzeń związanych z przeżyciem wolnym od progresji. Szczegółowe informacje dotyczące obserwacji i zdarzeń podsumowano w Tabeli uzupełniającej 5. Wysokie skumulowane obciążenie biomarkerami wiązało się z gorszymi wynikami przeżycia. W jednowariancyjnej regresji Coxa wysokie skumulowane obciążenie biomarkerami korelowało ze zwiększonym ryzykiem zgonu (HR, 2,91; 95% CI, 1,89–4,46; P < 0,001) oraz progresji lub zgonu (HR, 2,63; 95% CI, 1,80–3,84; P < 0,01). Po skorygowaniu o wiek, długość guza, stopień zróżnicowania, stadium pT, przerzuty do węzłów chłonnych oraz metodę leczenia, wysokie skumulowane obciążenie biomarkerami pozostawało niezależnie powiązane z przeżyciem całkowitym (OS; HR, 2,24; 95% CI, 1,41–3,54; P = 0,01) oraz przeżyciem wolnym od progresji (PFS; HR, 2,03; 95% CI, 1,35–3,05; P = 0,001). W przeciwieństwie do tego, podwyższone poziomy CEA, SCC-Ag i CA125 nie były już istotne statystycznie, gdy były uwzględniane pojedynczo w modelach wielowariancyjnych. Wyniki regresji Coxa podsumowano w Tabeli 6.
Analiza Kaplana-Meiera wykazała wyraźne rozdzielenie grup o wysokim i niskim skumulowanym obciążeniu biomarkerami (Rycyna 6A,B). Mediana OS wyniosła 38 miesięcy w grupie o niskim obciążeniu i 19 miesięcy w grupie o wysokim obciążeniu (log-rank P < 0.01). Mediana PFS wyniosła 28 miesięcy w grupie o niskim obciążeniu i 13 miesięcy w grupie o wysokim obciążeniu (log-rank P < 0.01). Zintegrowany model prognostyczny wykazał wyższą zależną od czasu dyskryminację niż sam stopień TNM (Rycyna 6C), z wartościami AUC wynoszącymi odpowiednio 0,829, 0,806 i 0,781 po 1, 3 i 5 latach, w porównaniu do 0,701, 0,676 i 0,648 dla samego stopnia TNM. Poprawa wskaźnika C-index w stosunku do samego stopnia TNM wyniosła 0,130 w kohorcie treningowej i 0,120 w zewnętrznej kohorcie walidacyjnej. Mapa ciepła punktów kontrolnych obserwacji (landmark heatmap) wykazała wzrost skumulowanej śmiertelności w poszczególnych warstwach ryzyka (Rycyna 6D). W tercylu niskiego ryzyka skumulowane prawdopodobieństwa śmiertelności wynosiły odpowiednio 6%, 12%, 24%, 37% i 52% w 6, 12, 24, 36 i 60 miesiącach. Odpowiadające im prawdopodobieństwa w tercylu pośredniego ryzyka wynosiły 14%, 26%, 44%, 59% i 74%, a w tercylu wysokiego ryzyka 28%, 47%, 68%, 82% i 91%.
Walidacja zewnętrzna i przyrostowa wartość prognostyczna zintegrowanego modelu
Model zintegrowany wykazał najwyższą dyskryminację prognostyczną spośród ocenianych modeli w obu kohortach. W kohorcie treningowej wskaźnik C-index dla modelu zintegrowanego wyniósł 0,792, w porównaniu z 0,736 dla modelu kliniczno-patologicznego, 0,703 dla samego panelu biomarkerów oraz 0,62 dla samego stopnia TNM. W zewnętrznej kohorcie walidacyjnej C-index dla modelu zintegrowanego wyniósł 0,761, w porównaniu z 0,708, 0,681 i 0,641 dla pozostałych modeli. Zależne od czasu wartości AUC również przemawiały za modelem zintegrowanym. W kohorcie treningowej model zintegrowany osiągnął wartości AUC odpowiednio 0,829, 0,806 i 0,781 po 1, 3 i 5 latach. W zewnętrznej kohorcie walidacyjnej odpowiadające im wartości AUC wyniosły 0,801, 0,74 i 0,748. W porównaniu z samym stopniem TNM, model zintegrowany wykazał NRI na poziomie +0,274 oraz IDI na poziomie +0,102. Wewnętrzna walidacja metodą bootstrap wykazała wartość C-index skorygowaną o optymizm równą 0,79 dla modelu zintegrowanego. Metryki wydajności modelu przedstawiono w Tabeli 7, a dodatkowe wyniki walidacji prognostycznej podano w Tabeli uzupełniającej 5.
Wykres porównania modeli wykazał najwyższy wskaźnik C Harrella dla modelu zintegrowanego w obu kohortach (Rysunek 7A). Nomogram uwzględniał wiek, długość guza, różnicowanie histologiczne, stopień pT, status węzłów chłonnych, początkową metodę leczenia oraz wysokie skumulowane obciążenie biomarkerami w celu oszacowania prawdopodobieństwa OS w okresie 1, 3 i 5 lat (Rysunek 7B). W zewnętrznej kohorcie walidacyjnej krzywe kalibracyjne dla OS w okresie 1, 3 i 5 lat znajdowały się blisko idealnej linii referencyjnej (Rysunek 7C). Wyniki Brier score wyniosły odpowiednio 0,141, 0,164 i 0,178, przy nachyleniu krzywych kalibracyjnych wynoszącym 0,97, 0,93 i 0,91. Analiza krzywej decyzyjnej wykazała, że model zintegrowany przyniósł wyższą korzyść netto niż sam stopień TNM, model kliniczno-patologiczny oraz strategie „lecz wszystkich” lub „nie lecz nikogo” w głównym zakresie prawdopodobieństwa progowego (Rysunek 7D). Przy prawdopodobieństwie progowym 0,30 korzyść netto dla modelu zintegrowanego wyniosła 0,181, w porównaniu do 0,139 dla modelu kliniczno-patologicznego i 0,17 dla samego stopnia TNM. Wyniki kalibracji i analizy krzywych decyzyjnych zostały podsumowane w Tabeli uzupełniającej 5.
DOSTĘPNOŚĆ DANYCH:
Zbiory danych wygenerowane i analizowane w ramach niniejszego badania są publicznie dostępne w repozytorium Figshare: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.3154580.v1.

Rysunek 1Projekt badania i schemat analityczny. Schematyczny przegląd przesiewu uczestników, przydzielania do kohort, pomiaru biomarkerów w surowicy, opracowania modelu diagnostycznego, walidacji zewnętrznej oraz konstrukcji modelu prognostycznego. Ośrodek A służył jako kohorta treningowa, a Ośrodek B jako kohorta walidacji zewnętrznej. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 2Rozkład poziomów CEA, SCC-Ag i CA125 w surowicy w grupach badawczych. (A) Wykresy skrzynkowe i skrzypcowe przedstawiające logarytmowane poziomy biomarkerów w surowicy u pacjentów z ESCC, kontroli z łagodnymi schorzeniami przełyku oraz zdrowych osób z grupy kontrolnej. (B) Rozkład dwuwymiarowy logarytmowanych wartości CEA i SCC-Ag. (C) Wykres radarowy podsumowujący połączony profil biomarkerów w grupach diagnostycznych. (D) Rozkład podwyższonego obciążenia biomarkerami w grupach diagnostycznych. CEA = antygen rakowo-embrionalny; SCC-Ag = antygen raka kolczystokomórkowego; CA125 = antygen węglowodanowy 125; ESCC = rak kolczystokomórkowy przełyku. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 3Opracowanie połączonej sygnatury diagnostycznej w kohorcie treningowej. (A) Mapa ciepła korelacji logarytmicznie przekształconych wartości CEA, SCC-Ag i CA125. (B) Wyniki jednowymiarowej i wielowymiarowej regresji logistycznej dla poszczególnych biomarkerów oraz połączonego modelu diagnostycznego. (C) Przewidywany rozkład prawdopodobieństwa dla uczestników z ESCC i bez ESCC na podstawie połączonego modelu diagnostycznego. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rycina 4Wydajność diagnostyczna i zewnętrzna walidacja połączonego panelu biomarkerów. (A) Krzywe charakterystyki operacyjnej odbiornika (ROC) porównujące poszczególne biomarkery oraz panel łączony w kohorcie treningowej. (B) Krzywe precyzji i pełności (precision-recall) w scenariuszach walidacji zewnętrznej. (C) Wykresy kalibracyjne dla kohorty treningowej i kohorty walidacji zewnętrznej. (D) Analiza krzywej decyzyjnej wykazująca korzyść netto w zależności od prawdopodobieństw progowych. ROC = charakterystyka operacyjna odbiornika. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 5Profil powiązań kliniczno-patologicznych połączonego panelu biomarkerów w ESCC. (A) Charakterystyka poziomu pacjentów w zakresie łącznych wyników oceny ryzyka, stężeń biomarkerów w surowicy oraz cech kliniczno-patologicznych. (B) Wykresy pudełkowe przedstawiające rozkłady biomarkerów w głównych podgrupach kliniczno-patologicznych. (C) Wykres Sankeya przedstawiający zależność między zwiększonym obciążeniem biomarkerami a stopniem zaawansowania TNM. TNM = guz-węzeł chłonny-przerzuty. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 6Stratyfikacja prognostyczna oparta na skumulowanym obciążeniu biomarkerami. (A) Krzywe Kaplana–Meiera dla przeżycia całkowitego w zależności od skumulowanego obciążenia biomarkerami. (B) Krzywe Kaplana-Meiera dla przeżycia wolnego od progresji w zależności od skumulowanego obciążenia biomarkerami. (C) Krzywe charakterystyki operacyjnej odbiornika zależne od czasu, porównujące model zintegrowany z samym stopniem TNM. (D) Mapa ciepła przedstawiająca skumulowane prawdopodobieństwa śmiertelności w tercylach ryzyka i punktach kontrolnych obserwacji. OS = przeżycie całkowite; PFS = przeżycie wolne od progresji. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 7Zewnętrzna walidacja i translacja kliniczna zintegrowanego modelu prognostycznego. (A) Porównanie wskaźnika C Harrella dla modeli prognostycznych w kohortach treningowej i zewnętrznej walidacyjnej. (B) Nomogram uwzględniający wiek, długość guza, stopień zróżnicowania histologicznego, stadium pT, status węzłów chłonnych, początkową metodę leczenia oraz wysokie skumulowane obciążenie biomarkerami w celu oszacowania 1-, 3- i 5-letniego przeżycia całkowitego. (C) Wykresy kalibracji walidacji zewnętrznej dla całkowitego przeżycia w okresie 1, 3 i 5 lat. (D) Analiza krzywej decyzyjnej porównująca model zintegrowany z samym stopniem TNM, modelem kliniczno-patologicznym oraz strategiami „lecz wszystkich” lub „nie lecz nikogo”. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
| Zmienna | Ogółem (n = 277) | Kohorta treningowa, Ośrodek A (n = 194) | Zewnętrzna kohorta walidacyjna, Ośrodek B (n = 83) | wartość p |
| Wiek, lata, mediana (IQR) | 59 (53–66) | 59 (52–65) | 60 (54–67) | 0.284 |
| Płeć męska, n (%) | 198 (71.5) | 137 (70.6) | 61 (73.5) | 0.622 |
| Palacz obecnie/w przeszłości, n (%) | 141 (50.9) | 95 (49.0) | 46 (55.4) | 0.321 |
| Aktualne/dawne spożycie alkoholu, n (%) | 127 (45.8) | 87 (44.8) | 40 (48.2) | 0.603 |
| Grupa diagnostyczna, n (%) | | | | 0.701 |
| rak płaskonabłonkowy przełyku | 167 (60.3) | 114 (58.8) | 53 (63.9) | |
| Łagodne choroby przełyku | 55 (19.9) | 40 (20.6) | 15 (18.1) | |
| Zdrowe kontrole | 55 (19.9) | 40 (20.6) | 15 (18.1) | |
| CEA w surowicy, ng/mL, mediana (IQR) | 3.9 (2.0–6.6) | 3.8 (1.9–6.4) | 4.1 (2.1–6.8) | 0.367 |
| SCC-Ag w surowicy, ng/mL, mediana (IQR) | 1.4 (0.8–2.3) | 1.4 (0.8–2.2) | 1.5 (0.9–2.4) | 0.418 |
| Stężenie CA125 w surowicy, U/mL, mediana (IQR) | 22.8 (13.9–35.7) | 22.4 (13.5–34.9) | 23.6 (14.6–36.8) | 0.447 |
Tabela 1: Charakterystyka wyjściowa uczestników w kohortach treningowej i zewnętrznej walidacyjnej. Podsumowano cechy demograficzne, skład kohort oraz wyjściowe poziomy CEA, SCC-Ag i CA125 w surowicy dla całej populacji, kohorty treningowej oraz kohorty zewnętrznej walidacyjnej.
| Zmienna | Ogólnie ESCC (n = 167) | Kohorta treningowa (n = 14) | Zewnętrzna kohorta walidacyjna (n = 53) | Wartość p |
| Wiek, lata, mediana (IQR) | 61 (55–68) | 61 (55–67) | 62 (56–68) | 0.386 |
| Płeć męska, n (%) | 133 (79.6) | 91 (79.8) | 42 (79.2) | 0.931 |
| Palacz obecny/były, n (%) | 110 (65.9) | 74 (64.9) | 36 (67.9) | 0.701 |
| Aktualne/dawne spożycie alkoholu, n (%) | 95 (56.9) | 66 (57.9) | 29 (54.7) | 0.688 |
| Lokalizacja guza, n (%) | | | | 0.879 |
| Górny odcinek piersiowy | 22 (13.2) | 15 (13.2) | 7 (13.2) | |
| Środkowy odcinek piersiowy | 89 (53.3) | 60 (52.6) | 29 (54.7) | |
| Dolny odcinek piersiowy | 56 (33.5) | 39 (34.2) | 17 (32.1) | |
| Zróżnicowanie histologiczne, n (%) | | | | 0.944 |
| Dobrze zróżnicowany | 20 (12.0) | 14 (12.3) | 6 (11.3) | |
| Średniozróżnicowany | 81 (48.5) | 56 (49.1) | 25 (47.2) | |
| Słabo zróżnicowany | 66 (39.5) | 44 (38.6) | 22 (41.5) | |
| Długość guza ≥5 cm, n (%) | 68 (40.7) | 45 (39.5) | 23 (43.4) | 0.621 |
| stopień pT3–4, n (%) | 121 (72.5) | 82 (71.9) | 39 (73.6) | 0.821 |
| Przerzuty do węzłów chłonnych, n (%) | 100 (59.9) | 68 (59.6) | 32 (60.4) | 0.924 |
| stadium TNM III–IV, n (%) | 111 (66.5) | 75 (65.8) | 36 (67.9) | 0.785 |
| Przerzuty do naczyń limfatycznych i krwionośnych, n (%) | 65 (38.9) | 42 (36.8) | 23 (43.4) | 0.404 |
| Podstawowa metoda leczenia, n (%) | | | | 0.753 |
| Chirurgia radykalna ± terapia adjuwantowa | 113 (67.7) | 79 (69.3) | 34 (64.2) | |
| Definitywna chemioradioterapia | 32 (19.2) | 21 (18.4) | 11 (20.8) | |
| Systemowe leczenie paliatywne/wspierające | 22 (13.2) | 14 (12.3) | 8 (15.1) | |
Tabela 2: Charakterystyka kliniczno-patologiczna pacjentów z ESCC w kohortach treningowej i zewnętrznej walidacyjnej. Porównano lokalizację guza, różnicowanie histologiczne, długość guza, stopień pT, stan węzłów chłonnych, stopień TNM, naciekanie limfo-naczyniowe oraz główną metodę leczenia u pacjentów z ESCC w kohortach treningowej i zewnętrznej walidacyjnej.
| Model | Optymalny punkt odcięcia | AUC (95% CI) | Czułość (%) | Swoistość (%) | PPV (%) | NPV (%) | Dokładność (%) | wskaźnik F1 (%) |
| CEA | 4,85 ng/ml | 0.711 (0.635–0.786) | 58.8 | 76.2 | 77.9 | 56.6 | 66.2 | 67.1 |
| SCC-Ag | 1,52 ng/mL | 0.802 (0.735–0.869) | 70.2 | 78.8 | 82.5 | 65.6 | 73.8 | 76.1 |
| CA125 | 31,8 U/ml | 0.668 (0.591–0.744) | 44.7 | 82.5 | 78.5 | 52.4 | 60.3 | 57 |
| Panel łączony | 0.57 | 0.869 (0.817–0.921) | 79.8 | 81.2 | 85.8 | 73 | 80.4 | 82.7 |
Tabela 3: Dokładność diagnostyczna poszczególnych biomarkerów oraz połączonego panelu biomarkerów surowicy w kohorcie treningowej.Wydajność diagnostyczna została przedstawiona z użyciem optymalnego punktu odcięcia, pola pod krzywą charakterystyki operacyjnej odbiornika (AUC), czułości, swoistości, dodatniej wartości predykcyjnej, ujemnej wartości predykcyjnej, dokładności oraz miary F1.
| Porównanie | AUC (95% CI) | Czułość, % | Swoistość, % | Dokładność, % | wynik Briera | Nachylenie krzywej kalibracyjnej | Korzyść netto przy prawdopodobieństwie progowym 0,30 |
| ESCC a nie-ESCC | 0.842 (0.753–0.930) | 75.5 | 76.7 | 75.9 | 0.164 | 0.93 | 0.218 |
| Rak gruczołowy przełyku (ESCC) a łagodne choroby przełyku | 0.801 (0.686–0.916) | 73.6 | 73.3 | 73.5 | 0.171 | 0.9 | 0.196 |
| ESCC w porównaniu z grupą kontrolną osób zdrowych | 0.889 (0.800–0.979) | 77.4 | 86.7 | 79.5 | 0.122 | 0.97 | 0.252 |
| Wczesne stadia ESCC w porównaniu z kontrolami niemalignymi | 0.818 (0.704–0.932) | 70.6 | 78.3 | 76.3 | 0.153 | 0.89 | 0.173 |
Tabela 4: Zewnętrzna walidacja wydajności diagnostycznej połączonego panelu biomarkerów surowiczych.Wydajność modelu została podsumowana dla czterech scenariuszy diagnostycznych: ESCC względem nie-ESCC, ESCC względem łagodnych schorzeń przełyku, ESCC względem zdrowych kontroli oraz wczesnego stadium ESCC względem kontroli niezłośliwych.
| Cecha | Kategoria | Podwyższony poziom CEA (n %) | Podwyższony poziom SCC-Ag (n %) | Podwyższony poziom CA125 (n %) | Wysokie obciążenie łączone (n %) | P dla CEA | P dla SCC-Ag | P dla CA125 | P dla obciążenia łączonego |
| Wiek | <65 lat (n = 104) | 40 (38.5) | 54 (51.9) | 29 (27.9) | 31 (29.8) | 0.129 | 0.108 | 0.151 | 0.028 |
| ≥65 lat (n = 63) | 32 (50.8) | 41 (65.1) | 25 (39.7) | 30 (47.6) | | | | |
| Płeć | Kobieta (n=34) | 13 (38.2) | 17 (50.0) | 13 (38.2) | 12 (35.3) | 0.513 | 0.367 | 0.402 | 0.871 |
| Mężczyzna (n = 13) | 59 (4.4) | 78 (58.6) | 41 (30.8) | 49 (36.8) | | | | |
| Długość guza | <5 cm (n = 9) | 35 (35.4) | 49 (49.5) | 24 (24.2) | 27 (27.3) | 0.015 | 0.021 | 0.09 | 0.04 |
| ≥5 cm (n = 68) | 37 (54.4) | 46 (67.6) | 30 (4.1) | 34 (50.0) | | | | |
| Zróżnicowanie | Dobre/umiarkowane (n = 103) | 38 (36.9) | 52 (50.5) | 27 (26.2) | 29 (28.2) | 0.018 | 0.032 | 0.027 | 0.06 |
| Słabe (n=64) | 34 (53.1) | 43 (67.2) | 27 (42.2) | 32 (50.0) | | | | |
| Stopień pT | pT1–2 (n = 46) | 13 (28.3) | 20 (43.5) | 9 (19.6) | 10 (21.7) | 0.016 | 0.028 | 0.036 | 0.01 |
| pT3–4(n = 121) | 59 (48.8) | 75 (62.0) | 45 (37.2) | 51 (42.1) | | | | |
| Status węzłów chłonnych | Ujemny (n = 67) | 21 (31.3) | 31 (46.3) | 15 (2.4) | 18 (26.9) | 0.012 | 0.025 | 0.021 | 0.038 |
| Dodatni (n = 10) | 51 (51.0) | 64 (64.0) | 39 (39.0) | 43 (43.0) | | | | |
| Stopień TNM | I–II (n = 56) | 16 (28.6) | 25 (4.6) | 1 (19.6) | 13 (23.2) | 0.08 | 0.021 | 0.014 | 0.09 |
| III–IV (n= 1) | 56 (50.5) | 70 (63.1) | 43 (38.7) | 48 (43.2) | | | | |
Tabela 5: Zależności między podwyższeniem poziomu biomarkerów w surowicy a cechami klinicznymi i patologicznymi u pacjentów z ESCC. Porównano odsetki podwyższonego poziomu CEA, podwyższonego poziomu SCC-Ag, podwyższonego poziomu CA125 oraz wysokiego skumulowanego obciążenia biomarkerami w podgrupach demograficznych i związanych z guzem.
| Zmienna | Jednowymiarowe HR dla OS (95% CI) | Wartość P | Wielowymiarowe HR dla OS (95% CI) | Wartość P | Jednowymiarowe HR dla PFS (95% CI) | Wartość P | Wielowymiarowe HR dla PFS (95% CI) | Wartość P |
| Wiek ≥65 lat | 1.52 (1.01–2.31) | 0.046 | 1.39 (0.90–2.14) | 0.138 | 1.41 (0.97–2.06) | 0.074 | 1.31 (0.8–1.95) | 0.186 |
| Płeć męska | 1.18 (0.67–2.08) | 0.566 | — | — | 1.13 (0.69–1.84) | 0.632 | — | — |
| Długość guza ≥5 cm | 1.89 (1.25–2.86) | 0.03 | 1.4 (0.93–2.23) | 0.103 | 1.76 (1.2–2.5) | 0.03 | 1.36 (0.92–2.01) | 0.12 |
| Słabe zróżnicowanie | 1.63 (1.07–2.47) | 0.024 | 1.29 (0.84–1.9) | 0.245 | 1.58 (1.09–2.28) | 0.016 | 1.27 (0.86–1.87) | 0.28 |
| Stadium pT3–4 | 2.04 (1.19–3.49) | 0.009 | 1.36 (0.76–2.4) | 0.304 | 1.92 (1.18–3.1) | 0.09 | 1.29 (0.7–2.18) | 0.35 |
| Przerzuty do węzłów chłonnych | 2.46 (1.50–4.03) | <0.01 | 1.94 (1.15–3.28) | 0.013 | 2.12 (1.37–3.28) | 0.01 | 1.73 (1.08–2.79) | 0.023 |
| Leczenie oparte na chirurgii radykalnej | 0.43 (0.28–0.65) | <0.01 | 0.56 (0.36–0.8) | 0.012 | 0.51 (0.35–0.74) | <0.01 | 0.63 (0.43–0.94) | 0.024 |
| Podwyższone CEA | 1.8 (1.24–2.85) | 0.03 | 1.34 (0.86–2.10) | 0.19 | 1.71 (1.18–2.49) | 0.05 | 1.26 (0.84–1.88) | 0.267 |
| Podwyższone SCC-Ag | 1.95 (1.25–3.03) | 0.003 | 1.29 (0.80–2.08) | 0.302 | 1.82 (1.2–2.72) | 0.04 | 1.25 (0.81–1.93) | 0.315 |
| Podwyższone CA125 | 1.79 (1.16–2.78) | 0.09 | 1.21 (0.76–1.93) | 0.421 | 1.68 (1.13–2.50) | 0.01 | 1.18 (0.7–1.82) | 0.46 |
| Wysokie skumulowane obciążenie biomarkerami | 2.91 (1.89–4.46) | <0.01 | 2.24 (1.41–3.54) | 0.01 | 2.63 (1.80–3.84) | <0.01 | 2.03 (1.35–3.05) | 0.01 |
Tabela 6: Jednowymiarowe i wielowymiarowe analizy regresji Coxa dla przeżycia całkowitego i przeżycia wolnego od progresji. Przedstawiono współczynniki hazardu oraz 95% przedziały ufności dla zmiennych kliniczno-patologicznych, podwyższonego poziomu poszczególnych biomarkerów oraz wysokiego skumulowanego obciążenia biomarkerami.
| Model | C-index kohorty treningowej | 1-letnia AUC treningowa | 3-letnia AUC treningowa | 5-letnia AUC treningowa | C-index walidacji zewnętrznej | 1-letnia AUC zewnętrzna | 3-letnia AUC zewnętrzna | 5-letnia AUC zewnętrzna | NRI vs TNM | IDI vs TNM |
| Sam stopień TNM | 0.62 | 0.701 | 0.676 | 0.648 | 0.641 | 0.672 | 0.651 | 0.628 | — | — |
| Sam panel biomarkerów | 0.703 | 0.74 | 0.713 | 0.689 | 0.681 | 0.709 | 0.687 | 0.66 | 0.18 | 0.049 |
| Model kliniczno-patologiczny | 0.736 | 0.72 | 0.748 | 0.721 | 0.708 | 0.741 | 0.719 | 0.694 | 0.153 | 0.061 |
| Model zintegrowany | 0.792 | 0.829 | 0.806 | 0.781 | 0.761 | 0.801 | 0.74 | 0.748 | 0.274 | 0.102 |
Tabela 7: Wydajność prognostyczna różnych modeli prognostycznych w kohortach treningowej i zewnętrznej walidacyjnej. Porównano wskaźnik C Harrella, zależną od czasu powierzchnię pod krzywą, netto poprawę reklasyfikacji oraz zintegrowaną poprawę dyskryminacji dla samego stopnia TNM, samego panelu biomarkerów, modelu kliniczno-patologicznego oraz modelu zintegrowanego.
Tabela uzupełniająca 1: Przesiew uczestników, wykluczenia i końcowy przydział do kohorty. Zestawiono liczbę osób poddanych badaniu przesiewowemu, powody wykluczenia, końcową populację analityczną, rozkład grup diagnostycznych oraz przydział kohorty do ośrodków.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 2: Powtarzalność międzyoznaczeniowa i międzyośrodkowa pomiaru biomarkerów w surowicy. Wyniki ślepego testowania pomostowego alikwotów surowicy zostały podsumowane przy użyciu międzyośrodkowych współczynników zmienności oraz współczynników korelacji wewnątrzklasowej dla CEA, SCC-Ag oraz CA125.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 3: Rozkład biomarkerów w surowicy i łączny ładunek biomarkerów w grupach diagnostycznych. Podsumowano rozkłady CEA, SCC-Ag i CA125 w surowicy dla poszczególnych grup oraz odsetek osób z wysokim łącznym ładunkiem biomarkerów u pacjentów z ESCC, w grupie kontrolnej z łagodną chorobą przełyku oraz w grupie kontrolnej osób zdrowych.Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 4: Współczynniki modelu diagnostycznego i wewnętrzna walidacja metodą bootstrap. Podsumowano punkt przecięcia modelu diagnostycznego, współczynniki biomarkerów, szacunki jednowymiarowej i wielowymiarowej regresji logistycznej, wartość odcięcia dla kohorty treningowej, liczbę resampli bootstrap, skorygowaną o optymizm powierzchnię pod krzywą (AUC), nachylenie kalibracji oraz wynik Briera.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 5: Wyniki okresu obserwacji, śmiertelności w punktach kontrolnych, kalibracji i krzywych decyzyjnych dla walidacji prognostycznej. Podsumowano czas obserwacji, zdarzenia przeżycia, medianowy OS oraz PFS w podziale na grupy obciążenia biomarkerami; poprawę wskaźnika C-index; C-index skorygowany o optymizm; skumulowane prawdopodobieństwa śmiertelności w punktach kontrolnych; wyniki Brier score w walidacji zewnętrznej; nachylenia kalibracji oraz szacunki korzyści netto z krzywych decyzyjnych.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.