W poniższych eksperymentach wykorzystano mikrofluidyczne urządzenie kompresyjne15 do modelowania oddziaływań między guzem a układem odpornościowym w fizjologicznie istotnym mikrośrodowisku 3D, które jednocześnie umożliwia przykładanie statycznej i dynamicznej kompresji do sferoidów nowotworowych (Rycina 1). Komponenty urządzenia (Rycina 1A1) oraz kolejność ich montażu (Rycina 1A2) przedstawiono na Rycynie 1A. Metalowa rama służy jako podstawa urządzenia, w której umieszczona jest warstwa komory komórkowej (L1). Jednostka kontroli ciśnienia, składająca się z warstw L2 i L3 połączonych w procesie bondingowania plazmowego, jest umieszczana nad L1, a następnie nakłada się kolektor (Rycina 1A2). Razem L1 i jednostka kontroli ciśnienia tworzą funkcjonalne urządzenie mikrofluidyczne i są zaciśnięte między metalową ramą a kolektorem za pomocą śrub. Kolektor zawiera porty wlotowe dla przewodów fluidycznych w celu dostarczenia ciśnienia do urządzenia, a także zbiorniki z medium, które ułatwiają długoterminowe eksperymenty z obrazowaniem żywych komórek.

Rysunek 1: Mikrofluidyczne urządzenie do kompresji przeznaczone do badań interakcji między komórkami odpornościowymi a sferoidami nowotworowymi pod wpływem kompresji mechanicznej. (A1) Fotografia komponentów niezbędnych do montażu urządzenia, przedstawionych od lewej do prawej: kolektor, jednostka kontroli ciśnienia (L2 + L3), warstwa komory komórkowej (L1) oraz metalowa rama. (A2) Schemat 3D komponentów urządzenia, przedstawionych od góry do dołu: kolektor, jednostka kontroli ciśnienia (L2 + L3), warstwa komory komórkowej (L1) oraz metalowa rama. Warstwy PDMS L2 i L3 są łączone plazmowo w celu utworzenia jednostki kontroli ciśnienia, która jest umieszczona nad komorą komórkową. Kolektor i metalowa rama stabilizują zmontowane urządzenie. (B1) Schemat przekroju jednostki kompresyjnej przed i po kompresji. Sferoidy nowotworowe osadzone w ECM oraz komórki NK są umieszczone w komorze komórkowej. Początkowa odległość między dnem L1 a dnem L2 przed kompresją jest oznaczona jako h. Po przyłożeniu ciśnienia do jednostki kontroli ciśnienia, L2 ugięta zostaje w dół, co powoduje, że tłok z PDMS kompresuje sferoid nowotworowy. Przesunięcie L2 w dół po kompresji jest oznaczone jako Δh. (B2) Połączone obrazy w jasnym polu i GFP sferoidu nowotworowego MCF-7 z komórkami NK przed (lewo) i po (prawo) kompresji. Komórki MCF-7 są znakowane GFP, natomiast komórki NK nie są znakowane. Reprezentatywne komórki NK zostały obwiedzione niebieskim kolorem, a żółte obrysy zaznaczają obrzeża sferoidów nowotworowych. Pasek skali = 50 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.
Po złożeniu urządzenie do kompresji mikrofluidycznej może być wykorzystane do ściskania sferoidów nowotworowych, jak zilustrowano na Rysunku 1B. W tym układzie sferoidy nowotworowe z komórkami NK osadzone w kolagenie są wprowadzane do komory komórkowej (L1). Po przyłożeniu ciśnienia do komory ciśnieniowej (L3), odkształcalna warstwa membrany (L2) ugina się w dół, co powoduje, że tłok z polidimetylosiloksanu (PDMS) przekazuje siły kompresyjne na sferoid. Komora ciśnieniowa jest sterowana przez zewnętrzne źródło ciśnienia. Dodatkowe szczegóły dotyczące projektu, wykonania i charakterystyki urządzenia do kompresji mikrofluidycznej zostały wcześniej opublikowane w innym badaniu15.
Odległość między dnem komory komórkowej (L1) a dnem odkształcalnej membrany (L2) definiujemy jako h (Rysunek 1B1, panel lewy). Przed kompresją odległość ta wynosi 200 µm. Po przyłożeniu ciśnienia cieczy do jednostki sterowania ciśnieniem odkształcalna membrana ugina się w dół, zmniejszając odległość h o Δh (Δh; Rysunek 1B1, panel prawy), co powoduje kompresję sferoidu nowotworowego osadzonego w kolagenie. W tym układzie odkształcenie kompresyjne definiuje się jako Δh/h, gdzie h jest początkową odległością między L1 a L2 przed kompresją, a Δh jest przemieszczeniem L2 w dół po kompresji. Przemieszczenie membrany zostało wcześniej skalibrowane poprzez wizualizację kulek fluorescencyjnych przylegających do dna L2. Szczegółowy opis procedury kalibracji oraz obliczeń odkształcenia kompresyjnego znajduje się w poprzednim badaniu17. Przykładową krzywą kalibracyjną można zobaczyć na Rysunku uzupełniającym 2.
Rysunek 1B2 przedstawia reprezentatywne, nałożone na siebie obrazy w jasnym polu i GFP sferoidu MCF-7 z komórkami NK zatopionymi w 1,5 mg/mL kolagenu przed (panel lewy) i po kompresji (panel prawy). Granice sferoidu nowotworowego zaznaczono na żółto. Po kompresji sferoid wykazał zwiększenie powierzchni rzutowanej, co wskazuje na odkształcenie w odpowiedzi na pomyślne przyłożenie obciążenia mechanicznego. we wszystkich eksperymentach przedstawionych w niniejszym manuskrypcie zastosowano odkształcenie kompresyjne Δh/h = 50%. Zauważamy, że średnica sferoidu mieści się w zakresie od 140 µm do 200 µm. Oznacza to, że rzeczywiste odkształcenie kompresyjne sferoidu jest nieco mniejsze niż 50%. Wideo uzupełniające 1 oraz Wideo uzupełniające 2 przedstawiają reprezentatywne stosy z-stacki X-Y uzyskane w kanale fluorescencji GFP sferoidu MCF-7 zatopionego w 1,5 mg/mL kolagenu odpowiednio przed i po przyłożeniu 50% odkształcenia kompresyjnego.
Mikrofluidyczne urządzenie do kompresji zostało wykorzystane do zbadania wpływu komórek NK, kompresji oraz ich połączenia na obumieranie sferoidów nowotworowych (Rysunek 2). Jest to możliwe dzięki konstrukcji urządzenia, które zawiera 12 dołków hodowlanych. Sześć z tych dołków można poddać kompresji, podczas gdy pozostałe sześć służy jako niekompresowane kontrole. Taka konfiguracja umożliwia zastosowanie czterech warunków eksperymentalnych (Rysunek 2A): same sferoidy bez kompresji (sp), sferoidy z komórkami NK bez kompresji (+NK), sferoidy poddane kompresji (+comp) oraz sferoidy poddane jednocześnie kompresji i działaniu komórek NK (+comp+NK).

Rysunek 2: Kompresja mechaniczna moduluje zależną od komórek NK cytotoksyczność wobec sferoidów nowotworowych. (A) Obrazy fluorescencyjne poklatkowe sferoidów MCF-7 zatopionych w kolagenie 1,5 mg/mL w czterech warunkach: kontrola tylko sferoidy (sp), sferoidy z komórkami NK (+NK), sferoidy poddane kompresji (+comp) oraz sferoidy poddane kompresji i inkubowane z komórkami NK (+comp+NK). Fluorescencja GFP znakuje żywe komórki nowotworowe MCF-7. Żółta obwiednia wskazuje obszar zainteresowania (ROI), który został zdefiniowany na obrazie z 18. godziny i zastosowany do wszystkich punktów czasowych w celu kwantyfikacji fluorescencji. Całkowita intensywność fluorescencji GFP wewnątrz ROI została zmierzona i wykorzystana do dalszej analizy. Pasek skali = 50 µm. (B) Całkowita intensywność fluorescencji GFP jednego sferoidu w czasie w 4 warunkach. Każda kolorowa linia reprezentuje całkowitą intensywność fluorescencji pojedynczego sferoidu, znormalizowaną do jego początkowej intensywności w t = 0. Czarna linia to dopasowanie wielomianowe drugiego stopnia do danych intensywności fluorescencji zgromadzonych z 7 sferoidów hodowanych w warunkach kontrolnych, które posłużyło jako referencja do obliczenia utraty komórek nowotworowych w części (C). (C) Znormalizowana utrata GFP dla warunków +comp, +NK oraz +comp+NK została obliczona poprzez odjęcie intensywności GFP w t = 18 h każdego sferoidu od linii referencyjnej dla samych sferoidów (sp). Zatem każdy punkt danych reprezentuje znormalizowaną utratę GFP pojedynczego sferoidu. Słupki błędów reprezentują SEM. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.
Wpływ komórek NK, kompresji oraz ich połączenia na sferoidy nowotworowe można zaobserwować na reprezentatywnych obrazach sferoidów MCF-7 w 1,5 mg/mL kolagenu (Rycina 2A). Ponieważ komórki MCF-7 wykorzystane do wytworzenia sferoidów nowotworowych zostały oznakowane GFP, żywotność nowotworu można było monitorować poprzez zmiany fluorescencji GFP. Obrazy GFP i w świetle przechodzącym pozyskiwano co 10 min przez 18 h przy użyciu odwróconego mikroskopu epifluorescencyjnego. Co istotne, sferoidy poddane kompresji wykazywały większą powierzchnię rzutowania niż sferoidy niekompresowane, co potwierdza skuteczny przekaz obciążenia mechanicznego z odkształcalnej membrany na sferoid nowotworowy. Z czasem zaobserwowano stopniowy zanik fluorescencji GFP w warunkach +NK oraz +comp+NK (Rycina 2A), co wskazuje na indukowaną przez komórki NK śmierć komórek nowotworowych.
Utratę fluorescencji GFP wykorzystujemy jako miarę śmierci komórek nowotworowych. Komórki MCF-7 oznakowane GFP użyte w niniejszym badaniu zostały wytworzone poprzez transdukcję lentiwirusową. W skrócie, wykorzystano wektor lentiwirusowy do wprowadzenia kasety ekspresyjnej wzmocnionego zielonego białka fluorescencyjnego (eGFP) sterowanej przez promotor czynnika elongacyjnego 1α (EF1α), wraz z genem oporności na puromycynę sterowanym przez promotor wirusa białaczki ptaków (RSV). Po infekcji lentiwirusowe kasety ekspresyjne zostały zintegrowane z DNA genomicznym komórek MCF-7, co doprowadziło do stabilnej ekspresji GFP. Następnie zastosowano selekcję puromycyną w celu wyeliminowania komórek nietransdukowanych. Oznakowanie komórek MCF-7 za pomocą GFP umożliwiło ilościowe określenie żywotności komórek nowotworowych poprzez monitorowanie zmian natężenia fluorescencji GFP w czasie (Ryc. 2B). Wcześniej wykazano silną korelację między utratą fluorescencji GFP a uznanymi markerami śmierci komórkowej, w tym markerem żywotności jodkiem propidium (PI) oraz markerem apoptozy anneksyną-V18, co potwierdza, że utrata fluorescencji GFP jest miarą zastępczą śmierci komórek nowotworowych.
Aby ilościowo określić wpływ czterech warunków eksperymentalnych na żywotność guza, w każdym punkcie czasowym zmierzono całkowitą intensywność fluorescencji GFP każdego sferoidu nowotworowego, odjęto tło i znormalizowano wynik do wartości początkowej (Rysunek 2B). Całkowitą fluorescencję sferoidu obliczono w zdefiniowanym obszarze zainteresowania (ROI). Obszar ROI uzyskano poprzez ręczne obrysowanie granicy sferoidu nowotworowego na obrazie z 18. godziny (żółty obrys na panelu 18 h, Rys. 2A) przy użyciu wewnętrznego skryptu MATLAB. Całkowitą intensywność fluorescencji w tym ROI obliczono następnie dla każdego punktu czasowego i skorygowano poprzez odjęcie średniej fluorescencji tła zmierzonej z oddzielnego ROI wybranego w innym miejscu obrazu. Uzyskane wartości fluorescencji skorygowane o tło zostały następnie znormalizowane do początkowej intensywności fluorescencji sferoidu.
Każda kolorowa krzywa na Rysunku 2B reprezentuje znormalizowaną intensywność GFP pojedynczego sferoidu w określonych warunkach eksperymentalnych. Krzywa została uzyskana poprzez dopasowanie wielomianu drugiego stopnia do danych eksperymentalnych. Krzywe fioletowe reprezentują sferoidy poddane wyłącznie kompresji (+comp, Rysunek 2B), krzywe czerwone reprezentują sferoidy z komórkami NK (+NK, Rysunek 2B), a krzywe niebieskie reprezentują sferoidy poddane zarówno kompresji, jak i działaniu komórek NK (+comp+NK, Rysunek 2B). W przeciwieństwie do nich, krzywa czarna stanowi dopasowanie wielomianem drugiego stopnia do danych z siedmiu sferoidów hodowanych w warunkach kontrolnych (same sferoidy; sp, Rysunek 2B). Na Rysunku 2B, dla zwiększenia przejrzystości, przedstawiono jedynie dane dopasowane wielomianem, a nie poszczególne punkty pomiarowe. Warto zauważyć, że intensywność fluorescencji GFP w warunkach kontrolnych (sp) oraz w warunkach sferoid + kompresja (+comp) wykazywała ogólną tendencję wzrostową w czasie (Rysunek 2B), co jest spójne z dalszym wzrostem guza lub utrzymaniem żywotności komórek. Z kolei w warunkach +NK oraz +comp+NK odnotowano stopniowy spadek intensywności fluorescencji GFP (Rysunek 2B), co wskazuje na śmierć komórek nowotworowych.
Skumulowaną utratę komórek nowotworowych określono poprzez odjęcie dopasowanej znormalizowanej intensywności fluorescencji GFP każdego sferoidu w danej kondycji (+comp, +NK lub +comp+NK) od wartości w warunkach kontrolnych po 18 h (Rysunek 2C). W rezultacie każdy punkt danych reprezentuje znormalizowaną utratę GFP poszczególnego sferoidu w stosunku do kontroli składającej się z samych sferoidów (Rysunek 2C). Odpowiednio, kondycja +comp odzwierciedla utratę GFP wynikającą z samej kompresji (kolor fioletowy, Rysunek 2C), kondycja +NK odzwierciedla utratę GFP wynikającą z samych komórek NK (kolor czerwony, Rysunek 2C), a kondycja +comp+NK odzwierciedla utratę GFP wynikającą z połączonego działania kompresji i komórek NK (kolor niebieski, Rysunek 2C). W kondycji +comp zaobserwowano najniższy stopień utraty GFP (Rysunek 2C), co sugeruje, że sama kompresja miała minimalny wpływ na żywotność sferoidów. W przeciwieństwie do tego, zarówno w kondycji +NK, jak i +comp+NK odnotowano znacznie większą utratę GFP niż w kondycji +comp (Rysunek 2C), co wskazuje, że komórki NK są głównym czynnikiem indukującym śmierć komórek nowotworowych. Choć w kondycji +comp+NK zaobserwowano większą średnią utratę GFP niż w kondycji +NK, różnica ta nie osiągnęła istotności statystycznej (Rysunek 2C). Wyniki te sugerują, że kompresja nie upośledza cytotoksyczności komórek NK wobec komórek nowotworowych. Podsumowując, dane te wykazują, że mikrofluidyczne urządzenie do kompresji może być skutecznie wykorzystane do ilościowego określenia niezależnych i połączonych efektów kompresji oraz komórek NK na żywotność sferoidów nowotworowych w fizjologicznie istotnym środowisku 3D.
Z kolei nieoptymalne wyniki mogą wystąpić, gdy (1) sferoidy znajdują się poza granicą tłoka, (2) sferoidy są rozmieszczone zbyt blisko granicy tłoka oraz (3) wiele sferoidów znajduje się w odległości mniejszej niż jedna średnica sferoidu od siebie (Rysunek 3). W takich przypadkach odpowiednie pola należy wykluczyć z analizy.

Rycina 3: Reprezentatywny przykład sekwencji obrazów sferoidów wykluczonych z analizy. Przedstawiono obrazy time-lapse w świetle przechodzącym (BF), fluorescencję GFP oraz obrazy scalone sferoidów MCF-7 z komórkami NK w kolagenie 1,5 mg/mL przed (lewa kolumna) i po kompresji (dwie prawe kolumny). Obrazy przed kompresją pozyskano 20 min przed przyłożeniem ciśnienia i 10 min przed rozpoczęciem obrazowania time-lapse. Następnie obrazy gromadzono co 10 min przez 18 h, gdzie 0 h odpowiada pierwszemu obrazowi uzyskanemu bezpośrednio po kompresji, a 18 h oznacza koniec eksperymentu. Niebieska strzałka wskazuje krawędź tłoka PDMS (L2). To pole obrazowania zostało wykluczone z analizy, ponieważ w obszarze kompresji znajdowały się dwa sferoidy i były one zlokalizowane zbyt blisko granicy tłoka. W konsekwencji nie można było wiarygodnie określić stopnia deformacji sferoidów ani intensywności fluorescencji GFP podczas kompresji. Pasek skali = 50 µm. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.
(1) Sferoidy znajdujące się poza granicą tłoka nie podlegają kompresji, ponieważ ciśnienie jest przykładane wyłącznie w obszarze tłoka. Sferoidy te powinny zatem zostać wykluczone zarówno z grupy poddanej kompresji, jak i z grupy kontrolnej. (2) Należy wykluczyć sferoidy znajdujące się na granicy tłoka lub w jej bezpośrednim sąsiedztwie (Rysunek 3, górny sferoid), ponieważ podlegają one nierównomiernemu obciążeniu mechanicznemu. (3) Należy wykluczyć sferoidy, których odległość od sąsiednich sferoidów jest mniejsza niż średnica sferoidu (Rysunek 3). Bliskie sąsiedztwo sferoidów utrudnia kwantyfikację intensywności fluorescencji GFP, ponieważ obszar zainteresowania (ROI) jest definiowany w końcowym punkcie czasowym. Z biegiem czasu granice sferoidów mogą stać się nierozróżnialne, co utrudnia wyznaczenie ROI, który precyzyjnie obejmuje tylko jeden sferoid. Problemy te można zminimalizować, zapewniając centrowanie sferoidów w obszarze kompresji podczas ładowania urządzenia. Zachowanie szczególnej uwagi przy rozmieszczeniu i pozycjonowaniu sferoidów oraz konfiguracji urządzenia jest niezbędne do osiągnięcia jednorodnej kompresji i uzyskania wiarygodnych, powtarzalnych wyników eksperymentalnych.
| Komponenty | Stężenie |
| pożywka α-MEM | |
| płodowa surowica bydlęca (FBS) | 10% |
| Penicylina/streptomycyna | 1% |
Tabela 1: Pełna pożywka dla komórek MCF-7.
| Składniki | Stężenie |
| pożywka α-MEM | |
| mio-inozytol | 0.2 mM |
| 2-merkaptoetanol | 0.1 mM |
| płodowa surowica bydlęca (FBS) | 12.50% |
| kwas foliowy | 0.02 mM |
| surowica końska (HS) | 12.50% |
| penicylina/streptomycyna | 1% |
Tabela 2: Pełna pożywka dla komórek NK.
Rycina uzupełniająca 1: Schemat systemu kontroli ciśnienia. Kompresor dostarcza sprężone powietrze (do 20 psi) do kontrolera ciśnienia. Kontroler ciśnienia reguluje ciśnienie powietrza dostarczanego do zbiornika ciśnieniowego zgodnie z ustawieniami zdefiniowanymi przez użytkownika. Kontroler posiada maksymalne ciśnienie robocze 200 mbar, stabilność ciśnienia 0,005% pełnej skali (FS), rozdzielczość ciśnienia 0,003% FS oraz czas odpowiedzi 9 ms, co umożliwia dokładną i powtarzalną kontrolę ciśnienia. Kontroler jest połączony z komputerem za pomocą uniwersalnej magistrali szeregowej (USB), co pozwala użytkownikowi na zaprogramowanie wartości i profilu przyłożonego ciśnienia przy użyciu dołączonego oprogramowania. Oprogramowanie obsługuje wiele kształtów fal kompresji, w tym kompresję stałą, sinusoidalną, trójkątną i okresową. Na tym schemacie ciśnienie jest ustawione na 120 mbar, a sprężone powietrze pod tym ciśnieniem jest dostarczane do zbiornika ciśnieniowego przez rurkę pneumatyczną. Zbiornik ciśnieniowy zawiera 50 mL wody dejonizowanej (DI) i służy do przekształcenia ciśnienia pneumatycznego w ciśnienie hydrauliczne. Po nadaniem ciśnienia, zbiornik tłoczy ciecz przez rurki doprowadzające do jednostki kontroli ciśnienia urządzenia kompresji mikrofluidalnej (szczegóły urządzenia znajdują się na Rycini 1), gdzie ciśnienie hydrauliczne jest wykorzystywane do wywarcia kompresji na sferoid nowotworowy. Należy zauważyć, że zastosowano ciśnienie cieczy, aby uniknąć pęcherzyków powietrza w urządzeniu z PDMS. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Rysunek uzupełniający 2: Krzywa kalibracyjna dla mikroprzepływowego urządzenia do kompresji przedstawiająca zależność między przesunięciem tłoka (, µm) a ciśnieniem przyłożonym do komory sterowania ciśnieniem (KPa). Pomiary eksperymentalne są reprezentowane przez kropki, natomiast linia ciągła odpowiada symulacji COMSOL. Słupki błędów wskazują błąd standardowy średniej (SEM) z ośmiu niezależnych pomiarów eksperymentalnych, lecz są zbyt małe, aby były widoczne. Rysunek ten został przedrukowany z pracy Suh i wsp.15 za zgodą Royal Society of Chemistry. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Wideo uzupełniające 1: Stos obrazów z-stack X-Y sferoidu MCF-7 znakowanego GFP przed kompresją. Sferoid został osadzony w kolagenie o stężeniu 1,5 mg/mL w mikrofluidycznym urządzeniu do kompresji, a następnie obrazowany w kanale fluorescencji GFP z krokiem z wynoszącym 1 µm. Następnie do poprawy kontrastu wykorzystano program ImageJ. Pasek skali = 50 µm. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Wideo uzupełniające 2: Następnie do sferoidu MCF-7 znakowanego GFP, osadzonego w kolagenie o stężeniu 1,5 mg/mL, przyłożono odkształcenie ściskające wynoszące 50% (Δh/h = 50%). Po ściskaniu, w kanale fluorescencji GFP, wykonano obrazowanie typu z-stack w płaszczyźnie X–Y z krokiem 1 µm, a następnie przetworzono materiał w programie ImageJ w celu poprawy kontrastu. Pasek skali = 50 µm. Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.