Wysoce wydajna ligacja małych cząsteczek RNA do kwantyfikacji mikroRNA za pomocą sekwencjonowania o wysokiej przepustowości

Ogólnym celem tej procedury jest bezstronne przygotowanie mikroRNA do sekwencjonowania o wysokiej przepustowości. Osiąga się to poprzez najpierw przygotowanie lub zakup oligonukleotydów DNA, które są zdolne do ligacji do trzech głównych końców mikro RNA. Drugim krokiem jest ligacja trzech głównych oligonukleotydów DNA do trzech głównych końców mikro RNA.

Następnie produkt ligacji jest oczyszczany w żelu, a łącznik oligonukleotydowy z pięcioma pierwszymi RNA jest ligowany do pięciu głównych końców mikro RNA. Ostatnim krokiem jest przekształcenie cząsteczek hybrydowych w CDNA, a następnie amplifikacja CDNA w reakcji łańcuchowej polimerazy. Ostatecznie klonowanie mikroRNA i sekwencjonowanie o wysokiej przepustowości wykorzystuje się do pokazania szerokiego profilu transkryptomu mikroRNA w sposób ilościowy przy rozdzielczości poszczególnych nukleotydów.