$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Mitochondria, organelle cytoplazmatyczne znane jako elektrownie komórki, ulegają drastycznym zmianom strukturalnym i funkcjonalnym podczas progresji raka.
Aby wyizolować mitochondria, weź czystą tkankę rakową do szklanego naczynia i zmiel ją na małe kawałki. Przenieść kawałki do probówki zawierającej bufor izolacyjny mitochondriów. Homogenizować próbkę, aby rozbić komórki i uwolnić ich zawartość, w tym organelle.
Odwirować mieszaninę z niską prędkością. Powoduje to granulowanie gęstszych składników, takich jak jądra, szczątki tkanek i wszelkie nienaruszone komórki, pozostawiając mniej gęste składniki, takie jak mitochondria, mikrosomy, peroksysomy i lizosomy w supernatancie. Zebrać supernatant i odwirować z dużą prędkością. Mikrosomy, będące stosunkowo lżejsze, pozostają w supernatancie, podczas gdy surowa frakcja zawierająca mitochondria granuluje się na dole.
Usunąć supernatant i ponownie zawiesić osad w podłożu o odpowiednim gradiencie gęstości. Ustaw nieciągły gradient gęstości, nakładając surową frakcję mitochondrialną na podłoża o różnej gęstości, układając je w malejącej kolejności gęstości od dołu do góry. Wirować z bardzo dużą prędkością. Organelle oddzielają się w probówce, aby przyjąć pozycję równowagi w oparciu o ich względną gęstość. Zbierz frakcję mitochondrialną utworzoną na granicy faz między mediami gęstości, zawierającymi peroksysomy i lizosomy.
Aby rozpocząć tę procedurę, przygotuj 250 mililitrów bufora izolacji mitochondriów, jak opisano w protokole tekstowym. Umieść około 1,5 grama tkanek raka jajnika w czystym szklanym naczyniu. Dodaj 2 mililitry wstępnie schłodzonego buforu izolacyjnego mitochondriów, aby lekko zmyć krew z powierzchni tkanki. Powtórz to pranie trzy razy.
Następnie użyj czystych nożyczek okulistycznych, aby całkowicie zmielić tkankę na kawałki o wielkości około jednego milimetra sześciennego i przenieść zmielone tkanki do 50-mililitrowej probówki wirówkowej. Dodać 13,5 mililitra mitochondrialnego buforu izolacyjnego zawierającego nagarzę w stężeniu 0,2 miligrama na mililitr. Użyj homogenizatora elektrycznego, aby homogenizować zmielone tkanki przez dwie minuty w temperaturze 4 stopni Celsjusza.
Następnie dodaj kolejne 3 mililitry mitochondrialnego buforu izolacyjnego do homogenatów tkankowych i dobrze je wymieszaj przez pipetowanie. Odwirować przygotowaną tkankę, homogenat o sile 1 300 x g i w temperaturze 4 stopni Celsjusza przez 10 minut. Usunąć osad i zachować supernatant.
Następnie odwirować supernatant w temperaturze 10 000 x g i w temperaturze 4 stopni Celsjusza przez 10 minut. Usunąć supernatant zawierający mikrosom i zachować osad. Dodać 2 mililitry mitochondrialnego buforu izolacyjnego i dokładnie zawiesić osad przez lekkie pipetowanie.
Odwirować tę zawiesinę granulek w temperaturze 7 000 x g i w temperaturze 4 stopni Celsjusza przez 10 minut. Odrzucić supernatant i zachować osad, który zawiera surowe mitochondria. Dodaj 12 mililitrów pożywki o gradiencie gęstości 25%, aby ponownie zawiesić wyekstrahowane surowe mitochondria. Wykonać nieciągły gradient gęstości zawierający zawieszone surowe mitochondria, zgodnie z opisem w protokole tekstowym, i odwirować go przy 52 000 x g i w temperaturze 4 stopni Celsjusza przez 90 minut.
Użyj długiej i strzykawki, aby zebrać oczyszczone mitochondria na granicy między mediami gradientowymi 25% i 30% i przenieś je do czystej probówki. Dodaj bufor izolacyjny mitochondriów do zebranych mitochondriów, aby rozcieńczyć go do trzykrotnej objętości. Wirować przy 15 000 x g i w temperaturze 4 stopni Celsjusza przez 20 minut. Odrzucić supernatant i zachować osad. Zbierz ostatnią osadkę, która zawiera oczyszczone mitochondria i przechowuj ją w temperaturze minus 20 stopni Celsjusza.