Streptococcus agalactiae (Grupa B Streptococcus, GBS) jest Gram-dodatnim bakteryjnym patobiontem, który kolonizuje wiele miejsc polimikrobowych, w tym przewód pokarmowy i drogi rodne. Chociaż kolonizacja pochwy jest zazwyczaj bezobjawowa, w czasie ciąży GBS może przedostać się z dróg rodnych do macicy i przeniknąć przez nienaruszone błony, powodując zakażenie płynu owodniowego i łożyska. W związku z tym stanowi on główny czynnik ryzyka niekorzystnych wyników ciąży, zakażeń płodu oraz chorób noworodków1,2Jako jedna z głównych przyczyn zakażeń inwazyjnych u noworodków, kluczowe jest scharakteryzowanie czynników wpływających na ryzyko transmisji i zakażenia. Przedporodowa profilaktyka antybiotykowa może ograniczyć transmisję pionową oraz wczesne występowanie choroby wywołanej przez GBS u noworodków.3,4; wiązano go jednak ze wzrostem wskaźników oporności na antybiotyki oraz potencjalnymi długofalowymi skutkami związanymi z podawaniem antybiotyków w okresie prenatalnym lub we wczesnym dzieciństwie5,6,7,8Czynniki te sprawiają, że konieczne jest opracowanie bardziej celowanych interwencji zapobiegawczych i terapeutycznych.
Coraz więcej dowodów wskazuje na to, że skład mikrobiomu oraz interakcje polimikrobowe wpływają na homeostazę i prawdopodobieństwo wystąpienia choroby9. Dominacja GBS w ludzkim mikrobiomie pochwy została powiązana ze spadkiem liczebności Lactobacillus, a zaobserwowano również interakcje specyficzne dla gatunków i szczepów , które mogą mieć zróżnicowany wpływ na kolonizację in vitro oraz in vivo10,11. Wcześniej nasza grupa badawcza opracowała mysi model kolonizacji pochwy przez GBS, aby zbadać korelacje gospodarza i bakterii dotyczące kondycji GBS12. Procedura ta polega na podaniu myszom pojedynczej dawki 17β-estradiolu, a następnego dnia na inokulacji dopochwowej GBS. Model ten wykorzystywano do charakterystyki znaczenia białek powierzchniowych GBS, regulacyjnych sieci sygnałowych oraz sekrecji toksyn w utrzymywaniu kolonizacji i naciekaniu tkanek FGT. Ponadto odkryliśmy, że GBS wykazuje złożone interakcje z innymi bakteriami w drogach pochwy, w tym z Akkermansia muciniphila oraz Enterococcus faecalis13,14,15, co pokazuje, jak styl życia i przetrwanie GBS są kształtowane przez obecność sąsiadujących drobnoustrojów.
Choć istniejący model został dostosowany do badania interakcji międzybakteryjnych, w celu badania innych drobnoustrojów wymagane były dodatkowe modyfikacje. Grzyby są niedostatecznie zbadanym składnikiem mikrobiomu pochwy, a za pomocą przedstawionego tutaj modelu dążyliśmy do opracowania narzędzia do badania kolonizacji grzybiczej oraz interakcji grzybkowo-bakteryjnych in vivo. Najczęściej izolowanym grzybem z ludzkiego przewodu rodnego jest Candida albicans, który kolonizuje ponad 70% osób16. C. albicans jest polimorficzny i może przechodzić morfogenezę, aby przełączać się między morfotypem drożdżakowym a nitkowatym. Filamentacja wiąże się z odrębnym zestawem ekspresji genów17,18. Niedawno doniesiono, że niektóre z tych genów specyficznych dla strzępek zapewniają przewagę adaptacyjną w kontekście kolonizacji polimikrobowej19,20,21.
W kilku badaniach zgłoszono współizolację C. albicans i GBS z wymazów z pochwy u ludzi, a nasza grupa badawcza stwierdziła niedawno, że u osób skolonizowanych przez C. albicans występuje znacznie wyższa częstość nosicielstwa GBS22. Opracowaliśmy system in vivo do badania trójstronnych interakcji między grzybami komensalnymi, bakteriami a gospodarzem. Badania nad grzybami u konwencjonalnych myszy zazwyczaj wymagają leczenia antybiotykami, aby przełamać oporność na kolonizację indukowaną przez bakterie i ustanowić trwałą kolonizację23. Aby osiągnąć ten cel bez zaburzania zdolności GBS do kolonizacji, podajemy myszom koktajl antybiotyków, inokulujemy je C. albicans, a po ustanowieniu kolonizacji przerywamy ekspozycję na antybiotyki, aby umożliwić późniejszą kolonizację przez GBS. Proces ten został zoptymalizowany w taki sposób, aby zarówno C. albicans, jak i GBS kolonizowały drogi rodne przy podobnym obciążeniu i w podobnym czasie, co umożliwia bezpośrednie interakcje w obrębie pochwy. Niniejszy protokół opisuje metodę przygotowania myszy za pomocą antybiotyków, podania 17β-estradiolu, ustanowienia kolonizacji zarówno przez grzyby, jak i bakterie oraz pobierania próbek płuczek i tkanek do późniejszej analizy.