Name: Badania chemotaksji bakteryjnej z wykorzystaniem mikrofluidyki - Wywiad (Wideo) | JoVE Journal
Uploaded: 2007-05-28T00:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 35 s
Description: Poznaj badania chemotaksji bakteryjnej z wykorzystaniem mikrofluidyki w ekologii mikroorganizmów morskich. Ta metoda pozwala zrozumieć, jak bakterie wykrywają źródła pokarmu w oceanie.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Autorzy nie zgłaszają żadnych konfliktów interesów.

badania nad chemotaksją bakteryjną z wykorzystaniem mikroprzepływów – wywiad

Studies of Bacterial Chemotaxis Using Microfluidics - Interview

Badania nad chemotaksją bakteryjną z wykorzystaniem mikroprzepływów – wywiad

Nazywam się Roman Stocker. Jestem adiunktem w drugim roku pracy w Laboratorium Ralpha Parsonsa, które wchodzi w skład Departamentu Inżynierii Lądowej i Środowiska tutaj, na MIT. Pochodzę z Włoch i studiowałem mechanikę płynów.Moje wykształcenie opiera się zatem bardziej na naukach fizycznych, jednak w ciągu ostatnich dwóch, a właściwie trzech lat, zaczęłam zajmować się w większym stopniu tematyką środowiskową i biologiczną. Dwa lata temu rozpoczęłam opracowywanie systemów mikroprzepływowych w celu badania problemów z zakresu ekologii mikrobowej; dzięki tym mikro urządzeniom jesteśmy w stanie analizować typowe pytania ekologiczne w skali mikronowej. Nasza praca koncentruje się przede wszystkim na organizmach zdolnych do poruszania się w oceanie i śledzenia źródeł pożywienia.W szczególności bakterie wykształciły bardzo pomysłowe sposoby poruszania się, co mogę tutaj krótko zademonstrować. Głowa bakterii ma kształt zbliżony do elipsoidy. Można sobie wyobrazić, że ma ona rozmiar około 2 µm.Z tyłu bakterii znajduje się jeden lub więcej wici. Wici te są strukturami helikalnymi, które bakteria może obracać. Ten ruch obrotowy wytwarza siłę napędową, która pozwala bakterii faktycznie płynąć

studies-of-bacterial-chemotaxis-using-microfluidics-interview

Research

JoVE Journal

Biology

Biologia

Badania chemotaksji bakteryjnej z wykorzystaniem mikrofluidyki - Wywiad

Opisano proces wytwarzania kanałów mikroprzepływowych oraz ich zastosowanie w eksperymentach służących do badania zachowań chemotaktycznych morskich drobnoustrojów w niejednorodnym środowisku nutrientowym (patchy nutrient seascape) oraz zachowań pływackich bakterii w przepływie ścinającym.

Odpowiedź chemotaktyczna mikroorganizmów morskich na mikroskalowe warstwy składników odżywczych

Niniejszy protokół opisuje opracowanie urządzenia mikroprzepływowego do badania chemotaksji bakteryjnej w stabilnych gradientach stężeń chemoefektorów.

Urządzenie mikroprzepływowe do ilościowego oznaczania chemotaksji bakteryjnej w stabilnych gradientach stężeń

Źródło: Scheidweiler, D. i in. Łączenie urządzeń płynowych z mikroskopią i cytometrią przepływową do badania transportu mikroorganizmów w ośrodkach porowatych na skalach przestrzennych. J. Vis. Exp. (2020).Ten film demonstruje użycie urządzenia mikrofluidycznego do ilościowego określania ruchliwości bakterii poprzez porowatą matrycę złożoną z losowo ułożonych filarów. Do urządzenia wprowadzane są fluorescencyjnie znakowane bakterie, obrazowane mikroskopią podczas przemieszczania się przez...

Ocena ruchliwości bakteryjnej za pomocą urządzenia mikrofluidycznego

Ten film demonstruje test chemotaksji neutrofili przy użyciu metody all-on-chip. Metoda ta pozwala na bezpośrednią izolację neutrofili z krwi pełnej poprzez immunomagnetyczną selekcję ujemną, a następnie test chemotaksji na chipie mikroprzepływowym.

Mikroprzepływowa metoda oparta na chipie do szybkiej analizy chemotaksji neutrofili przy użyciu krwi pełnej

Wizualne testy chemotaksji są niezbędne do lepszego zrozumienia, w jaki sposób komórki eukariotyczne kontrolują kierunkową migrację komórek za pośrednictwem chemoatraktantu. W tym miejscu opisujemy szczegółowe metody dla: 1) monitorowania w czasie rzeczywistym w wysokiej rozdzielczości wielu testów chemotaksji oraz 2) jednoczesnej wizualizacji gradientu chemoatraktantu i czasoprzestrzennej dynamiki zdarzeń sygnalizacyjnych w neutrofilopodobnych komórkach HL60.

Obrazowanie chemotaksji sprzężonej z białkiem G i jej zdarzeń sygnalizacyjnych w neutrofilowych komórkach HL60

Zbiorowa migracja komórek w procesie rozwoju, gojenia ran i przerzutów nowotworowych jest często kierowana przez gradienty czynników wzrostu lub cząsteczek sygnałowych. Opisano tutaj eksperymentalny system łączący mikroskopię trakcyjną z układem mikroprzepływowym oraz demonstrację sposobu ilościowego określania mechaniki migracji zbiorowej w warunkach gradientu biochemicznego.

Mikroskopia trakcyjna zintegrowana z mikrofluidyką do chemotaktycznej migracji zbiorowej

Przedstawiono protokół do generowania dynamicznych krajobrazów chemicznych przez fotolizę w układach mikroprzepływowych i milifluidowych. Metodologia ta jest odpowiednia do badania różnych procesów biologicznych, w tym zachowania ruchliwego, pobierania składników odżywczych lub adaptacji mikroorganizmów do substancji chemicznych, zarówno na poziomie pojedynczej komórki, jak i populacji.

Generowanie kontrolowanych, dynamicznych krajobrazów chemicznych w celu badania zachowania mikroorganizmów

Tutaj opisujemy metody wykorzystujące mikroskopię poklatkową z kontrastem fazowym do obrazowania makrofagów otrzewnowych rezydujących myszy w chemotaktycznym gradiencie dopełniacza C5a. Protokoły można rozszerzyć na inne komórki odpornościowe.

Obrazowanie poklatkowe chemotaksji makrofagów myszy

Prezentowany jest tutaj protokół testu chemotaksji in situ, niedawno opracowanego urządzenia mikroprzepływowego, które umożliwia badanie zachowania mikroorganizmów bezpośrednio w środowisku.

Test chemotaksji in situ w celu zbadania zachowania mikroorganizmów w ekosystemach wodnych

Jared Leadbetter wyjaśnia, dlaczego społeczność mikrobowa w jelitach termitów stanowi doskonały system do badania złożonych interakcji między mikroorganizmami. Omówiono symbiotyczną relację zachodzącą między owadem-gospodarzem a degradującymi lignocelulozę mikrobami jelitowymi, a także przemysłowe zastosowania tych mikroorganizmów w rozkładzie biomasy roślinnej i produkcji biopaliw.

Badanie społeczności mikrobowej w jelicie tylnym termitów – Wywiad

Poznaj badania chemotaksji bakteryjnej z wykorzystaniem mikrofluidyki w ekologii mikroorganizmów morskich. Ta metoda pozwala zrozumieć, jak bakterie wykrywają źródła pokarmu w oceanie.

Badania nad chemotaksją bakteryjną z wykorzystaniem mikroprzepływów – wywiad

Przeglądaj więcej filmów