13 lipca 2016
Ten protokół opisuje rozwój dwóch przeciwciał monoklonalnych klasy IgG (mAb) silnie reaktywnych na mioglobinę u waleni. Te mAb są nakładane na koloidalny złoty immunochromatograficzny pasek testowy oparty na formacie kanapkowym w celu odróżnienia Mb waleni od fok i innych zwierząt.
Ogólnym celem tego koloidalnego złota testu immunochromatograficznego jest odróżnienie mioglobiny waleni od mioglobiny fok oraz innych zwierząt. Metoda ta umożliwia szybkie i doraźne badanie przesiewowe mięsa waleni, co pozwala na ograniczenie jego nielegalnego handlu i spożycia. Główną zaletą tej techniki jest możliwość zaobserwowania pozytywnego wyniku bezpośrednio od pięciu do dziesięciu minut po homogenizacji 03 gram mięśnia, przy zachowaniu wyjątkowej specyficzności i czułości.
W związku z tym metoda ta umożliwia szybkie wykrywanie mięsa waleni w warunkach terenowych. Może ona zostać zastosowana również do innych rodzajów mięsa, takich jak mięso końskie lub wieprzowe. W celu zaprojektowania syntetycznych peptydów do wytworzenia przeciwciał monoklonalnych wykazujących reaktywność wobec mioglobiny waleni, przeanalizowano sekwencje aminokwasowe antygenowych regionów reaktywnych mioglobiny u różnych zwierząt.
Rozpocznij od pobrania z GenBank sekwencji aminokwasowych mioglobiny z tuńczyka, kurczaka, strusia, ssaków udomowionych, foki oraz 18 gatunków waleni. Następnie dopasuj sekwencje, korzystając z odpowiedniego oprogramowania. Uruchom Alignment Explorer, wybierając opcję Align Edit/Build Alignment na pasku uruchamiania.
Wybierz polecenie Create New Alignment i kliknij OK. Pojawi się okno dialogowe z pytaniem, czy tworzone wyrównanie dotyczy sekwencji DNA czy białek? Kliknij przycisk Protein, wybierz Data Open Retrieve sequences from File, a następnie wybierz plik z sekwencjami. Wybierz polecenie Edit Select All z menu, aby zaznaczyć wszystkie pozycje dla każdej sekwencji w zbiorze danych w celu utworzenia wielosekwencyjnego wyrównania.
Z głównego menu wybierz Align Alignment Align by ClustalW. Jako macierz wag białek wybierz BLOSUM, a następnie kliknij przycisk OK. Trzecim krokiem jest analiza dopasowania sekwencji.
Skupiono się na pięciu antygenowych miejscach reaktywnych i wyszukano fragment konserwowany u waleni. Gwiazdka symbolizuje konsensus w dopasowaniu i wskazuje pozycję, w której znajduje się pojedynczy, w pełni konserwowany aminokwas. Znaleziono dwa fragmenty konserwowane u waleni.
Następnie syntetyzuje się fragmenty sekwencji kandydackich i wykorzystuje je do wytworzenia przeciwciał monoklonalnych. Procedurę tę należy rozpocząć od wyznaczenia optymalnego pH dla roztworu złota koloidalnego, zdefiniowanego jako minimalne pH, przy którym mieszanina przeciwciała monoklonalnego i roztworu złota koloidalnego zachowuje czerwony kolor przez dwie godziny. Do 100 µL roztworu złota koloidalnego o wartościach pH w zakresie od pięciu do dziewięciu należy dodać 0,15 µg oczyszczonego detekcyjnego przeciwciała monoklonalnego.
Na potrzeby niniejszej demonstracji przetestowano pH 6 oraz pH 8. W tym etapie optymalizacji pH 8 uznano za wartość optymalną. Następnie należy wyznaczyć optymalne stężenie przeciwciała monoklonalnego, dodając różne ilości oczyszczonego wykrywającego przeciwciała monoklonalnego do 100 µl roztworu złota koloidalnego przy pH 8.
Optymalne stężenie, które w niniejszym badaniu wynosi 6 µg/mL, pozwoli zachować czerwony kolor mieszaniny bez powstania czarnego osadu. W oparciu o wyniki etapów optymalizacji, należy dodać po kropli 60 µg oczyszczonego wykrywającego przeciwciała monoklonalnego do 10 mL roztworu złota koloidalnego. Mieszaninę należy delikatnie emulgować w temperaturze pokojowej przez dziesięć minut.
Do mieszaniny dodać 2 mL 5% roztworu BSA w PBS i delikatnie emulgować w temperaturze pokojowej przez 15 minut w celu zmniejszenia tła. Mieszaninę wirować przy 10 000 ×g przez 30 minut w temperaturze 4 °C. Po wirowaniu ostrożnie usunąć nadosad zawierający nie sprzężone przeciwciała, a powstały osad zawiesić w 4 mL buforu PBS-T zawierającego 1% BSA i 0,1% Tween-20.
Powtórz wirowanie i resuspensję jeden lub dwa razy. Resuspenduj końcowe osady w 1mL PBS-T i przechowuj w temperaturze czterech stopni Celsjusza do momentu użycia. Tutaj przedstawiono schemat konstrukcji paska immunochromatograficznego.
Wymiary tektury, podkładek i membrany nitrocelulozowej są wymienione w tekście protokołu. Aby przedłużyć okres trwałości, paski immunochromatograficzne należy przygotować i złożyć w warunkach laboratoryjnych o niskiej wilgotności. Za pomocą mikropipety należy nanieść roztwór przeciwciała monoklonalnego znakowanego koloidalnym złotem na podkładkę z koniugatem, aby ją nasycić, a następnie suszyć podkładkę w temperaturze 37 °C przez jedną godzinę przed montażem.
Po wyschnięciu podkładki z koniugatami, użyj dwustronnej taśmy, aby najpierw przykleić membranę nitrocelulozową do tektury. Za pomocą drukarki do pasków immunologicznych nanieś specyficzne przeciwciało monoklonalne wychwytujące antygen w strefie testowej oraz szybkie przeciwciało anty-mysie IGG w strefie kontrolnej na membranie nitrocelulozowej. Zachowaj odległość większą niż pięć milimetrów pomiędzy obiema strefami.
Następnie przyklej podkładkę z koniugatem do jednej strony membrany nitrocelulozowej, a podkładkę absorbującą do drugiej strony, tak aby podkładki nachodziły na membranę o około dwa milimetry z każdej strony. Umieść podkładkę na próbkę tak, aby nachodziła na podkładkę z koniugatem o dwa milimetry, a następnie przyklej ją do tektury. Użyj gilotyny do papieru, aby wyciąć paski o szerokości sześciu milimetrów.
Zapakuj paski do aluminiowej folii z osuszaczem i przechowuj w temperaturze 4 °C do momentu użycia. Aby przygotować próbkę do testu reakcji krzyżowej, dodaj 1 mL PBS zawierającego 0,1% BSA do 0,03 g surowego mięśnia. Następnie użyj patyczka bambusowego lub pręta do rozcierania, aby zhomogenizować próbkę.
Trzymaj pasek immunochemiczny za koniec przeciwległy do obszaru testowego i zanurz część z podkładką do próbek w badanym materiale na pięć do dziesięciu minut. Odczytaj wynik bezpośrednio. Przetestuj różne próbki mięśni w trzech powtórzeniach.
Linia testowa T została zaprojektowana tak, aby wykazać sygnał dodatni, gdy oba przeciwciała monoklonalne wykryją mioglobinę waleni. Ponieważ mioglobina zwierząt innych niż walenie może zostać wykryta tylko przez jedno z tych dwóch przeciwciał monoklonalnych, linia testowa wykazuje wynik ujemny w przypadku badania próbek mięśni innych zwierząt. Linia kontrolna C powinna zawsze wykazywać wynik dodatni, ponieważ szybkie przeciwciała anty-mysie IgG wiążą znakowane koloidalnym złotem przeciwciało detekcyjne.
Brak wyniku w linii kontrolnej wskazuje na niską jakość materiałów na pasku. Analiza krwi metodą Western blot z wykorzystaniem supernatantów hybridom wykazała, że przeciwciało monoklonalne CGF5H9 wykrywa walenie oraz inne ssaki w postaci pojedynczego zabarwionego prążka o przewidywanej masie cząsteczkowej około 17kDa. U minke (walenia minke) prążek jest porównawczo słabszy niż w przypadku innych waleni.
Prążki nie występują dla tuńczyka, foki i kurczaka. Natomiast dla świni obserwuje się prążek o masie około 50kDa. Identyczne wyniki uzyskano w analizie kropelkowej krwi.
Choć analiza krwi zachodniej z użyciem przeciwciała monoklonalnego CSF1H13 wykazuje wiele niespecyficznych prążków dla świni i tuńczyka, CSF1H13 jest wysoce specyficzne, ponieważ reaguje wyłącznie z waleniami. W przypadku foki występuje prążek o przewidywanej masie cząsteczkowej około 17kDa. Identyczne wyniki uzyskano w analizie krwi metodą dot blot.
Wyniki pośredniego testu ELISA ekstraktów mięśniowych różnych gatunków z użyciem oczyszczonego CGF5H9 wykazują sygnały dodatnie dla krowy, kozy, psa, królika i waleni, słaby sygnał dodatni dla świni oraz sygnały ujemne dla tuńczyka, kurczaka i foki. CSF1H13 wykazuje wysokie powinowactwo do waleni i fok. Oba przeciwciała monoklonalne mogą silnie reagować ze wszystkimi czterema gatunkami waleni z różnych rodzin, co wskazuje na ich szeroką reaktywność wobec różnorodnych gatunków waleni.
Swoistość immunochromatograficznej paskowej analizy z użyciem złota koloidalnego została wykazana na podstawie tych reprezentatywnych wyników. Użycie próbek mięśni innych niż od waleni skutkuje pojawieniem się tylko jednego prążka na linii kontrolnej. Jednak w przypadku użycia próbek mięśni waleni, prążki sygnałowe pojawiają się zarówno na linii testowej, jak i kontrolnej.
Po opanowaniu techniki, przygotowanie znakowanych przeciwciał oraz konstrukcja pasków mogą zostać wykonane w ciągu czterech godzin, jeśli procedura zostanie przeprowadzona prawidłowo. Podczas wykonywania tej procedury ważne jest, aby starannie zaprojektować peptyd. Należy zastosować kilka metod w celu przesiewania odpowiednich przeciwciał monoklonalnych.
Należy użyć wysokiej jakości złota koloidalnego do przygotowania znakowanych przeciwciał. Po zastosowaniu tych procedur można przeprowadzić inne metody, takie jak analiza DNA oparta na PCR, w celu udzielenia odpowiedzi na dodatkowe pytania, na przykład dotyczące gatunku walenia oraz jego pochodzenia. Przeciwciało monoklonalne CSF1H13, które jest silne i wykazuje powinowactwo wyłącznie do ssaków morskich, może być wykorzystane w różnych formatach testu ELISA, co stwarza wiele innych możliwości badania aspektów biologicznych, fizjologicznych i chemicznych mioglobiny u ssaków morskich.
Po obejrzeniu tego filmu powinni Państwo posiadać dobrą wiedzę na temat tego, jak opracować specyficzne przeciwciała monoklonalne, a następnie zastosować je w szybkim teście paskowym.
Wyświetl pełny transkrypt i uzyskaj dostęp do tysięcy filmów naukowych
Niniejszy protokół opisuje koloidalny złoty test immunochromatograficzny w formie paska, zaprojektowany do odróżnienia mioglobiny waleni od mioglobiny fok oraz innych zwierząt. Metoda ta umożliwia szybkie badanie mięsa waleni w miejscu pobrania próbki, co wspomaga zapobieganie nielegalnemu handlowi.
Niniejsza metoda umożliwia szybką detekcję mioglobiny waleni w warunkach terenowych, wspierając inicjatywy z zakresu ochrony przyrody i bezpieczeństwa żywności poprzez dostarczenie specyficznego biomarkera do identyfikacji gatunków. Immunochromatograficzny pasek w formacie kanapkowym pozwala na uzyskanie wyników w ciągu 5–10 minut z wysoką swoistością, co ogranicza zależność od analiz laboratoryjnych. Rozwiązanie to odpowiada na zapotrzebowanie na przenośne i powtarzalne narzędzia w ochronie dzikiej przyrody oraz monitorowaniu nielegalnego handlu.
Metoda ta wpisuje się w kontinuum od odkrycia do walidacji, wspierając wczesną weryfikację biomarkerów oraz prototypowanie testów w zastosowaniach związanych z ochroną przyrody i bezpieczeństwem żywności.