Elektroakupunktura poprawia funkcję serca i łagodzi uszkodzenia mięśnia sercowego u szczurów z przewlekłą niewydolnością serca
W celu oceny wpływu EA na CHF utworzono model szczura poprzez podwiązanie tętnicy wieńcowej LAD, po czym zastosowano interwencje w postaci EA lub Sham EA. Przeprowadzono systematyczne oceny, w tym echokardiografię, analizy biochemiczne oraz barwienia histologiczne (Rysunek 2A). Pod względem funkcjonalnym w grupie CHF stwierdzono rozszerzenie komór oraz upośledzenie kurczliwości. Leczenie EA złagodziło spadki LVEF i LVFS obserwowane u szczurów z CHF, podczas gdy w grupie Sham EA poziom funkcji serca był porównywalny z poziomem w grupie CHF (Rysunek 2B i Rysunek 2C).
Ponadto EA obniżyło poziomy NT-proBNP i cTnT w surowicy, co wskazuje na zmniejszenie obciążenia serca i złagodzenie uszkodzenia mięśnia sercowego. W przeciwieństwie do tego, w grupie Sham EA zaobserwowano parametry biochemiczne podobne do tych w grupie CHF (Rycyna 2E,F). Analiza histologiczna wykazała, że w grupie CHF wystąpiły strukturalne uszkodzenia mięśnia sercowego oraz włóknienie. Leczenie EA poprawiło architekturę mięśnia sercowego i zmniejszyło CVF, podczas gdy w grupie Sham EA utrzymywały się zmiany patologiczne i poziomy CVF podobne do tych w grupie CHF (Rycina 2D). Podsumowując, EA wykazalo działanie kardioprotekcyjne przeciwko CHF, podczas gdy interwencja Sham EA nie przyniosła podobnych efektów terapeutycznych.
Elektroakupunktura aktywuje neurony w jądrze pasma samotnego u szczurów z przewlekłą niewydolnością serca
Aby ustalić, czy NTS pośredniczy w centralnej odpowiedzi na leczenie EA, oceniono aktywację neuronalną poprzez barwienie na c-Fos, marker pobudzenia neuronalnego. Obrazowanie immunofluorescencyjne (Rysunek 3A>) oraz ilościowe zliczanie komórek (Rysunek 3B>) wykazały, że liczba neuronów c-Fos-dodatnich w NTS była niższa w grupie CHF w porównaniu z grupą Sham. Jednak leczenie EA zwiększyło ekspresję c-Fos do poziomów porównywalnych z poziomem bazowym w grupie Sham. Równolegle z obwodowymi efektami funkcjonalnymi, grupa Sham EA wykazała poziomy ekspresji c-Fos podobne do grupy CHF.
Aby ocenić stan funkcjonalny tych neuronów NTS, zarejestrowano sygnały elektrofizjologiczne in vivo. Ślady wyładowań impulsowych (Rycina 3C) oraz ilościowa średnia częstotliwość wyładowań (Rycina 3D) były zgodne z wynikami histologicznymi. Spontaniczna częstotliwość wyładowań neuronów NTS była obniżona w warunkach CHF. Z kolei interwencja EA podniosła częstotliwość wyładowań neuronalnych, podczas gdy procedura Sham EA nie wywoła takich zmian elektrofizjologicznych.
Ten wzorzec aktywacji neuronalnej został potwierdzony przez analizę lokalnego potencjału polowego. Jak pokazano na dwuwymiarowych spektrogramach kolorystycznych LFP oraz trójwymiarowych mapach gęstości widma mocy (Rysunek 3E), energia oscylacji neuronalnych w obrębie NTS była osłabiona w stanie CHF. Po zastosowaniu EA odnotowano wzrost intensywności mocy w całym widmie częstotliwości neuronalnych, co wskazuje na aktywację sieci, która nie wystąpiła w grupie Sham EA.
Aby zbadać fizjologiczne znaczenie tej centralnej aktywacji, przeprowadzono analizę korelacji Pearsona, integrując obwodowe wskaźniki kardiologiczne z aktywnością neuronów w centralnym jądrze tractus solitarii (NTS) (Rysunek 3F). Analiza wykazała, że średnia częstotliwość wyładowań oraz ekspresja białka c-Fos w NTS były dodatnio skorelowane z LVEF. Odwrotnie, wskaźniki centralnej aktywności neuronalnej wykazywały ujemną korelację z surowiczym markerem niewydolności serca NT-proBNP. Korelacje te wskazują, że aktywacja neuronalna NTS modulowana przez EA jest powiązana z jej obwodową skutecznością kardioprotekcyjną.
Elektroakupunktura zmienia globalny profil proteomiczny w jądrze pasma samotnego
Ze względu na brak skuteczności terapeutycznej zaobserwowany w grupie Sham EA podczas poprzednich ocen funkcjonalnych, faza proteomiczna objęła jedynie grupy Sham, CHF i EA. Przed pobraniem tkanek 12 szczurów z każdej grupy poddano ocenie echokardiograficznej w celu zbadania efektów terapeutycznych EA, a wyniki te przedstawiono na Rysunku uzupełniającym 1A. Po tej ocenie 6 powtórzeń biologicznych z każdej grupy poddano ilościowej analizie proteomicznej opartej na spektrometrii mas.
W celu oceny niezawodności i ogólnego rozkładu danych proteomicznych przeprowadzono kontrolę jakości oraz analizy wielowymiarowe. Całkowita liczba zidentyfikowanych białek wyniosła 5 914 w grupie Sham, 5 980 w grupie CHF i 5 836 w grupie EA, co wskazuje na porównywalną detekcję białek we wszystkich trzech grupach eksperymentalnych (Rycina 4A oraz Tabela uzupełniająca 1). Analiza dyskryminacyjna metodą najmniejszych kwadratów cząstkowych wykazała wyraźny podział pomiędzy grupy Sham, CHF i EA, co wskazuje na odmienne globalne profile proteomiczne powiązane ze stanem chorobowym oraz interwencją EA (Rycina 4B).
Kolejna analiza dyskryminacyjna ortogonalnych cząstkowych najmniejszych kwadratów (OPLS-DA) w parach wykazała separację między grupą Sham a grupą CHF (Rysunek 4C) oraz między grupą CHF a grupą EA (Rysunek 4D). Odpowiednie testy permutacyjne potwierdziły wiarygodność poszczególnych modeli. Ponadto mapa cieplna korelacji Pearsona wykazała wysoką korelację wewnątrzgrupową oraz wyraźne wzorce międzygrupowe w próbkach proteomicznych, co potwierdza powtarzalność replikatów biologicznych (Rysunek 4E). Wspólnie te analizy wielowymiarowe i kontrola jakości wskazały, że zbiór danych proteomicznych był wystarczająco solidny do późniejszej identyfikacji i analizy bioinformatycznej białek różnicowo ekspresyjnych.
Elektroakupunktura moduluje kluczowe białka o różnym poziomie ekspresji oraz szlaki sygnałowe w jądrze pasma samotnego
W celu zbadania molekularnych celów EA przeanalizowano zmiany w białkach. Wykresy wulkaniczne przedstawiły rozkład białek o zwiększonej i zmniejszonej ekspresji w porównaniach grupy Sham względem CHF oraz grupy CHF względem EA (Rycina 5A, Tabela uzupełniająca 2 oraz Tabela uzupełniająca 3). Aby zidentyfikować cele terapeutyczne, przeprowadzono analizę części wspólną. Jak pokazano na diagramach Venna, zidentyfikowano 58 białek o zwiększonej ekspresji w grupie CHF, których ekspresja uległa zmniejszeniu po zastosowaniu EA, a także 27 białek o zmniejszonej ekspresji w grupie CHF, których ekspresja wzrosła w wyniku interwencji EA (Rycina 5B oraz Tabela uzupełniająca 4). Przesiewanie to pozwoliło na wyłonienie łącznie 85 kluczowych białek o zróżnicowanej ekspresji. Mapa ciepła z klastrowaniem hierarchicznym wykazała, że interwencja EA zmodyfikowała nieprawidłowe wzorce ekspresji tych 85 białek, przesuwając ich profile w stronę poziomu bazowego grupy Sham (Rycina 5C).
Aby określić funkcje biologiczne tych głównych celów, przeprowadzono oddzielne analizy wzbogacenia GO i KEGG dla dwóch różnych podzbiorów białek. Dla podzbioru 58 białek o obniżonej ekspresji pod wpływem EA, wykres bąbelkowy GO wykazał istotne wzbogacenie w procesach biologicznych, w tym organizację macierzy zewnątrzkomórkowej i organizację struktur zewnątrzkomórkowych, a także w komponentach komórkowych, takich jak zewnętrzna struktura otaczająca i trimer kolagenu, oraz funkcjach molekularnych, w tym wiązaniu kolagenu i wiązaniu receptorów glutaminianu (Rycina 5D oraz Tabela uzupełniająca 5). Następująca analiza ścieżek KEGG, zwizualizowana za pomocą diagramów chord i Sankey, ujawniła, że te 58 białek uczestniczy w kaskadach obejmujących trawienie i wchłanianie białek, cytoszkielet w komórkach mięśniowych oraz ścieżkę sygnalizacyjną TGF-β (Rycina 5E oraz Tabela uzupełniająca 6). Te wizualizacje topologiczne wyróżniły konkretne białka, w tym COL3A1, COL14A1, MYH11, DCN i DPF2, jako kluczowe węzły łączące wiele ścieżek patologicznych.
Z kolei adnotację funkcjonalną przeprowadzono dla podzbioru 27 białek wykazujących zwiększoną ekspresję w wyniku interwencji EA. Analiza wzbogacenia GO wskazała na zaangażowanie w procesy biologiczne, takie jak regulacja wzrostu komórek i pozytywna regulacja elongacji transkrypcji matrycyzowanej przez DNA, a także funkcje molekularne, w tym zależne od wapnia wiązanie białek oraz wiązanie tetrapiroli (Rysunek 5F oraz Tabela uzupełniająca 7). Odpowiadające im diagramy chord i Sankey w bazie KEGG przypisały te białka do kluczowych szlaków, w tym do ATP-zależnego przebudowywania chromatyny i represyjnego kompleksu polycomb (Rysunek 5G oraz Tabela uzupełniająca 8). Co istotne, to mapowanie sieci wyodrębniło kluczowe białka, takie jak YY1, E2F2 i ENTPD5, łączące te centralne sieci sygnalizacyjne. Ta kompleksowa stratyfikacja funkcjonalna stworzyła strukturalną podstawę do późniejszej walidacji głównych celów.
Topologia sieci i profilowanie ekspresji identyfikują YY1 jako potencjalny cel związany z efektami interwencji z użyciem elektroakupunktury
Aby wyłonić geny centralne spośród 85 białek o różnej ekspresji, skonstruowano sieć oddziaływań białko-białko. Analiza topologiczna zidentyfikowała 18 węzłów o wysokich wskaźnikach łączności (Rysunek 6A oraz Tabela uzupełniająca 9). Następnie przeprowadzono analizę szlaków KEGG specjalnie dla tych 18 białek centralnych. Odpowiednie diagramy chordowe i Sankeya odwzorowały złożone relacje między tymi węzłami a wzbogaconymi kaskadami sygnalizacyjnymi, w tym przebudową chromatyny zależną od ATP, represyjnym kompleksem polycomb oraz szlakiem sygnalizacyjnym TGF-β (Rysunek 6A oraz Tabela uzupełniająca 10). Na podstawie tego profilowania funkcjonalnego wybrano 10 białek o najwyższym stopniu wzbogacenia do dalszego przesiewu. Ponieważ cel terapeutyczny EA znajduje się w ośrodkowym układzie nerwowym, te 10 kandydatów oceniono z wykorzystaniem bazy danych ekspresji tkanek ludzkich GTEx (Rysunek 6B oraz Rysunek uzupełniający 1B–J). Wyniki wykazały, że tylko YY1 (Rysunek 6B), DMAP1 (Rysunek uzupełniający 1C) oraz DPF2 (Rysunek uzupełniający 1D) były ekspresjonowane w tkankach mózgu.
Aby wyizolować wysoce responsywny potencjalny cel EA, przeprowadzono eksperymenty molekularne in vivo z wykorzystaniem tkanek NTS. Do oceny responsywności transkrypcyjnej trzech kandydatów występujących obficie w mózgu wykorzystano ilościową reakcję PCR w czasie rzeczywistym. Ekspresja mRNA YY1 była obniżona w warunkach CHF i podwyższona po zastosowaniu EA, podczas gdy poziomy ekspresji mRNA DPF2 i DMAP1 nie wykazały statystycznie istotnych zmian w grupach eksperymentalnych (Rycina 6C). Ta analiza transkrypcyjna wykluczyła DPF2 i DMAP1 z dalszej walidacji i wskazała YY1 jako główny responsywny kandydat. Następująca analiza Western blot wykazała, że poziomy białka YY1 były obniżone w grupie CHF w stosunku do poziomu bazowego w grupie Sham, podczas gdy interwencja EA przeciwdziałała temu trendowi, zwiększając ekspresję białka YY1 (Rycina 6D oraz Rycina 6E). Wyniki tych eksperymentów wskazują, że EA zwiększa ekspresję YY1 w obrębie NTS.
Aby zbadać mechanizmy regulacyjne typu upstream kontrolujące ekspresję YY1, przeanalizowano powiązane z nią modyfikacje histonów oraz czynniki transkrypcyjne. Należy zauważyć, że wyniki te opierają się wyłącznie na obliczeniowych przewidywaniach bioinformatycznych pochodzących z Cistrome Data Browser i nie stanowią bezpośredniej walidacji eksperymentalnej metodą ChIP-seq. Przewidywania epigenetyczne wskazały na modyfikacje histonów, w tym H3K27ac, H3K27me3 oraz H3K4me3, z wysokimi wynikami potencjału regulacyjnego dla locus YY1 (Rysunek 6F). Jednocześnie ocena potencjału regulacyjnego zidentyfikowała czynniki transkrypcyjne, takie jak CDK9, PRDM1 i ELL2, jako regulatory upstream YY1 (Rysunek 6G). Te przewidywania bioinformatyczne zarysowują potencjalne sieci epigenetyczne i transkrypcyjne kontrolujące ekspresję YY1 w NTS.
Podsumowując, przedstawione dane wykazują, że interwencja EA skutecznie poprawia ogólnoustrojową funkcję serca i łagodzi uszkodzenia mięśnia sercowego u szczurów z CHF. Efektom tym, działającym obwodowo w charakterze kardioprotekcyjnym, towarzyszy centralnie przywrócenie aktywności wyładowań neuronalnych oraz energii oscylacji neuronalnych w obrębie NTS. Ponadto ilościowy screening proteomiczny zidentyfikował 85 kluczowych białek o różnej ekspresji i wskazał czynnik transkrypcyjny YY1 jako wysoce responsywny cel potencjalny. Wspólnie wyniki te sugerują, że skuteczność terapeutyczna EA w leczeniu CHF jest ściśle powiązana z przywróceniem funkcji neuronalnej NTS, a upregulacja YY1 może być zaangażowana w ten centralny proces neurobiologiczny.
Dostępność danych
Wszystkie dane wygenerowane i przeanalizowane w celu potwierdzenia wyników niniejszego badania zostały zawarte w manuskrypcie oraz w Pliku uzupełniającym 1. Aby spełnić wymóg publicznej dostępności danych, wszystkie dostępne surowe dane stanowiące podstawę tych badań zostały złożone w publicznym repozytorium Zenodo i są swobodnie dostępne pod następującym linkiem: https://doi.org/10.5281/zenodo.22030720. Dodatkowe dane wspierające są dostępne u autorów korespondencyjnych na uzasadnioną prośbę.

Rysunek 1: Schemat doświadczenia, opracowanie szczurzego modelu przewlekłej niewydolności serca oraz interwencja w postaci elektroakupunktury. (A) Ogólny schemat blokowy eksperymentu, zawierający oś czasu i przydział do grup dla dwóch niezależnych serii doświadczalnych. (B) Reprezentatywne zapisy elektrokardiograficzne przed i po podwiązaniu tętnicy wieńcowej LAD, gdzie strzałki wskazują uniesienie odcinka ST potwierdzające niedokrwienie mięśnia sercowego. (C) Analiza ilościowa LVEF 4 tygodnie po operacji w celu potwierdzenia prawidłowego opracowania modelu (powtórzenia biologiczne n = 6, średnia ± SD). ***p < 0.01 w porównaniu z grupą Sham. (D) Interwencja EA w obustronnych punktach akupunkturowych HT7. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 2: Elektroakupunktura poprawia funkcję serca i łagodzi uszkodzenie mięśnia sercowego u szczurów z przewlekłą niewydolnością serca. (A) Reprezentatywne echokardiogramy w trybie M obok obrazów tkanek mięśnia sercowego barwionych hematoksyliną i eozyną oraz trichromem Massona w 4 grupach eksperymentalnych (pasek skali = 50 µm). (B) Analiza ilościowa LVEF w grupach (powtórzenia biologiczne n = 6, średnia ± SD). ***p < 0,01 vs. grupa Sham; ###p < 0,01 vs. grupa CHF; ns, brak istotności statystycznej vs. grupa CHF. (C) Analiza ilościowa LVFS w grupach (powtórzenia biologiczne n = 6, średnia ± SD). ***p < 0,01 vs. grupa Sham; ###p < 0,01 vs. grupa CHF; ns, brak istotności statystycznej vs. grupa CHF. (D) Analiza ilościowa CVF w grupach (powtórzenia biologiczne n = 3, średnia ± SD). ***p < 0,01 vs. grupa Sham; ##p < 0,01 vs. grupa CHF; ns, brak istotności statystycznej vs. grupa CHF. (E) Analiza ilościowa poziomów NT-proBNP w surowicy w grupach (powtórzenia biologiczne n = 6, średnia ± SD). ***p < 0,01 vs. grupa Sham; ###p < 0,01 vs. grupa CHF; ns, brak istotności statystycznej vs. grupa CHF. (F) Analiza ilościowa poziomów cTnT w surowicy w grupach (powtórzenia biologiczne n = 6, średnia ± SD). ***p < 0,01 vs. grupa Sham; ###p < 0,01 vs. grupa CHF; ns, brak istotności statystycznej vs. grupa CHF. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 3: Elektroakupunktura przywraca aktywność neuronalną w jądrze pasma samotnego u szczurów z przewlekłą niewydolnością serca. (A) Reprezentatywne obrazy immunofluorescencyjne ekspresji c-Fos w NTS w poszczególnych grupach. Jądra komórkowe są barwione kontrastowo DAPI, a komórki c-Fos-dodatnie są zabarwione na zielono. Linie przerywane wyznaczają region anatomiczny, a białe groty strzałek wskazują reprezentatywne neurony c-Fos-dodatnie (pasek skali = 30 µm). (B) Analiza ilościowa liczby komórek c-Fos-dodatnich w poszczególnych grupach (powtórzenia biologiczne n = 3, średnia ± SD). ***p < 0.01 vs. grupa Sham; ###p < 0.001 vs. grupa CHF; ns, brak istotności statystycznej vs. grupa CHF. (C) Reprezentatywne zapisy wyładowań impulsowych (spike discharge) w badaniu elektrofizjologicznym in vivo w NTS w poszczególnych grupach. (D) Analiza ilościowa średniej częstotliwości wyładowań neuronalnych w poszczególnych grupach (powtórzenia biologiczne n = 3, średnia ± SD). ***p < 0.01 vs. grupa Sham; ###p < 0.01 vs. grupa CHF; ns, brak istotności statystycznej vs. grupa CHF. (E) Reprezentatywne 2D spektrogramy lokalnych potencjałów polowych oraz 3D topografie gęstości widmowej mocy ilustrujące energię oscylacji neuronalnych w obrębie NTS. (F) Macierz korelacji oceniająca zależności pomiędzy obwodowymi fenotypami sercowo-naczyniowymi a parametrami centralnej aktywności neuronalnej. Czerwone i niebieskie okręgi wskazują odpowiednio korelacje dodatnie i ujemne. **p < 0.01; ***p < 0.01. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tego rysunku.

Rysunek 4: Kontrola jakości i wielowymiarowa ocena statystyczna profili proteomicznych w jądrze pasma samotnego. (A) Ilościowy przegląd zidentyfikowanych białek w 3 grupach eksperymentalnych (powtórzenia biologiczne n = 6). (B) Wykres wyników analizy dyskryminacyjnej metodą cząstkowych najmniejszych kwadratów (PLS-DA), ilustrujący ogólny rozkład przestrzenny i separację między grupami. (C) Wykres wyników ortogonalnej analizy dyskryminacyjnej metodą cząstkowych najmniejszych kwadratów (OPLS-DA) oraz odpowiadający mu test permutacji walidujący wiarygodność modelu dla porównania grupy Sham względem CHF (20 permutacji). (D) Wykres wyników ortogonalnej analizy dyskryminacyjnej metodą cząstkowych najmniejszych kwadratów (OPLS-DA) oraz odpowiadający mu test permutacji walidujący wiarygodność modelu dla porównania grupy CHF względem EA (20 permutacji). (E) Mapa ciepła z hierarchiczną klastracją współczynników korelacji Pearsona, oceniająca powtarzalność wewnątrzgrupową i wariancję międzygrupową we wszystkich próbkach proteomicznych. Kliknij tutaj, aby wyświetlić większą wersję tego rysunku.

Rycina 5: Identyfikacja i analiza wzbogacenia funkcjonalnego kluczowych białek o zróżnicowanej ekspresji modulowanych przez elektroakupunkturę w jądrze pasma samotnego. (A) Wykresy wulkaniczne ilustrujące rozkład białek o zwiększonej i zmniejszonej ekspresji w porównaniach Sham versus CHF oraz CHF versus EA. (B) Diagramy Venna przedstawiające analizę przecięć w celu zidentyfikowania kluczowych białek o zmniejszonej i zwiększonej ekspresji po interwencji EA. (C) Mapa ciepła z klastrowaniem hierarchicznym profili ekspresji kluczowych białek o zróżnicowanej ekspresji. (D) Pęcherzykowe wykresy GO szczegółowo przedstawiające wzbogacone procesy biologiczne, komponenty komórkowe i funkcje molekularne dla podzbioru białek o zmniejszonej ekspresji. (E) Chordowe i Sankeyowskie diagramy KEGG mapujące ścieżki sygnalizacyjne wzbogacone przez białka o zmniejszonej ekspresji. (F) Pęcherzykowe wykresy GO szczegółowo przedstawiające wzbogacone procesy biologiczne, komponenty komórkowe i funkcje molekularne dla podzbioru białek o zwiększonej ekspresji. (G) Chordowe i Sankeyowskie diagramy KEGG mapujące ścieżki sygnalizacyjne wzbogacone przez białka o zwiększonej ekspresji. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 6: Topologia sieci, profilowanie ekspresji w tkankach oraz walidacja molekularna identyfikują YY1 jako kandydata na cel powiązany z elektroakupunkturą. (A) Sieć oddziaływań białko-białko, diagram chordowy i diagram Sankeya zidentyfikowanych białek hubowych. (B) Profil ekspresji YY1 w tkankach ludzkich pochodzący z bazy danych GTEx, gdzie czerwona ramka wyróżnia tkanki mózgowe. (C) Analiza ilościowa ekspresji mRNA YY1, DPF2 i DMAP1 w NTS w poszczególnych grupach (powtórzenia biologiczne n = 6, średnia ± SD). **p < 0,01, ***p < 0,01 vs grupa Sham; ###p < 0,001 vs grupa CHF; ns, brak istotności statystycznej vs grupa CHF. (D) Reprezentatywne prążki Western blot dla YY1 i β-actin w NTS w poszczególnych grupach. (E) Analiza ilościowa ekspresji białka YY1 w poszczególnych grupach (powtórzenia biologiczne n = 3, średnia ± SD). ***p < 0,01 vs grupa Sham; #p < 0,05 vs grupa CHF. (F) Bioinformatyczna predykcja epigenetycznych modyfikacji histonowych regulujących locus YY1 na podstawie wyników potencjału regulacyjnego. (G) Bioinformatyczna predykcja czynników transkrypcyjnych upstream regulujących locus YY1 na podstawie wyników potencjału regulacyjnego. Kliknij tutaj, aby wyświetlić powiększoną wersję tej ryciny.

Rycina 7: Proponowany model związku między elektroakupunkturą w punkcie HT7, zwiększoną ekspresją YY1, przywróceniem aktywności neuronalnej w jądrze pasma samotnego a poprawą w przebiegu przewlekłej niewydolności serca. (Lewo) Stan patologiczny: W modelu CHF indukowanym przez podwiązanie lewej tętnicy wieńcowej (LAD) aktywność neuronalna w NTS jest zmniejszona, co towarzyszy supresji czynnika transkrypcyjnego YY1. Ta centralna inhibicja neuronalna wiąże się z patologicznym przebudową serca, przejawiającą się obniżeniem LVEF, zwiększoną włóknieniem mięśnia sercowego oraz podwyższonym poziomem markerów niewydolności serca w surowicy. (Prawo) Leczenie EA: Interwencja EA w punkcie akupunkturowym HT7 zwiększa ekspresję YY1 w NTS i przywraca pobudliwość neuronalną. Ta centralna neuromodulacja wykazuje działanie kardioprotekcyjne, łagodząc patologiczną przebudowę i poprawiając ogólnoustrojową funkcję serca. Kliknij tutaj, aby zobaczyć powiększoną wersję tej ryciny.
Rysunek uzupełniający 1: Ocena funkcji serca w kohorcie proteomicznej oraz profile ekspresji w tkankach ludzkich dla kandydujących genów hub. (A) Analiza ilościowa LVEF i LVFS w poszczególnych grupach (powtórzenia biologiczne n = 12, średnia ± SD). ***p < 0.01 vs. grupa Sham; ###p < 0.001 vs. grupa CHF. (B-J) Profile ekspresji w tkankach ludzkich dla kandydujących genów hub pochodzących z bazy danych GTEx, w tym COL3A1 (B), DMAP1 (C), DPF2 (D), FMOD (E), MYH1 (F), E2F2 (G), LUM (H), DCN (I) oraz COL14A1 (J).Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 1: Kompleksowa macierz identyfikacji i kwantyfikacji globalnego proteomu w jądrze pasma samotnego.Tabela ta przedstawia pełny zestaw danych proteomicznych z analizy ilościowej dla wszystkich kohort eksperymentalnych. Ważne kolumny obejmują Protein ID (numer akcesyjny UniProt), Gene (symbol genu), First.Protein.Description (adnotacja funkcjonalna) oraz znormalizowane wartości intensywności białek dla każdej repliki biologicznej w grupach Sham, CHF i EA (n = 6 na grupę).Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 2: Wartości istotności zmiennych w projekcji (VIP) w modelu OPLS-DA dla białek w porównaniu grupy Sham z grupą CHF.Tabela ta wymienia cechy, które odróżniają grupy Sham i CHF zgodnie z modelem OPLS-DA. Kluczowe kolumny obejmują cechę (reprezentującą identyfikator konkretnego białka/genu) oraz wartość VIP_value (Variable Importance in Projection), która wskazuje wkład każdej cechy w rozdzielenie grup (próg VIP > 1.0).Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 3: Wyniki wskaźnika istotności zmiennych (VIP) w modelu OPLS-DA dla białek w porównaniu CHF i EA.Tabela ta wymienia cechy różnicujące grupy CHF i EA w oparciu o model OPLS-DA. Podobnie jak w Tabeli S2, zawiera ona kolumnę cech oraz odpowiadającą im wartość VIP_value, wyróżniając cechy najbardziej reaktywne na interwencję EA.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 4: Szczegółowa lista 85 kluczowych białek o różnej ekspresji modulowanych przez elektroakupunkturę.Tabela ta przedstawia część wspólną białek, których poziom uległ znaczącej zmianie w przebiegu CHF, a następnie został przywrócony przez interwencję EA. Ważne kolumny obejmują Protein_ID, Gene, log2FC (log2 Fold Change wskazujący zmienność ekspresji), P_value dla istotności statystycznej (próg p < 0,05) oraz VIP_value oceniający wkład w model.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 5: Analiza wzbogacenia Gene Ontology dla podzbioru obniżonych białek rdzeniowych. Tabela ta przedstawia adnotacje funkcjonalne Gene Ontology (GO) dla 58 białek o obniżonej ekspresji pod wpływem EA. Ważne kolumny obejmują ONTOLOGY (podzieloną na Proces Biologiczny [BP], Komponent Komórkowy [CC] oraz Funkcję Molekularną [MF]), opis funkcjonalny (Description), p.adjust (skorygowaną wartość p dla wielokrotnego testowania) oraz geneID, który odpowiada konkretnym genom wzbogaconym w każdym terminie.Prosimy kliknąć tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 6: Analiza wzbogacenia szlaków KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) dla podzbioru obniżonych białek rdzeniowych.Tabela ta przedstawia wzbogacone kaskady sygnalizacyjne dla 58 białek o obniżonej ekspresji. Kluczowe kolumny obejmują nazwę szlaku (Term), skorygowaną wartość p wskazującą na istotność statystyczną wzbogacenia oraz konkretne przecinające się geny zaangażowane w każdy szlak.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 7: Analiza wzbogacenia ontologii genów (Gene Ontology) dla podzbioru nadekspresyjnych białek kluczowych.Tabela ta przedstawia adnotacje funkcjonalne Gene Ontology (GO) dla 27 białek wykazujących nadekspresję pod wpływem EA. Format i definicje kolumn (ONTOLOGY [BP, CC, MF], Description, p.adjust, geneID) są identyczne z tymi szczegółowo opisanymi w tabeli S5.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 8: Analiza wzbogacenia szlaków Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes dla podzbioru nadrzędnych białek rdzeniowych.Tabela ta przedstawia wzbogacone kaskady sygnalizacyjne dla 27 nadrzędnych białek. Format i definicje kolumn (Term, Adjusted p-value, Genes) są identyczne z tymi szczegółowo opisanymi w Tabeli S6.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 9: Wyniki łączności topologicznej 18 białek hub wyznaczonych z sieci oddziaływań białko-białko.Tabela ta podsumowuje topologiczne parametry sieci wykorzystane do identyfikacji kluczowych genów hub. Główne kolumny obejmują nazwę genu oraz centralne metryki sieci, takie jak stopień (Degree), centralność pośrednictwa (Betweenness Centrality) i centralność bliskości (Closeness Centrality), które określają względne znaczenie i łączność każdego węzła w sieci biologicznej.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Tabela uzupełniająca 10: Analiza wzbogacenia szlaków Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes dla 18 białek centralnych sieci.Tabela ta przedstawia specyficzne szlaki sygnalizacyjne wzbogacone wyłącznie przez 18 zidentyfikowanych białek centralnych. Kluczowe kolumny obejmują nazwę szlaku (Term), skorygowaną wartość p określającą istotność oraz odpowiednie geny odpowiedzialne za wzbogacenie funkcjonalne.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.
Plik uzupełniający 1: Skrypty R wykorzystane do analizy i wizualizacji danych oraz nieprzycięte obrazy Western blot.Plik uzupełniający zawiera skrypty R wykorzystane do analizy korelacji Pearsona, generowania podwójnych wykresów wulkanicznych (volcano plot) i identyfikacji białek o odwróconej ekspresji w EA, analizy wzbogacenia Gene Ontology (GO), generowania map ciepła z klastrowaniem hierarchicznym, wizualizacji wzbogacenia Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), ortogonalnej analizy dyskryminacyjnej metodą najmniejszych kwadratów częściowych (OPLS-DA) i testowania permutacyjnego, analizy dyskryminacyjnej metodą najmniejszych kwadratów częściowych (PLS-DA), generowania mapy ciepła korelacji próbek proteomicznych oraz analizy diagramów Venna.Kliknij tutaj, aby pobrać ten plik.