18 maja 2016
Tutaj opisany jest protokół zbierania, utrzymywania i leczenia organoidów jelita cienkiego myszy z wzorcami molekularnymi związanymi z patogenami (PAMP) i Listeria monocytogenes, a także nacisk na ekspresję genów i właściwe techniki normalizacji białka.
Ogólnym celem tej procedury jest pomiar efektów wywołanych przez patogeny w organoidach jelita cienkiego, ze szczególnym uwzględnieniem technik normalizacji względem całkowitej liczby komórek. Metoda ta może pomóc w odpowiedzi na kluczowe pytania w dziedzinie immunologii wrodzonej oraz śluzówkowej, dostarczając narzędzi do badania in vitro interakcji między patogenami bakteryjnymi a komórkami nabłonka jelitowego gospodarza. Kluczowym elementem tej procedury jest metoda normalizacji względem całkowitej liczby komórek, co jest niezbędne podczas pomiaru białek wydzielanych przez organoidy za pomocą technik takich jak ELISA. Aby wyizolować krypt jelita cienkiego myszy do hodowli organoidów, należy rozpocząć od delikatnego zeskrobania kosmków z powierzchni światła jelita cienkiego za pomocą sterylnego szkiełka przedmiotowego. Następnie, używając nożyczek sekcyjnych, należy pociąć tkankę na paski o długości 1-2 centymetrów. Paski należy umieścić w 50-mililitrowej probówce stożkowej zawierającej 10 mililitrów schłodzonego na lodzie PBS. Zawartość należy wymieszać poprzez delikatne odwracanie probówki i pozwolić tkankom opaść na dno. Następnie należy odessać PBS i przemyć paski jeszcze trzy razy w 10 mililitrach świeżego PBS, za każdym razem w ten sam sposób. Po ostatnim płukaniu probówkę należy pozostawić na lodzie przez dziesięć minut. Następnie należy zastąpić PBS 25 mililitrami PBS uzupełnionego o 2 milimolar EDTA, inkubując w wiadrze z lodem na platformie kołyszącej przez 45 minut. Po zakończeniu inkubacji należy pozwolić paskom tkanki opaść na dno probówki i zastąpić PBS-EDTA 10 mililitrami PBS uzupełnionego o 10% FBS. Probówkę należy energicznie potrząsnąć ręcznie dziesięć razy. Następnie należy pozwolić tkance opaść na dno probówki i przenieść supernatant do 15-mililitrowej probówki stożkowej z etykietą „Frakcja 1”. Tkanki w PBS FBS należy wymieszać jeszcze pięć razy. Po każdym razie supernatant należy przenieść do nowej probówki na frakcje. Po ostatnim mieszaniu wszystkie próbki należy odwirować, a osady resuspendować w pięciu mililitrach wstępnie ogrzanej pożywki DMEM/F12 bez dodatku czynników wzrostu. Następnie próbki należy ponownie odwirować i odessać cztery mililitry supernatantu z każdej probówki. Osady należy resuspendować w ostatnim mililitrze pozostałej pożywki i pobrać 20-mikrolitrowe alikwoty z każdej frakcji, aby zwizualizować krypty i zanieczyszczenia na szkiełkach przedmiotowych. Po połączeniu odpowiednich frakcji w celu uzyskania najwyższego stosunku krypt do zanieczyszczeń, należy odwirować połączone frakcje i odessać cały supernatant z wyjątkiem ostatnich 50-100 mikrolitrów. Trzymając probówki na lodzie, do połączonych frakcji należy dodać 1 mililitr matrycy białkowej, powoli pipetując w górę i w dół, aby zapobiec powstawaniu pęcherzyków powietrza. Następnie należy dodać 50 mikrolitrów zawiesiny matryca białkowa/krypty do środka każdej studni 37
Wyświetl pełny transkrypt i uzyskaj dostęp do tysięcy filmów naukowych
Niniejszy artykuł opisuje protokół zbioru, utrzymania oraz traktowania organoidów jelita cienkiego myszy wzorcami molekularnymi związanymi z patogenami (PAMPs) oraz Listeria monocytogenes. Szczególny nacisk położono na ekspresję genów oraz właściwe techniki normalizacji w analizie białek.
Organoidy jelita myszy ex vivo stanowią fizjologicznie istotny system do badania interakcji między gospodarzem a patogenem oraz sygnalizacji odporności wrodzonej w tkankach śluzowych. Nacisk położony w protokole na normalizację względem całkowitej liczby komórek rozwiązuje krytyczny problem generowania powtarzalnych, ilościowych danych z heterogenicznych kultur organoidów. Możliwość ta zwiększa pewność prognostyczną we wczesnej fazie odkryć i walidacji celów dla programów terapeutycznych skoncentrowanych na immunologii i mikrobiomie.
Niniejszy protokół integruje kontinuum odkryć, od wczesnego testowania hipotez, przez identyfikację związków wiodących, aż po walidację przedkliniczną w programach dotyczących immunologii błon śluzowych oraz oddziaływań gospodarz-mikrob.